单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 3581 - 3600 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3581 2026-02-13
Electroacupuncture Slows Experimental Myopia Progression by Improving Retinal Mitochondrial Function: A Study Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-12, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,建立了透镜诱导型近视(LIM)及电针(EA)干预下豚鼠视网膜细胞的完整图谱,并揭示了EA通过改善视网膜线粒体功能来减缓实验性近视进展的潜在机制 首次在单细胞水平上建立了LIM和EA干预下豚鼠视网膜的综合图谱,并发现了EA通过上调视锥细胞和Müller胶质细胞中线粒体呼吸链相关基因(如COX3、ND4、ND2)的表达来改善视网膜线粒体功能,从而减缓近视进展 研究仅在豚鼠模型中进行,结果是否适用于人类近视尚需进一步验证;研究主要基于基因表达分析,功能验证实验相对有限 探索电针(EA)减缓实验性近视进展的潜在分子机制 透镜诱导型近视(LIM)的豚鼠模型 数字病理学 近视 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及LIM和EA处理的豚鼠视网膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3582 2026-02-13
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-12, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究探讨了年龄相关的细胞外基质硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞分化,揭示了其在肌肉再生障碍中的作用机制 首次结合单细胞RNA测序和体外基质工程,系统解析了年龄和基质硬度对肌肉干细胞分化的协同影响,并发现TRAIL通路在年龄相关纤维化群体中的特异性激活 研究主要基于体外模型和动物实验,人类肌肉组织的直接证据尚不充分;BAPN治疗的长期效果和副作用未深入评估 阐明年龄相关ECM硬化导致肌肉干细胞功能障碍的分子机制 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞 单细胞组学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻和年老肌肉干细胞在软/硬基质上的四组对比实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3583 2026-02-13
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序和流式细胞术,验证了骨髓中中央骨髓和骨内膜两个空间区室在炎症扰动下的特异性变化,揭示了I型干扰素反应如何影响间充质基质细胞的炎症表型,从而调节局部单核细胞动态 开发了一种可重复识别小鼠骨髓中7个关键中央骨髓和骨内膜群体的组合方法,并首次系统展示了不同扰动对骨髓区室的特异性影响,特别是I型干扰素反应在炎症中的作用机制 研究主要基于小鼠模型,人类骨髓区室的直接应用尚未验证;方法可能受技术限制,如单细胞测序的覆盖深度和流式细胞术的标记特异性 探究骨髓空间区室化在炎症和肿瘤响应中的重要性,开发分子和功能表征方法 小鼠骨髓中的造血干细胞和祖细胞(HSPC)以及基质细胞,特别是中央骨髓和骨内膜区室 单细胞组学 炎症相关疾病 scRNA-seq, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 跨多个小鼠品系的骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3584 2026-02-13
Activation of cGAS/STING Drives Inflammation and Cellular Senescence of Macrophages in Ovarian Endometrioma Induced by Endometriotic Cyst Fluid
2024-09, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究探讨了卵巢子宫内膜异位囊肿液通过激活cGAS/STING通路驱动巨噬细胞炎症和细胞衰老的机制,并验证了STING抑制剂H-151的治疗潜力 首次整合临床样本、单细胞测序及体内外模型,揭示OE液通过cGAS/STING通路导致卵巢功能下降的具体机制,并发现STING抑制剂H-151能有效缓解相关病理变化 未明确说明样本量大小或具体实验模型细节,机制研究可能仍需进一步验证 探究卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其分子机制 卵巢子宫内膜异位囊肿液、巨噬细胞、卵巢组织 数字病理学 卵巢子宫内膜异位症 单细胞测序、生物信息学分析、体内外实验模型 NA 测序数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3585 2026-02-13
Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges
2024-09, Advanced biology IF:3.2Q3
综述 本文综述了癌症类器官作为三维培养技术在癌症研究中的应用、优势、局限性和前景 介绍了四种主要癌症类器官类型,并讨论了单细胞RNA测序在探索癌症类器官中的最新应用 讨论了癌症类器官模型的局限性,包括其在模拟复杂肿瘤微环境方面的挑战 推动基础癌症研究向临床肿瘤治疗的转化,提高肿瘤药物开发成功率 癌症类器官模型 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3586 2026-02-13
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice
2024-09, Advanced biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,全面描述了雷公藤甲素诱导小鼠肾毒性的转录组图谱和细胞组成 首次在单细胞分辨率下系统解析雷公藤甲素诱导肾毒性的机制,揭示了肾单位上皮细胞的异质性反应、血管功能破坏以及免疫细胞损伤等新发现 研究仅基于小鼠模型,未在人体中进行验证;样本量相对有限;机制研究仍需进一步功能实验证实 阐明雷公藤甲素诱导肾毒性的分子机制和细胞类型特异性反应 小鼠肾脏组织 数字病理学 肾毒性 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 对照组和雷公藤甲素处理组小鼠肾脏组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3587 2026-02-13
The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma
2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了套细胞淋巴瘤中HSP90-MYC-CDK9网络是治疗耐药性的主要驱动力 首次在套细胞淋巴瘤中通过单细胞RNA测序分析揭示了从BTKi到CAR-T疗法的序贯耐药机制,并识别出HSP90AB1和CDK9作为早期驱动因子 样本量相对较小(25名患者的66个样本),且为观察性研究,需要进一步功能验证和临床试验确认 剖析套细胞淋巴瘤对BTKi和CAR-T疗法序贯耐药的潜在机制 套细胞淋巴瘤患者样本 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 25名患者的66个样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3588 2026-02-13
Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing
2023-Mar, Biophysics reviews IF:2.9Q2
综述 本文综述了空间转录组学中深度学习模型的应用,探讨了现有工具、挑战及未来方向 深入探讨深度学习在空间转录组学数据分析中的新兴应用,包括对齐、空间重建和空间聚类等前沿模型 深度学习模型在空间转录组学分析中仍处于早期阶段,应用范围有限且未充分探索 综述空间转录组学数据分析的现有工具,特别关注深度学习方法的进展与潜力 空间转录组学数据,包括基因表达谱和组织结构信息 数字病理学 NA 空间转录组学 深度学习 多模态数据(包括组织学图像、计数矩阵等) NA NA 空间转录组学 NA NA
3589 2026-02-13
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和RT-qPCR技术,发现体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞缺乏piRNA表达,与体内E13.5或更晚的性原细胞不同 首次揭示体外分化的mPGCLCs在特定时间点未激活piRNA通路,挑战了先前关于其作为研究胎儿piRNA通路模型的假设 研究仅针对第6天的mPGCLCs,未涵盖更长时间点的分化过程,且未深入探讨piRNA缺失的具体分子机制 评估体外分化的小鼠原始生殖细胞样细胞是否具备功能性piRNA通路,以验证其作为研究模型的适用性 小鼠原始生殖细胞样细胞(mPGCLCs)及其分化过程中的piRNA通路 发育生物学 NA 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 小RNA-seq NA RNA序列数据 多个第6天mPGCLC细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 小RNA-seq NA NA
3590 2026-02-13
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血液阶段从增殖型'细长体'向传播型'粗短体'的发育过程,重构了细胞周期进展和发育群体感应 首次通过单细胞转录组学在体外模型中系统解析了布氏锥虫异步发育过程中的转录动态和调控因子,并定位了粗短体细胞周期退出的精确阶段 研究基于体外诱导分化模型,可能无法完全模拟宿主体内的自然发育环境 解析布氏锥虫血液阶段发育分化的转录调控机制和细胞周期动态 布氏锥虫(Trypanosoma brucei) 单细胞组学 寄生虫感染(锥虫病) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 8,599个寄生虫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3591 2026-02-13
Application of single-cell transcriptomics to kinetoplastid research
2021-09, Parasitology IF:2.1Q2
综述 本文综述了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的应用,包括技术选择、样本制备和数据分析挑战 首次系统性地总结了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的潜力,并提供了实验设计和数据分析的实用指导 主要基于现有文献综述,缺乏原创实验数据,且技术应用仍处于早期阶段 探讨单细胞转录组学技术在动质体寄生虫研究中的应用潜力和方法学 动质体寄生虫(包括利什曼原虫、锥虫等)及其宿主相互作用 单细胞组学 寄生虫病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3592 2026-02-12
Consensus machine learning identifies cell death gene signature for carotid artery stenosis diagnosis
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法,开发了一个基于细胞死亡基因的共识诊断分类器,用于颈动脉狭窄的早期检测 首次整合了内部RNA-seq队列与八个公共数据集,结合十种机器学习算法构建了105个模型配置,并识别出IRF1、FYCO1和FDFT1组成的诊断签名,通过单细胞测序和功能实验验证了FYCO1的下调及其在自噬和炎症信号中的作用 研究依赖于多个公共数据集,可能存在批次效应或数据异质性,且样本量相对有限(共696个样本),需要进一步在独立队列中验证MLDS的临床适用性 开发一种分子工具以改善颈动脉狭窄的早期诊断 颈动脉狭窄患者样本及相关分子数据 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 蛋白质组学分析, RT-qPCR, 单细胞测序, 基因沉默实验 逻辑回归, 共识机器学习(结合十种算法) RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验验证数据 696个样本(整合一个内部队列和八个公共数据集) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学(未明确指定,但涉及单细胞分析) NA NA
3593 2026-02-12
Pre-operative risk assessment of HCC recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Feb-11, Clinical and molecular hepatology IF:14.0Q1
研究论文 本研究通过液体活检开发了一种基于无细胞DNA(cfDNA)拷贝数变异(CNA)特征的术前风险分层模型,用于预测肝细胞癌(HCC)患者肝移植后的复发风险 整合了cfDNA CNA特征与单细胞转录组数据,揭示了复发相关的cfDNA来源于肿瘤内特定恶性细胞亚群,并开发了结合传统临床因素和cfDNA CNA特征的ZJU Criteria风险预测工具 研究样本量相对有限(260例),且依赖于多中心数据,可能存在异质性 开发一种基于液体活检的术前风险分层模型,以预测HCC患者肝移植后的复发风险 260例HCC患者,包括临床数据、血浆cfDNA、匹配的肿瘤和非肿瘤组织 数字病理学 肝细胞癌 低覆盖度全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 风险分层模型(ZJU Criteria) 基因组数据、转录组数据、空间数据 260例HCC患者 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序, 全外显子测序 NA NA
3594 2026-02-12
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-Feb-11, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 首次使用数字空间谱分析技术,在混合肿瘤中识别出区分过渡巢与其他亚型的关键差异表达基因CK13和SCCA2,并揭示了BCL-2在基底样细胞中的表达模式 样本量有限,仅对4例病例进行了DSP分析,未来需要更大规模的研究来指导临床决策 阐明子宫颈腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系,以指导有效的治疗策略 20例子宫颈腺样基底癌病例,其中多数伴有鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 数字病理学 宫颈癌 空间转录组学,免疫组织化学 NA 空间转录组数据,组织学图像 20例ABC病例,其中4例进行了DSP分析 NA 空间转录组学 NA 数字空间谱分析
3595 2026-02-12
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性网络,并鉴定出SERPINE1和STK3作为预后生物标志物和治疗靶点 首次系统整合了机器学习、空间转录组学、单细胞RNA测序和分子对接模拟,全面解析了BaP诱导的毒性分子网络,并识别出核心毒性靶点 研究主要基于公共数据库和计算分析,缺乏体内实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 阐明苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性机制,并寻找预后生物标志物和治疗靶点 头颈鳞状细胞癌患者样本及相关分子数据 生物信息学 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 分子对接, 分子动力学模拟 随机森林, 支持向量机 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 GSE30784数据集和TCGA-HNSC队列(具体样本数未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
3596 2026-02-12
Distinct mural cells and fibroblasts drive fibrochondrogenesis in retrodiscal tissue following temporomandibular joint disc displacement
2026-Feb-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用猪模型和单细胞RNA测序技术,揭示了颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞和分子机制,并筛选出潜在治疗化合物 首次通过单细胞RNA测序识别了盘后组织重塑中的关键成纤维细胞亚群FB2和壁细胞亚群MC4,并揭示了它们通过FGF2/BMP5信号通路的互作机制 研究基于猪模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 探究颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞动力学和分子机制 猪颞下颌关节盘前移位模型中的盘后组织 单细胞组学 颞下颌关节疾病 单细胞RNA测序 P-NET, Seurat 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3597 2026-02-12
The single-cell transcriptional landscape of the pediatric cystic fibrosis lung from minimally invasive respiratory specimens
2026-Feb-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了儿童囊性纤维化肺部存在以中性粒细胞为主的失调性炎症和促炎性气道上皮细胞状态 首次在儿童囊性纤维化患者中,利用微创呼吸道标本进行单细胞转录组分析,揭示了疾病早期的共同病理程序 样本量较小(仅包含一名婴儿和一名青少年),且为观察性研究,难以确定因果关系 探究儿童囊性纤维化肺部的细胞组成、功能和细胞间通讯的异常变化 儿童囊性纤维化患者的呼吸道标本 单细胞转录组学 囊性纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 2名儿童囊性纤维化患者(一名婴儿和一名青少年) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3598 2026-02-12
Identifying 3D signal overlaps in spatial transcriptomics data with ovrlpy
2026-Feb-10, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为ovrlpy的计算工具,用于识别空间转录组学数据中的三维信号重叠,以解决细胞分割中的空间双重问题 开发了ovrlpy工具,首次通过分析三维转录本定位来识别重叠细胞、组织折叠和不准确的细胞分割 NA 解决成像空间转录组学中细胞分割在垂直维度上的空间双重问题,提高转录本分配的准确性 空间转录组学数据中的三维信号重叠 空间转录组学 NA 成像空间转录组学 NA 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3599 2026-02-12
Sustainable Cultivation of Rare and Endangered Medicinal Plant Multicellular Spheroids Producing Bioactive Therapeutics for Alcohol-Related Liver Disease Therapy
2026-Feb-10, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本研究开发了一种基于多细胞球体的培养策略,利用药用植物细胞高效生产生物活性代谢物,以濒危物种雪莲为例,并评估其在酒精相关肝病治疗中的潜力 首次采用多细胞球体培养策略可持续生产濒危药用植物的生物活性代谢物,结合单细胞转录组学和网络药理学系统解析其药理作用 研究主要基于体外和小鼠模型,尚未进行人体临床试验,且代谢物生产的长期稳定性和规模化可行性需进一步验证 开发可持续的生物制造方法,生产濒危药用植物的生物活性化合物,并探索其在酒精相关肝病治疗中的应用 雪莲(Saussurea involucrata)植物细胞及其衍生的次级代谢物 植物生物技术 酒精相关肝病 单细胞转录组学、超高效液相色谱-质谱联用、网络药理学 NA 转录组数据、代谢组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3600 2026-02-12
Inflammatory cytokines mediate thoracic aortic aneurysm formation via plasma metabolites: A two-step Mendelian randomization and single cell sequencing-based investigation
2026-Feb-06, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞测序分析,揭示了炎症细胞因子通过血浆代谢物介导胸主动脉瘤形成的因果关联 首次结合双向两样本孟德尔随机化、两步孟德尔随机化中介分析和单细胞测序技术,系统性地研究了炎症细胞因子、血浆代谢物与胸主动脉瘤风险之间的因果关系及潜在机制 研究结果需要在更多样化的人群中进行验证,且中介分析的机制有待进一步实验阐明 阐明炎症细胞因子、血浆代谢物与胸主动脉瘤风险之间的潜在因果关联及作用机制 炎症细胞因子、血浆代谢物、胸主动脉瘤 生物信息学 心血管疾病 孟德尔随机化分析,单细胞测序 逆方差加权法 基因组关联研究数据,单细胞测序数据 炎症细胞因子数据涉及14,824人,血浆代谢物数据涉及8,299人,胸主动脉瘤数据涉及385,857人 NA 单细胞测序 NA NA
回到顶部