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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3601 | 2025-10-06 |
Vaccine adjuvant-elicited CD8+ T cell immunity is co-dependent on T-bet and FOXO1
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112911
PMID:37516968
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研究论文 | 本研究揭示疫苗佐剂引发的CD8+ T细胞免疫需要T-bet和FOXO1转录因子的协同调控 | 发现疫苗佐剂诱导的T细胞应答需要T-bet和FOXO1的协同作用,与感染引发的应答机制不同 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究疫苗佐剂引发CD8+ T细胞免疫的转录调控机制 | 小鼠CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3602 | 2025-10-06 |
Anaplastic transformation in thyroid cancer revealed by single-cell transcriptomics
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169653
PMID:37053016
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示甲状腺癌向间变性癌转化的细胞谱系和命运转变过程 | 首次在单细胞水平解析甲状腺癌间变性转化的连续谱系,识别了二倍体和异倍体两个关键转化阶段 | 样本量有限,转化机制需要进一步功能验证 | 探究甲状腺癌向间变性癌转化的细胞分子机制 | 不同亚型甲状腺癌患者样本 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3603 | 2025-10-06 |
Exploring the optimization of autoencoder design for imputing single-cell RNA sequencing data
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.041
PMID:37671239
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研究论文 | 通过实证研究探索自编码器设计对单细胞RNA测序数据插补性能的影响 | 首次系统研究自编码器架构和超参数选择对scRNA-seq数据插补性能的影响,发现与计算机视觉领域不同的最佳实践 | 研究结果基于实证分析,缺乏理论证明 | 优化自编码器设计以提高单细胞RNA测序数据插补性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 多个真实和模拟的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3604 | 2025-10-06 |
Cerebrospinal fluid immune dysregulation during healthy brain aging and cognitive impairment
2022-12-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.019
PMID:36516855
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脑脊液免疫系统在健康脑老化和认知障碍期间的变化 | 首次在单细胞水平揭示脑脊液免疫系统随年龄和认知状态的变化,发现单核细胞脂质转运基因表达模式改变及CXCL16-CXCR6信号通路在认知障碍中的作用 | 样本量相对有限(共59名受试者),未涵盖更广泛年龄范围或不同神经退行性疾病类型 | 探究脑脊液免疫系统在健康脑老化和认知障碍期间的调控机制 | 45名54-82岁认知正常受试者和14名认知障碍受试者的脑脊液样本 | 单细胞基因组学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 59名受试者(45名认知正常,14名认知障碍) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3605 | 2025-10-06 |
CRISPRi screens in human iPSC-derived astrocytes elucidate regulators of distinct inflammatory reactive states
2022-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01180-9
PMID:36303069
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞转录组学系统解析了人类iPSC来源星形胶质细胞炎症反应状态的调控机制 | 首次建立人iPSC来源星形胶质细胞的CRISPRi筛选平台,发现STAT3调控两种不同炎症反应状态的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型,体内验证数据相对有限 | 系统研究炎症性星形胶质细胞反应状态的分子调控机制 | 人诱导多能干细胞分化的星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经退行性疾病 | CRISPR干扰筛选,单细胞RNA测序 | CRISPRi | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3606 | 2025-10-06 |
Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01091-3
PMID:34764492
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研究论文 | 开发了一种整合单细胞和批量测序数据识别表型相关细胞亚群的方法Scissor | 首次提出通过整合表型相关的批量表达数据和单细胞数据来识别与特定表型相关的细胞亚群 | NA | 开发识别与表型相关的细胞亚群的计算方法 | 单细胞RNA测序数据和批量表达数据 | 生物信息学 | 肺癌,黑色素瘤,面肩肱型肌营养不良症,阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
3607 | 2025-10-06 |
Loss of Mir146b with aging contributes to inflammation and mitochondrial dysfunction in thioglycollate-elicited peritoneal macrophages
2021-08-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66703
PMID:34423778
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研究论文 | 本研究通过RNA测序发现Mir146b随年龄增长在巨噬细胞中表达下降,并揭示其缺失导致炎症和线粒体功能障碍 | 首次发现Mir146b在巨噬细胞衰老过程中的单向性表达下降及其对炎症和线粒体功能的调控作用 | 研究仅基于硫乙醇酸盐诱导的小鼠腹腔巨噬细胞模型,未在人类样本或其他巨噬细胞类型中验证 | 探索巨噬细胞衰老的分子机制及其与免疫功能障碍的关系 | 小鼠硫乙醇酸盐诱导的腹腔巨噬细胞 | 免疫学 | 老年疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3608 | 2025-10-06 |
Deficiency of histone lysine methyltransferase SETDB2 in hematopoietic cells promotes vascular inflammation and accelerates atherosclerosis
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147984
PMID:34003795
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白赖氨酸甲基转移酶SETDB2在造血细胞中通过调控巨噬细胞活化抑制血管炎症和动脉粥样硬化进展的新机制 | 首次发现SETDB2在动脉粥样硬化病变中表达上调,并证明其在造血细胞中缺失会促进血管炎症和加速动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究SETDB2在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 人类和小鼠动脉粥样硬化病变、造血细胞、巨噬细胞 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、骨髓移植、基因敲除 | Ldlr基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3609 | 2025-10-06 |
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22361
PMID:32989764
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研究论文 | 开发了一种名为TWO-SIGMA的新型双组分单细胞模型关联方法,用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | 首个能同时处理零膨胀计数、样本内相关性、非平衡设计、多层级协变量并支持广义差异表达检验的单细胞RNA-seq分析方法 | 未明确说明对计算资源的要求和在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更灵活准确的单细胞RNA-seq差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应逻辑回归模型, 混合效应负二项回归模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3610 | 2025-07-22 |
Bulk RNA sequencing combined with single-cell RNA sequencing analysis revealed the ferroptosis immune target of osteoarthritis synovial fibroblasts
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101587
PMID:40687616
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3611 | 2025-10-06 |
Derlin-3 manipulates the endoplasmic reticulum stress and IgG4 secretion of plasma cells in lung adenocarcinoma
2025-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03435-8
PMID:40369338
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研究论文 | 本研究探讨Derlin-3通过内质网应激调控肺腺癌肿瘤微环境中浆细胞IgG4分泌及巨噬细胞极化的机制 | 首次揭示Derlin-3在肺腺癌肿瘤微环境中通过Hrd1/p38/PRDM1通路调控浆细胞内质网应激和IgG4分泌的新机制 | 未明确Derlin-3调控Hrd1/p38/PRDM1通路的具体分子机制 | 探究Derlin-3在肺腺癌肿瘤微环境中的免疫调控功能 | 肺腺癌组织、B淋巴细胞、浆细胞、巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3612 | 2025-10-06 |
TREM-1 as a potential biomarker for malignant transformation risk in oral leukoplakia: Insights from bioinformatics and dual immunofluorescence analysis
2025-Aug, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156088
PMID:40555060
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和免疫荧光分析探讨TREM-1在口腔白斑恶性转化中的作用 | 首次发现TREM-1是口腔白斑恶性转化的独立风险因素,并确定巨噬细胞是其主要表达细胞 | 临床样本的Cox回归分析未能确认TREM-1表达与恶性转化的显著关联 | 研究TREM-1在口腔白斑恶性转化过程中的作用机制 | 口腔白斑患者组织和对照组织 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 双标记免疫荧光, 生物信息学分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据, 图像数据 | 69例口腔白斑组织和63例对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3613 | 2025-10-06 |
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: single-cell transcriptome profiling
2025-Jul-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250250
PMID:40685857
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析SFTS急性期患者外周血单个核细胞中淋巴细胞的异质性及糖皮质激素治疗的影响 | 首次在单细胞水平揭示SFTS急性期淋巴细胞功能异常机制及糖皮质激素治疗对免疫反应的调节作用 | 样本量较小(16名参与者),且未明确说明糖皮质激素治疗的具体方案和剂量 | 研究SFTS急性期淋巴细胞功能异常机制及糖皮质激素治疗对免疫细胞的影响 | SFTS急性期患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 严重发热伴血小板减少综合征 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名参与者(3名健康志愿者和13名SFTS急性期患者) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
3614 | 2025-10-06 |
A Deep Learning Approach to Assessing Cell Identity in Stem Cell-Based Embryo Models
2025-Jul-22, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_654
PMID:40690128
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的集成模型,用于评估干细胞胚胎模型中细胞身份与发育保真度 | 首次将深度学习与单细胞RNA测序数据整合,创建了能够评估体外细胞类型身份并提供分类可靠性熵分数的工具 | NA | 评估干细胞胚胎模型中细胞类型与真实胚胎发育的相似程度 | 胚胎干细胞、胚胎体、体外分化细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3615 | 2025-10-06 |
IGCLAPS: an interpretable graph contrastive learning method with adaptive positive sampling for scRNA-seq data analysis
2025-Jul-21, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf411
PMID:40689508
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据分析的可解释图对比学习方法 | 开发了自适应正采样模块,基于表达相似性和软聚类标签动态识别真实正样本对 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习, 图变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3616 | 2025-07-22 |
Cellular-resolution spatial transcriptomics of skin remodelling after fractional CO2 laser treatment
2025-Jul-21, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20870
PMID:40689597
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3617 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in tuberculosis: Application and future perspectives
2025-Jul-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003095
PMID:39111829
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用现状与未来展望 | 系统总结了scRNA-seq在结核病领域的应用潜力,并首次探讨其在临床生物标志物发现、宿主导向治疗和精准治疗研究中的具体价值 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述和理论分析 | 探讨单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用前景和发展方向 | 结核病免疫机制和细胞异质性 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3618 | 2025-10-06 |
The Icarian flight of antibody-drug conjugates: target selection amidst complexity and tackling adverse impacts
2025-Jul-19, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf002
PMID:39813112
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综述 | 本文综述抗体药物偶联物(ADCs)在靶点选择和应对毒性挑战方面的研究进展 | 重点探讨多靶点策略、pH依赖性抗体和掩蔽肽技术等创新方法,并强调单细胞测序和人工智能在优化靶点选择中的作用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 分析ADC开发面临的挑战并探讨提高其疗效和安全性的策略 | 抗体药物偶联物(ADCs)及其靶向治疗应用 | NA | 癌症 | 单细胞测序,人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3619 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers for Laryngeal squamous cell carcinoma through Mendelian randomization and integrated bioinformatics analysis
2025-Jul-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03114-w
PMID:40679719
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研究论文 | 通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法,识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后模型 | 首次系统分析泛凋亡相关基因在LSCC中的作用,结合单细胞RNA测序数据构建预后模型并验证其临床价值 | 样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后预测模型 | 喉鳞状细胞癌患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 喉癌 | RNA-seq, scRNA-seq, CNV分析, qRT-PCR | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 拷贝数变异数据 | 训练集:114例LSCC和12例正常样本;验证集:270例LSCC样本;scRNA-seq:2例LSCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
3620 | 2025-10-06 |
Architecture mechanics mediated osteogenic progression in bone regeneration of artificial scaffolds
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv8804
PMID:40680128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人工骨支架结构通过应力刺激调控骨再生的生物力学机制 | 首次阐明了支架结构诱导应力刺激(SASS)对细胞的生物力学机制,发现了SASS通过调控间充质干细胞粘着斑和成骨分化通路平衡骨重塑过程 | 研究仅针对石墨、富勒烯和金刚石三种支架材料,未涵盖其他生物材料体系 | 探究支架结构通过力学刺激调控骨再生的生物力学机制 | 骨间充质干细胞、破骨细胞、成骨细胞及临界尺寸骨缺损动物模型 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |