单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39637 篇文献,本页显示第 3661 - 3680 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3661 2026-04-04
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
研究论文 本研究是一项随机II期临床试验,旨在比较帕博利珠单抗单药与联合低剂量化疗在体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性 首次在体能状态差(ECOG PS 2)的晚期NSCLC患者中,直接比较帕博利珠单抗单药与联合极低剂量化疗的疗效,并探索了基于血液的生物标志物,包括使用流式细胞术和单细胞测序分析免疫细胞 样本量较小(共43例患者),研究为II期试验,需要更大规模的III期试验验证结果;生物标志物分析为可选项目,样本量有限 确定帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗在体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者中的最佳治疗方案 晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者 NA 肺癌 流式细胞术,单细胞测序 NA 临床数据,血液样本数据 43例患者(每组20例可评估疗效),其中20例提供了可选血液样本用于生物标志物分析 NA 单细胞测序 NA NA
3662 2026-04-04
Spatial transcriptomic clocks reveal cell proximity effects in brain ageing
2025-02, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过构建空间分辨单细胞转录组脑图谱,开发空间衰老时钟模型,揭示了T细胞和神经干细胞在脑衰老中对邻近细胞的促衰老和促年轻化效应 首次开发了基于空间转录组数据的衰老时钟模型,能够识别罕见细胞类型的空间特异性转录组指纹,并量化细胞邻近效应对组织衰老的影响 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分;空间转录组技术分辨率有限,可能无法捕捉所有细胞间相互作用细节 探究脑衰老过程中细胞间相互作用机制及干预措施的影响 成年小鼠脑组织中的420万个细胞,涵盖20个不同年龄点及运动与部分重编程两种干预条件 空间转录组学 神经退行性疾病 空间分辨单细胞转录组测序 机器学习模型(空间衰老时钟)、深度学习 空间转录组数据 420万个细胞,覆盖20个年龄点及两种干预条件 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3663 2026-04-04
A single-cell compendium of human cerebrospinal fluid identifies disease-associated immune cell populations
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过整合公开数据集和自身研究,构建了一个包含139名受试者的单细胞转录组学图谱,涵盖脑脊液和血液样本,用于识别与神经系统疾病相关的免疫细胞群体 首次构建了一个全面的脑脊液免疫细胞单细胞转录组学参考图谱,识别了MS患者中特有的AREG+树突状细胞新亚群,并阐明了不同疾病间免疫细胞频率和分布的差异 研究依赖于公开数据集和自身样本的整合,可能存在批次效应或样本选择偏差,且疾病范围虽广但每种疾病的样本量可能有限 通过单细胞转录组学分析脑脊液免疫细胞,以阐明神经系统疾病的病理生理机制 人类脑脊液和血液样本中的免疫细胞 单细胞转录组学 多发性硬化症、阿尔茨海默病、帕金森病、COVID-19、自身免疫性脑炎等神经系统疾病 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 139名受试者,包括135个脑脊液样本和58个血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3664 2026-04-04
Stratifin Is Necessary for Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia Development After Acute Gastric Injury
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本文研究了Stratifin(SFN)在急性胃损伤后主细胞向SPEM转分化过程中的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了SFN在急性损伤后主细胞转分化中的关键调控作用,并发现其通过调节EGFR/ERK信号通路影响SPEM发育 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;机制研究仍待深入 探究SFN在急性胃损伤后主细胞转分化和SPEM发育中的功能 Mist1CreERT2; LSL-tdTomato小鼠和Mist1CreERT2; Sfnflox/flox小鼠模型中的主细胞和SPEM细胞 数字病理学 胃部疾病 单细胞RNA测序,免疫染色 NA RNA测序数据,图像数据 小鼠模型中的胃组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3665 2026-04-04
Epithelial tubule interconnection driven by HGF-Met signaling in the kidney
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了肝细胞生长因子(HGF)通过MAPK信号通路和基质金属蛋白酶(MMPs)促进小鼠胚胎肾脏上皮小管吻合的关键机制 首次明确了HGF-Met信号通路在驱动上皮小管相互连接(吻合)过程中的核心作用,并开发了一种可视化定量小管连接的新方法 研究主要基于小鼠胚胎肾脏模型,其在成年组织或人类组织中的普适性仍需验证 探究肾脏上皮小管网络形成过程中小管相互连接的分子机制 小鼠胚胎肾脏上皮小管 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3666 2026-04-04
Single-Cell RNA Sequencing of Mutant Whole Mouse Embryos: From the Epiblast to the End of Gastrulation
2024-06-14, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种针对突变小鼠胚胎在E6.5至E8天原肠胚形成阶段进行单细胞RNA测序的稳健方法 开发了一种克服突变胚胎单细胞分析技术限制的完整方法,包括优化育种、定时妊娠、同日基因分型和细胞/细胞核分离流程 方法主要针对小鼠胚胎,且在原肠胚形成阶段应用,可能不直接适用于其他发育阶段或物种 研究突变如何影响原肠胚形成阶段的细胞景观 突变小鼠胚胎(E6.5至E8天) 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 微滴式单细胞分析
3667 2026-04-04
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨了在Apoe-/-小鼠中,通过饮食诱导动脉粥样硬化消退后,抑制IL-1β对斑块稳定性和组成的意外有害影响 首次结合平滑肌细胞谱系追踪、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,揭示了IL-1β在维持饮食诱导的斑块稳定性和减少斑块负担中的关键作用,挑战了IL-1β抑制可能有益的预期 研究仅在Apoe-/-小鼠模型中进行,结果可能无法直接外推至人类;未探讨IL-1β抑制影响斑块稳定性的所有潜在分子机制 探究降低饮食脂质对晚期动脉粥样硬化病变组成和稳定性的影响,以及IL-1β抑制在此过程中的作用 Apoe-/-小鼠(平滑肌细胞谱系追踪模型)的主动脉和头臂动脉粥样硬化病变 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、免疫染色、高分辨率共聚焦显微镜z-stack分析 NA 基因表达数据、细胞表型数据、成像数据 Apoe-/-小鼠(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3668 2026-04-04
Single-cell RNA sequencing of mutant whole mouse embryos: from the epiblast to the end of gastrulation
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文设计了一种稳健的流程,用于对E6.5至E8阶段的小鼠胚胎进行单细胞和细胞核分析,以研究突变胚胎在胚胎发育过程中的细胞景观 开发了一种针对突变小鼠胚胎的单细胞RNA测序方法,克服了基因分型、定时妊娠和细胞数量少等技术限制,提高了在胚胎发育阶段进行单细胞分析的可行性 方法主要针对小鼠胚胎,可能不直接适用于其他物种或更晚期的发育阶段,且依赖于优化的育种和基因分型流程 研究突变如何影响胚胎发育过程中的细胞景观和基因表达动态 小鼠胚胎,特别是从E6.5到E8阶段的突变胚胎 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 微滴式单细胞分析
3669 2026-04-04
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示了骨髓微环境中IL-6信号通路在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用 建立了模拟年龄相关MDS向AML进展的小鼠模型,并首次证明骨髓微环境特异性IL-6信号是白血病转化的关键驱动因素 研究主要基于小鼠模型,人类患者样本验证相对有限,且未详细探讨IL-6信号下游的具体分子机制 探究骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的分子机制,特别是衰老微环境的作用 mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型、高风险MDS患者的CD34阳性细胞 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和MDS患者细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3670 2026-04-04
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究评估了在标准单细胞RNA测序样本制备条件下,混合来自无关供体的外周血单个核细胞是否会引起同种异体反应性转录响应 首次系统评估了在标准scRNA-seq样本制备条件下混合无关供体PBMCs是否会引起同种异体反应性基因表达变化,并识别了与PBMC制备方法和样本多重标记技术相关的技术假象 研究仅评估了30分钟4°C共孵育条件,未测试更长时间或不同温度条件;主要关注CD4+ T细胞中的同种异体反应性标记 评估样本多重技术在单细胞RNA测序中混合无关供体PBMCs时是否引入同种异体反应性假象,为横向免疫学研究建立基准 外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 单个供体PBMCs与无关供体PBMCs混合实验,并分析了公开可用的scRNA-seq数据集 10x Genomics, BD Biosciences 单细胞RNA-seq, 样本多重技术 10x Genomics scRNA-seq平台, BD单细胞多重试剂盒(SCMK) 10x Genomics单细胞RNA测序平台结合MULTI-seq和/或BD SCMK标记技术
3671 2026-04-04
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了CSEA-DB数据库,一个用于人类复杂性状与细胞类型关联的综合性资源库 整合了5120个GWAS汇总统计数据与超过90万个单细胞转录组数据,通过deTS算法进行了超过1000万次性状-细胞类型关联分析,首次构建了大规模的人类复杂性状与细胞类型特异性关联图谱 数据库依赖现有GWAS和单细胞数据的质量和覆盖范围,可能未涵盖所有组织或细胞类型 构建一个参考数据库,用于解析人类复杂性状与细胞类型特异性之间的遗传关联 人类复杂性状和疾病相关的遗传变异及细胞类型 生物信息学 复杂疾病 GWAS, 单细胞转录组测序 deTS算法 GWAS汇总统计数据, 单细胞RNA-seq数据 超过900,000个细胞,涵盖71个成人和胎儿组织的752种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3672 2026-04-03
Single-cell RNA sequencing and functional analysis reveal the role of altered glycosylation levels of hepatic macrophages in liver cirrhosis
2025-05, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示了肝巨噬细胞糖基化水平改变在肝硬化中的作用 首次在单细胞水平上结合糖基化和转录组数据,分析肝硬化中免疫细胞糖基化模式的变化及其功能影响,特别是巨噬细胞在免疫微环境重塑中的核心作用 研究基于现有数据,样本量可能有限,且未进行实验验证糖基化靶向治疗策略的有效性 探究肝硬化中免疫细胞糖基化水平的变化及其在疾病进展中的作用 肝硬化患者和健康对照者的肝组织样本 数字病理学 肝硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 肝硬化与健康对照肝组织样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3673 2026-04-03
Effect of tumor microenvironment in pancreatic cancer on the loss of β-cell mass: implications for type 3c diabetes
2025-04, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和病理分析,探讨了胰腺导管腺癌肿瘤微环境对β细胞质量减少的影响及其在3c型糖尿病发病机制中的作用 首次在单细胞水平上系统揭示了胰腺导管腺癌肿瘤微环境与邻近胰岛β细胞之间的相互作用,并明确了肿瘤微环境通过诱导β细胞凋亡导致β细胞质量减少,从而触发3c型糖尿病的具体机制 研究主要基于体外细胞实验和临床样本分析,缺乏体内动物模型的直接验证;样本量相对有限,可能影响统计效力;未深入探讨肿瘤微环境中具体信号分子介导β细胞凋亡的详细通路 阐明胰腺导管腺癌肿瘤微环境如何导致β细胞质量减少并引发3c型糖尿病的机制 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织、邻近胰腺组织(近端和远端)、正常供体胰腺组织、INS-1E细胞系和PANC-1细胞系 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, TUNEL染色, RT-qPCR, CCK8检测 NA 单细胞RNA测序数据, 病理图像, 基因表达数据 来自供体的正常胰腺组织、非糖尿病和3c型糖尿病患者的癌旁组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3674 2026-04-03
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-Apr, Comprehensive Physiology IF:4.2Q1
综述 本文挑战了迷走神经作为简单饱腹感信号被动传递器的传统观点,强调其作为主动编码多种餐食相关信息的复杂系统,并整合单细胞转录组学、神经环路映射和功能成像等最新进展 提出迷走神经传入神经元(VANs)不仅是饱腹感传感器,还具有特化亚群、多样感觉模态和下游脑环路,能主动编码机械拉伸、营养成分、代谢状态和微生物代谢物等多方面信息 NA 更新对迷走神经感觉通路在控制进食-饱腹感及更广泛功能(如食物奖赏和记忆形成)中作用的理解 迷走神经传入神经元(VANs)及其下游脑环路 神经科学 NA 单细胞转录组学、神经环路映射、功能成像 NA NA NA NA NA NA NA
3675 2026-04-03
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了乳腺浸润性小叶癌中MDC1作为ER共调节因子的新功能,及其与DNA修复功能障碍和PARP抑制剂敏感性的关联 发现MDC1在ILC细胞中作为ER共调节因子的新活性,这种活性与典型的DNA修复功能失调相关,但缺乏传统DNA修复缺陷特征,并揭示了ILC中一种独特的HR功能障碍形式 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证有限,且未详细探讨MDC1-ER相互作用的分子机制 探究MDC1在乳腺浸润性小叶癌中的双重功能及其与DNA修复和PARP抑制剂敏感性的关系 乳腺浸润性小叶癌细胞及肿瘤组织 癌症生物学 乳腺癌 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析 NA 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 多个ILC异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3676 2026-04-03
TEAD3 and TEAD4 play overlapping role in bovine preimplantation development
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 本研究揭示了在牛胚胎植入前发育过程中,TEAD3和TEAD4转录因子在滋养外胚层命运决定中发挥重要且重叠的功能 首次在牛中发现TEAD3特异性表达于滋养外胚层细胞,并证明TEAD3与TEAD4在牛胚胎植入前发育中具有冗余作用,这与小鼠中TEAD4的直接调控作用不同 研究主要聚焦于牛胚胎植入前发育阶段,未探讨TEAD3和TEAD4在其他发育阶段或物种中的功能 确定TEAD3在牛胚胎植入前发育中的功能角色 牛胚胎植入前发育过程中的胚胎细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,RNA干扰,碱基编辑技术,RNA测序分析,免疫荧光分析 NA RNA测序数据,免疫荧光图像数据 未明确指定样本数量,但涉及牛胚胎植入前发育阶段的胚胎 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3677 2026-04-03
Key glycometabolism during oocyte maturation and early embryonic development
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
综述 本综述探讨了葡萄糖代谢在卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的核心作用,及其对能量产生、发育决策和表观遗传调控的影响 揭示了葡萄糖、脂肪酸、氨基酸和核苷酸之间的复杂相互作用,并探索了非侵入性代谢监测如何革新胚胎选择和个性化辅助生殖技术 NA 推进生殖医学和胚胎学,通过研究代谢过程改善生育治疗结果 哺乳动物配子和早期胚胎 生殖医学 生育障碍 单细胞测序、代谢组学、生物信息学 NA 代谢数据 NA NA NA NA NA
3678 2026-04-03
Guided monocyte fate to FRβ/CD163+ S1 macrophage antagonises atopic dermatitis via fibroblastic matrices in mouse hypodermis
2024-Dec-25, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和流式细胞术,揭示了特应性皮炎中FRβ/CD163+ S1巨噬细胞亚型衰竭的机制,并发现通过外源性层粘连蛋白-211模拟成纤维细胞-巨噬细胞互作,可促进单核细胞向S1巨噬细胞分化并缓解皮炎 首次系统阐明了皮肤中单核细胞获得S1巨噬细胞身份的调控机制,并识别了由真皮下层成纤维细胞分泌的层粘连蛋白-α2和V型胶原是驱动CD163表达的关键因子,为通过靶向成纤维细胞-巨噬细胞互作治疗特应性皮炎提供了新策略 研究主要在鼠模型中进行,其结论在人类特应性皮炎中的适用性有待进一步验证 探究特应性皮炎(AD)中巨噬细胞状态失衡的机制,并寻找恢复组织稳态的治疗策略 小鼠皮肤中的巨噬细胞(特别是FRβ/CD163+ S1亚型)、单核细胞、嗜酸性粒细胞及真皮下层成纤维细胞 单细胞组学 特应性皮炎 单细胞转录组测序, 流式细胞术, 共培养实验, 计算机模拟配体表达分析 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3679 2026-04-03
Spatial, transcriptomic, and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-11-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过整合多物种单细胞转录组和开放染色质数据,揭示了慢性疼痛遗传易感性变异与脊髓背角神经元调控基因组学的关联 首次构建跨物种(猕猴、人类、小鼠)的背角神经元亚型统一图谱,并结合空间转录组学与开放染色质分析,将慢性疼痛GWAS变异定位到特定神经元亚型的调控区域 研究主要依赖动物模型(猕猴和小鼠)数据,人类样本数据相对有限;未直接验证遗传变异的功能性影响 探究慢性疼痛遗传易感性变异是否影响脊髓背角神经元的调控基因组学 猕猴、人类和小鼠的脊髓背角神经元 空间转录组学与表观基因组学 慢性疼痛 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学、单核开放染色质测序 跨物种整合分析框架 单细胞转录组数据、空间转录组数据、开放染色质数据 大规模猕猴单核RNA测序图谱,整合人类和小鼠数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq NA NA
3680 2026-04-03
Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway
2024-07, The Laryngoscope
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体相似性网络分析,探讨了健康个体和特发性声门下狭窄患者近端气道黏膜中适应性免疫应答的特征 首次在特发性声门下狭窄患者中,结合单细胞RNA测序与GLIPH2算法,分析了气道黏膜中T细胞克隆的分布、结构差异及共享抗原靶点,揭示了病毒靶点在疾病瘢痕中的适应性免疫作用 样本量相对有限(iSGS患者32例,健康对照10例),且研究聚焦于特发性声门下狭窄,可能不适用于其他气道疾病 探究近端气道黏膜中适应性免疫应答的分布、结构及抗原靶点,以理解特发性声门下狭窄的发病机制并寻找新的治疗策略 特发性声门下狭窄患者的瘢痕和未受影响黏膜组织,以及健康对照的气道黏膜组织 数字病理学 特发性声门下狭窄 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,相似性网络分析 GLIPH2算法 单细胞RNA测序数据,T细胞受体序列数据 特发性声门下狭窄患者32例,健康对照10例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部