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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3661 | 2026-01-28 |
Spatially resolved molecular signatures of Lewy body dementia
2026-Jan-26, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-02981-z
PMID:41588135
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,解析了路易体痴呆患者大脑皮层中基因表达的空间分布特征,揭示了SNCA基因剂量和APOE4基因型如何影响疾病的区域病理机制 | 首次在完整的大脑皮层结构中,结合SNCA三倍体和APOE4基因型,系统地绘制了路易体痴呆的空间分子图谱,并识别出皮层第5层为易感区域,以及Reelin信号通路的核心作用 | 研究基于死后脑组织样本,无法动态观察疾病进程;样本量相对有限;空间转录组学的分辨率可能不足以解析所有细胞亚型的细微变化 | 探究SNCA基因剂量和APOE4基因型如何影响路易体痴呆的神经元易感性和区域病理机制 | 死后颞叶皮层组织(来自路易体痴呆患者及年龄、性别匹配的对照) | 空间转录组学 | 路易体痴呆 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 路易体痴呆病例(含SNCA三倍体或不同APOE基因型)及对照的死后脑组织样本 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | NA |
| 3662 | 2026-01-28 |
International workshop report on "Animal resilience and organismal response to environmental change: insights from basal metazoans", Tutzing (Germany), 22-25 September 2025
2026-Jan-25, Frontiers in zoology
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12983-025-00592-0
PMID:41580841
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会议报告 | 本文是关于2025年在德国图青举行的“动物恢复力与生物对环境变化的反应:来自基础后生动物的见解”国际研讨会的报告 | 汇集了来自全球的最新研究成果,涵盖了从分子进化、功能基因组学到生态学、发育生物学和共生等多个领域,并重点关注利用基础后生动物来研究多细胞性起源、组织再生机制和环境适应等基本问题 | NA | 探讨动物恢复力与生物对环境变化的反应机制,并利用基础后生动物模型来研究多细胞性起源、组织再生和环境适应等基本生物学问题 | 基础后生动物,包括刺胞动物(水螅、海葵、水母、珊瑚)、海绵和栉水母 | NA | NA | 单细胞转录组学、基因组组装、表观遗传调控分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3663 | 2026-01-23 |
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12283-5
PMID:41566221
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3664 | 2026-01-28 |
Immunomodulatory role of megakaryocytes in the hematopoietic niche of myeloproliferative neoplasms
2026-Jan-22, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288948
PMID:41568522
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研究论文 | 本研究探讨了巨核细胞在骨髓增殖性肿瘤造血微环境中的免疫调节作用 | 首次揭示了JAK2V617F突变巨核细胞通过激活LINE-1逆转录转座子驱动慢性骨髓炎症的新机制 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证数量有限(13例患者) | 阐明突变巨核细胞在骨髓增殖性肿瘤发展中的免疫调节功能 | 骨髓增殖性肿瘤(MPN)中的巨核细胞和造血干细胞 | 血液肿瘤学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质检测数据 | 小鼠模型和13例MPN患者骨髓样本,5例骨科对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3665 | 2026-01-28 |
Microbial single-cell omics in situ
2026-Jan-22, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101128
PMID:41576946
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研究论文 | 本文介绍了一种利用激光诱导前向转移技术,在复杂样本中获取高质量微生物单细胞基因组或转录组的方法 | 开发了基于激光诱导前向转移技术的单细胞方法,可直接分析复杂样本中邻近的细菌细胞或与宿主细胞相邻的细菌细胞,并支持荧光标记后的单细胞可视化收集 | 未明确说明该方法在通量、成本或特定样本类型中的具体限制 | 开发一种能够在复杂环境中对微生物进行原位单细胞多组学分析的技术 | 小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等复杂样本中的微生物单细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞基因组学、单细胞转录组学、激光诱导前向转移 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等多种样本类型 | NA | 单细胞基因组学、单细胞转录组学 | 激光诱导前向转移系统 | 基于激光诱导前向转移技术的单细胞采集与分析平台 |
| 3666 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Jan-21, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0424
PMID:41563441
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研究论文 | 本研究优化了胰腺胰岛单细胞长读长测序方案,以改善读长和转录本检测,从而增强异构体识别能力 | 通过比较5'和3'文库制备方案,发现5'方案在转录本识别上更优,并展示了靶向去除胰岛素转录本策略可提升信息性读段的检测,实现了异构体特异性基因表达分析 | 长读长测序技术仍面临读长不足和错误率较高的技术挑战,且高表达单一转录本的细胞类型可能掩盖低丰度转录本的识别 | 优化单细胞长读长测序协议,以提升胰腺胰岛中异构体检测的准确性和效率 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型,特别是胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3667 | 2026-01-28 |
The Role of Cancer-Associated Fibroblasts and Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Microenvironment and Their Impact on Ovarian Cancer Survival and Therapy
2026-Jan-19, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol33010059
PMID:41590379
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对生存和治疗的影响 | 整合了单细胞测序和空间转录组学等先进技术来精确识别CAF和TAM亚型,并探讨了针对这些细胞的新型靶向治疗策略 | NA | 探讨CAFs和TAMs在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对治疗抵抗和预后的影响 | 卵巢癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3668 | 2026-01-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Jan-13, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组分析协议,旨在同时分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组分析协议,能够同时分析宿主和病原体的转录模式,以建立病原适应特征并预测感染结果 | NA | 建立一种用于感染组织的双重空间转录组分析协议,以研究宿主-病原体相互作用 | 感染组织 | 空间转录组学 | 感染性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3669 | 2026-01-28 |
Itaconate Promotes Cold Adaptation and Myocardial Protection by Enhancing Brown Adipose Tissue Metabolism
2026-Jan-12, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16010066
PMID:41590674
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研究论文 | 本研究揭示了免疫代谢物衣康酸在棕色脂肪组织中的表达模式及其通过增强棕色脂肪代谢功能促进冷适应和心肌保护的作用 | 首次阐明了衣康酸合成关键基因Irg1在棕色脂肪组织不同发育阶段的细胞特异性表达,并证明了外源性衣康酸通过依赖棕色脂肪组织的机制增强产热和改善心脏损伤 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;衣康酸的具体作用机制和信号通路仍需进一步探索 | 揭示衣康酸在棕色脂肪组织中的表达模式及其对冷适应和心肌保护的影响 | 小鼠棕色脂肪组织、心肌组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、气相色谱-三重四极杆质谱 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物数据 | P7新生小鼠和成年小鼠的棕色脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3670 | 2026-01-28 |
Stack: In-Context Learning of Single-Cell Biology
2026-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698608
PMID:41542582
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研究论文 | 本文提出了一种名为Stack的单细胞生物学基础模型,该模型利用上下文中的细胞信息来生成细胞表征,并在零样本设置下显著提升了多种下游任务的性能 | 提出了一种利用表格注意力机制、基于1.49亿个统一预处理的人类单细胞训练的基础模型,能够进行上下文学习,无需针对特定数据进行微调即可预测条件对目标细胞群的影响 | 模型主要基于人类单细胞转录组数据训练,其泛化能力到其他物种或数据类型尚未验证;技术局限性可能影响单细胞水平的测量精度 | 开发一个能够进行上下文学习的单细胞生物学基础模型,以更好地捕捉细胞表型多样性并预测生物条件的影响 | 人类单细胞,特别是跨28种组织、40种细胞类别和201种扰动条件下的细胞 | 单细胞生物学,机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 基础模型,表格注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 1.49亿个统一预处理的人类单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3671 | 2026-01-28 |
Proteotranscriptomic Dissection of Breast Cancer T Cell States Identifies CD103+ Tfh-derived Cytotoxic Cells Linked to Immunotherapy Response
2026-Jan-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8394722/v1
PMID:41542042
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和多重蛋白表位分析,解析了乳腺癌中免疫细胞状态,特别是CD4 T滤泡辅助样细胞的亚群及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在乳腺癌中识别出CD103+ Tfh样细胞亚群,该亚群具有细胞毒性特征,并与抗PD-1免疫治疗反应相关,超越了传统耗竭CD8 T细胞的预测价值 | NA | 探究乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞状态,特别是CD4 T细胞亚群在抗肿瘤免疫和免疫治疗反应中的作用 | 乳腺癌样本中的免疫细胞,特别是CD4 T滤泡辅助样细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重蛋白表位分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3672 | 2026-01-28 |
Loss of Ribosomal Protein L22 (RPL22) Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1-Deficient Endometrial Cancers With Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes
2026-Jan, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100899
PMID:41005533
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研究论文 | 本研究通过免疫组化与空间转录组学技术,首次揭示了RPL22蛋白缺失可识别MLH1缺陷型子宫内膜癌中一个独特的免疫低活性亚群 | 首次发现RPL22缺失可作为MLH1缺陷型子宫内膜癌免疫低活性亚群的生物标志物,并证明其与肿瘤微环境中CD8+ T淋巴细胞减少及β-2微球蛋白表达下调相关 | 未明确RPL22缺失影响免疫微环境的具体分子机制,且样本队列规模有限 | 探究RPL22蛋白缺失在MLH1缺陷型子宫内膜癌中的临床意义及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 子宫内膜癌组织样本及细胞系 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组化、数字空间转录组学、基因敲低 | NA | 组织图像、转录组数据 | 未明确具体数量的子宫内膜癌队列样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3673 | 2026-01-28 |
Macrophage-Targeted Magnesium Ion-Nourisher for NLRP3 Inflammasome Inhibition to Enhance Liver Inflammatory Disease Treatment
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513798
PMID:41194407
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研究论文 | 本文设计了一种靶向巨噬细胞的纳米镁离子营养剂MgC,通过增强细胞内镁离子水平来抑制NLRP3炎症小体激活,从而改善肝脏炎症性疾病 | 利用巨噬细胞的胞葬作用实现靶向递送镁离子,并整合干细胞成分以增强肠道屏障完整性,在单细胞水平揭示了库普弗细胞的抗炎和抗氧化基因表达变化 | 镁离子的具体作用机制尚未完全阐明,且纳米递送系统的长期安全性和体内分布需进一步评估 | 开发靶向巨噬细胞的镁离子递送策略,以抑制过度炎症反应并促进组织修复 | 巨噬细胞(特别是库普弗细胞)和肝脏炎症性疾病模型 | 免疫学 | 肝脏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3674 | 2026-01-28 |
Stromal Cell-Mast Cell Communication Orchestrates Anti-Viral Immunity in the Meninges
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514842
PMID:41195564
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研究论文 | 本研究揭示了肥大细胞在脑膜抗病毒免疫中的关键作用,通过单细胞RNA测序和机制分析,阐明了肥大细胞与基质细胞之间的通讯如何协调抗病毒反应 | 首次绘制了肥大细胞在脑膜血管周围的分布模式,并发现了一个断奶后成熟过程;揭示了肥大细胞通过IL-33受体响应基质细胞来源的IL-33,协同上调细胞因子和趋化因子以增强抗病毒免疫的新机制 | 研究主要基于LCMV感染模型,可能不适用于所有病毒类型;未深入探讨肥大细胞与其他免疫细胞在脑膜中的具体相互作用网络 | 探究肥大细胞在脑膜抗病毒免疫中的空间定位和功能作用 | 肥大细胞、基质细胞、CD8 T细胞以及LCMV感染的脑膜组织 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3675 | 2026-01-28 |
MCUB Inhibits PRKN-Dependent Mitophagic Degradation of PD-L1 to Promote Immune Evasion in Bladder Cancer
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514764
PMID:41221601
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体钙单向转运调节亚基MCUB通过抑制PRKN依赖性线粒体自噬来稳定PD-L1蛋白,从而促进膀胱癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现MCUB-PRKN-PD-L1轴是膀胱癌免疫逃逸的关键驱动因素,并提出了靶向MCUB-PRKN相互作用作为克服免疫抵抗的精准治疗策略 | 未明确提及 | 探究MCUB在肌层浸润性膀胱癌免疫逃逸中的作用机制 | 肌层浸润性膀胱癌 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学分析, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 空间转录组数据, 临床组织染色图像 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3676 | 2026-01-28 |
Single-cell analysis of adult mouse testes exposed to cigarette smoke
2026-Jan, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03703-2
PMID:41240254
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研究论文 | 本研究通过建立被动吸烟小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术分析了香烟烟雾暴露对成年小鼠睾丸细胞转录组的影响 | 首次在单细胞水平上系统揭示了香烟烟雾暴露导致睾丸细胞比例时间依赖性变化,并明确了其对细胞骨架、鞭毛发育、凋亡、外分泌功能和线粒体能量代谢的多重损害机制 | 研究仅使用小鼠模型,未涉及人类样本;被动吸烟模型可能无法完全模拟主动吸烟的所有效应;单细胞测序样本量有限 | 探究香烟烟雾暴露对睾丸组织结构和精子发生过程的损害机制 | 成年小鼠睾丸组织 | 数字病理学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因本体分析(GO),基因集富集分析(GSEA),凋亡实验,病理评估 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但包含对照组和吸烟组小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3677 | 2026-01-28 |
Integrated multi-Omics and network toxicology elucidate the multi-target mechanisms of environmental hormones in driving hepatocellular carcinoma
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119519
PMID:41371106
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研究论文 | 本研究通过整合多组学与网络毒理学,系统揭示了环境激素通过多靶点、多通路机制驱动肝细胞癌发生发展的机制,并构建了一个九基因风险模型用于诊断、预后和药物敏感性预测 | 首次系统性地整合了环境内分泌干扰物(EDCs)的潜在靶点预测、多种机器学习算法构建诊断模型、分子对接与动力学模拟验证、以及单细胞转录组学分析,从多靶点、多通路角度揭示了EDCs在HCC中的作用机制,并构建了一个具有跨癌种适用性的风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据库,缺乏体内或体外实验的直接功能验证;EDCs与靶蛋白相互作用的模拟结果需要实验确认;风险模型的临床转化价值需在前瞻性队列中进一步验证 | 阐明环境内分泌干扰物(EDCs)在肝细胞癌(HCC)发生发展中的多靶点作用机制,并构建用于诊断、预后和药物敏感性预测的风险模型 | 肝细胞癌(HCC)相关的基因表达数据、患者临床数据、环境内分泌干扰物(EDCs)的潜在靶点 | 生物信息学,计算生物学 | 肝细胞癌 | 多组学整合分析,网络毒理学,机器学习,分子对接模拟,分子动力学模拟,单细胞转录组学分析 | CatBoost, Cox比例风险模型,以及包括SHAP框架在内的14种机器学习算法 | 基因表达数据(来自GEO、TCGA数据库),单细胞转录组数据,药物敏感性数据(来自GDSC数据库),化学物质-靶点相互作用数据 | 涉及来自GEO和TCGA-LIHC等多个公共数据库的HCC患者样本,具体数量未在摘要中明确,但包括用于模型构建和验证的队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3678 | 2026-01-28 |
Single-cell transcriptomics unveils atrazine's impact on neurons and microglia in C57BL/6 mice
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119545
PMID:41371109
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了环境相关剂量的阿特拉津暴露如何通过神经元-小胶质细胞相互作用驱动帕金森病样病理 | 首次利用单细胞RNA测序结合CellChat算法,系统阐明了阿特拉津通过破坏神经元钙稳态和小胶质细胞极化,并经由CX3CL1信号通路介导神经免疫功能障碍的双重机制,为阿特拉津的神经毒性提供了新的机制证据 | 研究仅在小鼠模型中进行,未在人类样本中验证;暴露时间为28天,未能反映长期慢性暴露效应;样本量相对较小(每组n=6) | 探究环境相关剂量的阿特拉津暴露如何破坏神经元-小胶质细胞相互作用,从而驱动帕金森病样病理 | C57BL/6小鼠 | 单细胞转录组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,定量实时PCR,组织病理学,行为表型分析 | CellChat算法 | 单细胞转录组数据,行为数据,组织病理图像 | 每组6只C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3679 | 2026-01-28 |
Artificial Intelligence Revolution in Transcriptomics: From Single Cells to Spatial Atlases
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518949
PMID:41387122
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综述 | 本文综述了人工智能在单细胞RNA测序和空间转录组学数据分析中的应用、发展趋势及挑战 | 系统梳理了AI在转录组学分析工作流中的演进趋势,并提供了模型选择和新工具开发的实用指南 | 作为综述文章,未涉及原创实验数据或模型验证 | 探讨人工智能如何变革转录组学数据分析,以应对数据规模和复杂性的增长 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3680 | 2026-01-28 |
M6A-methylated MUC1 drives silica-induced lung inflammation and fibrosis
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119576
PMID:41411794
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷修饰的MUC1在二氧化硅诱导的肺部炎症和纤维化中的作用 | 首次揭示了MUC1的m6A修饰在矽肺病发病机制中的关键驱动作用,并阐明了其通过METTL3介导的修饰和YTHDF2识别促进炎症和纤维化的分子机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证相对有限,且未探讨其他m6A阅读蛋白的可能作用 | 探究m6A修饰的MUC1在二氧化硅诱导的肺部炎症和纤维化中的功能与机制 | 矽肺病患者血液样本、肺上皮细胞、支气管上皮细胞及动物模型 | 分子生物学与病理学 | 矽肺病 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体外功能实验 | NA | 基因表达数据、表观遗传修饰数据、临床样本数据 | 矽肺病患者血液样本及细胞与动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |