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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3581 | 2026-04-06 |
Integrated single‑cell and spatial transcriptomics reveal the colorectal cancer microenvironment
2026-Apr-01, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105311
PMID:41933856
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综述 | 本文综述了单细胞测序与空间转录组学整合技术在结直肠癌研究中的应用,揭示了肿瘤微环境的异质性及潜在治疗靶点 | 整合单细胞测序与空间转录组学技术,系统揭示了结直肠癌微环境中空间组织的肿瘤-基质-免疫网络及其功能机制 | 作为综述文章,主要总结现有研究,未提出新的实验数据或模型验证 | 解析结直肠癌的生物学特性、临床行为及肿瘤微环境,以推进精准诊疗 | 结直肠癌组织及其微环境中的细胞(包括肿瘤细胞、基质细胞、免疫细胞等) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3582 | 2026-04-06 |
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09932-0
PMID:41906042
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组技术解析了猪早期雌性性腺中原始生殖细胞向卵原细胞分化及进入减数分裂过程中的细胞类型空间动态 | 首次结合高分辨率空间转录组技术,在体内解析了猪早期性腺中生殖细胞与体细胞间的空间定位及通讯机制,特别是BMP信号通路在原始生殖细胞向卵原细胞分化及减数分裂启动中的关键作用 | 研究仅聚焦于猪模型,结果可能不完全适用于其他哺乳动物;空间转录组技术虽提供位置信息,但分辨率可能仍有限于某些精细细胞互作 | 探究猪早期雌性性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞分化及减数分裂的空间调控机制 | 猪早期雌性性腺中的原始生殖细胞、性腺体细胞(包括颗粒细胞、间质细胞和内皮细胞) | 空间转录组学 | NA | 高分辨率空间转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3583 | 2026-04-06 |
Single-cell RNA sequencing dissect the immunological network of immune checkpoint inhibitors-induced myocarditis
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag025
PMID:41934610
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探索了免疫检查点抑制剂(ICIs)诱导心肌炎的潜在机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术,在心脏组织和外周血单核细胞中,系统解析了PD-1/PD-L1抑制剂诱导心肌炎的免疫网络,并识别出CCL5+CD8+ T细胞与CCR5+巨噬细胞相互作用的轴心机制 | 研究基于小鼠模型,样本量较小,且仅使用了一种PD-1/PD-L1抑制剂(BMS-1),未涉及人类样本或其他抑制剂 | 探索免疫检查点抑制剂(ICIs)诱导心肌炎的免疫机制 | 小鼠的心脏组织和外周血单核细胞(PBMC) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 小鼠心脏组织和PBMC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3584 | 2026-04-06 |
Ventricular assist device unloading reverses microvascular senescence in single ventricle disease
2026-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00790-x
PMID:41781666
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,探讨了左心发育不全综合征患者右心室微环境在出生、手术后心力衰竭及心室辅助装置卸载后的变化,揭示了心肌细胞内在衰老及微血管衰老生态位的特征 | 首次在单心室疾病中结合单核RNA测序和空间转录组学,系统描绘了从出生到心力衰竭及心室辅助装置卸载过程中的心脏微环境动态变化,并发现心肌细胞内在衰老特性及缺氧相关的微血管衰老生态位 | 研究样本可能有限,且主要聚焦于左心发育不全综合征,结果推广至其他单心室疾病需谨慎 | 探究左心发育不全综合征患者心脏微环境在疾病进程中的变化,以及心室辅助装置卸载对微血管衰老的影响 | 左心发育不全综合征患者的右心室组织及诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3585 | 2026-02-28 |
Integrative analysis of single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing, and proteomic data identified NOTCH3 as a hub gene contributing to human intervertebral disc fibrosis
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40696-z
PMID:41748750
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3586 | 2026-04-06 |
Integrating Single-Cell and Microarray Data to Explore the Role of Autophagy-Related Gene Atg7 in Osteoporosis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S579167
PMID:41884166
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据,探索自噬相关基因Atg7在骨质疏松症中的作用 | 首次结合单细胞转录组学和芯片数据筛选骨质疏松相关自噬基因,并利用细胞通讯和伪时间分析揭示Atg7与EYA1间充质干细胞亚群的关系 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足,且临床转化潜力需进一步探索 | 探索自噬相关基因Atg7在骨质疏松症发生发展中的调控机制及其治疗潜力 | 骨质疏松症小鼠模型(OVX小鼠)的骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列芯片、微CT、免疫组化、双标三色荧光技术、qRT-PCR、Western blot | 伪时间轨迹分析、细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据、微阵列芯片数据、影像数据、蛋白质表达数据 | 未明确样本数量,使用OVX小鼠模型及正常对照小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3587 | 2026-04-06 |
A Single-Cell Atlas of Pan-Cancer Liver Metastasis Reveals Dynamic Cellular Programs Driving Metastatic Progression and Immune Modulation
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1208
PMID:41884334
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研究论文 | 本研究构建了一个跨多种癌症类型的肝转移单细胞转录组图谱,揭示了驱动转移进展和免疫调节的动态细胞程序 | 首次在泛癌水平上系统描绘肝转移的细胞和分子景观,定义了4个代表性细胞程序,阐明了肿瘤微环境中细胞组成和细胞间相互作用如何驱动转移进展和免疫调节的动态转变 | 研究基于单细胞RNA测序数据,可能受限于样本数量和癌症类型的覆盖范围,未深入验证功能机制 | 理解肝转移的异质性和演化机制,为靶向转移肿瘤微环境的治疗策略提供信息 | 肝转移样本中的细胞 | 数字病理学 | 肝转移癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100个单细胞RNA测序样本,超过460,000个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3588 | 2026-04-06 |
PD-1/PD-L1-CXCR3 Coexpression and CXCR3 on Intermediate Monocytes Predict Fibrosis, Leukemic Transformation, and Survival in Egyptian Philadelphia-Negative Myeloproliferative Neoplasms
2026, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549261431360
PMID:41884604
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研究论文 | 本研究旨在探索PD-1/PD-L1-CXCR3共表达及CXCR3在中性单核细胞上的表达作为预测埃及费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤患者纤维化、白血病转化和生存的新型生物标志物的效用 | 首次将PD-1/PD-L1与CXCR3的共表达以及CXCR3在单核细胞亚群(特别是中间单核细胞)上的表达作为预测MPN疾病进展、纤维化分级和白血病转化的新型免疫炎症生物标志物,并构建了整合这些生物标志物的增强预后评分系统 | 研究人群仅限于埃及患者,样本量相对有限(n=90),外部验证队列规模较小(n=30),需要更大规模的多中心研究进行验证 | 评估新型免疫炎症生物标志物(包括PD-1/PD-L1-CXCR3共表达、CXCR3在单核细胞亚群的表达及系统性炎症指数)在预测费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤患者纤维化分级、白血病转化和生存结局中的预后价值 | 90名埃及费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤患者及90名匹配对照 | 数字病理学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 流式细胞术, 靶向二代测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清细胞因子分析 | 逻辑回归, Cox回归, 随机森林, 梯度提升 | 流式细胞数据, 测序数据, 临床数据, 患者报告结局 | 患者队列90人,对照组90人,外部验证队列30人,单细胞RNA测序子集15人(10名PMF患者,5名对照),批量RNA测序子集30人(20名PMF患者,10名对照) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3589 | 2026-04-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of human fetal neural stem cells isolated from the subventricular zone
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1740851
PMID:41884782
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,深入表征了从胎儿大脑室下区分离的人类神经干细胞,揭示了其亚群组成、分化轨迹及长期培养中的稳定性 | 首次对从胎儿大脑室下区分离的人类神经干细胞进行单细胞转录组分析,揭示了其亚群组成、分化轨迹以及长期培养中干细胞特性的保持 | 样本来源于自发流产的胎儿,可能无法完全代表正常发育情况,且样本数量有限 | 旨在解析人类胎儿神经干细胞的细胞组成和分化动态,以促进再生医学应用 | 从胎儿大脑室下区分离的人类神经干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自不同捐赠者的胎儿大脑样本(自发流产来源),并经过不同培养传代 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3590 | 2026-04-06 |
The role of disulfidptosis-driven tumor microenvironment remodeling in pancreatic cancer progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1747560
PMID:41884834
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于13个关键基因的二硫死亡相关预后特征,用于胰腺导管腺癌患者的风险分层,并通过多组学分析揭示了二硫死亡与免疫抑制性肿瘤微环境之间的关联 | 首次在胰腺癌中开发了基于二硫死亡相关基因的预后特征,并通过整合多组学方法(包括单细胞转录组学和空间转录组学)系统性地揭示了二硫死亡在肿瘤免疫调节中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验,缺乏体内实验验证;UBASH3B在免疫调节中的具体机制仍需进一步研究 | 探究二硫死亡在胰腺癌进展和肿瘤免疫中的作用,并开发基于二硫死亡相关基因的预后模型 | 胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 功能实验 | 预后特征模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 多个独立队列的胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3591 | 2026-04-06 |
Plasma PFDN2 suppresses head and neck squamous cell carcinoma progression by restricting CD64 on monocyte-driven inflammatory microenvironments
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791776
PMID:41884853
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研究论文 | 本研究通过多样本孟德尔随机化分析,发现血浆蛋白PFDN2通过抑制单核细胞上的CD64来限制头颈部鳞状细胞癌的进展 | 首次将血浆蛋白PFDN2与HNSC风险通过单核细胞CD64介导的免疫微环境联系起来,并利用虚拟敲除和分子模拟验证其相互作用 | 研究主要基于遗传关联和计算模拟,需要更多实验验证PFDN2-CD64轴的功能机制 | 探究血浆蛋白对头颈部鳞状细胞癌免疫微环境的因果调控作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本、血浆蛋白质组、免疫细胞表型 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、免疫荧光染色 | scTenifoldKnk虚拟敲除模型 | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、组织病理数据 | 大规模血浆蛋白质组和HNSC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3592 | 2026-04-06 |
Macrophages protect against sensory axon loss in peripheral neuropathy
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08535-1
PMID:39939762
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在肥胖前驱糖尿病小鼠模型中对周围神经病变中感觉轴突丢失的保护作用 | 首次揭示了CCR2巨噬细胞在肥胖前驱糖尿病诱导的周围神经病变早期浸润神经并发挥神经保护作用,通过galectin 3延缓轴突退化 | 研究基于小鼠模型,结果在人类患者中的适用性尚需验证,且未详细探讨巨噬细胞保护作用的具体分子机制 | 研究肥胖前驱糖尿病条件下周围神经病变的发病机制及免疫细胞的作用 | 高脂高果糖饮食诱导的肥胖前驱糖尿病小鼠模型 | NA | 周围神经病变 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3593 | 2026-04-06 |
Creatine promotes endometriosis progression by inducing M2 polarization of peritoneal macrophages
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0278
PMID:39679878
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研究论文 | 本研究揭示了肌酸通过诱导腹膜巨噬细胞M2极化,促进子宫内膜异位症的血管生成、纤维化和病变进展 | 首次发现肌酸在子宫内膜异位症中通过重编程巨噬细胞M2极化发挥关键免疫调节作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据分析,缺乏体内模型的直接验证 | 探讨肌酸在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的腹膜巨噬细胞、子宫内膜基质细胞和HUVECs | 单细胞测序 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 单细胞测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3594 | 2026-04-06 |
Transcriptome and DNA methylation profiling during the NSN to SN transition in mouse oocytes
2025-Jan-03, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00527-3
PMID:39754059
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和DNA甲基化分析,表征了小鼠卵母细胞从非环绕核仁到环绕核仁阶段的转录组和DNA甲基化变化 | 开发了一种基于转录组数据的分类器,可用于推断单细胞或批量RNA-seq数据中的染色质状态,并识别了与异常染色质修饰组合相关的晚期甲基化区域 | 研究仅基于小鼠模型,可能不直接适用于其他物种,且单细胞技术可能存在技术变异 | 探究小鼠卵母细胞在NSN到SN过渡期间的转录组和DNA甲基化动态变化 | 小鼠卵母细胞,特别是GV期卵母细胞,根据核染色分为NSN和SN阶段 | 表观遗传学 | NA | 单细胞M&T-seq(scM&T-seq)、scRNA-seq、sc-bisulphite-seq(scBS-seq)、Hoechst染色、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | 分类器(基于转录组数据) | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、染色质修饰数据 | 未明确指定样本数量,但涉及多个已发表数据集的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 3595 | 2026-04-06 |
CD206+ Trem2+ macrophage accumulation in the murine knee joint after injury is associated with protection against post-traumatic osteoarthritis in MRL/MpJ mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312587
PMID:39752388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了小鼠膝关节损伤后免疫细胞变化与创伤后骨关节炎(PTOA)易感性之间的关系 | 首次在PTOA易感性和抵抗性小鼠模型中,通过单细胞RNA测序揭示了CD206+ Trem2+巨噬细胞在关节损伤后的积累与保护作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证,且样本量相对较小 | 探究创伤后骨关节炎(PTOA)发展或缓解的分子机制 | PTOA易感的C57BL/6J(B6)小鼠和PTOA抵抗的MRL/MpJ(MRL)小鼠的滑膜关节 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种小鼠品系(B6和MRL)的膝关节样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3596 | 2026-04-06 |
Dissecting the molecular mechanisms of T cell infiltration in psoriatic lesions via cell-cell communication and regulatory network analysis
2025, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1231
PMID:41883387
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞间通讯分析,揭示了银屑病皮损中T细胞浸润的分子机制,并发现姜黄素类似物CuE通过抑制IL-6-STAT3-MDK信号轴缓解症状 | 首次结合单细胞RNA测序、假时间分析、细胞间通讯分析和调控网络分析,系统解析了银屑病中成纤维细胞通过MDK信号介导T细胞募集的机制,并验证了CuE通过靶向该信号轴的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外分析,人体组织样本的验证可能有限;信号通路的上下游调控细节有待进一步阐明 | 阐明银屑病皮损中T细胞浸润的细胞间通讯机制和调控网络,并探索潜在的治疗靶点 | 银屑病皮肤组织(小鼠模型及可能的人体样本)、T细胞、成纤维细胞、内皮细胞、黑色素细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3597 | 2026-04-06 |
Rhythmic IL-17 production by γδ T cells maintains adipose de novo lipogenesis
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08131-3
PMID:39478228
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研究论文 | 本研究揭示了γδ T细胞通过昼夜节律性产生IL-17来维持脂肪组织从头脂肪生成,从而影响全身代谢稳态 | 首次发现IL-17产生的γδ T细胞依赖分子钟维持脂肪组织稳态,并揭示IL-17在全身代谢节律中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证 | 探究免疫系统昼夜节律在组织稳态中的作用,特别是IL-17产生细胞对脂肪代谢的影响 | 小鼠的γδ T细胞、iNKT细胞、MAIT细胞及脂肪组织 | 免疫学与代谢研究 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、分子钟报告基因、遗传操作、全身代谢分析 | NA | RNA测序数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3598 | 2026-04-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538498
PMID:37163077
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研究论文 | 本文开发了一种名为iAssembloids的3D共培养系统,结合CRISPRi筛选技术,用于研究神经元与胶质细胞之间的相互作用机制 | 首次将iAssembloids系统与大规模CRISPRi筛选结合,揭示了在3D共培养环境中GSK3β抑制NRF2介导的氧化应激反应的新机制,这在2D单培养神经元筛选中未被发现 | 研究基于体外3D模型,可能无法完全模拟体内大脑的复杂环境,且样本规模可能有限 | 阐明神经元与胶质细胞在脑健康和疾病中的相互作用机制 | 神经元和胶质细胞(包括星形胶质细胞) | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、CRISPRi筛选、免疫组织化学 | iAssembloids(诱导多谱系组装体) | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3599 | 2026-04-06 |
aKNNO: single-cell and spatial transcriptomics clustering with an optimized adaptive k-nearest neighbor graph
2024-Aug-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03339-y
PMID:39090647
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研究论文 | 本文介绍了一种名为aKNNO的新方法,用于单细胞和空间转录组学数据聚类,通过优化的自适应k近邻图同时识别丰富和稀有细胞类型 | aKNNO通过自适应k近邻图优化,克服了传统方法在识别稀有细胞类型时性能下降的问题,实现了对丰富和稀有细胞类型的准确同时识别 | NA | 开发一种能同时准确识别丰富和稀有细胞类型的单细胞和空间转录组学聚类方法 | 单细胞和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 自适应k近邻图 | 基因表达数据 | 38个模拟数据集和20个单细胞及空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3600 | 2026-04-06 |
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1336135
PMID:38690527
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研究论文 | 本文介绍了PAGER-scFGA工具,用于通过单细胞功能基因组学分析揭示细胞轨迹中的细胞功能和分子机制 | 开发了PAGER-scFGA工具,整合细胞功能注释和基因集富集分析到单细胞分析流程中,支持细胞轨迹的功能探索和基因网络构建 | NA | 促进细胞群的功能注释和细胞轨迹分子机制的表征 | 小鼠自然杀伤细胞 | 单细胞功能基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |