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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-05-29 |
ZNF469 drives TGF-β1/SMAD3-mediated extracellular matrix regulation in pulmonary fibrosis
2026-May-28, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.14165
PMID:42206677
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研究论文 | 本文发现ZNF469通过TGF-β1/SMAD3信号通路调控肺成纤维细胞中细胞外基质的转录,促进肺纤维化进程 | 首次揭示ZNF469在肺纤维化中的促纤维化作用,并阐明其通过TGF-β1/SMAD3轴调控ECM基因表达的机制 | 研究基于体外细胞实验和公共数据库分析,缺乏体内动物模型验证及临床试验数据 | 探究ZNF469在肺纤维化中调控成纤维细胞活化和ECM沉积的分子机制 | 肺成纤维细胞及特发性肺纤维化、系统性硬化症患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA测序、CUT&RUN检测 | NA | 转录组数据 | 特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本(具体数量未提及) | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 342 | 2026-05-29 |
Intrathecal Allogeneic B7-H3-targeted CAR γδ T Cells for Leptomeningeal Metastasis from Solid Tumors: Safety, Efficacy, and Immunological Dynamics in a Phase 1 Trial
2026-May-28, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-26-0738
PMID:42207176
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研究论文 | 评估异体B7-H3靶向嵌合抗原受体γδ T细胞鞘内注射治疗软脑膜转移瘤的安全性、有效性和免疫动力学 | 首次在临床试验中评估异体B7-H3-CAR γδ T细胞疗法通过鞘内给药治疗软脑膜转移瘤,并展示了早期安全性、临床活性、局部持久性和IFN-γ相关的脑脊液免疫重塑 | 样本量小,仅有三名患者,且为单臂试验,缺乏对照组,初步概念验证性质 | 评估鞘内注射异体B7-H3靶向CAR γδ T细胞治疗软脑膜转移瘤的临床反应、安全性、总生存期、生活质量和药代动力学/药效学特征 | 三名来自B7-H3阳性实体瘤的软脑膜转移瘤患者,包括两名肺腺癌患者和一名三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌, 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 3名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2026-05-29 |
Exploratory multiomics analysis identifies WDR17 as a potential biomarker of tyrosine kinase inhibitor resistance in lung adenocarcinoma
2026-May-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05286-5
PMID:42207214
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研究论文 | 利用多组学分析探索WDR17作为肺腺癌酪氨酸激酶抑制剂耐药潜在生物标志物的研究 | 首次通过多组学分析识别WDR17与肺腺癌TKI耐药相关,并发现其通过维持蛋白质稳态和代谢平衡影响药物敏感性 | 样本量小且为探索性研究,结果需在更大独立队列中验证 | 识别肺腺癌中TKI耐药相关的常见失调基因,为新型治疗策略提供机制见解 | TCGA LUAD患者TKI治疗队列及公开单细胞数据集中的TKI耐药细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 8例TCGA LUAD患者(TKI治疗后),以及公开数据集中的细胞系样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2026-05-29 |
Protocol for the isolation of human buccal cells for single-cell applications
2026-May-27, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104601
PMID:42201808
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研究论文 | 描述了一种从人体颊粘膜活检组织中分离高活力单细胞悬浮液的温和解离方案,适用于单细胞应用 | 结合可控酶消化(胶原酶和核酸酶)与优化的速度、温度和孵育时间,高效释放异质性细胞群同时最小化细胞损伤,获得≥80%活力的单细胞悬浮液 | NA | 建立一种可靠的人体颊粘膜细胞分离方案用于单细胞RNA测序和流式细胞术 | 人体颊粘膜活检组织中的上皮细胞、基质细胞和驻留免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、细胞表型数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2026-05-29 |
CCR5 and CD74 are potential therapeutic targets for necroinflammation in preclinical cholesterol crystal embolism
2026-May-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv8372
PMID:42202044
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胆固醇晶体栓塞肾脏的细胞图谱,发现CCR5和CD74是坏死性炎症的潜在治疗靶点 | 首次构建胆固醇晶体栓塞(CCE)肾脏的单细胞图谱,并鉴定CCR5和CD74通路在CCE相关坏死性炎症中的关键作用 | 基于小鼠模型和少量人类肾活检样本,需进一步验证临床转化潜力 | 探讨CCE诱导急性肾损伤的分子机制,并识别潜在治疗靶点 | C57BL/6J小鼠CCE模型和人CCE患者肾活检组织 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病、肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肾动脉注射CC模型(未明确具体样本数);人肾活检切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 346 | 2026-05-29 |
Genomic instability drives POSTN+ myofibroblasts via STING-WNT axis to promote immunosuppression and PARPi resistance in ovarian cancer
2026-May-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ady2719
PMID:42202048
|
研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌中基因组不稳定性通过STING-WNT轴驱动POSTN+肌成纤维细胞,促进免疫抑制和PARP抑制剂耐药性的机制 | 首次阐明肿瘤内在基因组不稳定性通过STING-WNT轴重编程基质成纤维细胞,形成免疫抑制微环境并导致PARP抑制剂耐药的完整机制,并发现POSTN作为基质特异性免疫检查点 | 未在更大样本或不同癌症类型中验证POSTN阻断的治疗效果,且可能缺乏体内长期安全性数据 | 探究肿瘤内在基因组不稳定性如何通过基质重编程驱动免疫抑制和治疗耐药 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本,以及卵巢癌和乳腺癌模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞表观基因组数据 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 347 | 2026-05-29 |
AdPrST:An Adversarial Graph Deep Learning Pre-clustering Framework for Deciphering Spatiotemporal Structures in Spatially Resolved Transcriptomics
2026-May-27, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3697726
PMID:42202195
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研究论文 | 提出一种名为AdPrST的对抗性图深度学习预聚类框架,用于从空间分辨转录组学数据中解码时空结构,包括空间域识别、轨迹推断和伪时空图谱构建 | 通过对抗性自监督对比学习结合Wasserstein距离GAN和双重视图图结构,实现鲁棒的时空结构推断 | 未明确提及 | 解决空间分辨转录组学中复杂组织时空结构推断的挑战 | 空间分辨转录组学数据中的空间域、发育轨迹和时空特征 | 数字病理学 | 未指定 | 空间转录组学 | 生成对抗网络 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 348 | 2026-05-29 |
Recurrence in the chemotherapy regimen of bladder carcinoma originates from quiescent epidermoid-like cells
2026-May-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73632-w
PMID:42203766
|
研究论文 | 通过整合高分辨率CRISPR/Cas9进化谱系追踪与单细胞RNA测序,研究膀胱癌在化疗下的演化及复发机制 | 首次识别出类表皮样细胞状态群体作为化疗后复发的起源,并揭示其可塑性和进化动态 | 未提及局限性 | 解析膀胱癌在化疗过程中自然进展和复发的关键事件与进化动力学 | 膀胱癌小鼠模型的肿瘤细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | CRISPR/Cas9谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 349 | 2026-05-29 |
Molecular signatures and lineage diversification of neurogenic and gliogenic radial glia in the gyrencephalic ferret cortex
2026-May-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10366-x
PMID:42203905
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研究论文 | 利用回皮层模型系统解析神经发生和胶质发生的放射状胶质细胞的分子特征与谱系分化 | 首次在回脑化雪貂皮层中发现ERK和PKA信号协同促进外放射状胶质细胞自我更新和神经发生,并鉴定YAP/TAZ和SHH信号对胶质发生区域特化的调控作用 | 未提供 | 阐明回脑化皮层中放射状胶质细胞的分子特征及其在神经发生和胶质发生中的谱系动态调控机制 | 雪貂和人类皮层放射状胶质细胞 | 机器学习 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 单细胞转录组数据 | 未提供样本量 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 350 | 2026-05-29 |
Scoring gene importance by interpreting single-cell foundation models
2026-May-27, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03112-5
PMID:42204361
|
研究论文 | 提出SIGnature框架,通过解释单细胞基础模型来评估基因功能重要性 | 首次利用单细胞RNA测序基础模型的归因评分来量化基因重要性,降低技术噪音、强调调控基因并实现跨数据集比较 | 未明确提及局限性 | 开发一种通过解释单细胞基础模型来评分基因重要性的方法,并展示其在跨疾病分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的基因及其功能重要性 | 机器学习 | COVID-19, 脓毒症, 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 基础模型(foundation model) | 单细胞转录组数据 | 来自400项研究的单细胞RNA测序图谱数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2026-05-29 |
Microglial state transitions dominate the brain immune response in the subacute phase after cardiac arrest
2026-May-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03874-4
PMID:42204534
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示心脏骤停后亚急性期大脑免疫反应中小胶质细胞状态的转变 | 首次描绘了心脏骤停后年轻和老年大脑在第三天的免疫景观,发现了五类心脏骤停相关小胶质细胞状态,并揭示了SPP1阳性小胶质细胞的时空动态特征 | 未提及具体局限 | 探究心脏骤停后大脑免疫反应中不同免疫细胞群体的贡献 | 心脏骤停后小鼠大脑免疫细胞 | 单细胞组学 | 心脏骤停相关脑损伤 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠(未具体说明数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2026-05-29 |
Thyroid-stimulating hormone receptor mediates peripheral-central neuroimmune crosstalk in autoimmune thyroid diseases
2026-May-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04957-y
PMID:42204533
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示促甲状腺激素受体在自身免疫性甲状腺疾病中介导外周-中枢神经免疫串扰的分子机制 | 首次从多组学层面系统证明TSHR作为分子枢纽连接外周与中枢神经免疫串扰,并鉴定出三种潜在的再利用化合物 | 样本量有限,缺乏纵向随访和体内验证,结果需谨慎解释并进一步研究 | 阐明促甲状腺激素受体如何连接外周自身免疫与中枢神经系统特征 | Graves病、Graves眼病患者及小鼠模型 | 自然语言处理 | 甲状腺疾病 | GWAS, RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 脑影像数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2026-05-29 |
MicroRNA-7: a versatile player and core target in brain disorders
2026-May-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08313-9
PMID:42204625
|
review | 系统综述了MicroRNA-7在神经系统疾病中的生物特性、调控机制及作用 | 综合分析了miR-7在脑疾病中的多面性作用及临床转化潜力 | 机制复杂性、递送系统靶向性不足以及缺乏临床转化标准 | 探讨MicroRNA-7在脑疾病中的调控机制和临床转化潜力 | MicroRNA-7(miR-7)及其在脑疾病中的作用 | machine learning | 帕金森病、阿尔茨海默病、缺血性卒中、脑出血、胶质母细胞瘤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 354 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk analyses reveal ATF4-associated immune suppression and WNT/β-catenin signaling in osteosarcoma
2026-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00797-1
PMID:42204636
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研究论文 | 整合单细胞和批量分析揭示骨肉瘤中ATF4相关的免疫抑制和WNT/β-catenin信号通路 | 首次通过整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,系统揭示ATF4在骨肉瘤中连接应激相关肿瘤程序、免疫抑制和WNT/β-catenin激活的关键作用,并构建了ATF/CREB相关风险评分(ACS)用于预后分层 | 主要依赖公开数据集进行生物信息学分析,缺乏大规模前瞻性临床验证;ATF4在骨肉瘤中的具体分子机制和调控网络仍需进一步实验验证 | 探究ATF/CREB应激反应网络(特别是ATF4)在骨肉瘤免疫抑制微环境和预后的作用机制 | 骨肉瘤(OS)肿瘤样本的单细胞RNA-seq和批量转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子动力学模拟 | NA | 单细胞基因表达数据, 批量转录组数据 | 多个公共数据集,包括TARGET和GEO队列,具体样本量未详细列出 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 355 | 2026-05-29 |
A human corticospinal organoid-slice connectoid model informs enhancer strategies for post-injury axon regrowth
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117399
PMID:42201810
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研究论文 | 开发了一种人类皮质脊髓类器官-切片连接体平台,用于研究轴突再生策略 | 首次构建三维人类皮质脊髓运动类器官-切片连接体平台,模拟了发育性轴突延长程序及其在成熟过程中的限制,并结合单细胞转录组学和药物筛选发现可逆转轴突生长下降的化合物 | 未提及具体限制 | 研究哺乳动物中枢神经系统发育过程中轴突生长停止的时机和机制,并寻找促进损伤后轴突再生的策略 | 人类皮质脊髓运动类器官-切片连接体中的皮质投射神经元 | 机器学习和数字病理学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞转录组学, 活体成像 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 356 | 2026-05-29 |
Syrosingopine enhances immune checkpoint blockade efficacy by inhibition of MCTs and metabolic reprogramming in triple-negative breast cancer
2026-May-26, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168308
PMID:42202910
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研究论文 | 研究西罗辛平通过抑制MCTs和代谢重编程增强三阴性乳腺癌免疫检查点阻断疗效 | 首次证明双MCT1/MCT4抑制剂西罗辛平可通过阻断乳酸输出重新编程肿瘤微环境,增强抗肿瘤免疫,与抗PD-1协同抑制三阴性乳腺癌生长 | 基于模型和细胞系研究,临床验证尚需进一步开展 | 探索MCT抑制作为三阴性乳腺癌免疫治疗增敏策略的潜力 | 三阴性乳腺癌肿瘤细胞、CD8 T细胞、NK细胞、免疫活性小鼠模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、组织分析 | NA | 转录组数据、组织切片数据 | 多个三阴性乳腺癌模型和免疫活性小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2026-05-29 |
Plasma-Derived Exosomes from Graves' Orbitopathy: Pathogenic Entities Causing Tissue Lesions
2026-May-26, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111088
PMID:42203012
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研究论文 | 研究血浆衍生的外泌体在Graves眼眶病(GO)中通过miRNA递送驱动组织损伤的致病机制,并建立了实验性GO模型 | 首次表明循环外泌体是GO的新型致病驱动因子,能通过miR-221-5p/CACNG4/AMPK通路重编程眼眶成纤维细胞,且稳定期GO患者外泌体仍具有致病活性 | 未明确提及局限性 | 探究血浆外泌体在Graves眼眶病发病中的直接作用及其从系统性到局部疾病进展的机制 | Graves眼眶病患者和健康对照的血浆外泌体,以及原代人眼眶成纤维细胞和BALB/c小鼠 | 数字病理学 | Graves眼眶病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GO患者和健康对照的血浆样本,BALB/c小鼠(每周静脉注射外泌体,持续150天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 用于分析外泌体介导的细胞重编程及免疫浸润 |
| 358 | 2026-05-29 |
Predicting neoadjuvant breast cancer therapy response using BRIDGE from tumor transcriptomics and histopathology
2026-May-26, Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology
IF:56.7Q1
DOI:10.1016/j.annonc.2026.05.700
PMID:42203036
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研究论文 | 开发BRIDGE框架,利用肿瘤转录组学和组织病理学预测乳腺癌新辅助治疗反应 | 首次整合转录组去卷积与组织病理学深度学习,实现低成本快速预测新辅助治疗病理完全缓解,并优于现有商业标志物 | 需在前瞻性队列中进一步验证,特别是免疫检查点抑制剂治疗场景的泛化性 | 利用预处理肿瘤转录组和组织病理学图像预测乳腺癌新辅助治疗反应 | 乳腺癌患者肿瘤样本的转录组数据和组织病理学H&E染色切片 | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序, 空间转录组学, 深度学习 | CNN | 转录组数据, 组织病理学图像 | 训练集10个转录组数据集,测试集24个数据集,6个含组织切片数据的独立数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 359 | 2026-05-29 |
Characterization of natural killer (NK) cells in lung adenocarcinoma and construction of an NK risk signature based on single-cell and macromolecular RNA-seg data
2026-May-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04552-w
PMID:42184019
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研究论文 | 基于单细胞和大分子RNA测序数据,研究肺腺癌中自然杀伤细胞的特性并构建其风险特征 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别肺腺癌中NK细胞亚群,并建立基于NK细胞相关基因的风险特征用于预后预测 | 该研究主要基于公共数据库的数据,尚未在独立外部队列中进行验证 | 分析肺腺癌中NK细胞特征并建立基于NK细胞的风险特征以预测患者预后 | 肺腺癌患者的NK细胞及其基因表达数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2026-05-29 |
Targeting VEGF signaling and stromal remodeling enhances chemoimmunotherapy efficacy in esophageal cancer
2026-May-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014249
PMID:42173653
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、免疫组库分析和空间转录组学,揭示了靶向VEGF信号和基质重塑可增强食管癌化学免疫治疗疗效,并识别出关键的基质细胞亚群 | 首次通过多组学整合分析揭示化疗免疫治疗后食管鳞癌肿瘤微环境中基质细胞(如ACKR1+内皮细胞和CFD+癌症相关成纤维细胞)的动态变化及其与治疗反应的关系,并发现VGFA信号驱动RGCC+内皮细胞和MMP11+癌症相关成纤维细胞协同形成免疫抑制微环境 | 样本量较小(9例患者),主要依赖计算分析结果,功能验证仍需进一步扩展 | 阐明新辅助化学免疫疗法在食管鳞癌中疗效的微环境驱动机制,为优化治疗方案提供理论基础 | 食管鳞癌患者肿瘤组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、免疫组库分析、空间转录组学 | 集成聚类、基因集富集分析、T细胞受体库表征、拷贝数估计、细胞间通讯推断 | 单细胞转录组数据、免疫组库数据、空间转录组数据 | 9例食管鳞癌患者,共18个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学 |