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当前共找到 37637 篇文献,本页显示第 3621 - 3640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3621 2026-01-29
A robust ammonia metabolism gene signature identified by machine learning predicts prognosis and immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过机器学习方法,识别了一个与氨代谢相关的基因特征,用于预测透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应 首次利用机器学习整合多组学数据,构建了氨代谢风险评分模型,并验证了其在预测预后和免疫治疗反应中的有效性,同时通过体外实验验证了关键基因CSAD的功能 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 开发一个能够预测透明细胞肾细胞癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物 透明细胞肾细胞癌患者 机器学习 肾细胞癌 RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, TMB分析 随机森林, LASSO, 多元Cox回归 RNA-seq数据, 多组学数据 TCGA数据库中的患者数据,以及外部验证队列和免疫治疗队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3622 2026-01-29
Berberine suppresses hepatocellular carcinoma progression by blocking IL-4-JAK1-STAT6-mediated M2 polarization of macrophage
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究揭示了小檗碱通过阻断IL-4-JAK1-STAT6信号轴抑制巨噬细胞M2极化,从而抑制肝细胞癌进展的机制 首次阐明小檗碱通过直接结合JAK1蛋白的FERM结构域并稳定该蛋白,进而抑制IL-4诱导的巨噬细胞M2极化,并与抗PD-L1抗体联合治疗显示出协同抗肿瘤效应 研究主要基于H22荷瘤小鼠模型和体外实验,缺乏临床患者样本验证;联合治疗策略的长期安全性和疗效需进一步评估 探究小檗碱是否通过调节肿瘤炎症微环境抑制肝细胞癌进展 肝细胞癌(HCC)、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、H22肿瘤细胞系、荷瘤小鼠模型 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、蛋白质稳定性测定、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 H22荷瘤小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3623 2026-01-29
Integrative transcriptomic analysis reveals microglial metabolic-inflammatory crosstalk of HK2-HSPA5-TNF axis after intracerebral hemorrhage
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学数据,揭示了脑出血后小胶质细胞中HK2-HSPA5-TNF轴介导的代谢-炎症相互作用 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,系统揭示了脑出血后小胶质细胞中葡萄糖代谢与炎症反应之间的时空动态调控网络 研究主要基于转录组学数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;动物模型与人类组织的直接可比性有待进一步确认 探究脑出血后葡萄糖代谢失调如何促进神经炎症的发病机制 脑出血后的小胶质细胞代谢-炎症调控网络 生物信息学 脑血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 加权基因共表达网络分析, 伪时间轨迹重建, 细胞间通讯推断 转录组数据 人类血肿周围组织和小鼠脑出血模型 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3624 2026-01-29
SpaLLM: a general framework for spatial domain identification with large language models
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 提出SpaLLM框架,通过整合大语言模型生成的基因描述嵌入与空间转录组学数据,改进空间域识别 首次将大语言模型生成的基因功能描述嵌入整合到空间转录组学分析中,利用预计算的GenePT嵌入创建生物学信息丰富的基因表示,从而增强空间域识别的准确性 未在摘要中明确提及具体局限性 改进空间转录组学中的空间域识别方法 空间转录组学数据,包括基因表达矩阵和空间坐标 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 大语言模型 基因表达矩阵、空间坐标、基因功能描述文本 12个基于测序的Visium切片和一个独立的基于成像的osmFISH数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 基于测序的Visium切片
3625 2026-01-29
High-dimensional co-expression network analysis reveals persistent TRH gene expression throughout axolotl telencephalon regeneration
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过高维加权基因共表达网络分析,结合空间转录组学,揭示了蝾螈端脑再生过程中基因共表达的动态图谱,并识别了包括TRH在内的关键枢纽基因 整合hdWGCNA、空间转录组学和蛋白质-蛋白质相互作用网络,首次在蝾螈端脑再生中系统识别了枢纽基因,并发现了TRH基因在多个阶段的持续表达模式 研究主要为描述性分析,未进行实验验证枢纽基因的功能机制 识别蝾螈端脑再生过程中的枢纽基因并定位其细胞位置,以阐明脑再生的分子基础 蝾螈(Ambystoma mexicanum)的端脑再生过程 生物信息学 NA 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、空间转录组学、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 NA 时空转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3626 2026-01-29
Integrated multi-omics and single-cell analysis identify SERPINE1 as a key mediator of the inflammatory tumor microenvironment in PDAC
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学与单细胞分析,揭示了SERPINE1是胰腺导管腺癌(PDAC)炎症性肿瘤微环境的关键调控因子 首次通过整合多组学与单细胞分析,系统性地将SERPINE1确立为PDAC炎症驱动基质重塑和免疫逃逸的核心协调者,并发现其作为药物靶点的新潜力 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,体内功能验证和临床转化研究有待进一步开展 阐明PDAC炎症性肿瘤微环境中的关键调控因子及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的细胞与分子 生物信息学,单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序,多组学分析,分子对接,CRISPR基因敲除 NA 基因组,转录组,单细胞转录组数据 来自TCGA、GEO、ArrayExpress数据库的多队列数据集,以及IMvigor210队列 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
3627 2026-01-29
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与批量转录组数据集,揭示了RDH16在肝细胞癌中调节免疫浸润的新机制 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析结合,识别RDH16作为免疫调节生物标志物,并发现其与CD163⁺ M2巨噬细胞浸润的负相关关系 研究未直接验证RDH16在体内对免疫微环境的具体调控机制,且功能实验未显示其对肿瘤细胞增殖、迁移或侵袭的直接影响 探究肝细胞癌中肿瘤异质性及免疫微环境,识别可操作的生物标志物和免疫调节机制以改善患者预后 肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织,重点关注RDH16基因表达及其与临床病理特征和免疫浸润的关联 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,批量转录组测序,孟德尔随机化分析 NA 转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织的比较 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
3628 2026-01-29
Revealing the role of regulatory microglial IRF7-NLRP3 interactions in optic nerve damage of normal-tension glaucoma based on single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序,揭示了正常眼压性青光眼中IRF7与NLRP3分子相互作用调控小胶质细胞炎症反应在视神经损伤中的作用机制 首次揭示了OPTN (E50K)突变通过削弱IRF7对NLRP3的抑制作用,导致促炎性小胶质细胞表型,从而加剧NTG视神经损伤的具体分子机制 研究基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性仍需进一步验证;研究聚焦于IRF7-NLRP3轴,可能存在其他未被探索的相关通路 探究正常眼压性青光眼(NTG)视神经损伤的分子机制,特别是小胶质细胞炎症反应的作用 野生型和OPTN (E50K)突变小鼠的视网膜小胶质细胞 数字病理学 青光眼 单细胞RNA测序, Western blot, qPCR, 免疫荧光, 分子对接 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质印迹数据, 基因表达数据, 荧光成像数据 野生型和OPTN (E50K)突变小鼠的视网膜小胶质细胞(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3629 2026-01-29
Unveiling the immunometabolic landscape of colorectal cancer through PANoptosis-related gene expression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过分析PANoptosis相关基因表达,揭示了结直肠癌的免疫代谢景观,并构建了基于CPAN-index的风险分层模型 首次将PANoptosis相关基因与结直肠癌免疫代谢微环境关联,构建了CPAN-index风险分层工具,并验证了CDKN2A在肿瘤进展中的关键作用 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床验证和实验机制探索 探究PANoptosis相关基因在结直肠癌中的作用及其对免疫代谢微环境的影响 结直肠癌组织和细胞系 生物信息学 结直肠癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 LASSO回归模型 RNA-seq数据 未明确具体样本数量,但使用了公共数据集和外部验证集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3630 2026-01-29
Decoding inflammatory regulation in ovarian cancer at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞技术如何揭示卵巢癌微环境中炎症驱动的重塑、免疫细胞信号通路及动态的炎症-免疫相互作用 聚焦卵巢癌的“双重微环境”,整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学技术,从单细胞分辨率解析炎症调控机制 综述性文章,未开展原始实验研究;将单细胞见解转化为精准诊疗策略仍面临挑战 阐明炎症在卵巢癌发生发展中的调控作用,并探讨其临床转化前景 卵巢癌微环境(OCME),包括肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 数字病理学 卵巢癌 scRNA-seq, 空间转录组学, 多组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
3631 2026-01-29
TRIM29 drives ulcerative colitis by disrupting lipid metabolism via lysosomal dysfunction: a multi-omics and experimental study
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学和实验方法,揭示了TRIM29通过破坏溶酶体功能并重编程脂质代谢来驱动溃疡性结肠炎进展的机制 首次将TRIM29鉴定为溃疡性结肠炎进展的关键调控因子,并阐明了其通过溶酶体功能障碍影响脂质代谢的新轴心机制 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未在人类患者中进行直接验证,且机制细节有待进一步深入探索 探究溃疡性结肠炎的发病机制,特别是脂质代谢与疾病之间的因果关系 溃疡性结肠炎患者数据、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、结肠上皮细胞 生物信息学 溃疡性结肠炎 加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、集成机器学习、单细胞RNA测序、转录组分析 LASSO、SVM、XGBoost 转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3632 2026-01-29
Integrated multi-omic profiling reveals macrophage-driven prognostic signatures in clear cell renal cell carcinoma through machine learning optimization
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与机器学习模型,揭示了透明细胞肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性,并构建了一个基于巨噬细胞的预后特征模型 首次在KIRC中系统鉴定出五个转录不同的巨噬细胞亚群,特别是三个脂质相关巨噬细胞亚群,并利用随机生存森林模型构建了具有强预后性能的巨噬细胞中心特征 研究样本量相对有限(十个KIRC肿瘤的单细胞数据),且主要依赖公共数据库(如TCGA和CPTAC)进行验证,可能受数据异质性影响 旨在阐明KIRC中肿瘤相关巨噬细胞的异质性,识别预后相关的巨噬细胞特征,并解析驱动KIRC进展的免疫代谢程序 透明细胞肾细胞癌(KIRC)患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 机器学习 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA),机器学习模型 随机生存森林(RSF)模型,共使用了二十种机器学习模型 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,临床数据 十个KIRC肿瘤的单细胞RNA测序数据,并在TCGA和CPTAC独立队列中进行验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3633 2026-01-29
Multi-omics integration identifies NK cell dysregulation and a five-gene diagnostic signature in major depressive disorder
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了自然杀伤细胞功能障碍在重度抑郁症中的核心作用,并鉴定出五个关键基因作为诊断标志物 首次整合bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq数据,结合机器学习方法,系统性地识别了MDD中NK细胞的功能失调及其相关的五个关键基因诊断特征 样本量较小(仅3名MDD患者和3名健康对照),且仅基于外周血单核细胞进行分析,可能无法完全反映大脑内的病理变化 揭示重度抑郁症的细胞类型特异性转录组失调和免疫功能障碍机制,并寻找诊断生物标志物和治疗靶点 重度抑郁症患者和健康对照者的外周血单核细胞 生物信息学 重度抑郁症 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 机器学习, 伪时间轨迹分析, GSVA, scMetabolism, SCENIC 机器学习 基因表达数据 3名MDD患者和3名健康对照的PBMCs单细胞数据,以及GSE39653数据集的bulk RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3634 2026-01-29
A multi-omics analysis of pancreatitis: bridging familial genetics and disease progression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,整合家族性慢性胰腺炎和急性胰腺炎队列,揭示了胰腺炎的共享分子和细胞病理学机制 整合罕见家族性慢性胰腺炎的全外显子组测序与大型急性胰腺炎队列的单细胞RNA测序及批量转录组学数据,首次构建了连接遗传变异与免疫细胞特征的统一发病机制模型 研究样本量相对有限,特别是家族性慢性胰腺炎病例较少,且主要依赖公共数据集进行验证 探究胰腺炎的遗传基础和免疫细胞机制,以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 家族性慢性胰腺炎患者及其家庭成员,以及公共急性胰腺炎队列患者 多组学分析 胰腺炎 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 批量转录组学 人工智能驱动模型 基因组数据, 转录组数据 2名儿科慢性胰腺炎患者及其家庭成员,以及119名急性胰腺炎患者 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
3635 2026-01-29
From multi-omics to functional validation: the PTMRS stratifies TME and positions PDGFRB in CRC biology
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究构建了一个基于翻译后修饰相关基因的风险特征模型(PTMRS),用于结直肠癌的预后分层,并通过实验验证了PDGFRβ在肿瘤微环境中的关键作用 首次整合多种翻译后修饰信号构建结直肠癌风险模型,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了PTMRS与肿瘤微环境的关联,实验验证了PDGFRβ在成纤维细胞中的促癌功能 需要在体内模型和前瞻性临床队列中进一步验证 开发结直肠癌的精准预后分层工具并探索其生物学机制 结直肠癌患者样本、人类结肠成纤维细胞和结直肠癌细胞 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞通讯分析(CellChat)、体外功能实验 Cox偏最小二乘框架 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GTEx数据集中的结直肠癌样本,多个独立队列和免疫治疗数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3636 2026-01-29
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization identifies mitochondrial targets in immune cells for Major Depressive Disorder
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组孟德尔随机化方法,识别了免疫细胞中与重度抑郁症风险相关的线粒体靶基因 整合多组学数据与机器学习,结合细胞类型特异性孟德尔随机化分析,首次在免疫细胞中鉴定出线粒体相关能量代谢基因对重度抑郁症风险的因果影响 研究主要基于遗传关联数据,需进一步实验验证基因功能机制;样本来源和模型验证可能限制结果的普适性 识别与重度抑郁症风险相关的免疫细胞中线粒体基因,为生物标志物和治疗靶点开发提供依据 免疫细胞中的线粒体相关能量代谢基因(MEMRGs)及重度抑郁症患者 生物信息学 重度抑郁症 单细胞转录组测序,孟德尔随机化,机器学习,ssGSEA,CIBERSORT 机器学习模型(未指定具体类型),孟德尔随机化模型 多组学数据(包括转录组数据),遗传数据 未明确指定人类样本数量,但包括独立队列验证和CUMS大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3637 2026-01-29
Single-cell transcriptional profiling revealed the protective effects of Buddleoside in sepsis-associated acute liver injury
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了天然化合物Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用及其免疫调节机制 首次在单细胞分辨率下系统阐明Buddleoside通过调节内皮细胞、中性粒细胞和巨噬细胞亚群来缓解脓毒症相关急性肝损伤的分子机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;机制研究主要依赖转录组数据,缺乏蛋白质功能验证 评估Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用并探索其免疫调节机制 小鼠脓毒症相关急性肝损伤模型中的肝脏细胞 单细胞组学 脓毒症相关急性肝损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3638 2026-01-29
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制及预后生物标志物 首次结合单细胞和批量转录组数据,系统探索乳腺癌与甲状腺癌的共病分子机制,并利用机器学习构建预后模型,验证了SMR3B作为共享预后基因 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分有限,且样本来源和数量可能影响结果的普适性 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制,并识别共同的预后生物标志物和治疗靶点 乳腺癌和甲状腺癌的转录组数据,包括单细胞和批量RNA测序数据 生物信息学 乳腺癌, 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 差异表达基因分析, 功能富集分析, 拷贝数变异分析, 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3639 2026-01-29
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞,并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱(树突状细胞),并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,生物信息学算法 Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 来自TCGA、GEO(GSE68465和GSE31210)和单细胞数据集(GSE131907)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3640 2026-01-29
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging IF:3.3Q2
综述 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用,并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 超越对通路的简单罗列,提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架,并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 机制复杂性高,动物模型和体外系统存在局限性 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制,并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型(心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞)的影响 NA 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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