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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3641 | 2025-10-06 |
Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas
2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.08.584091
PMID:38559270
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研究论文 | 本研究揭示了自噬在mIDH1胶质瘤中的关键生存作用,并发现通过抑制自噬可增强放射敏感性 | 首次发现mIDH1胶质瘤通过表观遗传重编程诱导自噬作为能量来源,并开发了靶向Atg7的合成蛋白纳米颗粒治疗策略 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的治疗新靶点 | 人类和小鼠mIDH1胶质瘤细胞及患者样本 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, 合成蛋白纳米颗粒技术 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,单细胞数据 | 人类和小鼠mIDH1胶质瘤神经球细胞及患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序, RNA测序 | NA | NA |
3642 | 2025-10-06 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
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研究论文 | 本研究揭示了放疗通过调控铜代谢诱导铜死亡的新机制,并提出联合铜离子载体治疗可克服肿瘤放疗抵抗 | 首次发现放疗可诱导铜死亡,阐明其通过上调CTR1和耗竭谷胱甘肽的分子机制,并鉴定BACH1-MT1E/X轴是放疗抵抗的关键调控通路 | 研究主要聚焦于食管癌模型,未验证其他癌种中的普适性 | 探索放疗与铜死亡的关联机制,开发克服肿瘤放疗抵抗的新策略 | 食管癌细胞系、患者肿瘤样本、细胞系来源和患者来源的异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 放疗不敏感患者的食管肿瘤样本及多种实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3643 | 2025-10-06 |
A multi-step immune-competent genetic mouse model reveals phenotypic plasticity in uveal melanoma
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657841
PMID:40502063
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研究论文 | 开发了一种多步骤基因工程小鼠模型来研究葡萄膜黑色素瘤的生物学特性和表型可塑性 | 首次建立了具有免疫活性的多步骤基因工程小鼠模型,能够更好地模拟人类葡萄膜黑色素瘤的疾病进展和肿瘤免疫微环境 | 模型仍为动物模型,与人类疾病存在固有差异 | 研究葡萄膜黑色素瘤的发病机制和表型可塑性 | 基因工程小鼠模型中的葡萄膜黑色素瘤 | 癌症生物学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3644 | 2025-10-06 |
Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness
2025-Jun-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656
PMID:40304034
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研究论文 | 本研究探讨了习惯性运动通过调节神经免疫相互作用缓解血管紧张素II诱导的主动脉硬化的机制 | 首次揭示了运动通过β2-肾上腺素能受体调节巨噬细胞与交感神经的相互作用,进而抑制成纤维细胞活化和细胞外基质沉积的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;神经免疫相互作用的详细分子通路仍需进一步阐明 | 探究运动如何调节交感神经与免疫细胞的相互作用以缓解主动脉硬化 | C57BL/6小鼠模型,包括野生型、Ccr2敲除小鼠和Col1a1-tdT报告基因小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,神经化学去神经术,细胞通讯分析 | 动物模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,生理测量数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3645 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182790
PMID:40067358
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观 | 首次使用单细胞RNA测序全面分析B细胞耗竭治疗后中枢和外周免疫细胞的变化,揭示细胞类型特异性重编程 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的调节机制 | 多发性硬化症患者在接受B细胞耗竭治疗前后的脑脊液和外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3646 | 2025-10-06 |
Polyamine acetylation mediates crosstalk between cancer cells and myeloid cells to promote mesenchymal/plurimetabolic states in glioblastoma
2025-May-27, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf128
PMID:40424600
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研究论文 | 本研究揭示了多胺乙酰化通过调节肿瘤细胞代谢和促进与髓系细胞的代谢串扰,驱动胶质母细胞瘤间充质/多代谢状态的形成 | 首次发现SAT1及其产物N1-乙酰亚精胺在连接肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞/髓系细胞代谢活动中的新作用机制 | SAT1对肿瘤细胞代谢的影响至少部分由N1-乙酰亚精胺介导,可能存在其他未明确的调控机制 | 探究多胺代谢重编程如何影响胶质母细胞瘤恶性细胞状态和肿瘤-免疫微环境串扰 | 人类和小鼠胶质母细胞瘤肿瘤组织及细胞系 | 癌症代谢研究 | 胶质母细胞瘤 | 液相色谱/串联质谱(LC-MS/MS), 单细胞RNA测序, 代谢分析 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
3647 | 2025-10-06 |
Spatial characterization of interface dermatitis in cutaneous lupus reveals novel chemokine ligand-receptor pairs that drive disease
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574422
PMID:38260617
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤驱动淋巴细胞募集的分子机制 | 首次系统描绘了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤到免疫细胞募集的完整信号通路,并鉴定出AIM2-Casp8-IL-18-CXCL6/CXCR1和CCL8/CCR2等新型趋化因子配体-受体对 | 样本量相对有限,研究主要聚焦于特定临床亚型 | 阐明皮肤红斑狼疮界面皮炎的免疫发病机制 | 皮肤红斑狼疮患者的水疱活检组织和穿刺活检组织 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 光谱流式细胞术, 96重免疫分析靶向蛋白质组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 数字空间分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 流式细胞数据 | 皮肤红斑狼疮患者和健康供者的活检样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 靶向蛋白质组学 | 数字空间分析技术 | 96重免疫分析靶向蛋白质组学检测皮肤间质液中184种蛋白质分析物 |
3648 | 2025-10-06 |
Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones
2025-May-19, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.02.040
PMID:40250431
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究鸟类光感受器的进化关系,发现双锥细胞的两个组成部分分别起源于祖先红色和蓝色视锥细胞 | 首次系统探索鸟类光感受器与其他脊椎动物的同源关系,提出双锥细胞两个组成部分分别起源于不同祖先视锥细胞的新假说 | 研究主要基于新孵化鸡的视网膜,可能无法完全代表所有鸟类物种 | 追溯鸟类光感受器细胞类型在物种间的进化同源关系 | 鸟类(鸡)和绿安乐蜥的光感受器细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 新孵化鸡的视网膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3649 | 2025-10-06 |
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17101681
PMID:40427178
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现KYNU基因在肺腺癌中的双峰表达模式与患者预后不良相关,并揭示了其在免疫抑制代谢中的作用 | 首次系统揭示KYNU在肺腺癌中的双峰表达特征及其与KEAP1/STK11共突变的关联,发现其在人类与小鼠模型中表达模式的物种特异性差异 | 人类与小鼠模型中KYNU表达模式存在显著差异,这为临床前建模带来挑战 | 发现与肺腺癌患者预后相关的双峰表达基因,揭示其潜在的致癌基因型和治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和鼠类肺腺癌模型 | 癌症基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学、代谢组学、批量转录组分析 | 模型聚类分析 | 基因表达数据、突变数据、代谢物数据 | 多个肺腺癌数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3650 | 2025-10-06 |
Direct microglia replacement reveals pathologic and therapeutic contributions of brain macrophages to a monogenic neurological disease
2025-May-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.019
PMID:40311614
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研究论文 | 本研究通过直接替换小胶质细胞揭示了脑巨噬细胞在单基因神经疾病中的病理和治疗作用 | 首次通过直接小胶质细胞替换证明CNS限制性巨噬细胞替换可改善单基因神经退行性疾病 | 研究主要使用小鼠模型,人类临床应用仍需进一步验证 | 探究巨噬细胞在GLD疾病病理和HSCT治疗中的作用机制 | Krabbe疾病(GLD)小鼠模型和人类脑标本 | 神经科学 | 单基因神经退行性疾病 | 单细胞测序, 基因消融, 直接微胶质细胞替换 | twitcher (Galc) 小鼠模型 | 单细胞测序数据, 组织病理学数据 | 小鼠模型和人类脑标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3651 | 2025-10-06 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序定义了慢性移植物抗宿主病中IL-17和CSF-1的致病性基因表达特征 | 利用小鼠模型反向工程推导出可在患者血液单核细胞中检测到的非直观IL-17和CSF-1特征 | 研究基于临床前模型,需要在临床研究中进一步前瞻性验证 | 开发识别慢性移植物抗宿主病患者中可药物治疗的免疫失调标志物 | 小鼠模型和异基因造血细胞移植患者 | 生物医学研究 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 70%的确诊患者和50%移植后100天患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3652 | 2025-10-06 |
EnrichSci: Transcript-guided Targeted Cell Enrichment for Scalable Single-Cell RNA Sequencing
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651937
PMID:40654882
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研究论文 | 开发了一种名为EnrichSci的可扩展单细胞RNA测序平台,通过转录本引导的靶向细胞富集技术解析复杂组织中特定细胞类型的分子动态 | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引技术,实现了无需微流控的靶向细胞类型单核转录组分析,具有全基因体覆盖能力 | NA | 开发可扩展的单细胞RNA测序平台,用于解析复杂组织中低丰度细胞类型的分子动态 | 衰老小鼠大脑中的少突胶质细胞及其亚型 | 单细胞测序技术 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,RNA FISH,组合索引 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | EnrichSci | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引的单核转录组分析平台 |
3653 | 2025-10-06 |
Decoding sexual dimorphism of the sex-shared nervous system at single-neuron resolution
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630541
PMID:40654890
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析性别共享神经系统中神经元水平的分子二态性 | 首次在单神经元分辨率揭示性别共享神经系统的广泛分子二态性,发现神经肽和信号相关基因的强烈性别偏好表达 | 研究仅针对成年雄性和雌雄同体线虫,未涵盖其他发育阶段或物种 | 探究遗传性别如何在单神经元水平塑造神经系统的分子结构 | 成年雄性和雌雄同体线虫的性别共享神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌雄同体线虫的神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3654 | 2025-10-06 |
scRegulate: Single-Cell Regulatory-Embedded Variational Inference of Transcription Factor Activity from Gene Expression
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.649372
PMID:40654959
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研究论文 | 开发了一种名为scRegulate的生成式深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据推断转录因子活性 | 通过结合变分推断和基因调控网络先验知识,能够捕获新颖、动态和上下文特异性的调控相互作用 | NA | 从单细胞RNA测序数据准确推断转录因子活性和基因调控网络 | 转录因子活性和基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序,深度学习,变分推断 | 生成式深度学习框架,变分推断模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共实验数据集和合成数据集,包括PBMC单细胞RNA测序数据和Perturb-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3655 | 2025-10-06 |
CXCL12+ fibroblastic reticular cells in lymph nodes facilitate immune tolerance by regulating T cell-mediated alloimmunity
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182709
PMID:40309773
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现淋巴结中CXCL12高表达的成纤维网状细胞通过调节T细胞介导的同种免疫反应促进移植耐受 | 首次鉴定出淋巴结中特定的CXCL12hi FRCs亚群,并证明其在调节移植免疫耐受中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步深入 | 探究特定FRC亚群在控制同种免疫反应中的作用机制 | 小鼠和人类淋巴结中的成纤维网状细胞及T细胞 | 免疫学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序, 遗传缺失技术, 纳米递送技术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 心脏移植小鼠的初始和引流淋巴结, 人类淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3656 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2025-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651042
PMID:40654653
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示SOCE阻断剂对免疫细胞炎症反应的靶向调控作用 | 首次在单细胞水平系统揭示SOCE阻断剂对不同免疫细胞亚群的差异化调控机制 | 研究仅使用体外刺激的正常人PBMCs,未涉及疾病模型或体内验证 | 探究SOCE阻断剂对免疫细胞功能的特异性调控机制 | 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常人PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 多重单细胞RNA测序 |
3657 | 2025-10-06 |
The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma
2025-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00818-8
PMID:40281242
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术揭示了高级别浆液性卵巢癌原发灶和转移灶的免疫微环境动态特征 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术系统比较卵巢癌原发灶与转移灶的免疫微环境差异,并发现上皮细胞与免疫细胞间的交叉通讯在免疫抑制中的关键作用 | 样本来源仅限于卵巢癌患者,未涉及其他癌症类型;研究结果需要更大样本量验证 | 探究高级别浆液性卵巢癌免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者的原发肿瘤和网膜转移肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确指定样本数量,但包含原发肿瘤和转移肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3658 | 2025-10-06 |
Dissection of tumoral niches using spatial transcriptomics and deep learning
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112214
PMID:40230519
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研究论文 | 本研究开发了TG-ME计算框架,通过整合空间转录组学数据和形态学图像来解析肿瘤微环境中的生态位 | 提出结合Transformer和图变分自编码器(GraphVAE)的创新计算框架,能够同时利用空间转录组数据和形态学图像进行肿瘤生态位分析 | NA | 开发计算工具解析肿瘤微环境的空间组织结构 | 肿瘤生态位和肿瘤微环境 | 空间转录组学,深度学习 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学,深度学习 | Transformer,GraphVAE | 空间转录组数据,形态学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3659 | 2025-10-06 |
Progesterone signaling in oviductal epithelial cells modulates the immune response to support preimplantation embryonic development
2025-Apr-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6113
PMID:40249812
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研究论文 | 本研究探讨孕酮信号通过调控输卵管上皮细胞免疫反应支持胚胎着床前发育的机制 | 首次揭示输卵管上皮细胞中孕酮受体通过抑制IL-22等促炎基因表达来保障胚胎正常发育的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,人类临床适用性需进一步验证 | 阐明孕酮信号在胚胎着床前发育过程中的免疫调节作用 | 条件性敲除孕酮受体的小鼠模型及其胚胎 | 生殖生物学 | 妊娠丢失 | 单细胞RNA测序,药理学抑制,共培养实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,胚胎发育表型数据 | 未明确样本数量的小鼠模型和胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3660 | 2025-10-06 |
Morphogenic, molecular and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-Apr-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 本研究通过多尺度成像和单细胞转录组学揭示了鸡肺中单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制 | 发现了鸡特有的表达KRT14的肺泡细胞类型(命名为腔细胞),并揭示了肺分支融合形成副支气管和径向肺泡生成的新机制 | 研究主要集中于鸡肺发育过程,与哺乳动物肺的比较分析相对有限 | 阐明鸟类肺中单向气流的发育适应机制及其与哺乳动物双向气流的差异 | 鸡肺发育过程中的关键阶段 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多尺度3D成像 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | 鸡肺发育关键阶段的多个样本 | 华大基因 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术 |