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当前共找到 40449 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-06-13 |
Integrated transcriptomic identification and validation reveal key autophagy-associated biomarkers in sleep deprivation
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21426
PMID:42254657
|
研究论文 | 通过整合转录组和实验验证，识别睡眠剥夺相关的关键自噬生物标志物 | 首次通过整合转录组分析、机器学习算法和实验验证，从自噬角度筛选出睡眠剥夺的关键生物标志物CDKN1A、HSPA5和NR4A1，并构建了诊断模型 | 未提及明显的局限性 | 识别与睡眠剥夺相关的自噬基因生物标志物，并揭示其在睡眠剥夺发病机制中的作用 | 小鼠脑组织、人外周血样本、大鼠脑组织 | 机器学习 | 睡眠剥夺 | RNA-seq, RT-qPCR, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 小鼠脑组织数据集GSE33302和GSE9442、人外周血样本数据集GSE9441和GSE3767、单细胞RNA-seq数据集GSE37665；大鼠模型：雄性Sprague-Dawley大鼠连续睡眠剥夺7天 | Illumina | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 未明确指定 | 未明确指定 |
| 342 | 2026-06-12 |
The prognostic factors and immune microenvironment of primary plasma cell leukemia: the KMMWP-2204 study
2026-Jun-11, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2026.300772
PMID:42273949
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研究论文 | 基于韩国多中心队列，分析原发性浆细胞白血病的预后因素及免疫微环境特征，并结合单细胞RNA测序探索其生物学机制 | 确认了2021年国际骨髓瘤工作组5%循环浆细胞诊断阈值的临床一致性，并首次通过scRNA-seq揭示pPCL中免疫分化异常和骨髓源性免疫调节信号特征 | 回顾性研究设计存在基线风险差异偏倚，scRNA-seq样本量较小（仅4例pPCL），发现需在大规模队列和正交功能研究中验证 | 明确原发性浆细胞白血病的预后因素、治疗结局及其免疫微环境特征 | 127例新诊断pPCL患者（韩国20个中心），4例pPCL、2例多发性骨髓瘤和3例健康供者的骨髓样本 | 数字病理学 | 浆细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 医学数据 | 127例患者临床数据（其中9例骨髓样本用于单细胞测序：4例pPCL、2例多发性骨髓瘤、3例健康供者） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 343 | 2026-06-12 |
In vitro ibuprofen has gene regulatory and anti-inflammatory properties in peripheral blood mononuclear cells of individuals with infection-provoked neurodevelopmental disorders
2026-Jun-11, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02282-7
PMID:42274981
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研究论文 | 研究布洛芬对感染诱发的神经发育障碍患者外周血单个核细胞的基因调控和抗炎作用 | 首次通过单细胞RNA测序在体外研究布洛芬对感染诱发的神经发育障碍患者的转录和抗炎效应 | 样本量小（仅2例患者），需进一步验证 | 探讨布洛芬对感染诱发的神经发育障碍的治疗机制 | 18名伴有感染诱发症状的神经发育障碍儿童（PANS或自闭症退行）及其外周血单个核细胞 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 45,134个细胞（来自2例患者及对应的年龄、性别匹配对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 344 | 2026-06-11 |
A 4-guanidinobutanoic acid-SLC36A1 axis drives a microbiota‒host feedback loop to regulate intestinal homeostasis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2639216
PMID:41782409
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物4-胍基丁酸通过SLC36A1轴驱动微生物-宿主反馈回路，调控肠道稳态 | 首次发现4-胍基丁酸作为关键调节因子，通过SLC36A1与Hedgehog信号通路增强肠道干细胞功能和杯状细胞分化，形成微生物-宿主反馈循环，并揭示其在溃疡性结肠炎中的诊断和治疗潜力 | NA（摘要未提供明确局限性信息） | 探究肠道微生物代谢物4-胍基丁酸在调节肠道稳态中的作用机制 | 肠道干细胞、杯状细胞、肠道屏障功能 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、类器官共培养、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据 | NA（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2026-06-11 |
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出了scMAG算法，一种通过多阶段深度融合与流形感知门控策略整合单细胞多组学数据的方法 | 创新性地提出了多阶段特征深度融合形式化方法，结合多核心流形保持与引导门控优化策略，实现了自适应对齐多组学潜在空间并优化数据分布 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞多组学数据的聚类精度和可视化效果，同时实现多组学潜在空间的自适应对齐并抑制生物噪声与测量误差 | 单细胞多组学数据集，包括scRNA-seq、scATAC-seq和ADT数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度融合网络 | 单细胞多组学数据 | 配对数据集（scRNA-seq与scATAC-seq和ADT） | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 | NA | NA |
| 346 | 2026-06-11 |
Dynamic Reprogramming of PDGFRA-Expressing Stromal Cells Facilitates WNT-Driven Transformation by Promoting a Fetal-Like State in the Intestinal Epithelium
2026-Jun-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0101
PMID:41784677
|
研究论文 | 本研究揭示PDGFRA表达的成纤维细胞通过分泌配体促进肠上皮进入胎儿样状态，从而驱动WNT介导的肿瘤转化 | 首次阐明PDGFRA+成纤维细胞在WNT驱动的肿瘤发生早期动态重编程并促进肠上皮胎儿样状态，发现TGFβ信号在此过程中的关键作用 | 主要基于小鼠模型和体外类器官实验，缺乏人体组织样本验证；胎儿样状态与肿瘤形成的因果关系需进一步确认 | 探究PDGFRA+基质成纤维细胞在WNT介导的肠道肿瘤发生中的动态变化及其对上皮细胞状态的影响 | PDGFRA表达的成纤维细胞、WNT驱动的肿瘤上皮细胞、肠隐窝绒毛轴 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 347 | 2026-06-11 |
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag044
PMID:41779628
|
研究论文 | 通过选择性抑制IκB激酶α靶向CYLD皮肤综合征中的非经典核因子κB信号 | 首次在CYLD皮肤综合征肿瘤角质形成细胞中发现非经典NF-κB信号激活，并鉴定IKKα为候选治疗靶点 | 主要基于患者来源的体外模型，缺乏体内实验和临床验证 | 探究CCS肿瘤中NF-κB信号通路，识别可药物靶向的分子 | CCS患者肿瘤细胞及肿瘤球体培养模型 | 医学研究 | CYLD皮肤综合征 | 转录组学,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 患者来源的CCS肿瘤细胞分群和肿瘤球体培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2026-06-11 |
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250363
PMID:41787974
|
研究论文 | 利用Scissor算法识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因，并据此对结直肠癌亚型进行分类及评估免疫景观 | 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据，筛选出与结直肠癌极差预后显著相关的Scissor+成纤维细胞亚群，并揭示其激活促转移通路及免疫活化但功能耗竭的特征 | 未明确提及，但可能包括数据来源的偏倚、Scissor算法对细胞亚群识别的可重复性、以及预测标志物的临床验证需求 | 通过整合单细胞与批量转录组数据，识别与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因，从而对结直肠癌进行亚型分类并评估其免疫景观 | 结直肠癌患者的批量RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据及临床信息 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Scissor算法 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个结直肠癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2026-06-11 |
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114757
PMID:41780688
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示胰腺导管腺癌中细胞异质性与动态相互作用方面的应用，包括样本制备、数据分析流程及治疗靶点发现 | 系统整合了scRNA-seq在解析PDAC肿瘤内异质性、微环境动态变化及生物标志物鉴定中的技术流程与关键发现，并探讨了联合免疫治疗策略 | 未提及Meta分析或计算方法的定量比较，对scRNA-seq技术在PDAC中的临床应用挑战讨论较为笼统 | 阐明单细胞转录组学在胰腺癌异质性及微环境研究中的应用价值与工作流程 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织中的肿瘤细胞、免疫细胞、肿瘤相关成纤维细胞及微环境成分 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 350 | 2026-06-11 |
BPHL promotes TNBC stemness by resolving R-loops via POLR2A lactylation inhibition and BARD1-mediated ubiquitination
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218388
PMID:41765360
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研究论文 | 本文揭示了BPHL通过抑制POLR2A乳酸化修饰和BARD1介导的泛素化来解析R-loop，从而维持三阴性乳腺癌干细胞的干性 | 首次发现BPHL通过调控R-loop稳态维持三阴性乳腺癌干细胞干性，并阐明了其通过POLR2A乳酸化抑制和BARD1介导的泛素化解决R-loop的分子机制 | 结果主要基于体外和动物模型，临床验证样本量有限 | 阐明三阴性乳腺癌干细胞中R-loop稳态的调控机制及BPHL的作用 | 三阴性乳腺癌干细胞和肿瘤样本 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个乳腺癌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 351 | 2026-06-11 |
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Transporter Gene Programs in Human Spermatogonial Stem Cells
2026-May, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11092-x
PMID:41770292
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研究论文 | 整合批量芯片和单细胞转录组数据分析揭示人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因程序 | 首次系统性描绘人类精原干细胞中线粒体转运蛋白（TOM/TIM复合体）和转运蛋白基因的转录谱，并识别关键枢纽基因和潜在miRNA调控机制 | 未在功能水平验证预测的miRNA调控关系，且样本量有限可能影响结果的普适性 | 阐明人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的表达特征和调控网络 | 人类精原干细胞富集群体（每组3个生物学重复） | 机器学习 | NA | 微阵列芯片, scRNA-seq | WGCNA, STRING/cytoHubba, limma | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 3组生物学重复（微阵列芯片）和多个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 352 | 2026-06-11 |
SEAL: Semantic-Aware Contrastive Learning for scRNA-Seq Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3669981
PMID:41774662
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研究论文 | 提出一种语义感知对比学习方法SEAL用于单细胞RNA测序数据聚类 | 首次将语义感知对比学习应用于scRNA-seq数据聚类，通过随机掩码生成增强数据并利用伪标签捕获语义不变表示 | 未明确说明局限性，但文中提到现有方法在高缺失率和噪声数据中无法完全捕获细胞内在特性，该方法可能仍面临类似挑战 | 开发一种稳定的无监督scRNA-seq聚类方法以准确区分不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | 不适用 | scRNA-seq | 对比学习（语义感知对比学习） | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 353 | 2026-06-11 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived small extracellular vesicles accelerate diabetic wound healing by reprogramming fibroblast subpopulations and delivering pro-regenerative cargos
2026-May, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.107910
PMID:41775031
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研究论文 | 人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡通过重编程成纤维细胞亚群和递送促再生因子加速糖尿病伤口愈合 | 首次利用单细胞转录组测序和邻近条形码分析技术揭示了hUC-MSC-sEVs通过重编程成纤维细胞亚群（特别是Trps1+成纤维细胞）和递送功能特异的sEV亚群（如ITGB1富集亚群）的双重机制来加速糖尿病伤口愈合 | 未明确指出具体局限性 | 探究人脐带间充质干细胞来源的小细胞外囊泡在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 糖尿病小鼠伤口模型中的成纤维细胞和小细胞外囊泡亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序、批量RNA测序、邻近条形码分析、免疫荧光 | 未指定 | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 354 | 2026-06-11 |
PH2ST: Prompt-guided hypergraph learning for spatial transcriptomics prediction in whole slide images
2026-May, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2026.104008
PMID:41775138
|
研究论文 | 提出了一种基于提示引导的超图学习框架PH2ST，用于从H&E染色全切片图像预测空间转录组学数据 | 提出提示引导的超图学习框架，利用有限的空间转录组信号指导多尺度组织学表示学习，实现准确稳健的空间基因表达预测 | 未明确说明，但基于摘要推断可能受限于数据集规模和提示采样策略的普适性验证 | 开发从H&E染色图像预测空间转录组学的计算框架，克服现有技术成本高、覆盖有限和异质性挑战 | 两个公共空间转录组学数据集 | 数字病理学 | 未指定 | 空间转录组学 | 超图学习、提示引导学习 | 图像（H&E染色全切片图像）和基因表达数据 | 两个公共空间转录组数据集 | 未指定 | 空间转录组学 | 未指定 | 未指定 |
| 355 | 2026-06-11 |
Inhibiting VTCN1 overcomes immunosuppression in colorectal cancer to activate T cells via galectin-3
2026-May-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00323.2025
PMID:41778365
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研究论文 | 通过多组学框架阐明VTCN1-半乳糖凝集素3轴在结直肠癌中驱动免疫抑制，抑制VTCN1可激活T细胞并抑制肿瘤进展 | 首次揭示VTCN1-半乳糖凝集素3轴作为结直肠癌免疫抑制的关键通路，并验证VTCN1抑制剂SGN-B7H4的治疗潜力 | NA | 探究VTCN1和半乳糖凝集素3在结直肠癌免疫抑制中的作用机制及治疗潜力 | 结直肠癌细胞及T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | 单细胞数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 356 | 2026-06-11 |
Comparison of single-cell sequencing technologies for allele-specific expression analysis in rabbit spermatids
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111224
PMID:41780767
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研究论文 | 比较单细胞测序技术在兔精子细胞等位基因特异性表达分析中的应用 | 首次在兔精子细胞中利用长读长测序技术进行等位基因特异性表达分析，并比较了不同测序平台的性能 | 短读长测序（Illumina）被认为不适用于该分析，且结果需要进一步验证其在基因生物防治中的适用性 | 识别兔精子细胞中候选等位基因特异性表达基因，用于未来基因生物防治研究 | 欧洲兔（Oryctolagus cuniculus）的精子细胞 | 数字病理学 | 遗传性疾病 | 单细胞测序、长读长测序、短读长测序 | NA | 序列数据 | 兔精子细胞样本（具体数量未提及） | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 长读长测序平台（具体未指定） | 短读长测序采用Illumina平台，长读长测序采用未明确指定的平台 |
| 357 | 2026-06-11 |
Neutrophil CAPNS1 regulates cardiac inflammation and injury by promoting NETosis in CVB3-induced myocarditis
2026-May, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 研究了中性粒细胞CAPNS1在柯萨奇病毒B3诱导的心肌炎中通过促进NETosis调节心脏炎症和损伤的作用 | 首次揭示中性粒细胞CAPNS1通过calpain介导的Nesprin 1降解促进NETs形成，从而加重病毒性心肌炎的心脏损伤，并提出了靶向CAPNS1的新治疗策略 | 未提及 | 探讨中性粒细胞CAPNS1在CVB3诱导心肌炎中的免疫调节机制及其作为治疗靶点的潜力 | CVB3感染的小鼠模型及分离的骨髓来源中性粒细胞 | machine learning | 心肌炎 | 单细胞测序，免疫共沉淀，条件性基因敲除 | NA | 单细胞测序数据 | CVB3感染小鼠及对照小鼠的心脏组织、骨髓来源中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2026-06-11 |
Targeting ACSS2 disrupts metabolic-epigenetic crosstalk to restore apoptosis and temozolomide chemosensitivity in pancreatic neuroendocrine tumors
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218406
PMID:41786280
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研究论文 | 本研究发现乙酰辅酶A合成酶2通过代谢表观遗传轴驱动胰腺神经内分泌肿瘤对替莫唑胺的耐药性，并揭示了靶向ACSS2/BCL6/P53通路可恢复凋亡和化疗敏感性 | 首次阐明ACSS2通过代谢-表观遗传互作调控BCL6转录进而抑制TP53表达的耐药机制，并验证了ACSS2抑制剂联合免疫治疗的协同增效作用 | 未提及具体研究局限 | 探究胰腺神经内分泌肿瘤对替莫唑胺耐药的分子机制并寻找治疗新靶点 | 胰腺神经内分泌肿瘤细胞、患者源性类器官和免疫活性Rip1-Tag2小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床队列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 359 | 2026-06-11 |
Sensitizer-Induced Basophils Accelerate Skin Re-Epithelialization via IL-4/IL-13-Mediated Macrophage Polarization
2026-May, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70279
PMID:41787818
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research paper | 本研究揭示致敏物诱导的嗜碱性粒细胞通过IL-4/IL-13介导的巨噬细胞极化加速皮肤再上皮化 | 发现嗜碱性粒细胞在致敏皮肤中具有促进组织修复的新功能，超越其传统致痒和促炎作用，并阐明IL-4/IL-13依赖的巨噬细胞重编程机制 | 未在论文标题和摘要中明确说明局限性 | 探究致敏皮肤反应中募集的嗜碱性粒细胞是否促进伤口愈合 | 嗜碱性粒细胞在致敏物诱导的皮肤损伤模型中的功能 | machine learning | atopic dermatitis | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、RT-qPCR、免疫组化 | NA | image | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2026-06-11 |
Tumor-Educated Extracellular Vesicle-Derived LINC01116 Drives Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Immunosuppression by Sponging miR-3614-5p to Upregulate ARHGAP1
2026-Apr-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116347
PMID:41764827
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研究论文 | 该文章研究了肿瘤教育细胞外囊泡来源的LINC01116通过海绵吸附miR-3614-5p上调ARHGAP1，驱动非小细胞肺癌进展和免疫抑制 | 首次发现细胞外囊泡来源的LINC01116在非小细胞肺癌中通过ceRNA机制调控ARHGAP1表达，并促进肿瘤进展和免疫抑制 | 未提及具体局限性 | 探究细胞外囊泡来源的长链非编码RNA在非小细胞肺癌进展和肿瘤免疫微环境中的作用 | 非小细胞肺癌患者组织样本、血液样本、细胞系、小鼠模型 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA数据集中的非小细胞肺癌样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA数据使用的测序平台 |