单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 38157 篇文献，本页显示第 36441 - 36460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 36441 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics approaches of the bone marrow microenvironment
2020-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000602
PMID:31833957
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综述 | 本文综述了利用单细胞和空间转录组学技术在稳态、应激和癌症诱导重塑过程中对小鼠骨髓微环境的研究主要发现 | 首次系统且无标签地识别了骨髓细胞类型，揭示了其分子和空间特征，并阐明了关键造血因子的细胞来源 | NA | 深入探索小鼠和人类骨髓微环境中的细胞类型及其分子身份和定位 | 骨髓微环境中的细胞类型及其在稳态、应激和癌症诱导重塑过程中的变化 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36442 | 2024-08-09 |
Time-Series Single-Cell RNA-Seq Data Reveal Auxin Fluctuation during Endocycle
2020-Feb-01, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcz228
PMID:31841158
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研究论文 | 本研究重新分析了根部的单细胞转录组数据，重建了有丝分裂细胞周期和内复制周期的细胞周期轨迹，揭示了生长素在内复制周期中的动态波动。 | 首次揭示了生长素在内复制周期中的动态波动，并展示了这种波动在维持内复制阶段中的作用。 | NA | 探究生长素在内复制周期中的作用及其维持机制。 | 拟南芥中的细胞周期调控。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36443 | 2024-08-09 |
Neurological Disorder Drug Discovery from Gene Expression with Tensor Decomposition
2020, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于张量分解的策略，用于从基因表达数据中发现神经疾病药物候选化合物 | 本文采用了张量分解（TD）进行无监督特征提取，以筛选出在阿尔茨海默病模型动物实验中表达改变的基因，并与人类细胞系中药物处理后的基因表达进行比较 | NA | 旨在通过基因表达数据识别神经疾病患者的有效候选药物化合物，以缩短寻找有效治疗的时间并改善治疗结果 | 神经疾病患者的基因表达数据及药物候选化合物 | 生物信息学 | 神经疾病 | 张量分解（TD） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 401个基因在阿尔茨海默病模型动物实验中被筛选出 | NA | NA | NA | NA |
| 36444 | 2024-08-09 |
A developmental landscape of 3D-cultured human pre-gastrulation embryos
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1875-y
PMID:31830756
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研究论文 | 本文报道了一种三维（3D）囊胚培养系统，能够支持人类囊胚发育至原条形成阶段 | 开发了一种新的三维培养系统，模拟了人类胚胎在体内的发育标志和三维结构 | NA | 探究人类胚胎在原肠形成前的发育过程，包括空间自我组织和细胞类型发育 | 人类早期胚胎的发育过程 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36445 | 2024-08-09 |
Loss of ADAMTS19 causes progressive non-syndromic heart valve disease
2020-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-019-0536-2
PMID:31844321
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研究论文 | 本文通过全外显子测序和基因敲除小鼠模型，揭示了ADAMTS19基因突变与渐进性非综合征性心脏瓣膜疾病之间的关系 | 首次发现ADAMTS19基因的截短无义突变是导致渐进性心脏瓣膜疾病的原因，并通过基因敲除小鼠模型验证了其病理机制 | NA | 研究ADAMTS19基因在心脏瓣膜疾病中的作用及其分子机制 | ADAMTS19基因及其在心脏瓣膜疾病中的功能 | NA | 心脏瓣膜疾病 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 两个近亲家族中的四名受影响成员及Adamts19基因敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 36446 | 2024-08-09 |
Identification of differentially expressed genes by single-cell transcriptional profiling of umbilical cord and synovial fluid mesenchymal stem cells
2020-01, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.14891
PMID:31845522
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了人脐带源性间充质干细胞（hUC-MSCs）和人滑膜液源性间充质干细胞（hSF-MSCs）的异质性 | 本研究首次通过scRNA-seq技术详细分析了hUC-MSCs和hSF-MSCs的转录组特征，并识别了多个亚群及其差异表达基因 | NA | 测量人脐带源性间充质干细胞和人滑膜液源性间充质干细胞的异质性 | 人脐带源性间充质干细胞（hUC-MSCs）和人滑膜液源性间充质干细胞（hSF-MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | hUC-MSCs样本有104,761,163条读取，hSF-MSCs样本有6,577,715条读取 | NA | NA | NA | NA |
| 36447 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of a mouse model of spontaneous uveoretinitis using single-cell RNA sequencing
2019-Dec-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915571116
PMID:31843893
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术对自发性葡萄膜视网膜炎的小鼠模型进行全面分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面且无偏地定义了与疾病相关的细胞群和基因表达模式 | NA | 研究自发性葡萄膜视网膜炎的疾病机制 | 小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 葡萄膜视网膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和自发葡萄膜视网膜炎小鼠的视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 36448 | 2024-08-09 |
Enteroendocrine and tuft cells support Lgr5 stem cells on Paneth cell depletion
2019-Dec-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1801888117
PMID:31843916
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研究论文 | 本研究探讨了在小鼠肠道中，当潘氏细胞被消除后，Lgr5干细胞的维持机制 | 发现潘氏细胞的消除并不影响Lgr5干细胞的维持，而是由肠内分泌细胞和绒毛细胞替代其位置，提供必要的Notch信号 | NA | 探究潘氏细胞消除后Lgr5干细胞的维持机制 | 小鼠肠道中的Lgr5干细胞及其在潘氏细胞消除后的维持情况 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞测序，组织学分析 | NA | 细胞 | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 36449 | 2024-08-09 |
Kidney Cells Regeneration: Dedifferentiation of Tubular Epithelium, Resident Stem Cells and Possible Niches for Renal Progenitors
2019-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms20246326
PMID:31847447
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综述 | 本文综述了肾脏再生的主要机制，包括上皮细胞的去分化和祖细胞的激活，特别关注肾脏祖细胞的可能生态位 | 探讨了转基因动物、单细胞转录组学等现代方法在解决去分化细胞和驻留祖细胞区分问题中的潜力 | 缺乏区分去分化细胞和驻留祖细胞的特定方法 | 探讨肾脏细胞再生的机制及其潜在的祖细胞生态位 | 肾脏细胞的再生能力及其机制 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36450 | 2024-08-09 |
Vireo: Bayesian demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq data without genotype reference
2019-12-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1865-2
PMID:31836005
|
研究论文 | 本文介绍了Vireo，一种用于无基因型参考的池化单细胞RNA测序数据贝叶斯解复用的计算高效模型 | Vireo模型可以在只有部分或没有基因型信息的情况下应用，这是其独特之处 | NA | 解决现有解复用策略依赖完整基因型数据的局限性 | 池化单细胞RNA测序数据的解复用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36451 | 2024-08-09 |
GCN2 drives macrophage and MDSC function and immunosuppression in the tumor microenvironment
2019-12-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aax8189
PMID:31836669
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研究论文 | 研究探讨了GCN2在肿瘤微环境中对巨噬细胞和髓源抑制细胞（MDSCs）功能及免疫抑制作用的影响 | 揭示了GCN2在肿瘤免疫反应中的新作用，即通过调控巨噬细胞和MDSCs的表型促进抗肿瘤免疫 | NA | 探究GCN2在肿瘤免疫反应中的作用及其机制 | GCN2在肿瘤微环境中对巨噬细胞和髓源抑制细胞（MDSCs）的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 质谱流式细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 36452 | 2024-08-09 |
Exploring inflammatory signatures in arthritic joint biopsies with Spatial Transcriptomics
2019-12-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-55441-y
PMID:31831833
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析类风湿关节炎和脊柱关节炎患者的滑膜活检，以探索炎症部位的无偏 mRNA 研究 | 利用空间转录组学技术，结合高分辨率组织学图像，实现对特定细胞类型的数字化描绘，从而深入理解慢性炎症疾病中的细胞机制和多样性 | NA | 探索慢性炎症疾病中炎症部位的转录组特征 | 类风湿关节炎和脊柱关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿关节炎, 脊柱关节炎 | 空间转录组学 (ST) | NA | 转录组数据 | 受影响的关节滑膜组织活检 | NA | NA | NA | NA |
| 36453 | 2024-08-09 |
A Spatiotemporal Organ-Wide Gene Expression and Cell Atlas of the Developing Human Heart
2019-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.11.025
PMID:31835037
|
研究论文 | 本文通过分子方法揭示了胚胎心脏在三个发育阶段中细胞类型的全面转录景观，并将细胞类型特异性基因表达映射到特定的解剖域 | 本文利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，首次详细描绘了人类胚胎心脏发育过程中的基因表达和细胞类型分布 | NA | 深入探索人类心脏形态发生过程中器官范围的基因表达协调 | 人类胚胎心脏在三个发育阶段的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 三个发育阶段的人类胚胎心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 36454 | 2024-08-09 |
Accuracy, robustness and scalability of dimensionality reduction methods for single-cell RNA-seq analysis
2019-12-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1898-6
PMID:31823809
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research paper | 本文比较了18种常用的降维方法在30个公开的单细胞RNA测序数据集上的性能 | 本文填补了单细胞RNA测序降维方法比较研究的空白 | NA | 评估不同降维方法在单细胞RNA测序数据分析中的有效性 | 18种降维方法在30个单细胞RNA测序数据集上的性能 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 30个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 36455 | 2024-08-09 |
A Galaxy-based training resource for single-cell RNA-sequencing quality control and analyses
2019-12-01, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giz144
PMID:31825480
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研究论文 | 本文开发了一系列实用的脚本及其相应的Galaxy包装器，使之前对scRNA-seq分析感到畏惧的研究人员能够进行scRNA-seq培训和质量控制 | 本文通过简单的命令行工具实现了“可视化-过滤-可视化”范式，并使用Loom格式在工具之间交换数据，使得scRNA-seq数据分析更加直观和易于操作 | NA | 开发易于使用的工具和培训材料，帮助研究人员掌握scRNA-seq数据的质量控制和后续分析 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析工具和培训资源 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 短读序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36456 | 2024-08-09 |
Semblance: An empirical similarity kernel on probability spaces
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aau9630
PMID:31840051
|
研究论文 | 本文提出了一种新的相似性度量方法Semblance，该方法利用特征的经验分布来计算观测值之间的成对相似性 | Semblance是一种无分布假设的相似性度量方法，能够更重视数据分布边缘的观测对之间的相似性 | NA | 研究如何在没有明确数据概率分布的情况下，更有效地计算观测值之间的相似性 | 观测值之间的相似性度量方法 | 机器学习 | NA | NA | Mercer核 | 多种数据类型 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36457 | 2024-08-09 |
Advancements in Single-cell Sequencing and the Prospect of Its Forensic Application
2019-Oct, Fa yi xue za zhi
|
研究论文 | 本文总结了单细胞测序技术的最新进展及其在法医学应用的前景 | 单细胞测序的超高分辨率为生命科学多个领域，包括法医基因组学，提供了新的视角和前沿 | NA | 探讨单细胞测序技术在法医学中的应用前景 | 单细胞测序技术及其在法医学中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA和RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36458 | 2024-08-09 |
Siglecs, Novel Immunotherapy Targets, Potentially Enhance The Effectiveness of Existing Immune Checkpoint Inhibitors in Glioma Immunotherapy
2019, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S223406
PMID:31819511
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研究论文 | 本文研究了Siglec家族成员在胶质瘤免疫抑制中的作用，并探讨了它们与现有免疫检查点抑制剂联合使用的可能性 | 首次揭示了Siglec-5、-7、-9和-16在胶质瘤中的免疫抑制作用，并提出了与免疫检查点抑制剂联合使用的新策略 | NA | 研究Siglec家族成员在胶质瘤免疫治疗中的作用 | Siglec家族成员及其在胶质瘤免疫抑制中的作用 | NA | 胶质瘤 | 单细胞测序分析 | NA | 转录组数据 | 1024个胶质瘤样本和1551个胶质瘤单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 36459 | 2024-08-09 |
Dissecting the human immune system with single cell RNA sequencing technology
2020-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5MR1019-179R
PMID:31803960
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在解析人类免疫系统中的最新进展和挑战 | 单细胞RNA测序技术能够分析单个细胞的转录组，特别适合解析免疫细胞的异质性 | 文章提到了单细胞RNA测序技术在免疫学应用中需要克服的潜在障碍 | 促进对人类免疫学的理解 | 人类免疫系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36460 | 2024-08-09 |
SpaCell: integrating tissue morphology and spatial gene expression to predict disease cells
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz914
PMID:31808789
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaCell的用户友好型深度学习软件，该软件能够整合组织形态学和空间基因表达数据，以预测疾病细胞 | SpaCell软件创新地整合了数百万像素强度值与数千个基因表达测量数据，提高了细胞类型识别和组织图像标签预测的分辨率和准确性 | NA | 开发一种能够整合组织形态学和空间基因表达数据以预测疾病细胞的深度学习软件 | 组织形态学和空间基因表达数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学(ST) | 深度学习模型 | 图像和基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |