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当前共找到 33643 篇文献,本页显示第 341 - 360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
341 2025-12-03
scATAnno: Automated Cell Type Annotation for single-cell ATAC Sequencing Data
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了scATAnno,一个用于自动注释单细胞ATAC测序数据的Python软件包 开发了基于大规模scATAC-seq参考图谱的自动注释工具,无需使用scRNA-seq数据,并整合了KNN和加权距离不确定性评分以提高准确性 NA 开发一种自动化工具,用于单细胞ATAC测序数据的细胞类型注释 单细胞ATAC测序数据 生物信息学 三阴性乳腺癌、基底细胞癌 单细胞ATAC测序 KNN 表观遗传数据 多个数据集,包括外周血单核细胞、三阴性乳腺癌和基底细胞癌样本 NA 单细胞ATAC-seq NA NA
342 2025-12-03
Regorafenib plus nivolumab in unresectable hepatocellular carcinoma: the phase 2 RENOBATE trial
2024-03, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究是一项多中心、单臂、II期临床试验,评估了瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为不可切除肝细胞癌一线治疗的疗效和安全性 首次在II期临床试验中评估瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为uHCC一线治疗的疗效,并通过单细胞RNA测序探索了长期应答者的免疫生物标志物 研究为单臂设计,缺乏对照组,样本量较小(42例患者) 评估瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为不可切除肝细胞癌一线治疗的疗效和安全性,并探索免疫应答的生物标志物 不可切除肝细胞癌患者 NA 肝癌 单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞RNA测序数据 42例患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
343 2025-12-03
Multiomic spatial landscape of innate immune cells at human central nervous system borders
2024-01, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、飞行时间质谱流式细胞术和单细胞空间转录组学等多种技术,全面描绘了人类中枢神经系统边界先天免疫细胞的多组学空间景观 首次在人类样本中系统性地揭示了中枢神经系统边界区域(如脑膜、脉络丛、血管周围间隙)先天免疫细胞(特别是CNS相关巨噬细胞,CAMs)的时空异质性和功能多样性,并比较了生理状态与疾病状态(如胶质母细胞瘤)下髓系细胞分布的差异 样本主要来自死后组织或手术切除样本,可能无法完全反映活体动态过程;空间转录组学分辨率虽高,但尚未达到单细胞水平;对某些罕见细胞亚群的功能验证仍需进一步实验 全面表征人类中枢神经系统边界区域的免疫系统组成、空间分布及在发育、健康和疾病状态下的变化 人类中枢神经系统边界区域的先天免疫细胞(包括小胶质细胞和CNS相关巨噬细胞),以及胶质母细胞瘤样本中的髓系细胞 空间转录组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞空间转录组学, 命运图谱, 高级免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 来自102个个体的超过356,000个转录组;15例外周血干细胞移植患者的脑组织样本;解剖分离的胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
344 2025-12-03
Global and cell type-specific immunological hallmarks of severe dengue progression identified via a systems immunology approach
2023-12, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和靶向蛋白质组学技术,揭示了严重登革热进展的全球和细胞类型特异性免疫学特征 首次在自然感染中证明B细胞携带复制性登革病毒,并系统性地识别了严重登革热进展中的免疫细胞迁移、炎症反应及抗原呈递细胞功能受损等关键特征 研究主要聚焦于儿童血液样本,可能无法完全代表成人或其他组织中的登革热病理机制 定义登革病毒靶细胞并识别严重登革热进展的免疫学标志 儿童血液中的免疫细胞和登革病毒 系统免疫学 登革热 病毒包容性单细胞RNA测序(viscRNA-Seq 2)、靶向蛋白质组学、分泌组分析、功能实验 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组学数据、分泌组数据 儿童血液样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
345 2025-12-02
Astrocytes and Alcohol Throughout the Lifespan
2026-Jan-01, Biological psychiatry IF:9.6Q1
综述 本文综述了星形胶质细胞在酒精使用障碍(AUD)和胎儿酒精谱系障碍(FASD)中的作用,包括其对酒精的反应、异质性、反应性以及细胞外基质重塑的贡献 首次系统回顾了星形胶质细胞在酒精暴露效应中的参与,并强调了单细胞RNA测序在揭示星形胶质细胞异质性和酒精敏感性亚群方面的应用 现有知识存在空白,特别是对酒精暴露敏感的星形胶质细胞亚群和分子的识别不足,需要进一步研究 评估星形胶质细胞在酒精暴露效应中的参与,并探讨其在AUD和FASD发展中的作用 星形胶质细胞及其在酒精使用障碍和胎儿酒精谱系障碍中的生物学角色 神经科学 酒精使用障碍 单细胞RNA测序 NA NA NA NA NA NA NA
346 2025-12-02
5-FU Resistance Facilitates Immune Evasion in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Through ADAM10-Mediated PD-L1 Shedding and Tumour Microenvironment Remodelling
2026-Jan, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示了5-FU耐药通过上调ADAM10和释放可溶性PD-L1,重塑食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境,促进免疫逃逸 发现了ADAM10介导的可溶性PD-L1释放是5-FU耐药导致免疫逃逸的新机制,并提出了靶向ADAM10-PD-L1轴的治疗策略 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体临床试验中验证 探究5-FU耐药如何通过ADAM10介导的PD-L1脱落和肿瘤微环境重塑促进免疫逃逸 5-FU耐药的AKR小鼠食管鳞状细胞癌细胞系及其亲本细胞系,以及异种移植模型 肿瘤免疫学 食管鳞状细胞癌 第三代DNA测序、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 NA 基因组、蛋白质组、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
347 2025-12-02
MIF Facilitates Resistance to Androgen Deprivation Therapy by Regulating AMPD2 Expression in Prostate Cancer Cells
2026-Jan, The Prostate
研究论文 本研究通过CRISPR/Cas9筛选和单细胞RNA测序,发现MIF通过上调AMPD2表达促进前列腺癌细胞增殖,从而介导对雄激素剥夺疗法的耐药性 首次将MIF与ADT耐药性联系起来,并揭示其通过调控AMPD2表达促进前列腺癌细胞增殖的新机制 研究主要基于细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据 探究前列腺癌对雄激素剥夺疗法产生耐药性的分子机制 前列腺癌细胞 癌症生物学 前列腺癌 全基因组CRISPR/Cas9敲除筛选, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
348 2025-12-02
Elucidating Wenshen Xuanbi Decoction's Anti-Osteoporotic Mechanisms via Integrated Multiomics Analysis
2026-Jan, Biomedical chromatography : BMC IF:1.8Q3
研究论文 本研究采用整合多组学方法,系统探讨了温肾宣痹汤(WSXBT)治疗原发性骨质疏松症(POP)的活性成分及作用机制 首次结合HPLC-Q-TOF-MS/MS、网络药理学、转录组学、单细胞RNA测序及WGCNA等多组学技术,全面解析WSXBT抗骨质疏松的多靶点机制,并确认CTNNB1和AKT1为核心靶点 研究主要基于公共数据库和计算模拟,缺乏体内或体外实验的直接验证,且样本来源和具体实验条件未详细说明 阐明温肾宣痹汤抗骨质疏松的活性成分及分子机制 温肾宣痹汤的化学成分及其在原发性骨质疏松症中的作用靶点 多组学分析 骨质疏松症 HPLC-Q-TOF-MS/MS, 网络药理学, 转录组分析, 单细胞RNA测序, WGCNA, 分子对接, 分子动力学模拟 NA 化学质谱数据, 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 转录组分析 NA NA
349 2025-12-02
Imbalances in adrenal hormones and their effects on bone metabolism
2025-Dec-01, Endocrine journal IF:1.3Q4
综述 本文综述了肾上腺激素失衡对骨代谢的影响,重点关注自主皮质醇分泌、原发性醛固酮增多症和嗜铬细胞瘤/副神经节瘤等病理状态,以及衰老过程中的激素变化 利用最新的类固醇谱分析和单细胞转录组技术揭示,在肾上腺皮质腺瘤中,多种类固醇激素共同影响骨代谢,而非单一激素作用 NA 探讨肾上腺激素失衡如何影响骨健康,特别是骨量减少、骨质量下降和骨折风险增加 肾上腺激素失衡相关的病理条件(如自主皮质醇分泌、原发性醛固酮增多症、嗜铬细胞瘤/副神经节瘤)及衰老过程 NA 骨质疏松症 类固醇谱分析,单细胞转录组分析 NA NA NA NA NA NA NA
350 2025-12-02
A Large-Scale Single-Cell Atlas Reveals the Peripheral Immune Panorama of Bacterial Pneumonia
2025-Dec, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 本研究通过构建大规模单细胞转录组图谱,揭示了细菌性肺炎外周免疫全景及其与疾病严重程度的关系 首次在细菌性肺炎中构建了大规模外周血免疫细胞单细胞转录组图谱,并整合临床与分子数据,系统揭示了不同疾病严重程度下外周免疫景观的重塑特征 研究主要关注外周血免疫细胞,未直接分析肺部局部免疫反应;样本量虽大但来自单中心,可能需要多中心验证 阐明细菌性肺炎的免疫学发病机制和疾病消退机制,识别疾病严重程度的关键细胞和分子驱动因素 100名个体的外周血免疫细胞,包括39名重症细菌性肺炎患者、31名轻症患者和30名健康对照 单细胞组学 细菌性肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床数据、分子数据 100名个体(39名重症、31名轻症、30名健康对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
351 2025-12-02
Integrating pathology genomics and single-cell genomics to identify lactate metabolism-related prognostic features and therapeutic strategies for melanoma
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究整合病理基因组学和单细胞基因组学,构建了基于乳酸代谢的预后模型,并探索了黑色素瘤的治疗策略 首次整合多组学数据(包括病理影像特征、单细胞RNA测序、空间转录组学等)系统表征黑色素瘤乳酸代谢特征,并开发了结合病理特征和基因的预后模型,同时通过实验验证了关键基因RAB32的功能 研究主要基于TCGA等公共数据集,外部验证可能有限;模型在临床广泛应用前需进一步前瞻性验证 系统表征黑色素瘤乳酸代谢的分子特征,构建预后模型并探索治疗策略 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者样本及细胞系 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因集变异分析, 机器学习 ResNet50, 10种机器学习算法组合 图像, 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 TCGA队列训练和验证集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
352 2025-12-02
Endothelial SPRY1 deficiency associates with angiogenic-metabolic reprogramming in pulmonary arterial hypertension: a multi-omics analysis of bulk and single-cell transcriptomic profiles
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组测序、高维加权基因共表达网络分析和机器学习,揭示了肺动脉高压中肺毛细血管内皮细胞的扩张及其代谢重编程,并鉴定出SPRY1为关键生物标志物 首次通过多组学分析结合机器学习,在肺动脉高压中系统揭示了毛细血管内皮细胞的异质性扩张与糖酵解-三羧酸循环代谢通路失调的关联,并鉴定出SPRY1这一新型关键生物标志物 研究主要基于GEO数据库的测序数据,虽然在大鼠模型中进行了验证,但临床样本量有限,且机制研究深度有待进一步实验验证 阐明肺动脉高压血管重塑的细胞分子机制,鉴定关键致病因子 肺动脉高压患者的肺组织样本、正常对照肺组织、野百合碱诱导的肺动脉高压大鼠模型 生物信息学 肺动脉高压 单细胞RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,机器学习 机器学习(未指定具体模型) 转录组测序数据 未明确样本数量,包含PAH患者和正常对照的肺组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
353 2025-12-02
Neutrophil-enriched gene signature correlates with teplizumab therapy resistance in different stages of type 1 diabetes
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了与teplizumab治疗1型糖尿病疗效相关的免疫基因特征,并开发了一个基于血液的26基因预测模型 首次在1型糖尿病中通过跨物种(小鼠和人类)单细胞转录组学分析,鉴定出与teplizumab治疗反应相关的特异性免疫细胞特征,特别是中性粒细胞富集特征与治疗抵抗的关联,并开发了高精度的血液基因预测模型 研究样本量相对有限,且主要基于观察性数据,需要在前瞻性队列中进一步验证预测模型的临床实用性 探究teplizumab治疗1型糖尿病疗效异质性的免疫学机制,并开发预测治疗反应的生物标志物 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠和1型糖尿病患者的血液及胰腺样本 单细胞转录组学 1型糖尿病 单细胞转录组测序 弹性网络逻辑回归模型 单细胞RNA-seq数据 来自NOD小鼠的配对外周血和胰腺样本,以及来自AbATE和TN10临床试验的人类全血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
354 2025-12-02
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学方法,识别并验证了结直肠癌中ERO1A阳性肿瘤上皮细胞亚群在促进肿瘤进展和不良预后中的关键作用 首次从多组学角度系统鉴定并验证了ERO1A阳性上皮细胞亚群在结直肠癌中的关键作用,并基于此构建了优于现有111个模型的预后预测工具ETSRM 研究结论主要基于回顾性队列数据,需前瞻性临床研究进一步验证;涉及的信号通路机制有待更深入的实验探索 探究结直肠癌进展的关键驱动细胞亚群及其与肿瘤微环境的相互作用 结直肠癌患者样本(来自21个多中心队列)及相关的细胞与动物模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、生物信息学分析、体外与体内实验 风险预测模型(ETSRM) 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 来自21个多中心队列的2767例结直肠癌样本 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
355 2025-12-02
Heterogeneity of Acute Myeloid Leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络,探索疾病异质性并揭示个性化治疗潜力 首次结合单细胞数据与单样本网络方法(LIONESS)构建患者特异性基因调控网络,实现完美患者区分并识别细胞类型特异性调控程序 网络构建依赖四种推断方法的一致性,可能受算法限制;样本量未明确说明,可能影响泛化性 探究急性髓系白血病在基因调控层面的异质性,为个性化治疗提供基础 急性髓系白血病患者与健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 生物信息学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 基因调控网络推断方法(ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3)与LIONESS 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
356 2025-12-02
Integrating computational pathology and multi-transcriptomics to characterize glioblastoma heterogeneity and identify prognostic biomarkers
2025-Dec, Human pathology IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过整合计算病理学和多转录组学数据,表征胶质母细胞瘤的异质性并识别预后生物标志物 创新性地结合了全切片图像的病理特征、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,并开发了机器学习模型来识别与预后相关的关键基因和细胞亚群 模型在验证集上的C-index相对较低(0.616),样本量可能有限,且研究主要基于TCGA等公共数据集,需要进一步的外部验证 改善胶质母细胞瘤的预后评估并识别潜在的治疗靶点 胶质母细胞瘤(GBM)患者 计算病理学 胶质母细胞瘤 bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 Lasso + plsRcox 图像, 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
357 2025-12-02
IFN-Mediated Bronchial Epithelium Cellular Senescence in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Dec, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中支气管上皮细胞衰老的机制,并探讨了IFN通路抑制剂对衰老的调控作用 首次在COPD患者中利用单细胞RNA测序技术系统分析支气管上皮细胞衰老的分布特征,并发现I/II型IFN介导的衰老表型可通过JAK-STAT或cGAS-STING通路抑制剂调控 研究样本量有限,未明确IFN通路激活的上游驱动因素,且体外培养模型可能无法完全模拟体内微环境 阐明COPD支气管上皮细胞衰老的分子机制及其在疾病发病中的作用 COPD患者和健康对照者的原代支气管上皮细胞及肺组织样本 单细胞组学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 COPD患者与健康对照者的原代支气管上皮细胞(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
358 2025-12-02
Integrative analysis of RiboSis-related gene expression in colorectal cancer: implications for prognosis and immunotherapy
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合分析结直肠癌中核糖体生物发生相关基因的表达,构建了一个预后特征模型,并探讨了其在免疫治疗响应中的潜在应用 首次利用单细胞RNA测序数据结合非负矩阵因子化方法鉴定结直肠癌中与核糖体生物发生相关的细胞亚型,并开发了一个基于多算法机器学习的预后特征模型,该模型在多个数据集中验证了高预测准确性 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据,样本量相对有限,且实验验证仅聚焦于单个枢纽基因PFDN2,未来需要更大规模的前瞻性研究和更全面的功能验证 探索核糖体生物发生相关基因在结直肠癌中的临床意义,包括预后评估和免疫治疗响应预测 结直肠癌组织样本及其中的单细胞数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 非负矩阵因子化, 机器学习集成方法 单细胞RNA测序数据 3个结直肠癌组织的scRNA-seq数据用于初步分析,13个结直肠癌样本的26,961个细胞用于详细研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
359 2025-12-02
Plasminogen activator inhibitor 1 promotes aortic aging-like pathophysiology in humans and mice
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过人类遗传学分析和基因工程小鼠模型,揭示了纤溶酶原激活物抑制剂1(PAI-1)在促进主动脉衰老样病理生理中的作用及其机制 首次结合人类功能缺失性SERPINE1变异体的保护效应与对应基因工程小鼠模型,系统阐明PAI-1通过调控细胞外基质和血管平滑肌细胞可塑性影响血管衰老的机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据来源于遗传变异分析,需进一步在人群中进行干预性验证 探究PAI-1在心血管衰老过程中的作用机制及作为治疗靶点的潜力 携带SERPINE1功能缺失变异的人类个体、Serpine1TA700/+基因工程小鼠、PAI-1过表达小鼠 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞转录组测序 基因工程小鼠模型 遗传学数据、生理学测量数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及基因工程小鼠品系比较 NA 单细胞RNA-seq NA NA
360 2025-12-02
SUV39H2 is a vulnerability in glioblastoma stem cells enhanced by co-targeting SUV39H1
2025-Dec, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究探讨了SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,并评估了同时靶向SUV39H2和SUV39H1对破坏GSC维持的有效性 首次发现SUV39H2是胶质母细胞瘤干细胞的新调控因子,并证明同时靶向SUV39H2和SUV39H1能更有效地破坏GSC维持 研究主要基于体外实验和公共数据集分析,缺乏体内验证和临床前模型数据 探究SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,评估其作为治疗靶点的潜力 胶质母细胞瘤干细胞 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,RT-qPCR,Western blot,肿瘤球形成实验,极限稀释实验 NA RNA-seq数据,mRNA表达数据,蛋白质表达数据 未明确指定具体样本数量,使用了公共数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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