单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
341	2025-05-17	miR142 silencing alleviates retinal inflammation by impairing mitochondrial function and reprogramming metabolism of CD4+ T cells via targeting MTFR1 2025-Jun-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114727 PMID:40334625	研究论文	研究miR-142在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其通过靶向MTFR1调控CD4+ T细胞线粒体功能和代谢重编程的机制	揭示了miR-142通过靶向MTFR1调控T细胞线粒体功能和代谢重编程的新机制，为自身免疫性葡萄膜炎的治疗提供了新靶点	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	阐明miR-142在葡萄膜炎发病中的作用及其分子机制	自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型	分子免疫学	葡萄膜炎	流式细胞术、单细胞测序、Seahorse能量代谢分析、线粒体染色、电子显微镜分析、荧光素酶报告基因检测、Western blot	miR-142基因敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据	葡萄膜炎患者外周血单核细胞和EAU小鼠模型
342	2025-05-17	Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway 2025-Jun-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808 PMID:40339488	研究论文	本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制，发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖	首次揭示CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞过度增殖的机制	研究主要基于体外细胞和小鼠模型，临床样本验证有限	探究CTSC在银屑病中的作用及分子机制	银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、HaCaT细胞	分子生物学	银屑病	scRNA-seq、siRNA敲降	IMQ诱导的小鼠银屑病模型	基因表达数据、细胞增殖数据	银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞
343	2025-05-17	TGF-β1 induces autophagy and mediates the effect on macrophages differentiation in primary liver cancer 2025-Jun-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114799 PMID:40339499	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性和分化谱，并探讨了TGF-β1通过自噬信号调控TAMs表型转换的机制	首次在原发性肝癌中鉴定出四种不同的TAMs亚群，并发现TGF-β1通过自噬信号驱动TAMs表型转换的新机制	样本量相对较小（19例患者），且需要进一步验证TGF-β1调控TAMs分化的具体分子机制	探究原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其分化机制	原发性肝癌患者的肿瘤相关巨噬细胞	肿瘤免疫学	原发性肝癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），Ingenuity通路分析（IPA）	NA	单细胞转录组数据	19例原发性肝癌患者的单细胞数据，TCGA数据库中428例患者的生存数据
344	2025-05-17	Single-cell transcriptome analysis identifies subclusters and signature with N-glycosylation in endometrial cancer 2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03802-z PMID:39589706	research paper	通过单细胞转录组分析鉴定子宫内膜癌中与N-糖基化相关的亚群和特征	首次在子宫内膜癌中利用单细胞RNA测序技术结合非负矩阵分解方法，识别出与N-糖基化相关的恶性细胞亚型，并构建了一个包含8个差异表达基因的预后模型	样本量较小（仅5例患者），且为回顾性研究	阐明N-糖基化相关基因在子宫内膜癌细胞异质性、预后和免疫治疗反应中的作用	子宫内膜癌患者	digital pathology	endometrial cancer	scRNA-seq, NMF, 机器学习算法	非负矩阵分解(NMF), 多种机器学习算法集成	单细胞RNA测序数据	5例子宫内膜癌患者的30,233个细胞
345	2025-05-17	EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS 2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.) DOI:10.1097/SHK.0000000000002529 PMID:39617402	研究论文	通过整合基因组和转录组分析，探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力	首次将BEND7鉴定为脓毒症中参与免疫调节的血小板特异性基因，并揭示了其通过细胞间粘附分子信号通路与免疫细胞（特别是单核细胞和中性粒细胞）的强相互作用	需要进一步实验验证BEND7在脓毒症免疫调节中的具体作用机制	探索脓毒症发病机制中的遗传因素，寻找新的治疗靶点	脓毒症相关基因，特别是BEND7基因	基因组学与转录组学	脓毒症	基于摘要数据的孟德尔随机化方法、全基因组关联研究、表达数量性状位点分析、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、转录组数据	多个基因表达数据集（包括独立验证数据集）
346	2025-05-17	Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03756-2 PMID:39621240	研究论文	该研究探讨了中性粒细胞中RNA甲基化模式在肝细胞癌（HCC）中的作用及其与肿瘤微环境（TME）的关系	首次在中性粒细胞中识别出高/低RNA甲基化亚型，并开发了新的中性粒细胞RNA甲基化（NRM）评分系统，用于评估TME异质性和临床特征	研究基于单细胞测序数据，样本量可能有限，且需要进一步实验验证TRPM3的功能	探索中性粒细胞RNA甲基化在HCC中的作用及其临床意义	肝细胞癌（HCC）患者的中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序、LASSO Cox回归分析	NRM评分系统	单细胞测序数据、lncRNA数据	未明确提及具体样本数量
347	2025-05-17	Bioinformatics identification of shared signaling pathways and core targets linking Benzo[a]pyrene exposure to HCC progression 2025-Jun, Toxicology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.tox.2025.154129 PMID:40174762	研究论文	通过生物信息学方法探索苯并[a]芘(BaP)在肝癌进展中的潜在分子机制	首次通过综合数据库分析和分子对接技术，确定了BaP与肝癌相关的核心靶点及其作用通路	研究主要基于数据库分析，缺乏实验验证	探索环境污染物BaP在肝癌进展中的分子机制	苯并[a]芘(BaP)和肝癌相关分子靶点	生物信息学	肝癌	生物信息学分析、分子对接	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	TCGA数据库中的肝癌样本
348	2025-05-17	Biology and Pathophysiology of Placenta Accreta Spectrum Disorder 2025-Jun-01, Obstetrics and gynecology IF:5.7Q1 DOI:10.1097/AOG.0000000000005903 PMID:40209229	review	本文综述了胎盘植入谱系障碍（PAS）的生物学和病理生理学，探讨了其临床挑战和管理策略	整合了单细胞RNA测序和蛋白质组学分析的新兴技术，为PAS的生物标志物和干预途径提供了新见解	未提及具体研究样本量或实验数据，主要基于现有文献综述	理解PAS的病理生理学以指导临床管理和预防策略	胎盘植入谱系障碍（PAS）及其相关的生物学和病理生理学机制	病理生理学	胎盘植入谱系障碍	单细胞RNA测序，蛋白质组学分析	NA	NA	NA
349	2025-05-17	Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia 2025-Jun, Current opinion in pharmacology IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.coph.2025.102524 PMID:40311558	review	本文综述了急性髓系白血病（AML）中CAR T细胞靶点识别的新方法	介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象，以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点	NA	提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用，为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径	急性髓系白血病（AML）	肿瘤免疫治疗	急性髓系白血病	结构表面组学，AI驱动的单细胞RNA测序，细胞表面捕获技术	NA	RNA测序数据，蛋白质构象数据	NA
350	2025-05-17	Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems 2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS IF:1.9Q2 DOI:10.1002/jms.5143 PMID:40360168	research paper	该论文探讨了空间多组学技术在理解神经系统动态生物过程中的应用及其潜力	结合代谢组学、转录组学和蛋白质组学，提供了一种更全面的方法来研究神经系统中的细胞相互作用	样本制备的优化、分子完整性的保持以及跨组学层数据的整合仍面临挑战	通过空间多组学技术增强对神经系统复杂疾病的理解	神经系统中的细胞类型及其相互作用	digital pathology	Alzheimer's disease, autism spectrum disorder	mass spectrometry imaging, transcriptomics, proteomics, metabolomics	NA	image, molecular data	NA
351	2025-05-17	Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution 2025-Jun, Cardiology research IF:1.4Q3 DOI:10.14740/cr2055 PMID:40370624	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压（PAH）内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物	首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征，并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物	研究主要基于体外模型和生物信息学分析，需要进一步的体内实验验证	探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用	肺动脉高压患者的内皮细胞	单细胞转录组学	肺动脉高压	scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting)	NA	单细胞RNA测序数据	NA
352	2025-05-17	Harnessing Calmodulin-Related Genes to Build a Prognostic Model in Esophageal Squamous Cell Carcinoma for a Comprehensive Analysis of Single-Cell Immune Characteristics and Drug Efficacy 2025-May-16, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997) DOI:10.1097/CJI.0000000000000561 PMID:40375794	研究论文	该研究利用钙调蛋白相关基因构建了一个食管鳞状细胞癌的预后模型，并分析了单细胞免疫特性和药物疗效	首次基于钙调蛋白相关基因构建了食管鳞状细胞癌的预后模型，并验证了特征基因的表达，同时发现了潜在的治疗药物AZD-8055	研究依赖于TCGA数据集，样本来源可能有限，且需要进一步实验验证模型的临床适用性	构建食管鳞状细胞癌的预后模型并探索其免疫特性和潜在治疗药物	食管鳞状细胞癌患者及其相关基因表达数据	数字病理学	食管鳞状细胞癌	qPCR, 单细胞测序, GSEA富集分析, 免疫浸润分析, 突变分析, 药物敏感性分析, 分子对接, CETSA	LASSO Cox回归模型, 多元Cox回归模型	基因表达数据, 单细胞测序数据	TCGA-ESCC数据集中的肿瘤和正常样本
353	2025-05-17	Deficiency of NPR-C triggers high salt-induced thoracic aortic dissection by impairing mitochondrial homeostasis 2025-May-16, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvaf085 PMID:40377018	研究论文	本研究探讨了NPR-C在胸主动脉夹层（TAD）发病中的作用及其分子机制	揭示了NPR-C通过调节线粒体稳态在TAD中的保护作用，并提出了NPR-C激活和亚精胺（SPD）补充作为新的TAD预防和治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究NPR-C在TAD发病中的作用及潜在治疗策略	人类TAD患者和小鼠模型	心血管疾病研究	胸主动脉夹层	RNA测序、单细胞测序	基因敲除小鼠模型	转录组数据、单细胞测序数据	人类TAD患者样本和BAPN处理的小鼠模型
354	2025-05-17	Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model 2025-May-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI181775 PMID:40100323	研究论文	本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，发现CTLA4在CD8+ T细胞中的上调与肺纤维化相关，并证明靶向CTLA4的药物ipilimumab可加速肺上皮再生并减少纤维化	首次发现CTLA4在CD8+ T细胞中的表达与肺纤维化的关系，并验证了ipilimumab通过促进衰老细胞清除来加速纤维化消退的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果尚需进一步验证	探究免疫检查点蛋白CTLA4在肺纤维化中的作用机制及潜在治疗策略	人类特发性肺纤维化患者样本和重复博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型	免疫学与纤维化研究	肺纤维化	空间转录组学、蛋白质组学	人类化CTLA4敲入小鼠模型	转录组数据、蛋白质表达数据	人类特发性肺纤维化患者样本和实验小鼠模型
355	2025-05-17	Acute kidney injury triggers hypoxemia by lung intravascular neutrophil retention that reduces capillary blood flow 2025-May-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI186705 PMID:40048367	research paper	该研究探讨了急性肾损伤（AKI）如何通过肺血管内中性粒细胞滞留引发低氧血症	揭示了AKI通过激活经典单核细胞释放CXCL2，导致中性粒细胞在肺毛细血管滞留，进而引起低氧血症的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类数据有限	阐明AKI引发低氧血症的细胞机制	急性肾损伤（AKI）患者和小鼠模型	NA	acute kidney injury	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	小鼠模型和有限的人类数据
356	2025-05-17	AI-Assisted Hypothesis Generation to Address Challenges in Cardiotoxicity Research: Simulation Study Using ChatGPT With GPT-4o 2025-May-15, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/66161 PMID:40373295	研究论文	本研究探讨了ChatGPT与GPT-4o在生成创新性研究假设以解决心脏毒性研究中的五大挑战方面的能力	利用ChatGPT与GPT-4o生成创新性假设，并通过专家评估其新颖性和可行性，展示了AI在心脏毒性研究中的潜在应用	实验设计常被认为过于雄心勃勃，需要更多实际考量	探索AI在心脏毒性研究中生成创新性假设的能力	心脏毒性研究的五大挑战	自然语言处理	心血管疾病	单细胞RNA测序、多组学方法、机器学习	GPT-4o	文本	96个生成的假设，其中13个被评为高度新颖，62个为中等新颖
357	2025-05-17	Single-Cell RNA-Seq Reveals Aging-Related Impairment of Microglial Efferocytosis Contributing to Apoptotic Cells Accumulation After Retinal Injury 2025-May-15, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70097 PMID:40374315	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了衰老如何影响小胶质细胞的胞葬功能，进而导致视网膜损伤后凋亡细胞的积累	首次在单细胞水平揭示了衰老视网膜中小胶质细胞胞葬功能受损的分子机制，并验证了AXL-GAS6和MERTK-GAS6等配体-受体互作的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类视网膜衰老的类似机制仍需进一步验证	阐明衰老对小胶质细胞胞葬功能的影响及其在视网膜疾病中的作用	年轻和老年小鼠的视网膜细胞	数字病理学	老年性疾病	sc-RNA-seq	小鼠视网膜缺血/再灌注损伤模型	单细胞转录组数据	74,412个来自年轻和老年小鼠的视网膜细胞
358	2025-05-17	Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal FAS+ T cell and autophagy-related signatures predicting chemoimmunotherapy response in diffuse large B-cell lymphoma patients 2025-May-15, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-024-2849-2 PMID:40374987	研究论文	本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了FAS阳性T细胞和自噬相关特征在预测弥漫大B细胞淋巴瘤患者对化疗免疫治疗反应中的作用	首次构建了基于自噬相关基因的预后模型，并鉴定FAS作为预后生物标志物，发现FAS阳性Treg和Tfh细胞富集的肿瘤微环境与良好预后相关	样本量相对有限，特别是单细胞测序数据仅来自4例患者，需要更大规模的研究验证	研究自噬相关基因在弥漫大B细胞淋巴瘤中的预后效应	弥漫大B细胞淋巴瘤患者	数字病理学	弥漫大B细胞淋巴瘤	单细胞测序, 空间转录组学, 抗体阵列	自噬相关预后模型	转录组数据, 蛋白质组数据	1409例DLBCL患者转录组数据, 531例健康对照, 4例单细胞测序数据, 10例空间转录组数据, 110例本地队列蛋白质组数据
359	2025-05-17	CD49d promotes T-cell senescence in chronic lymphocytic leukaemia 2025-May-15, British journal of haematology IF:5.1Q1 DOI:10.1111/bjh.20135 PMID:40375447	research paper	该研究探讨了CD49d在慢性淋巴细胞白血病（CLL）中对T细胞衰老的影响	揭示了CD49d在CLL患者T细胞衰老中的新作用，并提出了针对CD49d依赖性衰老途径可能逆转T细胞功能障碍的治疗策略	研究未涉及CD49d如何具体调控T细胞衰老的分子机制	探究CD49d对CLL患者T细胞生物学的影响	CLL患者和健康捐赠者的CD4+和CD8+ T细胞	免疫学	慢性淋巴细胞白血病	流式细胞术和单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞数据和基因表达数据	未明确提及样本数量，但包括CLL患者和健康捐赠者的T细胞
360	2025-05-17	Deciphering the Immunomodulatory Function of GSN+ Inflammatory Cancer-Associated Fibroblasts in Renal Cell Carcinoma Immunotherapy: Insights From Pan-Cancer Single-Cell Landscape and Spatial Transcriptomics Analysis 2025-May-15, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.70062 PMID:40375605	研究论文	本研究通过泛癌单细胞RNA测序和空间转录组学分析，探讨了GSN+炎症性癌症相关成纤维细胞在肾细胞癌免疫治疗中的免疫调节功能	首次利用泛癌单细胞RNA测序和空间转录组学分析GSN iCAFs的亚型及其在ICI治疗中的空间分布特征，并开发了预测ICI反应的Caf.Sig模型	研究主要基于体外和动物模型实验，临床验证仍需进一步扩大样本量	探究GSN+炎症性癌症相关成纤维细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的作用机制	泛癌患者样本和肾透明细胞癌(ccRCC)样本	癌症免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学测序(ST-seq)、机器学习	Caf.Sig模型	RNA测序数据	泛癌患者样本和ccRCC样本(具体数量未明确说明)