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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3561 - 3580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3561 | 2025-10-06 |
Impaired myofibroblast proliferation is a central feature of pathologic post-natal alveolar simplification
2024-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94425
PMID:39660606
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多种小鼠模型揭示了肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化病理过程的核心特征 | 首次通过单细胞RNA测序在多种BPD模型中系统证实肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化的核心机制，而非传统认为的TGFβ信号增强 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究支气管肺发育不良(BPD)中肺泡简化的发病机制 | 早产儿支气管肺发育不良和多种小鼠肺泡简化模型 | 单细胞生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 药理学方法, 遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3562 | 2025-10-06 |
Transcriptome Assembly at Single-Cell Resolution with Beaver
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621958
PMID:39574665
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研究论文 | 本文提出了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图结构，开发了高效的动态规划算法，并整合了两个基于51个精心设计特征的随机森林模型来准确估计候选转录本在单个细胞中表达的可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计，未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 开发能够在单细胞分辨率下准确重建全长转录本的组装方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林, 动态规划算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 3563 | 2025-10-06 |
Endothelial KLF11 is a novel protector against diabetic atherosclerosis
2024-10-26, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02473-y
PMID:39462409
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞KLF11在糖尿病动脉粥样硬化中的保护作用机制 | 首次发现内皮KLF11通过抑制内皮-间质转化和炎症反应来保护糖尿病动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究KLF11在糖尿病动脉粥样硬化中的保护机制 | 内皮细胞特异性KLF11转基因和敲除小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，功能获得和缺失实验 | NA | 基因表达数据 | 基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3564 | 2025-10-06 |
Atp13a5 Marker Reveals Pericyte Specification in the Mouse Central Nervous System
2024-Oct-23, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0727-24.2024
PMID:39261008
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学鉴定出小鼠中枢神经系统周细胞的特异性标记物Atp13a5，并建立了相应的基因工具模型 | 首次发现Atp13a5作为中枢神经系统周细胞的特异性标记物，并成功构建了兼具tdTomato报告基因和Cre重组酶的基因敲入模型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索中枢神经系统周细胞的功能特性和分子标记 | 小鼠中枢神经系统周细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组测序，基因敲入技术 | 基因敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据，成像数据 | 小鼠胚胎发育阶段（从E15开始）及成年小鼠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3565 | 2025-10-06 |
CXCL9, CXCL10, and CCL19 synergistically recruit T lymphocytes to skin in lichen planus
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179899
PMID:39190494
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现扁平苔藓中角质形成细胞和成纤维细胞特异性分泌CXCL9、CXCL10和CCL19细胞因子，并证实这些因子能协同增强CD8+ T细胞向皮肤的招募 | 首次揭示CCL19与CXCL9/CXCL10在T细胞招募中的协同作用机制，并发现CCL19可作为扁平苔藿治疗新靶点 | 样本量较小（仅7名患者），需更大规模研究验证发现 | 探究扁平苔藓的分子发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 扁平苔藓患者的配对血液和皮肤样本（病变和非病变组织） | 单细胞转录组学 | 扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，体外迁移实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 7名扁平苔藓患者的配对血液和皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3566 | 2025-10-06 |
LMD: Cluster-Independent Multiscale Marker Identification in Single-cell RNA-seq Data
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.12.566780
PMID:38014159
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研究论文 | 提出了一种名为LMD的新工具，用于在单细胞RNA测序数据中识别局部化基因标记 | 通过构建细胞-细胞亲和图并在细胞图上扩散基因表达值，基于扩散动力学为每个基因评分，实现多分辨率和细粒度的细胞多样性表征 | NA | 开发一种不依赖聚类的多尺度标记识别方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图扩散算法 | 基因表达数据 | 9个单细胞RNA测序数据集，包括小鼠骨髓和毛囊真皮凝聚物数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3567 | 2025-10-06 |
Distinct tumor architectures and microenvironments for the initiation of breast cancer metastasis in the brain
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.015
PMID:39270646
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研究论文 | 本研究揭示了不同类型乳腺癌脑转移的独特肿瘤结构和微环境特征 | 发现TNBC和HER2+乳腺癌在脑转移过程中形成不同的肿瘤结构，并引发差异性的阿尔茨海默病相关小胶质细胞反应 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类组织样本 | 探索乳腺癌脑转移的早期定植机制 | 三阴性乳腺癌和HER2+乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3568 | 2025-10-06 |
The spatial impact of a Western diet in enriching Galectin-1-regulated Rho, ECM, and SASP signaling in a novel MASH-HCC mouse model
2024-Oct-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00660-3
PMID:39402682
|
研究论文 | 本研究通过新型MASH-HCC小鼠模型探讨西方饮食如何通过Galectin-1信号通路影响肿瘤微环境 | 开发了新型MASH-HCC小鼠模型，首次揭示西方饮食通过空间特异性方式调控Galectin-1介导的Rho信号、ECM重塑和SASP通路 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明西方饮食通过Galectin-1信号通路促进MASH向HCC发展的机制 | MASH-HCC小鼠模型和人类MASH-HCC组织 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学，多重免疫组织化学 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 3569 | 2025-10-06 |
Colorectal cancer-associated bacteria are broadly distributed in global microbiomes and drivers of precancerous change
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70702-1
PMID:39384807
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研究论文 | 通过宏基因组分析发现结直肠癌相关细菌在全球微生物组中广泛分布并驱动癌前病变 | 采用参考基因组无关的基因水平聚类方法，首次将约23-40%的肠道细菌与结直肠癌或健康状态关联，并验证了先前未知细菌在癌前病变中的作用 | 研究主要基于已发表的宏基因组数据，需要进一步实验验证具体机制 | 定义全球人群中与结直肠癌和健康相关的肠道细菌规模和成员 | 全球微生物组调查中的肠道细菌 | 微生物组学 | 结直肠癌 | 超深度鸟枪法宏基因组测序，单细胞RNA测序，类器官共培养 | NA | 宏基因组测序数据，单细胞RNA测序数据 | 来自全球微生物组调查的已发表数据 | NA | 宏基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3570 | 2025-10-06 |
Intraocular Immune Response in Human Uveitis: Time to Look Beyond Animal Models
2024-Oct, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.04.026
PMID:38703799
|
综述 | 探讨研究人类葡萄膜炎眼内免疫反应的现有及未来方法 | 提出超越动物模型的研究策略，强调单细胞RNA测序技术在人眼内免疫细胞分析中的优势 | 当前技术成本高且操作复杂，人眼研究样本获取受限 | 比较人类与动物模型在葡萄膜炎免疫反应研究中的优劣 | 葡萄膜炎患者的眼内组织和液体样本 | 免疫学 | 葡萄膜炎 | 组织病理学分析, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 液体样本, 血液样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3571 | 2025-10-06 |
Monocytes Reprogrammed by 4-PBA Potently Contribute to the Resolution of Inflammation and Atherosclerosis
2024-Sep-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325023
PMID:39224974
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用4-PBA重编程单核细胞的新方法，可有效促进炎症消退并减轻动脉粥样硬化 | 首次发现4-PBA可将单核细胞重编程为具有免疫调节功能的消退表型，并阐明其通过CD24介导抗炎活性传播的新机制 | 研究主要基于ApoE-/-小鼠模型，人体应用效果尚需验证 | 开发针对单核细胞的精准治疗方法以解决动脉粥样硬化中的慢性炎症 | 单核细胞和ApoE-/-小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫学方法, 生化遗传学方法, 共培养实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3572 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics reveal intratumoral humoral immunity niches associated with tertiary lymphoid structures in pancreatic cancer immunotherapy pathologic responders
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.22.613714
PMID:39386736
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了胰腺癌免疫治疗病理应答者中与三级淋巴结构相关的瘤内体液免疫微环境 | 首次构建了胰腺癌免疫治疗的空间多组学图谱，发现了TLS特异性空间基因表达特征与患者生存改善的关联，揭示了TLS成熟与IgG/IgA分布共定位的空间特征 | 样本量相对有限（26例肿瘤），研究结果需要在更大队列中验证 | 探究三级淋巴结构在胰腺癌免疫治疗中的作用及其在肿瘤微环境中的空间关系 | 26例接受联合免疫治疗的胰腺导管腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学,空间蛋白质组学,BCR谱分析,H&E图像分析 | 机器学习分类模型,无监督基因表达矩阵因子分解方法,无监督学习 | 图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 26例PDAC肿瘤 | NA | 空间多组学,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 3573 | 2025-10-06 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52490-4
PMID:39294132
|
研究论文 | 开发了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架，用于识别细胞类型特异性的顺式调控元件 | 将高度多重化的CRISPRa扰动与单细胞RNA测序相结合，能够同时测试多个调控元件在特定细胞类型中的功能 | 未明确说明样本规模限制或技术重复次数 | 开发识别细胞类型特异性顺式调控元件的筛选方法 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用493个gRNA文库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3574 | 2025-10-06 |
Oncogenic Calreticulin Induces Immune Escape by Stimulating TGFβ Expression and Regulatory T-cell Expansion in the Bone Marrow Microenvironment
2024-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3553
PMID:38885318
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研究论文 | 本研究揭示了致癌性钙网蛋白通过刺激TGFβ表达和调节性T细胞扩增诱导骨髓微环境中免疫逃逸的机制 | 首次发现CALRdel52突变通过ERK/Sp1/TGFβ1轴促进免疫抑制，并证明靶向该轴可增强T细胞活性 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩大 | 探究致癌性CALR突变在骨髓增殖性肿瘤中诱导免疫逃逸的分子机制 | 骨髓微环境中的TGFβ1产生细胞和调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠MPN模型 | 基因表达数据 | 四个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3575 | 2025-10-06 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.26.600782
PMID:38979296
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研究论文 | 开发了一个名为STAN的计算框架，用于从空间转录组数据推断转录因子活性 | 提出首个整合TF-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和形态学特征的线性混合效应计算方法，实现点特异性TF活性预测 | 方法仅在线性框架下建模，可能无法捕捉复杂的非线性调控关系 | 开发空间信息化的转录因子活性推断方法 | 淋巴结、乳腺癌和胶质母细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据, 成像数据 | 多个组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3576 | 2025-10-06 |
A distribution-free and analytic method for power and sample size calculation in single-cell differential expression
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae540
PMID:39231036
|
研究论文 | 提出了一种基于广义估计方程的scPS方法，用于单细胞差异表达分析中的功效和样本量计算 | 无需假设数据分布，考虑样本内细胞间相关性，采用解析方法而非耗时模拟策略 | 未在摘要中明确说明 | 开发单细胞差异表达分析中功效和样本量计算的统计方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义估计方程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3577 | 2025-10-06 |
Age-related epithelial defects limit thymic function and regeneration
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01915-9
PMID:39112630
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了与年龄相关的非典型胸腺上皮细胞状态及其对胸腺功能和再生的限制机制 | 首次发现两种年龄相关的非典型胸腺上皮细胞状态，这些细胞形成无胸腺细胞的高密度上皮簇，作为TEC生长因子的吸收池并干扰再生通路 | 未明确说明样本数量和研究对象的详细信息 | 探究胸腺年龄相关功能衰退和再生能力下降的细胞机制 | 非造血基质细胞和胸腺上皮细胞 | 空间转录组学 | 衰老相关免疫缺陷 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 谱系追踪, 先进成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3578 | 2025-10-06 |
Fc-engineered antibodies promote neutrophil-dependent control of Mycobacterium tuberculosis
2024-Sep, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01777-9
PMID:39174703
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造识别结核分枝杆菌荚膜的抗体Fc区域，探索了抗体介导的结核病控制机制 | 构建了52种Fc变体抗体，首次发现Fc工程化抗体可通过中性粒细胞依赖性方式促进结核分枝杆菌限制 | 研究主要基于人类全血感染模型，尚未进行体内验证 | 探索抗体Fc介导的结核分枝杆菌限制机制及治疗潜力 | 结核分枝杆菌和工程化抗体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，Fc工程化 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3579 | 2025-10-06 |
Plasma proteomics of acute tubular injury
2024-Aug-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51304-x
PMID:39191768
|
研究论文 | 通过血浆蛋白质组学识别急性肾小管损伤的生物标志物 | 首次使用SomaScan蛋白质组学平台系统鉴定与ATI严重程度相关的血浆生物标志物，并整合多组学数据揭示免疫调节和细胞器应激反应在ATI发病机制中的作用 | 样本量相对有限（434例活检确诊患者），需要在更大队列中验证生物标志物的临床适用性 | 开发急性肾小管损伤的非侵入性生物标志物用于早期检测和药物开发 | 肾病患者（活检确诊）和多个队列研究的参与者 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | SomaScan蛋白质组学、区域转录组学、单细胞RNA测序、通路分析 | NA | 血浆蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 主要队列434例活检确诊肾病患者，验证队列包括KPMP（44例）、ARIC（4610例）和CHROME（268例） | SomaLogic | 血浆蛋白质组学 | SomaScan | SomaScan蛋白质组学平台 |
| 3580 | 2025-10-06 |
Integration of Clinical Trial Spatial Multiomics Analysis and Virtual Clinical Trials Enables Immunotherapy Response Prediction and Biomarker Discovery
2024-Aug-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0943
PMID:38861365
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研究论文 | 本研究开发了一种计算模型，整合空间多组学分析和虚拟临床试验，用于预测肝细胞癌免疫治疗反应和发现生物标志物 | 开发了能够同时追踪器官尺度肿瘤进展和捕获肿瘤空间异质性的新型计算模型，将数学建模与高通量空间多组学数据相结合 | 模型参数主要来源于文献，需要进一步临床验证 | 促进免疫治疗方案设计和生物标志物发现 | 肝细胞癌患者 | 计算生物学 | 肝细胞癌 | 空间定量系统药理学模型，成像质谱流式技术，空间转录组学 | 空间定量系统药理学模型 | 空间多组学数据，空间蛋白质组学数据，空间转录组学数据 | 来自新辅助HCC临床试验和独立抗PD1单药治疗研究的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组分析 |