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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-11-08 |
Distinct Roles of Atf3, Zfp711, and Bcl6b in Early Embryonic Hematopoietic and Endothelial Lineage Specification
2025-Nov-07, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204792
PMID:41200855
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b三个转录因子在早期胚胎造血和内皮谱系特化中的不同作用 | 首次在单细胞分辨率下系统研究这三个相对未被充分研究的转录因子在早期胚胎造血发育中的功能,并揭示了Zfp711对Atf3启动子的结合调控关系 | Bcl6b在造血内皮祖细胞中特异性表达但敲除后对早期造血无显著影响,其具体功能仍需进一步研究 | 解析转录因子在早期胚胎造血和内皮谱系特化中的调控机制 | 小鼠胚胎干细胞体外分化模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 342 | 2025-11-08 |
Biological and Therapeutic Potentials of MXenes in Tumor Microenvironment-Driven Oncology
2025-Nov-07, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00982
PMID:41200882
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综述 | 探讨MXenes二维纳米材料在肿瘤微环境驱动肿瘤学中的生物学和治疗潜力 | 首次系统阐述MXenes在直接肿瘤消融和肿瘤免疫微环境调控中的双重作用,及其与代谢重编程的关联 | NA | 探索MXenes在精准肿瘤治疗中的应用潜力 | MXenes纳米材料及其在肿瘤治疗中的作用机制 | 纳米医学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 高维免疫分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2025-11-08 |
GPC3-based circular RNA vaccine suppresses hepatocellular carcinoma progression by activating adaptive immune responses
2025-Nov-07, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001605
PMID:41201153
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研究论文 | 本研究开发了一种基于GPC3的环状RNA疫苗,通过激活适应性免疫反应抑制肝细胞癌进展 | 首次开发靶向GPC3的环状RNA癌症疫苗,克服传统mRNA疫苗的不稳定性,结合TLR4激动剂增强免疫反应 | 研究目前仅在小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发更稳定有效的癌症疫苗治疗肝细胞癌 | 肝细胞癌小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | 多重免疫荧光,单细胞测序,空间转录组学,质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据,免疫细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 344 | 2025-11-08 |
Unraveling the effects and characteristics of proliferating tumor and cytotoxic T cells in colorectal cancer
2025-Nov-07, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2026
PMID:41201451
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研究论文 | 本研究通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析结直肠癌中增殖肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特征及预后意义 | 首次系统揭示肿瘤细胞增殖与更好预后的关联,并发现增殖性细胞毒性T细胞的空间定位会减弱其预后价值差异 | 研究基于回顾性队列,需要前瞻性研究验证 | 探讨结直肠癌中增殖肿瘤细胞和细胞毒性T细胞的特性及预后价值 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化,单细胞RNA测序,数字图像分析 | NA | 图像,基因表达数据 | 1839例患者(两个独立队列),62例结肠癌单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2025-11-08 |
Functional Role of Granulocytic Myeloid-Derived Suppressor Cells in CAR-T Therapy: Insights from Single-Cell RNA Sequencing in Multiple Myeloma
2025-Nov-06, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗前后的粒细胞样髓源性抑制细胞功能 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制,并构建基于G-MDSC基因特征的风险预测模型 | 样本量有限且存在患者间异质性,结果应视为探索性和假设生成性质 | 阐明G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用机制 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,RNA-seq,功能富集分析,GSEA分析 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者(单细胞数据),713例多发性骨髓瘤患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2025-11-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers molecular features underlying microglial lipid accumulation and depression-related behaviors in high-fat diet mouse model of obesity
2025-Nov-06, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02273-2
PMID:41198848
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高脂饮食肥胖小鼠模型中微胶质细胞脂质积累的分子特征及其与抑郁相关行为的联系 | 首次在单细胞分辨率下发现高脂饮食诱导的脂滴积累微胶质细胞(LDAM)及其转录特征,并鉴定ACSL1作为关键调控因子 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未探讨性别差异;机制研究主要基于体外实验 | 探索肥胖相关神经精神共病的神经炎症机制 | 高脂饮食诱导的肥胖雄性小鼠脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖及相关神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高脂饮食喂养的雄性小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 347 | 2025-11-08 |
Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer
2025-Nov-06, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00366-y
PMID:41198929
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研究论文 | 本研究探讨核酸代谢在三阴性乳腺癌中的预后价值和免疫浸润影响 | 首次发现PDE8B作为致癌基因通过促进上皮间质转化诱导TNBC转移,构建了包含四个核酸代谢相关基因的精准预后预测模型 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证预测模型的普适性 | 阐明核酸代谢在三阴性乳腺癌发展中的作用机制及其临床意义 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体内外实验验证 | 预后预测模型 | RNA测序数据,临床数据 | 297个TNBC样本来自三个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-11-08 |
Advancements in single-cell sequencing for cervical cancer research
2025-Nov-06, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05407-8
PMID:41199110
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在宫颈癌研究中的最新进展,包括肿瘤异质性、肿瘤微环境动态和分子机制 | 揭示了宫颈癌中HPV驱动的致癌机制、代谢重编程空间组织以及肿瘤微环境中免疫细胞与基质细胞的复杂相互作用 | 临床转化面临耐药机制挑战,缺乏关键靶点抑制剂,需要进一步功能验证 | 推动单细胞测序在宫颈癌精准免疫治疗领域的应用 | 宫颈癌肿瘤微环境中的各类细胞(肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞) | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间多组学 | NA | NA |
| 349 | 2025-11-08 |
Targeting Treg-fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Nov-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335084
PMID:40695620
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术揭示了脂肪性肝病相关肝癌中Treg细胞与CAF通过TNFSF14-TNFRSF14信号轴驱动免疫抑制和免疫治疗抵抗的机制 | 首次发现TNFSF14-TNFRSF14介导的Treg-CAF相互作用是SLD-HCC免疫治疗抵抗的关键驱动因素,并证明靶向该信号轴可增强抗肿瘤免疫 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证 | 研究SLD-HCC的免疫微环境和免疫治疗抵抗机制 | 脂肪性肝病相关肝癌患者组织和肝癌模型 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞转录组学,质谱流式细胞术,空间转录组学,多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质表达数据 | 22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC病例,另有103例患者独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 350 | 2025-11-08 |
Sox9 prevents retinal degeneration and is required for limbal stem cell differentiation in the adult mouse eye
2025-Nov-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102337
PMID:41190718
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研究论文 | 本研究揭示了Sox9转录因子在成年小鼠眼睛中维持视网膜完整性和促进角膜缘干细胞分化的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术证明Sox9在基底角膜缘干细胞群体中的表达及其在形成两种长寿细胞克隆中的功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 揭示Sox9转录因子在成年眼睛不同细胞类型中的功能 | 成年小鼠的眼睛组织,特别是视网膜色素上皮细胞、Müller胶质细胞和角膜缘基底上皮细胞 | 发育生物学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | 成年基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-11-08 |
scCausalVI disentangles single-cell perturbation responses with causality-aware generative model
2025-Nov-05, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101443
PMID:41197632
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研究论文 | 开发了一种因果关系感知生成模型scCausalVI,用于解耦单细胞RNA测序数据中的内在细胞状态与外部刺激效应 | 通过深度结构因果网络显式建模细胞状态特异性对外部扰动的响应机制,整合结构因果建模与跨条件计算机预测 | NA | 解耦单细胞数据中内在细胞变异与外部刺激诱导的外在效应 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 生成模型, 深度结构因果网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 352 | 2025-11-08 |
Single-nuclei sequencing of Moricandia arvensis reveals bundle sheath cell function in the photorespiratory shuttle of C3-C4 intermediate Brassicaceae
2025-Nov-04, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf245
PMID:40590299
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序技术揭示了Moricandia arvensis中维管束鞘细胞在C3-C4中间型光合作用中的功能 | 首次在十字花科C3-C4中间型植物中应用单核RNA测序技术,揭示了光呼吸相关基因在维管束鞘细胞中的特异性表达模式 | 研究仅限于十字花科中的一种C3-C4中间型植物,需要更多物种验证 | 探究C3-C4中间型植物中细胞特异性对光呼吸途径的影响 | Moricandia arvensis(十字花科C3-C4中间型植物)和拟南芥(C3植物)的叶片组织 | 植物生物学 | NA | 单核RNA测序,电子显微镜,免疫金标记 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | Moricandia arvensis单核RNA测序数据集和拟南芥公开单细胞转录组数据 | NA | 单核RNA测序,单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-11-08 |
RANBP1 promotes immune evasion in triple-negative breast cancer by suppressing T cell infiltration via the miR-769-5p/PRUNE2 axis
2025-Nov-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03872-7
PMID:41186818
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研究论文 | 本研究揭示RANBP1通过miR-769-5p/PRUNE2轴抑制T细胞浸润,促进三阴性乳腺癌免疫逃避的分子机制 | 首次发现RANBP1通过调控miR-769-5p/PRUNE2通路影响T细胞浸润,揭示了三阴性乳腺癌免疫逃避的新机制 | 研究样本量有限(87例TNBC组织),机制研究仍需进一步验证 | 探究RANBP1在三阴性乳腺癌中调控T细胞浸润和肿瘤进展的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组织化学、Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床生存数据 | 87对三阴性乳腺癌肿瘤及癌旁组织,TCGA和GSE65194数据库 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 354 | 2025-11-08 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning reveals 4-aminobiphenyl exposure signatures and novel diagnostic biomarkers in bladder cancer
2025-Nov-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03819-y
PMID:41186865
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了4-氨基联苯暴露特征并识别了膀胱癌的新型诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明4-氨基联苯的致癌机制,并通过机器学习识别出由六个核心基因组成的诊断面板 | 研究具有回顾性性质,依赖公共测序数据,缺乏详细临床元数据,无法对识别亚型进行生存分析 | 研究环境致癌物4-氨基联苯在膀胱癌发生中的分子机制并识别诊断生物标志物 | 膀胱癌组织样本 | 生物信息学, 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接模拟, ssGSEA | LASSO, SVM, 随机森林 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 95,136个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-11-08 |
Heterogeneity in an adeno-associated virus transfection-based production process limits the production efficiency
2025-Nov-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26261-0
PMID:41188389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了基于腺相关病毒转染的生产过程中细胞异质性对生产效率的限制 | 首次在单细胞水平上揭示了rAAV生产过程中细胞转染异质性的关键瓶颈,发现仅不到5%的细胞实际产生病毒颗粒 | 研究仅针对rAAV9血清型和HEK293T细胞系,结果可能不适用于其他AAV血清型或生产细胞系 | 提高基于瞬时转染的rAAV生产效率和产量 | HEK293T细胞系和rAAV9病毒载体 | 生物技术 | 基因治疗 | 单细胞转录组学,流式细胞术,qPCR | NA | 转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 356 | 2025-11-08 |
Single-cell multi-omics analysis revealed the expansion of age-associated B cells in the pancreas of type 1 autoimmune pancreatitis patients
2025-Nov-04, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01567-w
PMID:41188893
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示了1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺中年龄相关B细胞的扩增现象 | 首次在AIP胰腺中发现IgD-年龄相关B细胞(ABCs)的扩增,并揭示了CXCL9+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴招募ABCs以及Tfh细胞通过IL-21与ABCs相互作用的新机制 | 样本量有限,仅基于活检样本分析,需要更大规模研究验证 | 表征1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺的局部免疫特征 | 1型自身免疫性胰腺炎患者的胰腺活检组织 | 单细胞组学 | 自身免疫性胰腺炎 | 单细胞RNA测序,免疫受体组库测序,空间转录组测序,流式细胞术,多色免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫受体序列数据 | AIP患者胰腺活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞免疫受体组库测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 357 | 2025-11-08 |
PA2G4 in CAFs promotes biochemical recurrence of prostate cancer via H3K18la
2025-Nov-04, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01485-9
PMID:41189032
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定前列腺癌相关成纤维细胞乳酸代谢特征并建立预后指数 | 首次发现CAFs通过乳酸代谢影响前列腺癌进展,建立新型乳酸代谢相关临床预后指数LMCAFCPI,并揭示PA2G4通过抑制H3K18la调控前列腺癌增殖转移的新机制 | NA | 探索前列腺癌相关成纤维细胞通过乳酸代谢影响前列腺癌进展的机制并开发预后工具 | 前列腺癌相关成纤维细胞和前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习,CUT-TAG测序 | 机器学习模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2025-11-08 |
Loss of Actrt1 in non-hematopoietic stroma suppresses pathological angiogenesis and tumor progression
2025-Nov-04, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152916
PMID:41197408
|
研究论文 | 本研究揭示了Actrt1通过非造血基质细胞促进肿瘤血管生成和肿瘤进展的新机制 | 首次发现Actrt1在肿瘤微环境中通过非造血内皮细胞调控病理性血管生成,而不影响发育性血管生成 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性有待进一步验证 | 探究Actrt1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤血管生成的影响 | B16F1和MC38肿瘤模型小鼠、骨髓嵌合体、主动脉环、后肢缺血模型 | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、骨髓移植、主动脉环分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织图像数据 | 多种小鼠肿瘤模型和实验体系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2025-11-08 |
A new model of gastric pre-neoplasia induced by aberrant ADAR1-mediated double-stranded RNA signaling
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101673
PMID:41197768
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研究论文 | 本研究通过构建胃壁细胞特异性敲除ADAR1的小鼠模型,揭示了异常双链RNA信号传导在胃前瘤形成中的作用机制 | 首次建立了由ADAR1介导的双链RNA信号异常驱动的胃前瘤形成新遗传模型,并发现线粒体双链RNA在此过程中的富集现象 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 明确双链RNA反应失调在胃上皮细胞中对胃前瘤形成的影响 | ADAR1基因敲除小鼠的胃组织 | 分子病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫电子显微镜,免疫沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,组织学图像,免疫学数据 | 多种基因型小鼠的胃组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-11-08 |
Heterogeneity of acute myeloid leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Nov-04, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2025.195119
PMID:41197948
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络,探索疾病异质性 | 首次结合单细胞数据和单样本网络分析方法,在细胞类型特异性水平上揭示AML患者的基因调控异质性 | 样本量有限,网络推断方法的一致性有待进一步验证 | 探索急性髓系白血病在基因调控水平的异质性,为个性化治疗提供依据 | 急性髓系白血病患者和健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3, LIONESS | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |