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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-30 | 
         Decidual cell invasion and decidualization at the trophoblast-decidual interaction in the progression of cesarean scar pregnancy 
        
          2025-Oct-25, Journal of reproductive immunology
          
          IF:2.9Q2
          
         
        
          DOI:10.1016/j.jri.2025.104747
          PMID:41151220
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠中蜕膜细胞侵袭和蜕膜化过程中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示CSP中蜕膜细胞KISS1表达下调及其通过PI3K/AKT信号通路影响细胞侵袭迁移的机制 | 样本量有限,未涉及其他潜在信号通路的研究 | 阐明KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠进展过程中对蜕膜细胞侵袭过程的作用 | 剖宫产瘢痕妊娠和正常早孕宫内妊娠的蜕膜组织样本 | 单细胞测序分析 | 剖宫产瘢痕妊娠 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, qRTPCR, Western blotting, RNA干扰, RNA-seq, 荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | CSP和正常早孕宫内妊娠的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA | 
| 342 | 2025-10-30 | 
         Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning 
        
          2025-Oct-24, Biochemical and biophysical research communications
          
          IF:2.5Q3
          
         
        
          DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
          PMID:41151411
         
       | 
      
      研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习,系统识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次整合多组学数据识别FGL1作为AS-CAD的新型生物标志物,并通过单细胞测序解析其细胞来源 | 样本量有限,需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后价值 | AS-CAD患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序,机器学习,ELISA,免疫组化,Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,临床数据 | AS-CAD患者组织样本,独立临床队列,多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA | 
| 343 | 2025-10-30 | 
         Interrogation of the cellular hierarchies reveals neoplastic evolution and therapeutic vulnerability in craniopharyngioma 
        
          2025-Oct-24, Neuro-oncology
          
          IF:16.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1093/neuonc/noaf249
          PMID:41159376
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示颅咽管瘤的细胞层级结构和肿瘤演化过程 | 首次在单细胞和空间水平揭示颅咽管瘤的肿瘤编程和演化,识别出PCP和RCC之间的疾病谱系连续性 | 研究样本数量有限,动物模型结果需要进一步临床验证 | 阐明颅咽管瘤的发病机制和肿瘤演化过程 | 颅咽管瘤(包括ACP、PCP亚型)和Rathke裂囊肿 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,离体垂体培养 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA | 
| 344 | 2025-10-30 | 
         Acquisition of an immunosuppressive microenvironment after anti-CD19 CAR T-cell therapy is associated with T-cell dysfunction and resistance 
        
          2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1136/jitc-2025-011768
          PMID:41135951
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析,揭示了抗CD19 CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境获得免疫抑制特性与T细胞功能障碍和治疗抵抗的关联 | 首次在单细胞水平系统揭示了CAR-T治疗后肿瘤微环境的动态变化,发现髓系细胞激活、干扰素反应、缺氧和TGF-β信号通路在驱动免疫抑制中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要在动物模型中进行,人类样本中的直接证据仍需进一步确认 | 探究CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境的变化及其对治疗反应的影响 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者和造血干细胞/祖细胞人源化小鼠模型 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | B-ALL患者治疗前后骨髓样本,人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 345 | 2025-10-30 | 
         TRIM28 drives immune evasion via PARP1 SUMOylation and NAD+ depletion in clear cell renal cell carcinoma 
        
          2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1136/jitc-2025-013025
          PMID:41135953
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了TRIM28通过调控PARP1稳定性和NAD+代谢重编程促进肾透明细胞癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现TRIM28通过双重免疫代谢机制驱动免疫逃逸:稳定PARP1并促进其SUMO化,以及通过NAD+耗竭削弱CD8+ T细胞功能 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索肾透明细胞癌中免疫检查点阻断疗法疗效有限的机制 | 肾透明细胞癌细胞模型、CD8+ T细胞、患者来源异种移植模型 | 癌症免疫学 | 肾癌 | 单细胞转录组学、RNA-seq、代谢组学、质谱分析、虚拟筛选 | Geneformer | 转录组数据、代谢组数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE159115数据集 | 
| 346 | 2025-10-30 | 
         Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma 
        
          2025-Oct-22, Biochemical and biophysical research communications
          
          IF:2.5Q3
          
         
        
          DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
          PMID:41151408
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制的关联机制 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 347 | 2025-10-30 | 
         Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels 
        
          2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
        
          DOI:10.1101/2025.04.25.650540
          PMID:40654702
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了13线地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子机制 | 发现视锥细胞不仅来源于早期神经源性祖细胞,还来源于晚期神经源性祖细胞,这一过程由转录因子表达的异时性转变驱动 | 研究仅针对13线地松鼠,未在其他物种中验证 | 探索视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 | 13线地松鼠视网膜发育过程 | 发育生物学 | 视力障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA | 
| 348 | 2025-10-30 | 
         Enhanced RNA Preservation in Mouse Brain Tissue: A Strategy Combining Cardiac Perfusion with Hypersaline Immersion 
        
          2025-Oct-21, ACS omega
          
          IF:3.7Q2
          
         
        
          DOI:10.1021/acsomega.5c05379
          PMID:41141763
         
       | 
      
      研究论文 | 开发了一种结合心脏灌注和高渗盐水浸泡的策略,用于增强小鼠脑组织RNA保存效果 | 首次将心脏灌注与高渗盐水浸泡相结合,建立了标准化的RNA保存框架,显著延长了RNA在组织切片中的完整性保持时间 | 仅在小鼠脑组织中验证,未在其他组织类型或物种中测试 | 解决空间转录组学研究中RNA降解问题,建立标准化的RNA保存方法 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,RNA完整性检测 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 349 | 2025-10-30 | 
         Commentary: Toward a global atlas of ocular surface biology: Rationale, design, and clinical applications 
        
          2025-Oct-21, Experimental eye research
          
          IF:3.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.exer.2025.110705
          PMID:41130333
         
       | 
      
      评论 | 提出构建全球眼表生物学图谱的倡议,通过整合多组学技术系统解析眼表组织在健康和疾病状态下的生物学特征 | 首次提出建立全球眼表生物学图谱,采用单细胞和空间组学技术系统解析眼表微环境动态,并制定了临床转化路线图 | NA | 构建全面的眼表生物学图谱,推动精准眼科诊断和治疗 | 眼表组织(角膜、结膜、泪膜装置)及其微环境 | 数字病理 | 眼科疾病 | 单细胞/单核RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学, 泪液蛋白质组学/代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA | 
| 350 | 2025-10-30 | 
         Single-cell and spatial transcriptomics reveal intratumor heterogeneity and immune evasion in natural killer/T cell lymphoma 
        
          2025-Oct-17, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.isci.2025.113626
          PMID:41142990
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和免疫逃逸机制 | 首次在NKTCL中鉴定出五个具有不同功能通路、分化轨迹和空间分布的恶性元程序亚群,并发现FABP5抑制剂可下调c-Myc抑制肿瘤生长 | NA | 探究自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境相互作用 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 351 | 2025-10-30 | 
         Deciphering the cellular tumor microenvironment landscape in salivary gland carcinomas using multiplexed imaging mass cytometry 
        
          2025-Oct-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
          
          IF:11.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s13046-025-03551-z
          PMID:41083996
         
       | 
      
      研究论文 | 利用多重成像质谱流式技术解析唾液腺癌肿瘤微环境的细胞景观 | 首次在唾液腺癌中应用13标志物成像质谱流式技术进行空间单细胞分析,发现基质癌相关成纤维细胞(mCAF)与内皮细胞的空间相互作用与转移相关 | 样本量相对有限(54例),空间转录组数据仅包含3例病例 | 空间表征唾液腺癌单细胞肿瘤微环境并鉴定预后生物标志物 | 唾液腺癌患者组织样本,包括唾液腺导管癌、腺泡细胞癌、黏液表皮样癌和分泌性癌 | 数字病理 | 唾液腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,RNA测序 | CAF算法,空间分析,Cox回归分析 | 多通道图像数据,单细胞数据,RNA测序数据 | 54例原发灶和淋巴结转移病例,验证队列包含67例唾液腺导管癌病例 | NA | 成像质谱流式,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | 13标志物成像质谱流式面板 | 
| 352 | 2025-10-30 | 
         EED226 treatment targets key immune genes to suppress LPS response in Chinese tongue sole splenocytes 
        
          2025-Oct-10, Fish & shellfish immunology
          
          IF:4.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.fsi.2025.110927
          PMID:41076212
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探索EED226通过靶向关键免疫基因抑制中华半滑舌鳎脾细胞中LPS诱导的免疫反应 | 首次在硬骨鱼中揭示EED蛋白及其抑制剂EED226的免疫调节功能,发现跨物种保守的EED靶向治疗潜力 | 研究局限于中华半滑舌鳎这一特定鱼种,未验证其他硬骨鱼类的适用性 | 探究表观遗传机制在硬骨鱼LPS免疫应答中的调控作用 | 中华半滑舌鳎脾细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序,转录组分析,定量RT-PCR,系统发育分析 | NA | 基因表达数据,序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 353 | 2025-10-30 | 
         Linking ion channel gene expression to neuronal firing patterns through a statistical-biophysical model 
        
          2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
          
         
        
          DOI:10.1016/j.patter.2025.101390
          PMID:41142910
         
       | 
      
      研究论文 | 通过统计生物物理模型建立离子通道基因表达与神经元放电模式之间的定量联系 | 开发了基于生物物理模拟和现代机器学习技术的新型统计生物物理模型 | NA | 建立转录组特性与生理特性之间的机制联系 | 神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理记录, 形态学重建 | 统计生物物理模型, 机器学习 | 基因表达数据, 电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 354 | 2025-10-30 | 
         Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types 
        
          2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
          
         
        
          DOI:10.1016/j.patter.2025.101323
          PMID:41142913
         
       | 
      
      研究论文 | 开发了一种结合统计和机制模型的混合建模方法,通过基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的机制模型相结合,通过可解释的线性稀疏回归模型将基因表达与生物物理模型参数联系起来 | 模型与数据之间存在不匹配问题,需要克服这一挑战 | 建立基因表达与神经元生理特性之间的联系 | 多种皮层细胞类型 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学,仿真推断,多模态Patch-seq数据 | Hodgkin-Huxley模型,线性稀疏回归模型 | 基因表达数据,电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 355 | 2025-10-30 | 
         Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response 
        
          2025-Oct, Journal of hepatology
          
          IF:26.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
          PMID:40220905
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了肿瘤源性可溶性CD109通过重编程肿瘤相关巨噬细胞抑制免疫反应的机制 | 首次发现sCD109作为'分泌性免疫检查点'通过双重机制调控CD73表达,并证明CD109与PD-L1双重阻断可增强免疫治疗效果 | 研究主要在临床前模型中进行,需要进一步临床验证 | 探索iCCA免疫抑制机制并开发新的免疫治疗靶点 | 肝内胆管癌(iCCA)及其肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式细胞术、RNA测序、质谱分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | 
| 356 | 2025-10-30 | 
         Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence 
        
          2025-Oct, Expert review of clinical immunology
          
          IF:3.9Q2
          
         
        
          DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
          PMID:40999941
         
       | 
      
      综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群,包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞 | 尚未将机制发现与靶向治疗完全衔接,需要改进动物模型和开展转化研究 | 探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞、成纤维细胞等免疫细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA | 
| 357 | 2025-10-30 | 
         RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease 
        
          2025-Oct-01, Inflammatory bowel diseases
          
          IF:4.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1093/ibd/izaf159
          PMID:40876844
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究报道了一例由RELA单倍体不足引起的克罗恩病非典型表型病例,通过基因组学和免疫学分析揭示了其发病机制 | 首次将RELA单倍体不足与克罗恩病样表型联系起来,揭示了Th1/Th17极化和干扰素驱动炎症的新机制 | 单病例研究,样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 表征由RELA单倍体不足驱动的非典型克罗恩病样表型的临床、基因组和免疫学特征 | 一名17岁男性患者,诊断为全肠克罗恩病伴肛周瘘管、慢性皮肤黏膜念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 | 医学遗传学 | 克罗恩病 | 全外显子组测序, Sanger测序, 蛋白质建模, Western blotting, 免疫荧光, NF-κB激活试验, 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA | 
| 358 | 2025-10-30 | 
         Immunophenotypic changes in the tumor and tumor microenvironment during progression to multiple myeloma 
        
          2025-Oct, PLoS genetics
          
          IF:4.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1371/journal.pgen.1011848
          PMID:41056512
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞分析研究多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤细胞和肿瘤微环境的免疫表型变化 | 首次在未分选的骨髓单核细胞样本中结合单细胞RNA测序、表面蛋白分析和B淋巴细胞抗原受体分析,构建了骨髓微环境的细胞图谱 | 样本量相对有限,需要进一步验证研究结果 | 研究多发性骨髓瘤前驱疾病向活动性疾病进展过程中的细胞和分子机制 | 健康志愿者和单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤、多发性骨髓瘤患者 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 表面蛋白分析, B淋巴细胞抗原受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白表达数据 | 123名受试者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 359 | 2025-10-30 | 
         Liquid Biopsy-Multiomics Link Adhesion Pathway Dysregulation to Kidney Injury Severity 
        
          2025-Oct, Kidney international reports
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.ekir.2025.07.021
          PMID:41141506
         
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      研究论文 | 本研究通过液体活检多组学分析揭示细胞粘附通路失调与急性肾损伤严重程度的关联 | 首次结合尿液蛋白质组学、血浆蛋白质组学和尿液沉淀单细胞转录组学,系统识别严重急性肾损伤的细胞特异性机制 | 样本量相对有限,特别是单细胞转录组学样本仅40例 | 预测急性肾损伤严重结局并探索其分子机制 | COVID相关和非COVID相关的急性肾损伤患者 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 蛋白质组学,单细胞转录组学,机器学习 | 随机森林 | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 169例尿液蛋白质组学样本,437例血浆蛋白质组学样本,40例尿液沉淀单细胞转录组学样本 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA | 
| 360 | 2025-10-30 | 
         Single-cell multi-omic and spatial profiling of esophageal squamous cell carcinoma reveals the immunosuppressive role of GPR116+ pericytes in cancer metastasis 
        
          2025-Oct, Nature genetics
          
          IF:31.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41588-025-02341-9
          PMID:41073785
         
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      研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学揭示食管鳞癌中GPR116+周细胞通过免疫抑制促进肿瘤转移的机制 | 首次发现GPR116+周细胞亚群在食管鳞癌转移中的关键作用,阐明其通过分泌EGFL6激活整合素β1/NF-κB通路促进转移的分子机制 | 样本量相对有限(16个单细胞多组学样本,5个空间转录组样本),动物模型结果需进一步临床验证 | 探究食管鳞癌肿瘤微环境中细胞多样性和空间结构对肿瘤转移的影响机制 | 食管鳞癌患者组织样本(人类)和Prrx1基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞多组学测序,空间转录组学,基因敲除技术 | NA | 单细胞多组学数据,空间转录组数据 | 16个单细胞多组学样本(117,169个细胞),5个空间转录组样本(195,366个细胞) | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |