单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
341	2025-07-03	Endothelium-specific sensing of mechanical signals drives epidermal aging through coordinating retinoid metabolism 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.112299 PMID:40585982	research paper	研究揭示了机械响应性内皮细胞通过整合素介导的机械转导调控视黄醇代谢，从而驱动皮肤衰老的机制	首次揭示了内皮细胞通过机械信号感知调控皮肤衰老的三方轴（成纤维细胞-内皮-表皮）机制，并验证了视黄醇代谢物的 rejuvenating 效果	研究主要基于体外皮肤类器官模型和小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究	探究机械敏感的内皮细胞在皮肤衰老过程中的作用机制	人类皮肤样本（年轻、中年、老年）、小鼠衰老模型、皮肤类器官系统	生物医学	皮肤衰老	scRNA-seq、空间转录组学、PCCFM、CellChat分析、RNA-seq、免疫荧光染色、HE染色、RT-qPCR	皮肤类器官模型、小鼠衰老模型	单细胞转录组数据、空间转录组数据、机械特性数据	不同年龄段的人类皮肤样本（具体数量未明确说明）、小鼠模型和皮肤类器官系统
342	2025-07-03	Epithelial cells with high TOP2A expression promote cervical cancer progression by regulating the transcription factor FOXM1 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1604960 PMID:40589640	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究宫颈癌中高表达TOP2A的上皮细胞亚群及其在肿瘤进展中的作用	发现了一个高表达TOP2A的上皮细胞亚群，该亚群通过LAMC1-(ITGA3-ITGB1)信号通路在肿瘤微环境中起关键作用，并揭示了FOXM1作为关键转录因子的功能	未提及样本量是否足够大，以及是否进行了临床验证	探索宫颈癌进展中上皮细胞的分子特征，为精准治疗提供潜在靶点	宫颈癌中的上皮细胞(EPCs)	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), Slingshot, Cellchat, SCENIC, CCK-8, 集落形成实验, EDU实验, 划痕实验, transwell实验	NA	单细胞RNA测序数据	NA
343	2025-07-03	ScRNA-seq combined with ATAC-seq analysis to explore the metabolic balance mechanism of CCl4-induced liver inflammatory injury 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1600685 PMID:40589742	研究论文	通过结合scRNA-seq和ATAC-seq分析，探索CCl4诱导的肝脏炎症损伤的代谢平衡机制	首次揭示了肝细胞组蛋白乙酰化随损伤时间延长而增强的现象，并发现了脂肪酸代谢在肝细胞损伤中的主导作用，以及Zhx2和Zbtb20在代谢平衡恢复中的关键调控作用	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探索CCl4诱导的肝损伤后的细胞代谢机制	CCl4诱导的慢性肝损伤小鼠模型	生物信息学	肝病	scRNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq	NA	基因组数据	小鼠模型
344	2025-07-03	Sphingosine-1-phosphate stimulates colorectal cancer tumor microenvironment angiogenesis and induces macrophage polarization via macrophage migration inhibitory factor 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1564213 PMID:40589755	研究论文	本研究通过整合多组学数据和体外实验，探讨了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）在结直肠癌肿瘤微环境中的作用及其通过巨噬细胞迁移抑制因子（MIF）途径促进血管生成和诱导巨噬细胞极化的机制	揭示了S1P在结直肠癌肿瘤微环境中通过MIF途径促进血管生成和巨噬细胞极化的新机制，并提出了抑制S1P合成可能具有抗肿瘤效果的新策略	研究主要基于体外实验和组学数据分析，缺乏体内实验验证	阐明S1P在结直肠癌肿瘤微环境中的作用机制及其对血管生成和巨噬细胞极化的影响	结直肠癌肿瘤微环境中的S1P及其相关分子机制	肿瘤生物学	结直肠癌	RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组化染色（IHC）, 空间转录组学	NA	基因表达数据, 蛋白质表达数据	NA
345	2025-07-03	Therapeutic implications of cancer-associated fibroblast heterogeneity: insights from single-cell and multi-omics analysis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1580315 PMID:40589759	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多组学数据分析，探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤微环境中的功能作用	识别了四种CAF亚群及其与肿瘤相关信号通路的差异，开发了用于生存预测和免疫治疗敏感性评估的风险评分模型（RiskScore），并验证了核心基因在肿瘤发展中的关键作用	研究可能受限于样本数量和多样性，且实验验证仅在部分基因上进行	探索CAF异质性及其在肿瘤微环境中的功能作用，为个性化治疗提供理论支持	癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的亚群	肿瘤生物学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多组学数据分析、siRNA干扰、qPCR、Western blotting	RiskScore模型、Cox和LASSO回归	单细胞RNA测序数据、多组学数据	未明确提及具体样本数量
346	2025-07-03	Cell types and neuronal genetic architecture in the rat CSF-contacting nucleus and the role of 5-HT in this nucleus in mediating morphine addiction through the brain-CSF circuit 2025, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fnins.2025.1603486 PMID:40589789	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征，并探讨了其在吗啡成瘾中的作用机制	首次系统描绘了脑脊液接触核的单细胞转录组图谱，发现其通过调控5-HT释放参与脑脊液介导的神经调节机制	研究主要基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	阐明脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征，探究其在吗啡成瘾中的作用机制	大鼠脑脊液接触核	神经科学	药物成瘾	单细胞RNA测序、化学遗传学技术、UPLC-MS、ELISA	NA	基因表达数据、行为学数据、生化检测数据	单细胞RNA测序数据(登录号CRR790158)
347	2025-07-03	Spatial Transcriptomic Analyses of Spermatogenesis 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4698-4_3 PMID:40601269	研究论文	本文介绍了空间转录组技术在精子发生研究中的应用，并提供了使用Curio Biosciences的Seeker（SlideSeq V2）方法的具体步骤	利用空间转录组技术解决了传统转录组方法破坏组织三维结构的局限性，提供了精子发生过程中细胞异质性的空间信息	仅针对小鼠睾丸中的圆形精子细胞进行了示例分析，可能无法全面代表其他生殖细胞类型	探索精子发生过程中的细胞异质性和空间组织	小鼠睾丸组织中的生殖细胞	空间转录组学	NA	空间转录组学（SlideSeq V2）	NA	空间转录组数据	小鼠睾丸组织样本
348	2025-07-03	Diverse NKT cells regulate early inflammation and neurological outcomes after cardiac arrest and resuscitation 2024-12-04, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adq5796 PMID:39630883	研究论文	该研究探讨了心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制，发现特定的NKT细胞与良好的神经预后相关	首次发现多样NKT细胞（dNKT）在心脏骤停后神经保护中的作用，并验证了硫酸酯脂质治疗可改善神经功能	研究结果主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证	探索心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制及潜在治疗靶点	心脏骤停患者和小鼠模型	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序	小鼠基因敲除模型	临床样本数据和小鼠实验数据	大型OHCA患者队列和实验小鼠
349	2025-07-03	Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells 2024-11-27, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adl1666 PMID:39602512	研究论文	本研究利用空间转录组学技术，构建了儿童期狼疮性肾炎(cLN)肾脏组织的单细胞分辨率空间图谱，揭示了肾脏基质与浸润免疫细胞之间的复杂相互作用	首次在单细胞分辨率下结合空间信息解析cLN肾脏组织的细胞互作网络，发现了免疫细胞的特异性定位模式以及空间相关的基因表达模块	样本量较小(8例患者和4例对照)，且单个肾小球转录特征与组织学评分相关性较低	解析儿童期狼疮性肾炎的免疫发病机制	狼疮性肾炎患者的肾脏组织	数字病理学	狼疮性肾炎	空间转录组学	NA	空间转录组数据	8例cLN患者和4例对照个体的肾脏组织样本
350	2025-07-03	Monoclonal antibodies that block Roundabout 1 and 2 signaling target pathological ocular neovascularization through myeloid cells 2024-11-20, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adn8388 PMID:39565875	研究论文	研究开发了针对ROBO1和ROBO2的单克隆抗体，用于阻断SLIT-ROBO信号通路，以治疗病理性眼血管新生	首次开发出能够阻断ROBO1和ROBO2信号传导的人源单克隆抗体，并证实其通过调节髓系细胞功能来减轻病理性眼血管新生	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	开发针对病理性眼血管新生的新型治疗策略	ROBO1和ROBO2受体及其信号通路	生物医学	眼科疾病	单克隆抗体开发、单细胞RNA测序	氧诱导视网膜病变(OIR)和激光诱导角膜新生血管(CNV)小鼠模型	基因表达数据、病理学数据	小鼠模型（具体数量未说明）
351	2025-07-03	A Paradoxical Tumor Antigen Specific Response in the Liver 2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.19.614002 PMID:39372792	research paper	该研究探讨了肝脏中肿瘤特异性CD8+ T细胞的反应及其在抗肿瘤免疫中的作用	揭示了肝脏中肿瘤特异性CD8+ T细胞的高数量但功能耗竭的现象，并发现了SPP1+巨噬细胞与CD8+ T细胞的相互作用机制	研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据，可能需要更多临床验证	研究肝脏中肿瘤特异性CD8+ T细胞的反应及其对肿瘤免疫治疗的影响	小鼠肿瘤模型和患者的肝脏转移瘤	免疫学	肝癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质组学CODEX、高维多组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据	小鼠肿瘤模型和患者样本（具体数量未明确说明）
352	2025-07-03	Molecular pathology, developmental changes and synaptic dysfunction in (pre-) symptomatic human C9ORF72-ALS/FTD cerebral organoids 2024-09-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01857-1 PMID:39289761	研究论文	研究通过iPSC衍生的脑类器官模型，揭示了C9ORF72基因六核苷酸重复扩增（HRE）导致的肌萎缩侧索硬化症（ALS）和额颞叶痴呆（FTD）的早期分子病理和突触功能障碍	首次在3D人脑类器官模型中揭示了C9-ALS/FTD的早期分子病理和突触功能障碍，包括细胞类型丰度和分布的变化	研究样本量有限，且类器官模型可能无法完全模拟人脑的复杂性	理解C9ORF72-HRE导致的ALS和FTD的早期病理机制	C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的iPSC衍生的脑类器官	分子病理学	肌萎缩侧索硬化症, 额颞叶痴呆	iPSC衍生技术, 单细胞RNA测序, 膜片钳电生理学	脑类器官模型	分子和细胞数据, 电生理数据	C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的脑类器官
353	2025-07-03	Spatial transcriptomic analysis of adult hippocampal neurogenesis in the human brain 2024 Sep-Oct, Journal of psychiatry & neuroscience : JPN IF:4.1Q1 DOI:10.1503/jpn.240026 PMID:39414359	研究论文	通过空间转录组学和多重荧光原位杂交技术，评估了人类死后海马样本中的成人海马神经发生现象	结合空间转录组学和多重荧光原位杂交技术，首次在人类死后海马样本中评估成人海马神经发生的存在	样本量小且仅包括男性样本	评估人类成人海马神经发生的存在及其特征	人类死后齿状回（DG）样本	神经科学	NA	空间转录组学, 多重荧光原位杂交	NA	空间转录组数据, 荧光原位杂交图像	婴儿（n = 1, 2岁）, 青少年（n = 1, 16岁）, 年轻成人（n = 2, 平均23.5岁）, 中年（n = 2, 平均42.5岁）, 以及固定冷冻的中年男性DG组织（n = 6, 平均43.5岁）
354	2025-07-03	Microglia-specific IL-10 gene delivery inhibits neuroinflammation and neurodegeneration in a mouse model of Parkinson's disease 2024-08-21, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adm8563 PMID:39167665	研究论文	本研究探讨了在小鼠帕金森病模型中，通过小胶质细胞特异性递送IL-10基因抑制神经炎症和神经退行性变的治疗效果	揭示了IL-10通过诱导小胶质细胞新状态增强吞噬和清除活性，并调节T淋巴细胞分化，为帕金森病治疗提供了新策略	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证其安全性和有效性	探索通过调节神经炎症来保护多巴胺能神经元的新治疗方法	帕金森病小鼠模型中的小胶质细胞和多巴胺能神经元	神经科学	帕金森病	病毒基因递送技术、单细胞转录组学	小鼠帕金森病模型	基因表达数据、细胞表型数据	多个常用帕金森病小鼠模型
355	2025-07-03	Natural killer cells promote neutrophil extracellular traps and restrain macular degeneration in mice 2024-08-14, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adi6626 PMID:39141700	研究论文	研究发现自然杀伤细胞（NK细胞）通过促进中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）的形成来抑制小鼠模型中的黄斑变性	首次揭示了NK细胞在nvAMD中的保护作用及其通过CCR5和NKG2D的机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本数据有限	探究自然杀伤细胞在新生血管性年龄相关性黄斑变性（nvAMD）中的作用机制	自然杀伤细胞（NK细胞）、中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）、小鼠模型和人类样本	免疫学	黄斑变性	Olink蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、基因敲除研究	小鼠模型	蛋白质组数据、RNA测序数据	小鼠模型和有限的人类供体样本
356	2025-07-03	Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19 2024-07-17, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136 PMID:39018367	研究论文	通过比较临床样本和动物模型的单细胞RNA测序数据，揭示了IFN-γ在急性COVID-19后呼吸道后遗症中的关键作用	首次在人类和小鼠模型中比较了呼吸道PASC的单细胞RNA测序数据，并确定了IFN-γ作为免疫异常的关键节点	研究主要基于呼吸道样本，可能无法完全代表其他器官系统的PASC症状	理解SARS-CoV-2感染后急性后遗症(PASC)的病因学	临床PASC样本和小鼠PASC模型	免疫学	COVID-19后遗症	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	临床PASC样本和小鼠模型样本（具体数量未提及）
357	2025-07-03	Control of goal-directed and inflexible actions by dorsal striatal melanocortin systems, in coordination with the central nucleus of the amygdala 2024-Jul, Progress in neurobiology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102629 PMID:38763506	研究论文	研究揭示了背侧纹状体中表达黑素皮质素-4受体（MC4R）的多巴胺D1受体神经元在控制小鼠基于奖励可能性的行为灵活性中的作用	发现MC4R+神经元通过抑制背侧纹状体中的即刻早期基因水平来调控行为灵活性，并揭示了其与杏仁核中央核的功能性连接	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究背侧纹状体中MC4R在调控目标导向行为和刻板行为中的作用机制	小鼠的背侧纹状体和杏仁核中央核	神经科学	NA	空间转录组学分析、行为实验	NA	基因表达数据、行为数据	NA
358	2025-07-03	Wnt Signaling Inhibition Prevents Postnatal Inflammation and Disease Progression in Mouse Congenital Myxomatous Valve Disease 2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320388 PMID:38660802	研究论文	本研究探讨了Wnt信号通路在小鼠先天性黏液瘤性瓣膜病（MVD）中的作用及其作为早期治疗靶点的潜力	首次揭示了Wnt信号通路在MVD起始阶段的关键作用，并证明早期抑制Wnt信号可阻止疾病发展	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	阐明Wnt信号通路在MVD发病机制中的作用并探索潜在治疗策略	携带Fbn1C1039G/+基因变异的Marfan综合征小鼠模型	心血管疾病	先天性黏液瘤性瓣膜病	单细胞RNA测序，TCF/Lef-lacZ报告基因系统，免疫荧光	小鼠遗传模型	基因表达数据，组织学图像	野生型和Fbn1C1039G/+小鼠的瓣膜组织
359	2025-07-03	Salivary Gland Tissue Recombination Can Modify Cell Fate 2024-07, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241247484 PMID:38715201	研究论文	通过单细胞RNA测序和成像分析，研究胚胎小鼠唾液腺组织中间质和上皮重组对细胞命运的影响	首次全面无偏地分子表征了组织重组方法在探索细胞命运调控中的作用，并发现了双向诱导的证据	研究仅限于小鼠胚胎唾液腺组织，未涉及其他器官或发育阶段	阐明组织相互作用在细胞分化中的具体作用	胚胎小鼠的腮腺（浆液腺）和颌下腺（主要为粘液腺）	分子生物学	NA	单细胞RNA测序、成像分析	NA	基因表达数据、图像数据	胚胎小鼠唾液腺组织
360	2025-07-03	Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway 2024-Jul, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.31376 PMID:38450771	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和相似性网络分析，探讨了特发性声门下狭窄（iSGS）患者近端气道黏膜中适应性免疫反应的T细胞克隆分布及其抗原靶点	首次揭示了健康气道黏膜中T细胞克隆在多个解剖亚位点的高度保守性，以及iSGS患者疤痕组织中低频率克隆共享抗原靶点的现象	样本量相对较小（iSGS患者32例，健康对照10例），且仅针对特发性声门下狭窄这一特定疾病	探究近端气道黏膜中适应性免疫反应的T细胞克隆分布及其抗原靶点	特发性声门下狭窄患者（iSGS）和健康对照者的气道黏膜组织	免疫学	特发性声门下狭窄	单细胞RNA测序，T细胞受体（TCR）序列分析，GLIPH2算法	NA	RNA测序数据	iSGS患者32例，健康对照10例