单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3601	2025-03-23	A prognostic molecular signature of hepatic steatosis is spatially heterogeneous and dynamic in human liver 2024-Dec-17, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101871 PMID:39657669	研究论文	本文通过整合临床表型、循环蛋白质组学和组织转录组学，识别了肝脂肪变性的动态功能生物标志物	使用多模态成像和广泛的蛋白质组分析，识别了与肝脂肪变性进展相关的蛋白质，并通过空间转录组学揭示了这些转录本在脂肪变性区域中的差异表达	NA	识别肝脂肪变性的动态功能生物标志物，并探索其在脂肪肝疾病和多系统代谢结果中的关联	人类肝脏	生物医学	脂肪肝	多模态成像、蛋白质组分析、空间转录组学	NA	蛋白质组数据、转录组数据	NA
3602	2025-03-23	Safety and reactogenicity of a controlled human infection model of sand fly-transmitted cutaneous leishmaniasis 2024-Nov, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03146-9 PMID:39095597	研究论文	本文介绍了一项关于沙蝇传播的皮肤利什曼病的受控人类感染模型（CHIM）的安全性和反应原性的研究	首次提供了人类皮肤利什曼病病变中免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达的综合图谱，揭示了离散的免疫生态位	由于CL和活检程序的结合，疤痕明显	促进疫苗开发，建立沙蝇传播的皮肤利什曼病的受控人类感染模型	14名暴露于L. major感染的Phlebotomus duboscqi的参与者	传染病学	皮肤利什曼病	免疫组织化学和空间转录组学	受控人类感染模型（CHIM）	临床数据	14名参与者
3603	2025-03-23	Neoadjuvant nivolumab or nivolumab plus ipilimumab in early-stage triple-negative breast cancer: a phase 2 adaptive trial 2024-Nov, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03249-3 PMID:39284953	研究论文	本研究探讨了在早期三阴性乳腺癌患者中，使用纳武利尤单抗或纳武利尤单抗联合伊匹木单抗进行新辅助免疫治疗的潜在疗效	研究首次在早期三阴性乳腺癌患者中探索了不联合化疗的免疫检查点抑制剂新辅助治疗的疗效，并通过单细胞RNA测序揭示了与治疗反应相关的免疫细胞特征	样本量较小（每组15例患者），且研究仅针对早期三阴性乳腺癌患者，结果可能不适用于其他类型乳腺癌或晚期患者	评估不联合化疗的免疫检查点抑制剂新辅助治疗在早期三阴性乳腺癌患者中的疗效和安全性	早期三阴性乳腺癌患者	肿瘤免疫治疗	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	临床数据、RNA测序数据	45例患者（3个队列，每组15例）
3604	2025-03-23	Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-associated platelet bias are evolutionarily conserved 2024-08-23, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk3469 PMID:39178276	研究论文	本文通过高通量单细胞RNA测序技术，研究了人类骨髓造血干细胞（HSCs）的功能和转录谱系偏向性，特别是血小板偏向性HSCs及其在衰老过程中的变化	首次在人类骨髓HSCs中证实了功能和转录谱系偏向性，并发现血小板偏向性HSCs在衰老过程中比例和转录血小板启动水平增加	研究主要基于小鼠模型和人类骨髓HSCs的异种移植，可能不完全反映人类体内HSCs的真实情况	研究人类骨髓HSCs的功能和转录谱系偏向性，特别是血小板偏向性HSCs及其在衰老过程中的变化	人类骨髓造血干细胞（HSCs）	生物医学	血液系统疾病	高通量单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	年轻和年老小鼠的骨髓HSCs
3605	2025-03-23	Timing and location dictate monocyte fate and their transition to tumor-associated macrophages 2024-07-26, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk3981 PMID:39058763	研究论文	本文探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的来源、演化及其在胰腺导管腺癌（PDAC）中的作用	揭示了单核细胞在肿瘤发展过程中如何分化为具有不同基因表达谱、表型和肿瘤内定位的终末分化TAMs	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究	研究TAMs在PDAC中的来源和演化过程	胰腺导管腺癌（PDAC）中的单核细胞和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞转录组学和高维流式细胞术	NA	单细胞转录组数据和高维流式细胞数据	诱导性单核细胞命运映射小鼠和PDAC患者肿瘤样本
3606	2025-03-23	Age-associated CD4+ T cells with B cell-promoting functions are regulated by ZEB2 in autoimmunity 2024-03-29, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk1643 PMID:38330141	研究论文	本文通过流式细胞术和批量RNA测序分析了354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群，发现了一种随着年龄增长而扩增的CXCR3CD4效应记忆T细胞亚群，命名为'年龄相关T辅助细胞（TA细胞）'	发现了一种新的年龄相关T细胞亚群（TA细胞），并揭示了其在自身免疫性疾病中的作用及其调控机制	研究主要基于流式细胞术和RNA测序，未涉及功能验证实验	探讨年龄与自身免疫性疾病之间的关系	354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群	免疫学	自身免疫性疾病	流式细胞术，批量RNA测序，单细胞RNA测序	NA	细胞数据，RNA测序数据	354名患者和健康对照
3607	2025-03-23	Increased Chemokine Production is a Hallmark of Rhesus Macaque Natural Killer Cells Mediating Robust Anti-HIV Envelope-Specific Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity 2024, Pathogens & immunity DOI:10.20411/pai.v10i1.734 PMID:39911143	研究论文	本文研究了恒河猴自然杀伤细胞（RMNK）在介导抗HIV包膜特异性抗体依赖性细胞介导的细胞毒性（ADCC）反应中的异质性及其功能子集	通过单细胞RNA测序分析，发现CD107a+ RMNK细胞亚群产生更多的趋化因子，表明这些细胞不仅清除感染细胞，还提供免疫调节信号并可能抑制HIV-1复制	研究中使用的抗CD16抗体与ADCC抗体的结合效果存在显著差异，导致脱颗粒和趋化因子产生的幅度减少了6至30倍	探讨恒河猴自然杀伤细胞在抗HIV ADCC反应中的功能异质性及其对HIV-1复制的潜在抑制作用	恒河猴自然杀伤细胞（RMNK）	免疫学	HIV感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
3608	2025-03-23	Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice 2023-Dec, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-023-00515-w PMID:37996758	研究论文	本研究探讨了老化对CD8 T细胞在动脉粥样硬化中的作用，发现老化小鼠中CD8 T细胞的耗竭能减轻动脉粥样硬化	首次发现老化相关的CD8 T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆扩增及其转录组特征	研究仅使用雌性小鼠，未涉及人类样本	探讨老化对CD8 T细胞在动脉粥样硬化中的作用	老化小鼠和年轻小鼠的CD8 T细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	雌性小鼠
3609	2025-03-23	APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids 2023-08-21, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-023-03444-y PMID:37605285	研究论文	本研究探讨了APOE基因缺失对人类iPSC来源的脑类器官中神经分化和胆固醇生物合成的影响	首次在人类iPSC来源的脑类器官中揭示了APOE缺失对脑脂质稳态的影响，并发现了APOE4与APOE3在神经发生和胆固醇代谢上的差异	研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响	探讨APOE基因在脑稳态中的作用及其与阿尔茨海默病的关系	人类iPSC来源的脑类器官	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	人类iPSC来源的脑类器官，包括APOE缺失和未缺失的样本
3610	2025-03-22	Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11075-6 PMID:40113718	研究论文	本研究采用网络药理学和单细胞RNA测序技术，筛选脓毒症中的核心治疗基因，并探讨金银花的潜在治疗机制	结合网络药理学和单细胞RNA测序技术，首次系统性地筛选并验证了脓毒症中的核心治疗基因及其与金银花成分的潜在相互作用	研究结果需要进一步的实验验证，特别是金银花成分与核心基因的具体作用机制尚未明确	阐明金银花在脓毒症中的潜在治疗机制，并筛选核心治疗基因	脓毒症患者和健康对照者的血液样本	生物信息学	脓毒症	RNA测序、单细胞RNA测序、网络药理学	NA	RNA测序数据	22名脓毒症患者和10名健康对照者
3611	2025-03-22	The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11086-3 PMID:40113719	研究论文	本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用，包括肿瘤微环境、预后和治疗反应	首次从肿瘤微环境、凝血功能差异、治疗和预后等多个角度全面探讨了凝血相关基因在GBM中的作用，并构建了基于五个CRGs的风险特征模型	研究主要依赖于公开数据集和体外实验，缺乏大规模的临床验证	探讨凝血相关基因在GBM中的作用及其对预后和治疗的影响	胶质母细胞瘤（GBM）患者及其肿瘤微环境	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、免疫组化、CCK8实验、伤口愈合实验、克隆形成实验	LASSO回归、随机生存森林分析	SNP、拷贝数变异数据、单细胞RNA测序数据	461例GBM患者（TCGA队列）和CGGA693队列
3612	2025-03-22	Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration 2025-Mar-18, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02085-2 PMID:40100436	研究论文	本研究探讨了STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能，发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中显著下调，并与较好的预后相关	首次系统地评估了STAT家族在结直肠癌中的表达水平和预后价值，并探索了其与免疫功能和免疫浸润水平的关系	研究主要依赖于公共数据库和有限的临床样本，可能影响结果的普遍性	研究STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能	结直肠癌样本	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序、空间转录组学技术	NA	基因表达数据、临床数据	TCGA数据库644样本、GTEx数据库308样本、中国临床样本30样本
3613	2025-03-22	Identification of a Subpopulation of Astrocyte Progenitor Cells in the Neonatal Subventricular Zone: Evidence that Migration is Regulated by Glutamate Signaling 2025-Jan-09, Neurochemical research IF:3.7Q2 DOI:10.1007/s11064-024-04326-2 PMID:39789409	研究论文	本研究通过基因工程小鼠模型，探索了新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群及其迁移机制，特别是谷氨酸信号在其中的调控作用	首次发现并描述了新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群，并提供了谷氨酸信号调控这些细胞迁移的新证据	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探索新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群及其迁移机制	基因工程小鼠模型中的星形胶质细胞前体细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、器官型切片培养	NA	基因表达数据、荧光成像数据	1-3天大的小鼠皮质星形胶质细胞培养物
3614	2025-03-22	LKB1 inactivation promotes epigenetic remodeling-induced lineage plasticity and antiandrogen resistance in prostate cancer 2025-Jan, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-024-01025-z PMID:39743630	研究论文	本文探讨了LKB1失活在前列腺癌中促进表观遗传重塑诱导的谱系可塑性和抗雄激素耐药性的分子机制	揭示了LKB1失活导致AR独立的谱系可塑性和全局DNA低甲基化，并提出了通过靶向DNA低甲基化的潜在治疗策略	研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序，尚未在人类临床试验中验证	研究AR独立谱系可塑性的分子机制，并探索潜在的治疗策略	人类和小鼠前列腺癌样本	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序	基因工程小鼠模型	RNA测序数据、DNA甲基化数据	人类和小鼠前列腺癌样本
3615	2025-03-22	Identification and Evaluation of Lipocalin-2 in Sepsis-Associated Encephalopathy via Machine Learning Approaches 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S504390 PMID:40109658	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，识别并评估了在脓毒症相关脑病中起关键作用的Lipocalin-2（LCN2）基因	首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，识别出LCN2作为中性粒细胞诱导的脓毒症相关脑病的关键基因，并通过体内实验验证了其作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	识别与脓毒症相关脑病（SAE）相关的关键基因，并探索潜在的治疗靶点	脓毒症患者和小鼠模型	机器学习	脓毒症相关脑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blotting、行为测试	多种二分类机器学习算法	基因表达数据、行为数据	脓毒症患者和小鼠模型
3616	2025-03-22	Integrated single-cell analysis reveals the regulatory network of disulfidptosis-related lncRNAs in bladder cancer: constructing a prognostic model and predicting treatment response 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1527036 PMID:40110199	研究论文	本研究通过单细胞测序和RNA测序数据，构建了一个与膀胱癌（BLCA）患者预后相关的二硫化物死亡相关长链非编码RNA（DRLs）模型	首次将二硫化物死亡相关基因（DRGs）与长链非编码RNA（lncRNAs）结合，构建了一个新的预后模型，并探讨了其在膀胱癌中的潜在应用	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探讨二硫化物死亡相关长链非编码RNA（DRLs）作为膀胱癌（BLCA）患者预后标志物的潜力	膀胱癌（BLCA）患者	生物信息学	膀胱癌	单细胞测序，RNA测序，RT-qPCR	LASSO回归，Cox回归	单细胞测序数据，RNA测序数据，临床信息	来自GEO和TCGA数据库的样本
3617	2025-03-22	Single-cell transcriptome analysis of stem cells from human exfoliated deciduous teeth investigating functional heterogeneity in immunomodulation 2024-12-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82734-8 PMID:39732760	研究论文	本文通过单细胞转录组分析研究了人类脱落乳牙干细胞（SHED）在免疫调节中的功能异质性	揭示了SHED在不同分化状态下的免疫调节能力，并比较了其与人类骨髓来源间充质干细胞（hBMSCs）和人类脐带来源间充质干细胞（hUCMSCs）的免疫调节特性	研究主要基于体外实验，未涉及体内实验验证	探讨SHED在炎症和自身免疫疾病治疗中的潜力	人类脱落乳牙干细胞（SHED）	单细胞转录组学	炎症和自身免疫疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	未明确提及具体样本数量
3618	2025-03-22	Extrasinusoidal macrophages are a distinct subset of immunologically active dural macrophages 2024-12-20, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adh1129 PMID:39705337	研究论文	本文通过单细胞转录组学、命运图谱、共聚焦成像、克隆分析和转基因小鼠模型，全面表征了硬脑膜外窦巨噬细胞，揭示了它们在自身免疫性神经炎症中的作用	首次全面表征了硬脑膜外窦巨噬细胞，揭示了其与软脑膜和中枢神经系统实质巨噬细胞在起源、扩展动力学和转录谱上的差异，并发现其在自身免疫性神经炎症中执行凋亡粒细胞的吞噬作用	研究中使用的转基因小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病状态，且单细胞转录组学数据的解释可能存在偏差	研究硬脑膜外窦巨噬细胞的细胞和功能异质性，及其在生理和病理过程中的作用	硬脑膜外窦巨噬细胞	免疫学	自身免疫性神经炎症	单细胞转录组学、命运图谱、共聚焦成像、克隆分析、转基因小鼠模型	NA	单细胞转录组数据、成像数据	转基因小鼠模型
3619	2025-03-22	New Window Into Hepatitis B in Africa: Liver Sampling Combined With Single-Cell Omics Enables Deep and Longitudinal Assessment of Intrahepatic Immunity in Zambia 2024-Nov-15, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiae054 PMID:38332750	研究论文	本文介绍了在赞比亚卢萨卡进行的肝脏细针穿刺活检（FNAB）研究，结合单细胞组学技术，深入评估了慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染患者的肝内免疫情况	首次在非洲地区将肝脏细针穿刺活检与单细胞RNA测序技术结合，用于评估HBV感染患者的肝内免疫反应	样本量相对较小，且仅在一个地区进行，可能无法完全代表整个非洲的HBV感染情况	深入了解非洲地区HBV感染的免疫学特征，为治愈策略提供信息	未接受过治疗的慢性HBV感染成人患者，包括有和无HIV共感染的患者，以及急性HBV感染患者	数字病理学	乙型肝炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	117例入组样本和47例纵向随访样本
3620	2025-03-22	Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans 2024-07-31, Bioscience reports IF:3.8Q2 DOI:10.1042/BSR20240768 PMID:38904098	研究论文	本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和免疫定位技术，对小鼠、大鼠和人类肾脏中的内皮素系统进行了全面分析	首次结合scRNA-seq和免疫定位技术，跨物种（小鼠、大鼠、人类）和性别分析肾脏内皮素系统的表达特征	商业抗体无法在所有物种中有效工作，RNA表达水平并不总是与蛋白质水平相关，需采用多种方法以确保研究的严谨性和可重复性	表征肾脏内皮素系统的表达特征，探讨其在慢性肾病病理生理和进展中的作用	小鼠、大鼠和人类肾脏样本	生物医学	慢性肾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫定位	NA	RNA测序数据、免疫定位数据	正常人类活检样本（两性）、啮齿动物肾脏样本