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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3561 - 3580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3561 | 2025-10-06 |
Dynamic WT1 expression during gastrulation specifies peritoneal smooth muscle fate independently of mesothelial fate
2025-Jul-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204332
PMID:40554754
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研究论文 | 本研究揭示了WT1在小鼠原肠胚形成过程中动态表达，独立于间皮细胞命运指定腹膜平滑肌细胞谱系 | 首次发现WT1在原肠胚形成阶段表达，并独立于间皮细胞形成过程指定血管平滑肌和内脏平滑肌细胞命运 | 研究仅聚焦于小鼠胚胎发育早期阶段，尚未验证在人类或其他物种中的保守性 | 探究WT1在胚胎发育过程中对平滑肌细胞谱系特化的作用机制 | 小鼠胚胎发育过程中的WT1表达细胞和平滑肌前体细胞 | 发育生物学 | 发育异常疾病 | 他莫昔芬诱导遗传谱系追踪、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | 小鼠胚胎（E7.5-E12.5阶段） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3562 | 2025-10-06 |
Alevin-fry-atac enables rapid and memory frugal mapping of single-cell ATAC-seq data using virtual colors for accurate genomic pseudoalignment
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf234
PMID:40662809
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研究论文 | 本文介绍了alevin-fry-atac工具，该工具通过虚拟颜色技术实现单细胞ATAC-seq数据的快速且内存高效的处理 | 提出了一种改进的伪比对方案，通过将参考基因组分割为'虚拟颜色'（重叠的固定最大范围区域），解决了大基因组参考序列的伪比对挑战 | NA | 开发快速、内存高效的单细胞ATAC-seq数据处理工具 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 伪比对算法 | 基因组测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞ATAC-seq | Cell Ranger ATAC | 单细胞ATAC-seq分析流程 |
| 3563 | 2025-10-06 |
Prediction of gene regulatory connections with joint single-cell foundation models and graph-based learning
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf217
PMID:40662821
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研究论文 | 提出一种结合单细胞基础模型和图学习的基因调控链接预测框架scRegNet | 首次将大规模预训练的单细胞基础模型与联合图学习方法相结合用于基因调控网络推断 | 需要依赖已知的转录因子-DNA结合数据进行监督学习 | 解决单细胞RNA测序数据中基因调控链接预测问题 | 基因调控网络和转录因子-DNA相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基础模型, 图学习 | 基因表达数据 | 七个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3564 | 2025-10-06 |
ARTEMIS integrates autoencoders and Schrödinger Bridges to predict continuous dynamics of gene expression, cell population, and perturbation from time-series single-cell data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf218
PMID:40662824
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研究论文 | 提出ARTEMIS生成模型，整合变分自编码器和薛定谔桥来预测基因表达、细胞群体和扰动的连续动态 | 将变分自编码器与不平衡扩散薛定谔桥结合，首次在连续潜空间中重建细胞轨迹并估计时间依赖性细胞死亡率 | 基于单时间点快照数据推断连续动态，可能受限于数据稀疏性和技术噪声 | 从时间序列单细胞数据重建细胞轨迹、揭示基因表达动态和恢复细胞群体变化 | 胰腺β细胞分化、斑马鱼胚胎发生、癌细胞上皮间质转化过程 | 单细胞数据分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE), 薛定谔桥, 随机微分方程(SDEs) | 单细胞基因表达数据 | 三个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3565 | 2025-10-06 |
Transcriptome assembly at single-cell resolution with Beaver
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf236
PMID:40662838
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研究论文 | 开发了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图组织个体组装，采用动态规划算法搜索全长转录本，并整合两个随机森林模型准确估计候选转录本在单个细胞中的表达可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计，未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 解决单细胞分辨率下全长转录本重建的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 3566 | 2025-10-06 |
Biallelic Mutations in the Otogelin-Like Gene (OTOGL) Associated With Congenital Non-Syndromic Sensorineural Hearing Loss in a Chinese Family
2025-Jul, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.70122
PMID:40682330
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研究论文 | 通过全外显子测序在中国家庭中发现OTOGL基因双等位基因突变与非综合征性先天性听力损失相关 | 首次在中国家庭中鉴定出OTOGL基因复合杂合突变(p.Ile34Val和p.Phe319del)与先天性听力损失的关联 | 研究仅针对单个中国家庭，OTOGL基因突变谱和功能相关性仍需进一步研究 | 探索OTOGL基因突变与非综合征性感觉神经性听力损失的遗传机制 | 患有不明原因听力损失的中国家庭成员 | 遗传学 | 听力损失 | 全外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 1个中国家庭(先证者为6岁男孩) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3567 | 2025-10-06 |
T Cells Enhance Tissue Complexity and Function to Study Fibrosis in 3D Skin-Like Tissue Models
2025-Jul, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1177/19373341251360742
PMID:40690724
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研究论文 | 本研究开发了含有T细胞的3D皮肤样组织模型，用于研究纤维化疾病中T细胞的作用机制 | 首次在3D皮肤样组织中整合自体T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞，并通过单细胞RNA测序鉴定T细胞亚群 | 模型仍需进一步验证其在其他器官纤维化研究中的适用性 | 研究T细胞在组织纤维化发病机制中的作用 | 硬皮病患者的血液来源T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞 | 组织工程 | 硬皮病、特发性肺纤维化、肝纤维化、肾纤维化 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、组织分析 | 3D组织工程模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织形态数据 | 硬皮病患者来源的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3568 | 2025-10-06 |
Isolation of mitochondrial mutation-specific T cell receptors
2025-Jun-30, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf139
PMID:40587813
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研究论文 | 本研究首次成功分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性T细胞受体 | 首次报道了从健康供体中分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性TCRs，证明了线粒体突变也可作为肿瘤新抗原来源 | 研究中存在一些生物学障碍需要考虑，且仅针对HLA-A*0201等位基因进行了筛选 | 探索肿瘤线粒体DNA突变是否能够产生被T细胞受体识别的新抗原 | 肿瘤线粒体DNA非同义突变及其对应的T细胞受体 | 免疫学 | 多种肿瘤类型 | 单细胞测序，表位预测算法，TCR验证 | NA | 基因组数据，肽段筛选数据 | 38种肿瘤类型的3,798个非同义单核苷酸突变，10名HLA-A*0201纯合子健康供体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3569 | 2025-10-06 |
Iterative transcription factor screening enables rapid generation of microglia-like cells from human iPSC
2025-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59596-3
PMID:40494892
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研究论文 | 开发了一种迭代高通量单细胞转录因子筛选方法，用于快速将人类iPSC分化为小胶质细胞样细胞 | 提出迭代转录因子筛选方法，可在4天内通过六个转录因子将iPSC分化为小胶质细胞样细胞，并开发了新的计算方法构建基因调控网络 | NA | 开发高效的人类iPSC向特定细胞类型分化的方法 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)和小胶质细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，转录因子扰动实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3570 | 2025-10-06 |
Single-nucleus transcriptional and chromatin accessibility analyses of maturing mouse Achilles tendon uncover the molecular landscape of tendon stem/progenitor cells
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619991
PMID:39484401
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核测序技术分析小鼠跟腱成熟过程中的转录组和染色质可及性，揭示了肌腱干/祖细胞的分子特征 | 首次鉴定CD55和CD248作为肌腱干/祖细胞的新型表面抗原标记物，并发现该细胞群在发育过程中数量减少 | 研究仅使用小鼠模型，样本年龄范围有限(2周和6周)，未涉及人类样本或更广泛的年龄阶段 | 探索肌腱干/祖细胞的分子特征及其在肌腱发育和修复中的作用机制 | 小鼠跟腱细胞，特别是肌腱干/祖细胞群体 | 单细胞生物学 | 肌腱韧带损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 2周和6周龄小鼠跟腱细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 3571 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Host Responses in Bovine Milk Somatic Cells (bMSCs) Following HPAIV Bovine H5N1 Influenza Exposure
2025-06-03, Viruses
DOI:10.3390/v17060811
PMID:40573402
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牛乳体细胞在H5N1禽流感病毒暴露后的宿主免疫反应 | 首次对H5N1病毒暴露的牛乳体细胞进行单细胞分析，揭示了乳腺免疫反应向2型免疫转变的动态特征 | 单细胞测序数据中未检测到病毒读数，免疫反应可能仅源于病毒成分暴露而非生产性感染 | 理解牛乳腺对H5N1病毒暴露的宿主免疫反应机制 | 体外暴露于H5N1病毒的牛乳体细胞(bMSCs) | 单细胞组学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3572 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing-derived signatures define response patterns to atezolizumab + bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.016
PMID:39709141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了晚期肝细胞癌患者对阿特珠单抗+贝伐珠单抗联合治疗的两种不同应答模式及耐药特征 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示了晚期肝癌对atezo+bev联合治疗的分子应答机制，定义了免疫主导型和血管生成主导型两种获益亚组 | 研究为回顾性分析，需要前瞻性研究验证；样本量相对有限；未涉及其他潜在耐药机制 | 探索晚期肝细胞癌患者对阿特珠单抗+贝伐珠单抗联合治疗的应答和耐药机制 | 晚期肝细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | 基因表达特征分析 | 单细胞RNA测序数据，RNA测序数据 | 422例RNA测序样本（317例接受atezo+bev治疗，47例接受atezolizumab单药，58例接受索拉非尼治疗） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3573 | 2025-10-06 |
Redefining macrophage phenotypes after spinal cord injury: An open data approach
2025-Jun, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115222
PMID:40113007
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研究论文 | 通过整合分析三个公开的单细胞RNA测序数据集，重新定义了脊髓损伤后巨噬细胞表型的异质性 | 采用无偏倚的数据整合方法，首次在三个独立数据集中一致识别出四种保守的巨噬细胞群体 | 研究仅聚焦于7天损伤时间点的年轻雌性小鼠模型，未涵盖其他时间点或不同性别/年龄的动物 | 重新定义脊髓损伤后巨噬细胞的表型异质性 | 脊髓损伤后小鼠脊髓组织中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat, SingleR | 单细胞基因表达数据 | 三个独立研究团队的公开数据集，样本来自接受中胸段脊髓挫伤的年轻雌性小鼠7天损伤时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3574 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals transcriptional plasticity of var gene expression in Plasmodium falciparum for host immune avoidance
2025-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02008-5
PMID:40379932
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫var基因表达的可塑性及其在宿主免疫逃避中的作用 | 首次在单细胞水平证明恶性疟原虫除了单等位基因var基因表达外，还能同时表达多个var基因或进入低/无表达状态 | 研究仅使用了3D7和IT4两个克隆寄生虫系，可能需要更多寄生虫株验证 | 探究恶性疟原虫var基因表达机制及其在免疫逃避中的作用 | 恶性疟原虫克隆株3D7和IT4 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个克隆寄生虫系(3D7和IT4) | NA | 单细胞RNA-seq | 便携式微孔系统 | 使用富集探针和便携式微孔系统的单细胞转录组学技术 |
| 3575 | 2025-10-06 |
Meningeal-derived retinoic acid regulates neurogenesis via suppression of Notch and Sox2
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115637
PMID:40310723
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研究论文 | 本研究揭示脑膜来源的视黄酸通过抑制Notch和Sox2通路调控神经发生的新机制 | 首次发现脑膜来源的视黄酸通过结合Sox2ot启动子抑制Notch信号通路和Sox2表达，从而促进神经发生 | 研究主要基于Foxc1突变胚胎模型，机制验证仍需进一步扩展 | 探究脑膜来源视黄酸调控端脑神经前体细胞神经发生的分子机制 | 小鼠胚胎端脑神经前体细胞 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，RARα DNA结合分析，子宫内电穿孔 | Foxc1突变胚胎模型 | 基因表达数据，DNA结合数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3576 | 2025-10-06 |
Exploring the immune environment of glioblastoma through single-cell RNA sequencing in humanized mouse models
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.17.654526
PMID:40475625
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型中的单细胞RNA测序探索胶质母细胞瘤的免疫环境 | 建立了利用患者来源异种移植的人源化小鼠胶质母细胞瘤模型，该模型能更好地模拟复发性胶质母细胞瘤的免疫特征 | 模型基于免疫缺陷小鼠，可能无法完全模拟人类完整的免疫系统功能 | 研究胶质母细胞瘤的肿瘤免疫微环境并评估新疗法 | 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个免疫缺陷小鼠模型，使用人脐带血来源的CD34+造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3577 | 2025-10-06 |
Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112418
PMID:40343269
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研究论文 | 本研究揭示腺苷脱氨酶活性性别差异与SARS-CoV-2先天免疫差异的关联机制 | 首次发现女性ADA活性较低与内源性逆转录病毒-干扰素刺激基因信号增强的关联，并阐明IL-18驱动性别特异性ADA2表达的机制 | 样本来源和数量未明确说明，机制研究仍需进一步验证 | 探究抗病毒免疫性别差异的分子机制 | 健康人群和COVID-19患者的血液、肺组织和呼吸道细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3578 | 2025-10-06 |
Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100849
PMID:40233746
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研究论文 | 本研究构建了首个以免疫为重点的猕猴单细胞多组织图谱，通过对比转录谱与免疫谱系揭示了无监督聚类在免疫细胞分析中的局限性 | 创建了首个猕猴免疫参考图谱，识别了具有高判别价值的基因程序，包括模拟T/NK细胞成熟的多基因特征 | 无监督聚类在T细胞和自然杀伤细胞分析中会导致功能不同亚群的系统性混合 | 提高通过单细胞图谱解读免疫细胞表型和功能的准确性 | 猕猴免疫细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 转录组数据 | 多组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3579 | 2025-10-06 |
Reparative immunological consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2025-May-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333558
PMID:39961646
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研究论文 | 本研究探讨自体造血干细胞移植治疗难治性克罗恩病的免疫修复机制 | 首次揭示干细胞移植通过影响肠道髓系细胞谱系发挥治疗作用，并发现克罗恩病患者造血干细胞功能异质性 | 样本量较小(n=19)，为单臂II期研究 | 理解干细胞移植后免疫系统重建机制及其作为细胞疗法的潜在作用 | 难治性克罗恩病成人患者 | 数字病理 | 克罗恩病 | scRNA-seq, CyTOF, 小鼠异种移植模型 | NA | 血液样本, 肠道组织样本 | 19例难治性克罗恩病患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 3580 | 2025-10-06 |
Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413253
PMID:40087815
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研究论文 | 本研究发现了PAD2对NF-κB p65的新型瓜氨酸化修饰机制，并开发了靶向M1巨噬细胞的纳米药物治疗急性肺损伤 | 首次发现NF-κB p65在精氨酸171位点的PAD2介导瓜氨酸化修饰，并开发了ICAM-1抗体靶向的金纳米颗粒递送系统 | 研究主要聚焦于铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤模型，其他病因的ALI是否适用仍需验证 | 探索PAD2调控巨噬细胞极化的分子机制并开发急性肺损伤的新型治疗策略 | 巨噬细胞极化过程及铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 分子生物学与纳米医学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 纳米颗粒递送系统 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |