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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3621 | 2025-10-06 |
Nicotinamide boosts oocyte quantity and quality by promoting N4-acetylation modification in lupus mice
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu0955
PMID:40680131
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示烟酰胺通过促进N4-乙酰化修饰改善狼疮小鼠卵母细胞数量和质量的作用机制 | 首次绘制狼疮小鼠卵母细胞acC修饰图谱,揭示NAT10介导的acC修饰在卵母细胞发育异常中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究系统性红斑狼疮影响卵母细胞发育的分子机制及烟酰胺的治疗潜力 | 系统性红斑狼疮小鼠模型的卵母细胞 | 生殖医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序, 翻译组测序, acC-RNA免疫沉淀测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 翻译组数据, 表观遗传修饰数据 | 狼疮小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 翻译组测序, 表观遗传学测序 | NA | NA |
3622 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomic profiling of eosinophils and airway immune cells in childhood asthma
2025-Jul-18, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.034
PMID:40684957
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研究论文 | 本研究通过优化单细胞RNA测序方法,显著提高了儿童哮喘患者鼻腔灌洗样本中粒细胞(特别是嗜酸性粒细胞)的检测效率 | 采用10x Genomics Flex平台结合定制化数据处理流程,实现了粒细胞检测量16倍以上的提升,首次在组织样本中成功捕获嗜酸性粒细胞和中性粒细胞亚群 | 研究仅针对鼻腔灌洗样本,未验证其他组织类型;样本量相对有限 | 优化单细胞RNA测序技术在粒细胞检测中的应用,探索儿童哮喘的免疫细胞特征 | 儿童哮喘患者的鼻腔灌洗样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童哮喘患者鼻腔灌洗样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics Flex | 10x Genomics Flex平台结合定制化数据处理流程 |
3623 | 2025-10-06 |
NPLOC4 constructs tumor immunosuppressive microenvironment in pan-cancer and hepatocellular carcinoma
2025-Jul-17, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究探讨NPLOC4在泛癌和肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统揭示NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的免疫抑制作用及其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现需进一步实验验证 | 探究NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的作用机制和治疗价值 | 多种肿瘤类型和肝细胞癌患者组织样本及肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 单细胞测序分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | 多个公共数据库数据及肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3624 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome and Microbiome Profiling Uncover Ileal Immune Impairment in Intrauterine Growth-Retarded Piglets
2025-Jul-17, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和微生物组分析揭示了宫内生长迟缓仔猪回肠免疫功能障碍的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和16S rRNA测序技术,系统揭示了IUGR仔猪免疫细胞比例变化、信号通路异常及肠道菌群失调的关联机制 | 样本量较小(仅3对仔猪),且仅观察了7日龄时的表型变化 | 探究宫内生长迟缓仔猪的基因调控模式和微生物组变化 | 宫内生长迟缓仔猪和正常同窝仔猪的回肠组织和肠道内容物 | 单细胞组学 | 宫内生长迟缓 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA扩增子测序 | SCENIC, 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 微生物组数据 | 3只IUGR仔猪和3只正常同窝仔猪 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
3625 | 2025-10-06 |
Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192
PMID:40397797
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研究论文 | 本研究探讨了TP53突变MDS/AML患者对地西他滨初始治疗产生良好反应及后续复发的潜在机制 | 首次通过整合靶向测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学,系统分析TP53突变患者在地西他滨治疗过程中白血病细胞与免疫群体的动态变化 | 样本量有限,属于II期临床研究,需要更大规模研究验证 | 阐明TP53突变MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制 | 骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者 | 血液肿瘤学 | 骨髓增生异常综合征,急性髓系白血病 | 靶向髓系panel测序,纳米孔DNA胞嘧啶甲基化测序,单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据,甲基化数据,单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但为系列样本(治疗前、治疗完成时、形态学缓解期和复发期) | NA | 单细胞RNA-seq,DNA甲基化测序 | NA | NA |
3626 | 2025-10-06 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示调控肿瘤微环境中组织驻留记忆CD8 T细胞分化的转录因子网络 | 首次通过配对单细胞RNA测序和ATAC测序技术,构建增强子驱动的调控网络,揭示KLF2和BATF转录因子在Trm样TIL形成中的拮抗作用 | 研究基于模型系统,需要在人类患者样本中进一步验证 | 阐明肿瘤微环境中CD8 T细胞组织驻留记忆表型形成的调控机制 | T细胞受体匹配的CD8 T细胞,包括感染和癌症模型中的T细胞 | 单细胞多组学 | 实体恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
3627 | 2025-10-06 |
Prenatally derived macrophages support choroidal health and decline in age-related macular degeneration
2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242007
PMID:40261298
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研究论文 | 本研究揭示了人类脉络膜中两种FOLR2表达不同的巨噬细胞群体及其在年龄相关性黄斑变性中的变化 | 首次发现脉络膜中存在产前来源的FOLR2+巨噬细胞,并证明其在AMD中数量减少和功能失调 | 研究主要基于观察性数据,机制验证仍需进一步实验 | 探究人类脉络膜的免疫细胞组成及其在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 人类脉络膜组织和巨噬细胞 | 眼科疾病研究 | 年龄相关性黄斑变性 | 3D多重免疫荧光,单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 图像,基因表达数据,细胞计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3628 | 2025-10-06 |
The Dichotomy of Tumor Control by Recruited and Resident Tumor-Associated Macrophages
2025-Jul-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6977440/v1
PMID:40630529
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞中不同亚群在肿瘤控制中的双重作用 | 首次明确区分了组织驻留间质巨噬细胞不同亚群的促瘤和抑瘤功能,并发现CCR5阻断可改善肿瘤控制 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肺腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 阐明肿瘤相关巨噬细胞不同亚群在肿瘤进展中的功能异质性 | 肿瘤相关巨噬细胞(包括recMacs和IMs) | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤,肺腺癌 | 空间转录组学,基因敲除模型 | Pf4 Cx3cr1小鼠模型 | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3629 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in Hirschsprung's disease tissues reveals lack of neuronal differentiation in the aganglionic colon segment
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662516
PMID:40631286
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先天性巨结肠症组织,揭示无神经节结肠段中神经元分化缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和全基因组测序系统比较先天性巨结肠患者健康与无神经节结肠段的细胞组成差异 | 样本量有限,未明确说明具体患者数量 | 探究先天性巨结肠症无神经节结肠段神经元分化障碍的分子机制 | 先天性巨结肠患者的健康与无神经节结肠组织 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3630 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal a Tumor-Associated Macrophage Subpopulation that Mediates Prostate Cancer Progression and Metastasis
2025-Jul-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0791
PMID:40105746
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学发现介导前列腺癌进展和转移的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 首次识别并验证了SPP1+/TREM2+肿瘤相关巨噬细胞亚群在前列腺癌转移中的关键作用及其治疗潜力 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 揭示肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌进展和转移中的作用机制 | 前列腺癌患者样本和鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫荧光 | 鼠模型 | 基因表达数据,空间定位数据,免疫染色数据 | 人类患者样本和鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
3631 | 2025-10-06 |
Examination of an iPSC model of human eye development reveals progressive emergence of critical embryonic cell types
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06602-9
PMID:40596144
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研究论文 | 通过多时间点形态学和转录组分析研究人类iPSC衍生的眼发育模型(SEAM)中关键胚胎细胞类型的渐进出现过程 | 开发了模拟人类全眼发育早期阶段的2D模型,首次实现了多种胚胎细胞类型的同步发育研究 | 模型仅覆盖28天的分化过程,可能无法完全模拟更长期的发育事件 | 建立人类眼发育的体外模型并解析关键细胞类型的发育轨迹 | 人类iPSC衍生的SEAM眼细胞模型 | 发育生物学 | 眼发育疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SEAM模型 | 转录组数据, 形态学数据 | 多时间点(第0、14、28天)的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3632 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.30.662374
PMID:40631144
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究致病性SHP2变异的多样化表型结果 | 结合单细胞转录谱分析与蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学,揭示致病突变如何失调信号传导 | NA | 解释致病性SHP2突变如何失调信号传导及其与人类疾病的关联 | 表达临床多样化SHP2变异的细胞 | 单细胞组学 | 努南综合征, 癌症 | 单细胞转录组分析, 蛋白质生物化学, 结构分析, 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3633 | 2025-10-06 |
Cadmium exposure following early-life respiratory syncytial virus infection promotes lung fibrosis through autophagy inhibition
2025-Jul-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfaf054
PMID:40268749
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研究论文 | 本研究探讨了早期呼吸道合胞病毒感染后镉暴露通过抑制自噬促进肺纤维化的机制 | 揭示了mTORC1激活-自噬抑制通路在镉暴露加重病毒感染后肺纤维化中的关键作用 | 使用小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 研究慢性低剂量镉暴露在早期RSV感染后促进肺纤维化的分子机制 | 小鼠模型 | 病理生理学 | 肺纤维化 | 代谢组学分析,单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据,代谢物数据,组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3634 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic and chromatin dynamics of the human brain in PTSD
2025-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09083-y
PMID:40533550
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研究论文 | 通过单细胞转录组和染色质分析揭示创伤后应激障碍患者前额叶皮层的细胞特异性分子调控机制 | 首次在超过200万个细胞核中系统分析PTSD的细胞类型特异性表观基因组调控机制,整合遗传、转录组和表观遗传数据 | 使用死后脑组织样本,可能无法完全反映活体状态;样本量相对有限 | 解析创伤后应激障碍的细胞特异性分子调控机制 | 111例人类大脑背外侧前额叶皮层组织(含PTSD、重度抑郁症患者和对照组) | 单细胞组学 | 创伤后应激障碍 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 111例人脑样本,超过200万个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
3635 | 2025-10-06 |
Technologies for Decoding Cancer Metabolism with Spatial Resolution
2025-Jul-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041553
PMID:39284668
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综述 | 本文讨论了三种新兴的代谢组学技术在解码癌症代谢中的应用 | 聚焦空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学三种新兴技术 | NA | 研究癌症代谢及其技术发展 | 癌细胞代谢途径 | 代谢组学 | 癌症 | 代谢组学、质谱分析 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 单细胞代谢组学, 细胞器代谢组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
3636 | 2025-10-06 |
Noncanonical Differentiation of Memory B Cells Drives Latent Tuberculosis Infection Reactivation Upon Tumor Necrosis Factor-Alpha Inhibitor Therapy: An Integrative Transcriptomic Study
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70311
PMID:40686471
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研究论文 | 通过整合转录组分析揭示记忆B细胞在肿瘤坏死因子抑制剂治疗期间驱动潜伏结核感染复活的非经典分化机制 | 首次发现ROR1+记忆B细胞在结核病进展中的非经典分化轨迹及其代谢重编程作用 | 基于六项现有转录组数据集的二次分析,缺乏实验验证 | 探索TNFi治疗导致潜伏结核感染复活的分子机制 | 记忆B细胞在结核病进展和TNFi治疗过程中的变化 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 伪时间分析,转录因子分析 | 转录组数据 | 六个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3637 | 2025-10-06 |
A spatial transcriptomic atlas of the host response to oropharyngeal candidiasis
2025-Jun-30, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00849-25
PMID:40586608
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研究论文 | 利用空间转录组学技术构建宿主对口腔念珠菌病免疫反应的细胞图谱 | 首次通过空间转录组学揭示口腔念珠菌感染微环境中2型免疫反应和M2巨噬细胞的平衡作用,发现新型富含脯氨酸抗菌蛋白家族 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探索口腔念珠菌病感染环境中免疫平衡机制 | 小鼠口腔念珠菌感染模型中的舌组织 | 空间转录组学 | 口腔念珠菌病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
3638 | 2025-10-06 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本研究揭示了鸟苷酸结合蛋白通过平衡骨髓细胞中iNOS/Arg-1表达在防御硕大利什曼原虫感染中的关键作用 | 首次发现GBPs通过调节iNOS/Arg-1平衡控制利什曼原虫感染,揭示了GBPs在皮肤利什曼病免疫防御中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究鸟苷酸结合蛋白在皮肤利什曼病免疫防御中的作用机制 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3基因敲除小鼠、骨髓来源巨噬细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq、基因敲除技术 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | C57Bl/6和GBPChr3 KO小鼠模型 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
3639 | 2025-10-06 |
Protocol for deep-learning-driven cell type label transfer in single-cell RNA sequencing data
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103768
PMID:40232935
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研究论文 | 介绍使用SIMS工具进行单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的详细操作流程 | 提出了一个基于深度学习的标准化协议,用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型标签转移,支持多种使用方式 | NA | 开发单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的标准化操作流程 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3640 | 2025-10-06 |
Identifying condition-related cell-cell communication events using supervised tensor analysis
2025-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571918
PMID:38168391
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研究论文 | 开发了一种名为STACCato的监督张量分析工具,用于识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 首次将监督张量分析方法应用于细胞间通讯研究,能够同时调整混杂因素和考虑CCC事件间的依赖关系 | 方法主要基于scRNA-seq数据,可能不适用于其他类型的数据 | 开发统计方法来识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 细胞间通讯事件 | 生物信息学 | 狼疮,自闭症 | 单细胞RNA测序 | 张量回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |