单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 3561 - 3580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3561 | 2026-02-13 |
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Feb-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514786
PMID:41674342
|
研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞激活蛋白（FAP）通过非酶促机制，经由FAP/PLAUR/ITGB1/FAK轴介导的成纤维细胞-巨噬细胞相互作用，促进胸主动脉夹层（TAD）的发生发展 | 首次发现FAP在TAD中通过非酶促功能（而非其已知的蛋白酶活性）发挥作用，具体机制是FAP直接结合巨噬细胞上的PLAUR，激活ITGB1/FAK信号通路，驱动促炎巨噬细胞极化 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限；FAP非酶促作用的具体结构域和结合位点有待进一步阐明；靶向该通路的治疗策略尚未进行临床前疗效评估 | 探究成纤维细胞激活蛋白（FAP）在胸主动脉夹层（TAD）发病机制中的作用及其分子机制 | 人类TAD组织标本、β-氨基丙腈诱导的小鼠TAD模型、全局性和成纤维细胞特异性Fap基因敲除小鼠 | 病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、表面等离子共振（SPR）、免疫共沉淀（co-IP）、药理学抑制 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确具体样本数量，涉及人类TAD标本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3562 | 2026-02-13 |
SpatialESD: Spatial Ensemble Domain Detection in Spatial Transcriptomics
2026-Feb-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520912
PMID:41677098
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SpatialESD的空间集成域检测方法，用于改进空间转录组学数据中的空间域检测 | SpatialESD通过整合不同空间域检测方法的结果，捕获直接共现模式和多尺度间接关系，提高了空间域检测的鲁棒性和准确性 | NA | 改进空间转录组学数据中的空间域检测任务 | 空间转录组学数据，包括模拟数据集和真实样本（如人脑、乳腺癌和卵巢癌） | 空间转录组学 | 乳腺癌, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 集成方法 | 空间转录组学数据 | 多个10x Visium空间转录组学数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 3563 | 2026-02-13 |
Diagnostic model and identification of IGFBP2 as an aging-related biomarker and therapeutic target for systemic sclerosis-associated interstitial lung disease through integrated bioinformatics and machine learning approaches
2026-Feb-12, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004351
PMID:41677271
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法，识别了IGFBP2作为系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）的衰老相关生物标志物和治疗靶点 | 结合临床数据、基因表达分析和机器学习算法，首次将IGFBP2鉴定为SSc-ILD的关键衰老相关基因，并构建了诊断模型 | 研究样本量有限（106例患者），且主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证和更大规模临床研究 | 识别SSc-ILD的临床特征和衰老相关遗传标志物，验证IGFBP2在基底细胞衰老和纤维化进展中的作用 | 系统性硬化症患者（SSc-ILD和SSc-NILD组）、小鼠模型、基因表达数据集 | 机器学习 | 系统性硬化症相关间质性肺病 | 基因表达分析、免疫荧光、定量PCR、Western blotting、单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据、临床数据 | 106例患者（73例SSc-ILD，33例SSc-NILD）、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3564 | 2026-02-13 |
A systems biology framework uncovers multi-level genetic regulation of dizziness/vertigo through eQTL-GWAS integration and single-cell analysis
2026-Feb-11, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2627258
PMID:41640369
|
研究论文 | 本研究通过整合GWAS、eQTL和单细胞分析，构建了一个系统生物学框架，以揭示眩晕/头晕的多层次遗传调控机制 | 首次将GWAS与脑单细胞类型、免疫细胞和血浆的eQTL数据整合，并结合听觉神经的单细胞RNA测序分析，系统性地揭示了眩晕/头晕的遗传和细胞基础 | 研究主要基于遗传关联和表达数据，功能验证和临床转化仍需进一步实验 | 揭示眩晕/头晕的分子机制，发现新的治疗靶点 | 眩晕/头晕患者及相关遗传和表达数据 | 系统生物学 | 神经系统疾病 | GWAS, eQTL分析, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 系统生物学整合框架 | 遗传数据, 表达数据, 单细胞转录组数据 | 涉及多个公共数据集（包括oneK1K免疫细胞等），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3565 | 2026-02-13 |
Efficacy and Safety of Tunlametinib in Adults with Inoperable Neurofibromatosis Type 1-Associated Plexiform Neurofibromas: Phase IIa Trial and Biomarker Research
2026-Feb-11, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3291
PMID:41671075
|
研究论文 | 本文报道了tunlametinib在成人不可手术的神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤中的疗效和安全性的IIa期临床试验及生物标志物研究 | 首次在成人PN患者中评估tunlametinib的疗效和安全性，并结合单细胞转录组学分析探索了治疗反应的异质性 | 单臂、开放标签设计，样本量较小（15例），且单细胞测序仅分析了3例患者的样本 | 评估tunlametinib治疗成人不可手术PN的疗效和安全性，并探索生物标志物 | 成人不可手术、放射学可测量的丛状神经纤维瘤患者 | NA | 神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、患者报告结果、单细胞转录组数据 | 15例成人患者（10男5女，中位年龄27岁） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3566 | 2026-02-13 |
Single-cell resolution of splicing regulation in peripheral blood mononuclear cells uncovers heterogeneity-driven mechanisms underlying human complex traits
2026-Feb-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69325-z
PMID:41672992
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，在欧洲人群的外周血单个核细胞中，系统性地研究了遗传变异对选择性剪接的调控及其与复杂性状的关联机制 | 首次在单细胞分辨率下，系统性地揭示了遗传变异对选择性剪接的细胞类型特异性调控，并阐明了剪接调控作为复杂性状易感位点作用机制的重要性 | 研究仅针对欧洲血统人群，结果可能无法直接推广到其他人群；样本量相对有限（980人） | 探究遗传变异在免疫细胞类型和人口统计学层次上对选择性剪接的调控机制，及其与复杂性状的关联 | 欧洲血统人群的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | 复杂性状（多基因性状） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），基因分型 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因型数据 | 980名欧洲血统个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3567 | 2026-02-13 |
B-Cell Landscape in Inflamed Dental Pulp Reveals Potential Autoimmune Involvement
2026-Feb-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251415328
PMID:41673562
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织病理学分析，揭示了牙髓炎中B细胞的动态变化及其潜在的自身免疫参与机制 | 首次从B细胞角度全面解析牙髓炎，发现B细胞在炎症中的促炎作用及自身反应性倾向，为牙髓炎发病机制提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型和有限的组织样本，人类样本的验证及长期临床意义需进一步探索 | 探究牙髓炎中B细胞的角色及其在局部病理和全身免疫特征中的潜在贡献 | 健康和炎症状态下的牙髓组织，包括人类和小鼠样本 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序，组织病理学分析，多重免疫荧光，流式细胞术，孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织图像，血清学数据 | 未明确指定样本数量，但包括健康和炎症牙髓组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3568 | 2026-02-13 |
Integrated analysis of spatial and single-cell profiles reveals cell type-specific regulation of synaptic plasticity in human brain aging
2026-Feb-10, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf202
PMID:41495924
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据，揭示了人类前额叶皮层衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制 | 首次整合单细胞多组学（scRNA-seq和scATAC-seq）与空间转录组学技术，系统解析了人脑衰老过程中兴奋性神经元的表观遗传和转录调控变化，并识别出EGR1作为突触可塑性的关键潜在调控因子 | 研究样本量相对有限（51例），且为横断面研究，无法确定因果关系；主要关注前额叶皮层，其他脑区的衰老机制可能不同 | 揭示人类前额叶皮层衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制，寻找与认知衰退相关的生物标志物和治疗靶点 | 51例健康人类前额叶皮层样本，分为青年、中年和老年组 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间基因表达数据 | 51例人类前额叶皮层样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3569 | 2026-02-13 |
Mouse skeletal muscle satellite cells co-opt the tenogenic gene Scleraxis to instruct regeneration
2026-Feb-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95854
PMID:41660703
|
研究论文 | 本研究揭示小鼠骨骼肌卫星细胞在再生过程中利用肌腱基因Scleraxis来指导肌肉再生 | 发现Scleraxis在成年肌肉干细胞中的表达模式及其对肌肉再生的关键作用，并通过单细胞RNA测序和CUT&RUN技术识别其直接靶基因 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本，且机制探索可能不完全 | 探究骨骼肌再生过程中Scleraxis基因的功能及其在肌肉干细胞中的作用 | 成年小鼠骨骼肌及其卫星细胞 | 发育生物学 | 肌肉损伤 | 单细胞RNA测序, CUT&RUN | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但基于小鼠实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3570 | 2026-02-13 |
Appearance of Amyloid-β Early in Life Initiates Neuronal Hyper-excitability, Mitochondrial Decay, and Loss of Dendritic Complexity in the Hippocampal CA1 Region of 5xFAD Mice
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703883
PMID:41676529
|
研究论文 | 本研究在5xFAD小鼠模型中，揭示了在淀粉样斑块显著沉积之前，海马CA1区神经元就出现突触过度兴奋、线粒体功能衰退和树突复杂性丧失的早期细胞事件 | 首次在5xFAD小鼠模型中系统定义了淀粉样斑块沉积前的早期时间窗，并整合了电生理、线粒体功能、形态学和空间转录组学数据，揭示了海马亚区（特别是CA1区）在疾病早期的选择性易损性 | 研究基于转基因小鼠模型（5xFAD），其结果向人类阿尔茨海默病的直接转化性尚需验证；且主要关注海马区，其他脑区的早期变化未涉及 | 探究阿尔茨海默病（AD）在显著斑块沉积和可测量行为障碍出现之前的最早细胞事件，特别是突触过度兴奋和亚细胞代谢功能障碍是否在早期出现并导致区域特异性神经元易损性 | 5xFAD杂合子小鼠模型的海马组织，重点关注CA1、CA3和齿状回等海马亚区 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 离体电生理学、线粒体结构与功能评估、形态学分析（树突结构）、空间转录组学 | 5xFAD转基因小鼠模型 | 电生理信号、线粒体功能数据、形态学图像数据、空间转录组数据 | 5xFAD小鼠模型（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3571 | 2026-02-13 |
Querying functional drivers in primary murine naïve and memory T cells using RNP-mediated CRISPR-Cas9 Gene Deletion
2026-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704062
PMID:41676462
|
研究论文 | 本文提出了一种基于RNP介导的CRISPR-Cas9基因删除技术，用于在原发性小鼠幼稚和记忆T细胞中快速评估候选基因的功能作用 | 开发了一种无需生殖系基因敲除小鼠的快速CRISPR-Cas9协议，可直接在激活效应、静止幼稚和记忆CD8 T细胞中进行基因删除，适用于急性和慢性感染模型 | 未明确提及样本量或技术验证的局限性，可能依赖于体外模型 | 研究CD8 T细胞在感染和癌症中的功能驱动基因，以加速免疫疗法和疫苗设计 | 原发性小鼠CD8 T细胞，包括幼稚、记忆和效应亚群 | 免疫学 | 癌症 | CRISPR-Cas9基因编辑，微阵列，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3572 | 2026-02-13 |
Exacerbated salmonellosis in poly(ADP-ribose) polymerase 14-deficient mice
2026-Feb-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02971-25
PMID:41468544
|
研究论文 | 本研究探讨了PARP14蛋白在小鼠沙门氏菌感染模型中的作用，发现PARP14缺失会加剧肠道炎症和组织损伤 | 首次揭示了PARP14在沙门氏菌感染中作为多细胞类型多效性调节因子的作用，特别是在Th17反应和上皮细胞转录组特征中的关键功能 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；PARP14的具体作用机制仍需进一步探究 | 探究PARP14蛋白在沙门氏菌感染引起的黏膜炎症中的功能 | 小鼠模型中的沙门氏菌感染及PARP14缺失小鼠 | 分子生物学与免疫学 | 感染性疾病（沙门氏菌感染） | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, TaqMan qPCR, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但涉及PARP14缺失小鼠和对照小鼠的组织分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3573 | 2026-02-13 |
RNA Quality Control Enables Antibiotic Tolerance
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.02.703294
PMID:41676483
|
研究论文 | 本研究通过实验进化方法探索了细菌在抗生素和免疫压力下的适应机制，揭示了RNA质量控制如何驱动抗生素耐受性 | 首次发现RNA降解酶RNase Y的突变通过bet-hedging策略调控RNA周转，作为可调的主调节器来应对抗生素和免疫的联合压力 | 研究主要基于实验进化模型，可能未完全反映真实宿主环境中的复杂相互作用 | 探究细菌在抗生素和免疫压力下的适应机制及RNA质量控制的作用 | 细菌种群 | 微生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3574 | 2026-02-13 |
Maternal Obesity Reprograms Differentiation Trajectories of Fetal Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Through Altered Inflammatory Signaling
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702548
PMID:41676530
|
研究论文 | 本研究通过非人灵长类模型，揭示了母体肥胖如何通过改变炎症信号重编程胎儿造血干细胞和祖细胞的分化轨迹 | 首次在非人灵长类模型中系统研究母体肥胖对胎儿骨髓造血的影响，结合光谱流式细胞术、单细胞RNA测序和功能分化实验，揭示了HSPC成熟改变、谱系轨迹重编程和炎症偏向的机制 | 研究基于非人灵长类模型，结果向人类直接外推需谨慎；未探讨母体肥胖的具体分子机制或长期后效 | 探究母体肥胖对胎儿免疫系统发育的影响，特别是对胎儿骨髓造血干细胞和祖细胞分化轨迹的调控 | 非人灵长类（猕猴）胎儿骨髓中的造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | 单细胞组学 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序，光谱流式细胞术，功能分化实验 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 非人灵长类胎儿骨髓样本（肥胖母体与瘦对照组后代） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3575 | 2026-02-13 |
Histotripsy-initiated immune response synergizes with chemotherapy in a neuroblastoma murine model
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702878
PMID:41676730
|
研究论文 | 本研究探讨了组织超声消融术（Histotripsy）在神经母细胞瘤小鼠模型中引发的免疫反应，及其与化疗的协同抗肿瘤效应 | 首次证明组织超声消融术不仅能局部消融肿瘤，还能诱导全身性抗肿瘤免疫反应，从而增强化疗对远端转移灶的疗效 | 研究基于小鼠模型，结果需在人体临床试验中验证；未详细探讨组织超声消融术的最佳参数与长期免疫记忆效应 | 探究组织超声消融术对神经母细胞瘤肿瘤微环境的免疫调节作用，及其与化疗联用的协同治疗效果 | 神经母细胞瘤小鼠模型（Neuro-2a细胞系） | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | NA | 测序数据，图像数据，流式数据 | 雌性A/J小鼠，双侧接种1×10⁶ Neuro-2a细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3576 | 2026-02-13 |
hSNMF: Hybrid Spatially Regularized NMF for Image-Derived Spatial Transcriptomics
2026-Feb-02, ArXiv
PMID:41675352
|
研究论文 | 本研究提出了一种用于高分辨率空间转录组学数据（如Xenium平台数据）的混合空间正则化非负矩阵分解方法，以改善表示学习和聚类效果 | 提出了两种空间正则化的NMF变体：轻量级的空间NMF（SNMF）和混合空间NMF（hSNMF），后者通过可调参数α整合空间邻近性和转录组相似性，并在Leiden聚类前进行空间正则化 | 方法仅在胆管癌数据集上进行了评估，其普适性有待在其他组织和疾病类型中进一步验证 | 解决高分辨率空间转录组学数据因维度极高而带来的表示学习和聚类挑战 | 来自Xenium平台的肿瘤微阵列组织高分辨率图像数据 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 非负矩阵分解，Leiden聚类 | 图像，细胞-基因矩阵 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台，用于捕获肿瘤微阵列组织的高分辨率图像并生成细胞-基因矩阵 |
| 3577 | 2026-02-13 |
Forward Programming Identifies Inducers of Blood-Brain Barrier Properties in Human Pluripotent Stem Cell-Derived Endothelial Cells
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.02.699492
PMID:41676611
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序挖掘转录因子，并利用正向编程技术诱导人多能干细胞来源的内皮细胞获得血脑屏障特性 | 首次结合单细胞RNA测序数据挖掘和正向编程方法，系统识别并验证了能诱导血脑屏障特性的转录因子组合 | 研究基于体外细胞模型，可能无法完全模拟体内血脑屏障的复杂微环境 | 探索血脑屏障特性在发育过程中的诱导机制，并开发用于建模和药物筛选的细胞工具 | 人多能干细胞来源的内皮细胞 | 单细胞组学 | 神经血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 正向编程 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3578 | 2026-02-13 |
Modeling cell-cell interactions to advance drug discovery in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702646
PMID:41676623
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于支架的人源共培养肺泡类器官模型，用于模拟特发性肺纤维化（IPF）的起始和进展过程 | 开发了首个利用健康与IPF患者原代肺成纤维细胞及携带家族性IPF突变（SFTPC 173T）的iPSC来源肺泡II型细胞构建的三维共培养类器官模型，以模拟纤维化过程中的上皮-间质细胞通讯 | 模型虽能模拟疾病进展的关键特征，但仍为体外系统，可能无法完全复制体内复杂的微环境及全身性因素 | 开发一种能有效模拟特发性肺纤维化（IPF）起始与进展的体外模型，以研究其发病机制并评估抗纤维化药物的疗效 | 健康及IPF患者的人原代肺成纤维细胞、携带SFTPC 173T突变（家族性IPF）或同基因校正对照的诱导多能干细胞（iPSC）来源的肺泡II型（iAT2）细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 三维共培养类器官模型 | 基因表达数据（单细胞水平） | 未明确具体样本数量，但使用了来自健康个体和IPF患者的原代细胞以及基因工程改造的iPSC系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3579 | 2026-02-13 |
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514502
PMID:41309494
|
研究论文 | 提出了一种名为scPER的计算方法，用于从总RNA测序数据中估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 | 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术，整合多个scRNA-seq数据集构建综合参考面板，有效分离混杂因素与真实信号 | NA | 开发一种计算方法来估计肿瘤微环境中的细胞比例并识别与癌症表型相关的细胞亚群 | 肿瘤微环境中的细胞亚型 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序，总RNA测序 | 对抗自编码器，极端梯度提升 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，总RNA-seq | NA | NA |
| 3580 | 2026-02-13 |
Mapping heterogeneity in the tumor microenvironment of renal cell carcinoma through single-cell omics
2026-Feb, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2025.11.001
PMID:41339185
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在揭示肾细胞癌肿瘤微环境异质性方面的应用与发现 | 整合多种单细胞技术（scRNA-seq、snRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq和成像质谱流式）的系统性综述，首次全面定义RCC中CD8 T细胞亚群、耗竭轨迹及多种免疫细胞（如TAMs、DCs、NK细胞、CAFs）的起源、表型多样性和功能状态 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，结论依赖于已发表研究的整合分析 | 解析肾细胞癌肿瘤微环境的细胞与分子异质性，为精准免疫治疗提供依据 | 肾细胞癌的肿瘤微环境细胞（包括恶性细胞、CD8 T细胞、肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞、癌症相关成纤维细胞等） | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、转座酶可及染色质测序、T细胞受体测序、成像质谱流式 | NA | 单细胞组学数据、空间多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |