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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3641 | 2026-01-22 |
Designing 5' UTR sequences improves the capacity of mRNA therapeutics in preclinical models of aging and obesity
2026-Jan-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.060
PMID:41485049
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研究论文 | 本研究通过设计5' UTR序列,在衰老和肥胖小鼠模型中提高了mRNA疗法的治疗潜力 | 发现RPL18、RPL35和RPS9的5' UTR能增强合成mRNA的蛋白质输出,特别是在高活性氧水平细胞中,且独立于其末端寡嘧啶基序 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索5' UTR序列设计对mRNA疗法在衰老和肥胖模型中的治疗潜力提升 | 小鼠模型(衰老和肥胖)、人类和小鼠细胞 | 生物信息学 | 衰老和肥胖 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、核糖体分析、交联免疫沉淀测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3642 | 2026-01-22 |
Multi-omics data mining reveals macrophage-mediated effects of cathepsin B on esophageal adenocarcinoma risk
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149423
PMID:41349740
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法,揭示了组织蛋白酶B通过调节巨噬细胞表型影响食管腺癌风险的因果机制 | 首次采用整合多组学方法(包括孟德尔随机化、转录组关联研究、单细胞RNA测序和单细胞表达数量性状位点分析)系统阐明CTSB通过巨噬细胞清道夫受体调控巨噬细胞表型从而影响食管腺癌风险的因果路径 | 研究主要基于西方人群数据,结论在其他人群中的普适性有待验证;实验验证部分主要依赖免疫组化,后续需要更多功能实验支持 | 探究组织蛋白酶家族与食管腺癌的因果关系及潜在发病机制 | 食管腺癌患者样本及相关的多组学数据 | 生物信息学与计算生物学 | 食管腺癌 | 孟德尔随机化, 转录组关联研究, 单细胞RNA测序, 单细胞表达数量性状位点分析, 免疫组化, 蛋白质对接 | 多组学整合分析模型 | 基因组, 转录组, 单细胞表达, 蛋白质互作 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3643 | 2026-01-22 |
Protrichocysts: a hybrid defense extrusive organelle bridging mechanical projection and chemical secretion in ciliates
2026, Current research in microbial sciences
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.crmicr.2025.100539
PMID:41551587
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研究论文 | 本研究通过综合方法探究了纤毛虫中原毛囊的结构与功能,揭示了其作为一种结合机械投射与化学分泌的混合防御细胞器的新机制 | 首次系统揭示了原毛囊的三阶段喷射过程、生化成分及其作为混合防御细胞器的多功能性,提出了其在细胞间通讯中的潜在作用 | 研究主要基于特定纤毛虫物种,其机制在其他原生生物中的普适性仍需验证;单细胞转录组分析的样本量有限 | 探究纤毛虫中原毛囊这一喷射细胞器的结构、功能及其在真核生物分泌系统进化中的意义 | 纤毛虫中的原毛囊(一种喷射细胞器) | 细胞生物学 | NA | 捕食者-猎物互作实验、电子显微镜、组织化学分析、SDS-PAGE、HPLC-MS/MS、单细胞转录组分析 | NA | 显微图像、蛋白质电泳数据、质谱数据、转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及捕食互作实验、显微观察及单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 3644 | 2026-01-22 |
Integrative Bioinformatics and Machine Learning Identify Novel Diagnostic Biomarkers and Molecular Mechanisms in Sjögren's Syndrome
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5044551
PMID:41551935
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明了其分子机制 | 结合12种机器学习算法、加权基因共表达网络分析及单细胞RNA测序数据验证,识别出12个具有卓越诊断性能的枢纽基因,并进行了药物重定位分析 | 研究主要基于公共转录组数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且未进行实验验证 | 识别干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明其分子机制 | 干燥综合征患者和健康对照者的外周血转录组数据 | 机器学习 | 干燥综合征 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 351名干燥综合征患者和91名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3645 | 2026-01-22 |
Transient interferon-driven NK cell activation in acute hepatitis C
2025-Dec-27, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf654
PMID:41453396
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞测序技术,探讨了急性丙型肝炎病毒感染期间自然杀伤(NK)细胞的动态变化及其在抗病毒反应中的作用 | 首次在急性丙型肝炎患者中,通过纵向采样结合单细胞测序,识别出一个具有强烈I型干扰素印记的高度激活NK细胞亚群,并揭示了其在病毒清除后的动态变化 | 研究样本量可能有限,且未详细探讨NK细胞激活的具体分子机制或长期功能影响 | 探究急性丙型肝炎病毒感染期间NK细胞的免疫反应特征及其与病毒清除的关系 | 急性丙型肝炎患者、慢性丙型肝炎患者和健康对照者 | 数字病理学 | 丙型肝炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA-seq | NA | 细胞表型数据, 转录组数据 | 纵向采样的急性丙型肝炎患者、慢性丙型肝炎患者和健康对照者(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3646 | 2026-01-22 |
Spatial transcriptomics uncovers unique tumor microenvironments in folliculotropic versus classic mycosis fungoides
2025-Dec-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.013
PMID:41338334
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿之间肿瘤微环境的差异 | 首次应用空间转录组学技术,在空间分辨率上直接比较了滤泡性蕈样肉芽肿(FMF)和经典型蕈样肉芽肿(MF)的肿瘤微环境,明确了恶性T细胞在滤泡微环境中的独特表型和代谢适应性 | 研究样本量未明确说明,且研究结果主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证 | 探究滤泡性蕈样肉芽肿(FMF)相较于经典型蕈样肉芽肿(MF)更具临床侵袭性的肿瘤微环境机制 | 滤泡性蕈样肉芽肿(FMF)和经典型蕈样肉芽肿(MF)患者的皮肤组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样肉芽肿) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3647 | 2026-01-22 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,识别出一种新型的OLR1+ SLC7A7+肝脏富集转移亚群(LEMS),并揭示了其在胰腺癌肝转移中的免疫代谢重编程机制 | 首次识别并验证了LEMS这一终末分化的恶性细胞亚群,其特征为代谢重编程和免疫抑制通路超活化,并发现其与SPP1+巨噬细胞通过配体-受体网络相互作用,驱动侵袭和免疫逃逸 | 需要扩大临床队列和体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制性相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群,阐明其与转移微环境的相互作用,并定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的原发肿瘤(PT)和肝转移(LM)样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 来自PDAC PT和LM患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3648 | 2026-01-22 |
Integration of Transcriptome Profiling and Single-Cell Sequencing Analysis to Establish a CD8+ T Cell-Related Prognostic Model for Patients With NSCLC: From Assessment to Therapy
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71337
PMID:41223031
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析和单细胞测序,构建了一个基于CD8+ T细胞的预后模型,用于非小细胞肺癌患者的精准预后评估和免疫治疗决策 | 首次结合加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术,识别出CD52、CD69和PLIN2作为生物标志物,构建了高精度的CD8+ T细胞相关风险模型,并开发了临床预后列线图 | 研究依赖于公共数据集(TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127),可能受到样本异质性和数据质量的限制,且模型需要在独立的前瞻性队列中进行进一步验证 | 开发一个CD8+ T细胞相关的预后模型,以改善非小细胞肺癌患者的预后评估和免疫治疗临床决策 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析,单细胞测序 | LASSO回归,Cox回归,列线图 | 基因表达数据,单细胞数据 | 三个公共数据集(TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127)中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3649 | 2026-01-22 |
Lyz1-Expressing Alveolar Type II Cells Contribute to Lung Regeneration
2025, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.70322/jrbtm.2025.10011
PMID:41550210
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别并表征了一个表达Lyz1的肺泡II型细胞亚群,揭示了其在肺损伤后肺泡再生中的关键作用 | 首次发现并定义了表达Lyz1的AT2细胞作为一个先前未被识别的肺泡祖细胞群,扩展了肺泡再生的范式 | NA | 探究异质性肺泡II型细胞在肺修复中的贡献 | 小鼠肺组织中的肺泡II型细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3650 | 2026-01-22 |
Single-cell RNA sequencing unraveled immune-related expression heterogeneity and lymphoid cell development dysregulation in childhood asthma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1606650
PMID:41550933
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了儿童哮喘患者与健康对照的外周血单个核细胞,揭示了免疫相关表达异质性和淋巴细胞发育失调在儿童哮喘中的作用 | 首次在单细胞水平上系统揭示了儿童哮喘中免疫细胞发育轨迹的异常模式,并识别了JUN、SPI1等关键基因及S100A家族蛋白的普遍上调,为理解哮喘的分子机制提供了新视角 | 样本量较小(仅3例患者和4例对照),且未涉及组织特异性分析,可能限制结果的普适性 | 阐明免疫失调在儿童哮喘发病机制中的作用 | 儿童哮喘患者和健康对照的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例儿童哮喘患者和4例年龄匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3651 | 2026-01-22 |
Role of SUV39H2 in shaping the malignant phenotype of triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1679640
PMID:41551146
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研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在三阴性乳腺癌中的表达模式、临床相关性及功能作用 | 首次系统分析SUV39H2在多种癌症中的表达,并验证其在TNBC中的促癌功能 | 临床实用性需进一步验证,样本量有限 | 阐明SUV39H2在TNBC恶性表型中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系及患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、功能实验 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 5对TNBC患者样本,MDA-MB-231和Hs-578T细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3652 | 2026-01-22 |
Research progress of stem cells in the treatment of atherosclerosis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1722416
PMID:41552013
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综述 | 本文系统综述了干细胞在治疗动脉粥样硬化中的研究进展,包括其作用机制、动物实验与临床试验证据、当前面临的挑战以及未来的优化策略与应用前景 | 聚焦于2023-2025年的最新研究证据,并提出了结合单细胞测序、类器官模型和精准递送系统等前沿技术来推动干细胞临床转化的具体实施路径 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据,其分析基于对现有文献的总结 | 总结干细胞治疗动脉粥样硬化的研究进展,分析核心挑战,并探讨促进其临床转化的未来方向 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、内皮祖细胞等用于治疗动脉粥样硬化的干细胞类型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3653 | 2026-01-22 |
Bu-Yi-Xin-Shen formula targets monocytes through PI3K-Akt/NF-κB signaling in post-percutaneous coronary intervention angina
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/CMPK4691
PMID:41552316
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的机制 | 结合生物信息学、分子对接、单细胞RNA测序和体内实验,首次系统揭示了补益心肾方通过靶向单核细胞中的PI3K-Akt/NF-κB信号通路发挥治疗作用 | 研究主要基于动物实验和生物信息学预测,缺乏临床样本的直接验证,且活性成分的具体体内药效学需进一步确认 | 探究补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的作用机制 | 单核细胞及相关信号通路(PI3K-Akt、NF-κB) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3654 | 2026-01-22 |
Visualizing stability: a sensitivity analysis framework for t-SNE embeddings
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1719516
PMID:41552665
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研究论文 | 本文提出一个计算框架,用于扩展标准t-SNE图,通过可视化线索展示t-SNE嵌入的稳定性 | 结合隐函数定理与自动微分进行敏感性分析,计算嵌入对输入数据的敏感性,并通过雅可比矩阵热图可视化特征影响和结构不稳定区域 | 未明确讨论框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一个框架来评估t-SNE嵌入的稳定性和可解释性,以增强生物信息学中的科学结论严谨性 | 高维生物数据,包括批量RNA-seq、蛋白质组学和单细胞转录组学数据集 | 机器学习 | NA | t-SNE, 敏感性分析, 自动微分 | t-SNE | 高维数据 | 三个不同的生物数据集 | NA | bulk RNA-seq, proteomics, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 3655 | 2026-01-22 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物组研究中的新兴技术、当前挑战以及未来的发展方向 | 系统性地总结了用于克服肿瘤内微生物低生物量检测挑战的新兴技术,包括改进的污染控制策略、高分辨率检测方法以及人工智能辅助的多组学整合分析,并指出了该领域从描述性研究向机制理解和临床转化发展的趋势 | NA | 探讨肿瘤内微生物组研究领域的技术挑战、最新进展及未来前景,以推动该领域向机制研究和临床转化发展 | 肿瘤内微生物组 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 厌氧培养优化, 基因组解析分析, 酶水平分析, 人工智能辅助分析 | NA | 微生物组数据, 临床数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3656 | 2026-01-22 |
Tumor-like characteristics of vascular smooth muscle cells in atherosclerosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734123
PMID:41552822
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综述 | 本文综述了动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表现出的类肿瘤特征,包括DNA损伤、基因组不稳定性、逃避衰老、过度增殖、迁移与侵袭激活、癌症干细胞样特性以及癌症相关信号通路激活 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学技术,揭示了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中表现出高度可塑性和类肿瘤特征,这一发现挑战了传统观点 | NA | 探讨动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的类肿瘤特征,为针对血管平滑肌细胞的新治疗策略提供理论基础 | 血管平滑肌细胞及其衍生细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪,单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3657 | 2026-01-22 |
Matrine induces V-ATPase-dependent cytoplasmic vacuolation and inhibits the function of the lysosome in leukemia cells
2024-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2023.100013
PMID:41550167
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研究论文 | 本文研究了苦参碱通过诱导V-ATPase依赖性细胞质空泡化并抑制溶酶体功能来抑制白血病细胞增殖的新分子机制 | 揭示了苦参碱通过质子化激活V-ATPase导致溶酶体功能抑制和空泡形成的新机制 | NA | 探究苦参碱抑制白血病细胞增殖的分子机制 | 白血病细胞 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜, 荧光显微镜, 蛋白质印迹, 流式细胞术 | NA | RNA-seq数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3658 | 2026-01-22 |
Schizophrenia endothelial cells exhibit higher permeability and altered angiogenesis patterns in patient-derived organoids
2024-01-23, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-02740-2
PMID:38263175
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研究论文 | 本研究利用精神分裂症患者来源的iPSCs生成3D脑类器官,通过单细胞RNA测序发现其内皮细胞比例增加,并揭示了基因表达、血管结构和通透性的异常变化 | 首次在患者来源的脑类器官模型中系统揭示了精神分裂症内皮细胞的高通透性和血管生成模式改变,为疾病病因提供了新视角 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;样本量相对有限(23名供体) | 探究精神分裂症中内皮/血管功能障碍对疾病发展的贡献 | 精神分裂症患者和健康对照者来源的诱导多能干细胞生成的3D脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、显微图像数据 | 23名供体(患者与健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3659 | 2026-01-22 |
The MURAL collection of prostate cancer patient-derived xenografts enables discovery through preclinical models of uro-oncology
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25175-5
PMID:34413304
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研究论文 | 本文介绍了一个前列腺癌患者来源异种移植(PDX)模型的集合,用于加速临床前药物测试和候选疗法的系统评估 | 建立了包含59个肿瘤样本的PDX资源库,覆盖了从初治原发性肿瘤到去势抵抗性转移的临床病理和基因组谱,并利用单细胞RNA测序揭示了肿瘤异质性 | 样本量相对有限(59个肿瘤来自30名患者),且时间跨度可能影响治疗反应的普遍性 | 建立前列腺癌PDX模型资源,以促进临床前药物测试和有效治疗方案的优先筛选 | 前列腺癌患者来源的肿瘤样本及衍生的PDX模型和类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | PDX模型,类器官模型 | 基因组数据,转录组数据 | 59个肿瘤样本来自30名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3660 | 2026-01-21 |
Multi-omics profiling of ACOX3 unveils pan-cancer clinical biomarker potential
2026-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析全面评估了ACOX3作为新型泛癌生物标志物的表达异质性、临床相关性、肿瘤-免疫相互作用和治疗潜力 | 首次将ACOX3作为泛癌生物标志物进行系统表征,结合单细胞和空间转录组学揭示其在肿瘤微环境中的富集模式,并通过分子对接和动力学模拟筛选出潜在抑制剂 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于HNSCC细胞系,缺乏体内模型验证和更广泛的癌症类型实验数据 | 评估ACOX3作为泛癌生物标志物的诊断和预后价值,探索其与肿瘤免疫微环境的关联及治疗潜力 | 多种癌症类型(包括KICH、PRAD、THCA、COAD、HNSCC等)的肿瘤样本和HNSCC细胞系 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 多组学分析、Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、ROC分析、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 涉及多种癌症类型的公共数据集和HNSCC细胞系 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |