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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-01-17 |
Single-Cell Analysis Reveals a Subset of High IL-12p40-Secreting Dendritic Cells within Mouse Bone Marrow-Derived Macrophages Differentiated with M-CSF
2024-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300431
PMID:38416039
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了在小鼠骨髓来源巨噬细胞中,存在一个高分泌IL-12p40的树突状细胞亚群 | 首次在M-CSF分化的巨噬细胞培养物中识别出一个转录独特的DC样亚群,该亚群在LPS刺激下表现出典型的DC激活程序 | 研究基于体外小鼠BMDM培养模型,可能无法完全反映体内情况;且该DC样亚群无法通过表面标记物分离 | 探究巨噬细胞与树突状细胞在先天免疫中的异质性和功能重叠 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)及其中的细胞亚群 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,微孔分泌检测 | NA | RNA测序数据,基因表达数据 | 小鼠骨髓来源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 342 | 2026-01-16 |
Unveiling CDKN1A and RELA: Machine learning-driven aging biomarkers for precision diagnosis and therapy in knee osteoarthritis
2026-Mar, Journal of orthopaedics
IF:1.5Q3
DOI:10.1016/j.jor.2025.11.045
PMID:41536554
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和机器学习方法,鉴定出CDKN1A和RELA作为膝骨关节炎中下调的生物标志物,并进行了实验验证 | 首次结合多数据集、多种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)和单细胞RNA测序分析,系统性地识别膝骨关节炎中与衰老相关的核心生物标志物,并探索其与免疫细胞浸润、代谢通路及潜在治疗化合物(姜黄素)的关联 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅在动物模型中进行,缺乏大规模临床样本验证;机器学习模型的泛化能力有待进一步在不同队列中验证 | 系统识别膝骨关节炎中与衰老相关的生物标志物,以用于精准诊断和治疗 | 膝骨关节炎(KOA)相关的基因表达数据、衰老相关基因、小鼠KOA模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 基因表达分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、qRT-PCR、Western blotting | LASSO回归、SVM-RFE、随机森林 | 基因表达数据(微阵列、RNA-seq)、单细胞RNA测序数据 | 两个公共基因表达数据集(GSE12021、GSE169077)和一个单细胞RNA测序数据集(GSE176308),以及小鼠KOA模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 343 | 2026-01-16 |
Piezo1 dictates K+ homeostasis through coordinated regulation of the ubiquitin ligase Kelch-like 3 in RBCs and the kidney
2026-Jan-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2513222123
PMID:41533447
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研究论文 | 本研究揭示了机械传感器Piezo1通过协调红细胞和肾脏中泛素连接酶KLHL3的活性来调控钾离子稳态的机制 | 首次发现Piezo1-KLHL3相互作用是红细胞与肾脏之间调控钾离子稳态的关键组织间信号传导机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,人类数据仅来自遗传关联分析,需要进一步验证该通路在人类疾病中的直接作用 | 探究钾离子稳态调控中组织间信号传导的分子机制 | 红细胞、肾脏集合管细胞、小鼠模型、人类遗传数据 | 分子生物学 | 电解质紊乱 | CRISPR基因编辑、单细胞转录组测序、遗传关联分析 | 基因敲入小鼠模型 | 遗传数据、转录组数据、生理参数数据 | 200,367名UK Biobank参与者 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 344 | 2026-01-16 |
Microglial CX3CR1 deficiency regulates the selective vulnerability of cone photoreceptors via STAT3/CCL-ACKR1 signaling in the mouse retina
2026-Jan-15, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01618-7
PMID:41535549
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路导致小鼠视网膜中视锥光感受器选择性死亡的分子机制 | 首次发现CX3CR1缺陷通过激活STAT3/CCL-ACKR1通路介导小胶质细胞神经毒性,并揭示了小胶质细胞-视锥细胞通过CCL-ACKR1相互作用以及小胶质细胞-星形胶质细胞通过Bmp2-Bmpr1a/Bmpr1b对通讯导致视锥选择性丢失的双重机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类或临床样本中得到验证 | 探究神经退行性疾病中神经元选择性易损性的分子机制 | 小鼠视网膜中的小胶质细胞、星形胶质细胞和视锥光感受器 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2026-01-16 |
Whole genome sequence analysis of pulmonary function and COPD in 44,287 multi-ancestry participants
2026-Jan-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03921-y
PMID:41535900
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研究论文 | 本研究通过对44,287名多族裔参与者进行全基因组序列分析,探索与肺功能和慢性阻塞性肺疾病相关的遗传变异 | 首次在多族裔样本中结合全基因组序列、结构变异和基因基础分析,发现新的遗传位点如LY86、MAGI1,并利用单细胞RNA-seq数据验证基因表达 | 研究依赖于特定人群样本,可能无法完全代表所有族裔群体,且功能验证仅限于部分细胞类型 | 识别与肺功能和慢性阻塞性肺疾病相关的低频率或族裔特异性遗传变异 | 44,287名多族裔参与者,包括肺功能测量和慢性阻塞性肺疾病病例对照状态 | 基因组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 全基因组序列分析,单细胞RNA-seq,CRISPR基因编辑 | NA | 基因组序列数据,基因表达数据 | 44,287名多族裔参与者 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2026-01-16 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-15, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌(HCC)患者样本的单细胞转录组数据,识别出具有癌症干细胞样特征的细胞群体,并构建了一个12基因特征用于预测患者生存和治疗反应 | 基于单细胞转录组数据识别HCC中的癌症干细胞样细胞,并开发了一个新的癌症干细胞样细胞风险评分(CARS),用于预测患者对索拉非尼和免疫检查点抑制剂的治疗反应 | 研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏来自患者样本的直接实验验证,且样本量可能有限 | 构建基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因特征,以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌(HCC)患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 基因特征评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 347 | 2026-01-16 |
Biomimetic Liposome Coloaded ES-Cu and PFK15 Amplify Cuproptosis through Inhibition of Glycolysis in Fibroblast-Like Synoviocytes for Rheumatoid Arthritis Therapy
2026-Jan-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17592
PMID:41457948
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研究论文 | 本研究开发了一种仿生脂质体,通过共递送铜死亡诱导剂和糖酵解抑制剂,特异性靶向并杀死类风湿关节炎中的成纤维样滑膜细胞,以治疗类风湿关节炎 | 首次通过单细胞RNA测序揭示RAFLS中过度活跃的糖酵解是抵抗铜死亡的关键机制,并提出并验证了抑制糖酵解可放大铜死亡的假设,进而开发了融合RAFLS膜的仿生脂质体实现特异性靶向共递送 | NA | 开发一种通过放大铜死亡来治疗类风湿关节炎的新策略 | 类风湿关节炎中的成纤维样滑膜细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 348 | 2026-01-16 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-Jan-14, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了人类二维单层和三维肝微组织对乙酰氨基酚暴露的细胞反应 | 首次在单细胞分辨率下,系统比较了2D和3D肝细胞培养模型对乙酰氨基酚暴露的转录组反应,揭示了氧气可用性与药物代谢之间的动态相互作用 | 研究仅使用了24小时的药物暴露时间,且2D培养仅测试了低剂量,可能无法完全反映长期或更广泛剂量范围的毒性效应 | 评估和比较不同体外肝模型(2D单层与3D球状体)在预测药物性肝损伤方面的生理相关性和机制洞察 | 由原代人肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的2D单层和3D球状体培养物 | 单细胞转录组学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 349 | 2026-01-16 |
stRGAT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics via a relational graph attention network
2026-Jan-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07676-9
PMID:41535938
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2026-01-16 |
FOXM1 regulates platelet-induced anoikis resistance in pancreatic cancer cells
2026-Jan-14, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02644-8
PMID:41535944
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研究论文 | 本研究探讨了血小板如何通过调控FOXM1基因表达增强胰腺癌细胞的失巢凋亡抵抗,从而促进转移 | 首次在胰腺癌细胞中详细研究了血小板通过调控FOXM1基因表达来调节失巢凋亡抵抗的机制 | 研究基于体外细胞培养模型,未在体内动物模型中验证 | 探究血小板对胰腺癌细胞失巢凋亡抵抗的调控机制及其在转移中的作用 | 胰腺癌细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、免疫组织化学图像 | 未明确指定样本数量,涉及多个胰腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2026-01-16 |
Tumor-initiating stem cells fine-tune the plasticity of neutrophils to sculpt a protective niche
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.11.001
PMID:41349542
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了肿瘤起始干细胞如何通过调节中性粒细胞的塑性,塑造保护性微环境以影响癌症免疫治疗疗效 | 首次发现SOX2肿瘤起始干细胞通过Fads1-AA-PGE信号通路调节中性粒细胞的塑性,从而影响免疫治疗响应 | 研究主要聚焦于鳞状细胞癌,其他癌症类型中的类似机制尚未验证 | 探究肿瘤相关中性粒细胞异质性及其在癌症免疫治疗中的作用机制 | 肿瘤相关中性粒细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 遗传操作 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 352 | 2026-01-16 |
Tumor-infiltrating bacteria disrupt cancer epithelial cell interactions and induce cell-cycle arrest
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.09.010
PMID:41106380
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤浸润细菌通过破坏上皮细胞接触诱导细胞周期停滞,从而促进化疗耐药性的机制 | 首次通过空间成像和单细胞空间转录组学证明胞外细菌在肿瘤微生态位中的定位及其诱导癌细胞静止和免疫逃逸表型的作用 | 研究主要基于结直肠癌和口腔癌模型,在其他癌症类型中的普适性有待验证,且患者队列规模有限 | 探究肿瘤浸润细菌如何调节癌症进展和治疗耐药性 | 结直肠癌和口腔癌中的肿瘤浸润细菌(如具核梭杆菌)及癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间成像、单细胞空间转录组学、活细胞成像、空间分析、小鼠模型、转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 52名结直肠癌患者队列及独立直肠癌队列 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 353 | 2026-01-16 |
A standardized approach for the isolation of vascular smooth muscle cells from carotid atherosclerotic plaques
2026-Jan-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24161-x
PMID:41519833
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研究论文 | 本文优化了一种从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离高活性血管平滑肌细胞的酶消化方案,并通过单细胞转录组分析验证了其有效性 | 开发了一种简化的酶消化方案,能够高效分离高活性的血管平滑肌细胞,适用于单细胞研究,并通过单细胞RNA测序验证了细胞身份和表型转换 | 样本量较小,仅涉及四个颈动脉斑块(两个稳定和两个不稳定),且来自特定患者群体,可能限制结果的普遍性 | 优化从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离血管平滑肌细胞的方案,以支持下游细胞培养分析和单细胞研究 | 人类颈动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Harmony集成分析、伪时间轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | 四个颈动脉斑块(两个稳定、两个不稳定),来自男性和女性患者,共23,661个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics Chromium | 10X Genomics Chromium平台用于单细胞RNA测序 |
| 354 | 2026-01-16 |
Integrative spatial omics and artificial intelligence: transforming cancer research with omics data and AI
2026-Jan-09, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.01.002
PMID:41520911
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综述 | 本文综述了空间组学与人工智能在癌症研究中的整合应用,探讨了其在数据分析和临床转化方面的进展与挑战 | 整合空间转录组学、空间蛋白质组学与AI驱动计算模型,聚焦肿瘤微环境空间动态,推动精准肿瘤学发展 | 面临高维数据复杂性、计算资源限制、分析流程标准化不足等挑战 | 探索空间组学与AI在肿瘤研究中的应用,以改善治疗结果和深化对癌症机制的理解 | 多组学数据(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、表观基因组学、代谢组学)与组织学空间数据 | 机器学习 | 癌症 | 空间条形码、原位测序、数字空间分析 | 深度学习模型、基于空间图的分析 | 空间组学数据、高维数据集 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 355 | 2026-01-16 |
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Jan-08, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2025.111892
PMID:41519218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化,并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 | 研究仅基于斑马鱼模型,结果外推至哺乳动物或人类需谨慎;未涉及长期暴露后的恢复效应 | 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 | 斑马鱼(Danio rerio) | 单细胞转录组学 | 造血功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 356 | 2026-01-16 |
Machine learning reveals sex-biased platelet-associated molecular signatures in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-06, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2026.107136
PMID:41506349
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析系统性红斑狼疮(SLE)患者的转录组数据,揭示了性别差异相关的血小板分子特征 | 首次整合多个SLE研究的转录组数据,利用机器学习识别出性别特异性候选基因(如GP6),并发现GP6与PTCRA在男性SLE患者中的显著相关性及其与疾病活动指数的关联,揭示了性别依赖的血小板分子表型 | 研究基于公共数据库的转录组数据,样本量相对有限(338人),且未进行实验验证;分析主要依赖生物信息学工具,可能受数据异质性和批次效应影响 | 探索系统性红斑狼疮(SLE)中性别差异的分子基础,特别是血小板相关基因的表达模式 | 338名个体(包括175名正常对照和163名SLE患者)的转录组数据,来自六个公开的SLE研究 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 转录组学分析、差异基因表达分析、单细胞RNA-seq(scRNA-seq) | 机器学习算法(未指定具体模型) | 转录组数据(基因表达数据) | 338名个体(175名正常对照,163名SLE患者) | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学分析 | NA | NA |
| 357 | 2026-01-16 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1473
PMID:41521668
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAN的计算框架,用于从空间转录组学数据中推断空间信息化的转录因子活性 | 提出了一个线性混合效应计算方法,整合了TF-靶基因先验、mRNA表达、空间坐标和组织学特征,以预测具有空间信息的、斑点特异性的TF活性 | NA | 系统性地推断转录因子活性及其在细胞身份中的作用,以充分利用空间转录组学数据的潜力 | 淋巴结、背外侧前额叶皮层、乳腺癌和胶质母细胞瘤的空间转录组学数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 358 | 2026-01-16 |
Clonal Hematopoiesis and Lymphoma-Associated Mutations in Hematopoietic Progenitors in B-Cell Non-Hodgkin Lymphoma
2026-01-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030489
PMID:41490454
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研究论文 | 本研究通过多组学测序方法,系统分析了B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的克隆性造血和淋巴瘤相关突变,揭示了疾病起始前体细胞的作用 | 首次系统性地在B-NHL患者中揭示了克隆性造血突变的B细胞偏向性扩张,并识别了肿瘤促进型和肿瘤浸润型CH克隆的动态差异,为疾病起源提供了新见解 | 样本量相对较小(43例患者),且主要关注特定亚型的B-NHL,可能限制了结果的普遍适用性 | 探究克隆性造血和疾病起始前体细胞在B细胞非霍奇金淋巴瘤发生发展中的作用 | 43例B细胞非霍奇金淋巴瘤患者,包括惰性和侵袭性亚型 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 全外显子组测序、靶向测序、单细胞测序 | NA | 基因组测序数据、单细胞测序数据 | 43例B-NHL患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 359 | 2026-01-16 |
Loss of E3 ligase Ube4A Disrupts Colon Homeostasis and Accelerates Experimental Colitis via Altered Lipid Handling
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.02.697430
PMID:41502940
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶Ube4A在维持结肠稳态中的关键作用,其缺失会通过改变脂质处理过程加剧实验性结肠炎 | 首次阐明了Ube4A在胃肠道中的生理功能,并发现其缺失会导致结肠上皮应激和脂质代谢重编程,从而增加对炎症损伤的敏感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析依赖于公开的单细胞RNA测序数据集,需要进一步在人类组织中进行验证 | 明确Ube4A在结肠中的功能,并确定其缺失如何影响实验性结肠炎的易感性 | 人类结肠组织(健康个体和IBD患者)、全局Ube4A敲除小鼠 | 单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织图像、流式细胞数据 | 未明确具体样本数量,使用了公开的人类单细胞RNA测序数据集和Ube4A敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 360 | 2026-01-16 |
scSurv: a deep generative model for single-cell survival analysis
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf671
PMID:41429574
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scSurv的深度生成模型,用于单细胞生存分析,旨在量化单个细胞对临床结果的异质性影响 | 首次将Cox比例风险模型与单细胞转录组深度生成模型结合,在单细胞分辨率下揭示细胞异质性如何影响癌症患者生存 | 未明确说明模型在更大规模或更复杂疾病类型中的泛化能力限制 | 开发一种方法以在单细胞水平上分析细胞异质性对患者生存的影响 | 单细胞转录组数据,涉及癌症(如黑色素瘤、肾细胞癌)和传染病 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组测序 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |