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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3561 | 2025-02-14 |
RNA-seq analysis reveals prenatal alcohol exposure is associated with placental inflammatory cells and gene expression
2024-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147951
PMID:37918548
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研究论文 | 本研究通过RNA-seq分析揭示了产前酒精暴露与胎盘炎症细胞和基因表达的关系 | 首次在胎盘细胞类型组成和转录组分析中考虑了细胞类型的影响,揭示了产前酒精暴露对胎盘细胞类型比例和炎症基因表达的影响 | 需要进一步研究以表征这些影响并评估胎盘炎症在胎儿酒精谱系障碍中的潜在功能作用 | 研究产前酒精暴露对胎盘细胞类型组成和基因表达的影响 | 35名重度饮酒孕妇和33名对照的胎盘样本 | 生物信息学 | 胎儿酒精谱系障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 线性回归模型 | RNA-seq数据 | 68名孕妇的胎盘样本 |
3562 | 2025-02-14 |
The many faces of the megakaryocytes and their biological implications
2024-01-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000793
PMID:37910197
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究揭示的巨核细胞谱系内的转录异质性及其独特亚群的功能和表型可塑性,以及对健康和疾病的影响 | 揭示了巨核细胞(MKs)的多个亚群及其不同功能,包括血小板生成、生态位支持、免疫和循环细胞,并发现这些细胞在非造血组织中的存在及其增强的免疫相关特性 | NA | 探讨巨核细胞亚群的功能和表型可塑性及其在健康和疾病中的作用 | 巨核细胞(MKs)及其亚群 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
3563 | 2025-02-14 |
Single-cell RNA sequencing revealed PPARG promoted osteosarcoma progression: based on osteoclast proliferation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506225
PMID:39936154
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PPARG在促进骨肉瘤进展中的作用,特别是通过破骨细胞增殖 | 首次在单细胞水平上详细研究破骨细胞,并发现PPARG作为新的治疗靶点 | 研究主要基于单细胞测序数据,需要进一步实验验证 | 寻找新的骨肉瘤治疗靶点,防止肿瘤进展和局部扩散 | 骨肉瘤患者的破骨细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 骨肉瘤患者的单细胞测序数据 |
3564 | 2025-02-14 |
RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Traumatic Spinal Cord Injury (Review)
2023, Sovremennye tekhnologii v meditsine
DOI:10.17691/stm2023.15.6.08
PMID:39944372
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术以及空间转录组学在创伤性脊髓损伤中的应用,探讨了这些技术在揭示细胞类型、定位损伤区域和解析病理机制方面的潜力 | 结合单细胞/单核RNA测序与空间转录组学技术,提供了更精确的细胞定位和病理分析,为神经连接重组和感觉运动功能恢复机制的研究开辟了新视角 | 需要更多关于人类细胞群体特异性的全面信息,以确定脊髓损伤中细胞选择性易感性的原因 | 探讨单细胞和单核RNA测序技术以及空间转录组学在创伤性脊髓损伤中的应用,以揭示细胞类型、定位损伤区域和解析病理机制 | 创伤性脊髓损伤中的细胞类型及其在正常和病理反应中的作用 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA |
3565 | 2025-02-14 |
[Research advances on the role and mechanism of epidermal stem cells in skin wound repair]
2022-Sep-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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综述 | 本文综述了表皮干细胞在皮肤自我更新和伤口修复中的作用及其机制 | 结合单细胞测序和基因敲除等新技术和新概念,揭示了表皮干细胞在表皮自我更新和伤口修复中的新机制 | NA | 探讨表皮干细胞在皮肤伤口修复中的作用和机制 | 表皮干细胞 | NA | NA | 单细胞测序, 基因敲除 | NA | NA | NA |
3566 | 2025-02-14 |
[Investigation on the growth factor regulatory network of dermal fibroblasts in mouse full-thickness skin defect wounds based on single-cell RNA sequencing]
2022-Jul-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术,探索了小鼠全层皮肤缺损伤口中真皮成纤维细胞的异质性及其生长因子调控网络 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细描绘了小鼠全层皮肤缺损伤口中真皮成纤维细胞的异质性及其在生长因子信号通路中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类或其他动物模型,且样本量较小 | 探索小鼠全层皮肤缺损伤口中真皮成纤维细胞的异质性及其生长因子调控网络 | 小鼠全层皮肤缺损伤口中的真皮成纤维细胞 | 数字病理 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 10只8周龄雄性C57BL/6小鼠(5只正常皮肤组织,5只伤口组织) |
3567 | 2025-02-14 |
[Re-understanding the physiological and pathophysiological roles of neutrophils]
2022-Feb-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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综述 | 本文综述了近年来关于中性粒细胞的生物学行为及其在各种疾病中的作用的研究进展 | 重新审视了中性粒细胞的生理和病理生理作用,特别是其异质性及与其他免疫细胞相互作用的机制 | NA | 重新理解中性粒细胞在生理和病理生理中的作用 | 中性粒细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术、空间转录组测序技术、多组学联合测序技术 | NA | NA | NA |
3568 | 2025-02-13 |
Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2459136
PMID:39868995
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了猴痘病毒(MPXV)感染患者的外周血单核细胞,揭示了HIV感染者与非感染者的免疫景观差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了HIV感染与非感染猴痘患者的免疫细胞表型和基因表达差异,揭示了HIV感染者病情严重的潜在机制 | 样本量较小,仅包括6名患者,可能影响结果的普遍性 | 研究猴痘病毒在HIV感染与非感染患者中的免疫病理学机制 | 猴痘病毒感染患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 猴痘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 6名患者(3名HIV+,3名HIV-) |
3569 | 2025-02-13 |
The secretomes of bovine mammary epithelial cell subpopulations differentially modulate macrophage function
2025-Dec, The veterinary quarterly
DOI:10.1080/01652176.2025.2463338
PMID:39921381
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研究论文 | 本文研究了牛乳腺上皮细胞亚群的分泌组对巨噬细胞功能的不同调节作用 | 首次发现不表达CD73的牛乳腺上皮细胞亚群的分泌组能显著增强巨噬细胞的吞噬作用和活性氧积累 | 未探讨分泌组中具体哪些生物活性因子对巨噬细胞功能起关键作用 | 优化牛乳腺上皮细胞分泌组作为治疗乳腺炎的生物制剂 | 牛乳腺上皮细胞亚群及其分泌组、巨噬细胞 | 细胞生物学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光激活细胞分选(FACS) | NA | RNA测序数据、细胞表型数据 | NA |
3570 | 2025-02-13 |
A single-cell transcriptome analysis reveals astrocyte heterogeneity and identifies CHI3L1 as a diagnostic biomarker in Parkinson's disease
2025-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42051
PMID:39931480
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性,并发现CHI3L1可能作为帕金森病的诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平上揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性,并识别出CHI3L1作为潜在的诊断标志物 | 研究主要基于公开的GEO数据库数据,缺乏独立验证队列 | 识别帕金森病中星形胶质细胞的异质性并研究与其分化轨迹相关的基因 | 帕金森病患者和正常样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组分析, qRT-PCR, Western Blot | Monocle2, AUCell | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括帕金森病患者和正常样本 |
3571 | 2025-02-13 |
Mosaic loss of Y chromosome and mortality after coronary angiography
2025-Feb-12, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf035
PMID:39935193
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研究论文 | 本研究探讨了Y染色体嵌合体缺失(LOY)与接受冠状动脉造影的男性患者心血管死亡率之间的关系 | 首次在人类中量化LOY,并发现LOY与心血管死亡率显著相关,揭示了LOY通过促纤维化和促炎症蛋白表达谱影响心血管健康的机制 | 研究仅限于男性患者,未探讨LOY在女性中的影响 | 确定LOY与接受冠状动脉造影的男性患者心血管死亡率之间的关联 | 1698名接受冠状动脉造影的男性参与者 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组甲基化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,血浆蛋白表达数据 | 1698名男性参与者 |
3572 | 2025-02-13 |
Mechanism of Ca2+ overload caused by STIM1/ORAI1 activation of store-operated Ca2+ entry (SOCE) in hydrogen peroxide-induced mitochondrial damage and apoptosis in human primary melanocytes
2025-Feb-12, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10329-1
PMID:39937331
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研究论文 | 本研究探讨了氧化应激下正常人黑色素细胞中钙离子水平变化的调控机制,为白癜风的发病机制和治疗提供了新的见解和潜在临床治疗靶点 | 揭示了STIM1/ORAI1激活在氧化应激诱导的线粒体损伤和细胞凋亡中的作用机制,并提出了SOCE抑制作为保护黑色素细胞免受氧化应激损伤的新策略 | 研究主要基于体外实验,未涉及动物模型或临床试验,可能无法完全反映体内复杂环境 | 研究氧化应激下正常人黑色素细胞中钙离子水平变化的调控机制 | 正常人黑色素细胞(NHMs) | 细胞生物学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、定量实时PCR、蛋白质印迹 | NA | RNA测序数据、细胞实验数据 | NA |
3573 | 2025-02-13 |
A multi-omic single-cell landscape of the aging mouse ovary
2025-Feb-11, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01556-2
PMID:39934558
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)技术,描绘了小鼠年轻和年老卵巢的多组学单细胞图谱,揭示了卵巢衰老过程中的细胞类型特异性转录变化及其调控元件 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术,全面描绘了小鼠卵巢衰老的多组学单细胞图谱,并揭示了TGF-beta信号通路和ER应激在衰老过程中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类卵巢衰老的直接证据 | 探究卵巢衰老的分子机制,以理解女性年龄相关的生育功能障碍 | 小鼠年轻和年老卵巢 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 小鼠年轻和年老卵巢样本 |
3574 | 2025-02-13 |
Spatiotemporal transcriptomics elucidates the pathogenesis of fulminant viral myocarditis
2025-Feb-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02143-9
PMID:39924580
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研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术,全面分析了A/J小鼠中柯萨奇病毒B3(CVB3)诱导的暴发性心肌炎(FM)的发病机制 | 揭示了间皮细胞在心肌炎早期作为CVB3感染的主要靶点,以及Cd8效应T细胞通过释放IFN-γ调控Spi1表达,加剧心肌细胞损伤的新机制 | 研究仅限于A/J小鼠模型,未涉及人类样本 | 阐明暴发性心肌炎的发病机制并探索有效治疗策略 | A/J小鼠中的CVB3诱导的暴发性心肌炎 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | A/J小鼠,七个不同时间点 |
3575 | 2025-02-13 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-06, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法,识别了肺鳞状细胞癌(LUSC)的潜在治疗靶点,并对其进行了分层 | 结合了bulk RNA测序、WGCNA、生存分析、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、免疫浸润评估、单细胞RNA测序和伪时间分析等多种技术手段,全面探索了LUSC的治疗靶点 | 未提及具体样本量,可能影响结果的普适性 | 识别肺鳞状细胞癌(LUSC)的新型治疗靶点,以改善其治疗策略 | 肺鳞状细胞癌(LUSC) | 数字病理 | 肺癌 | bulk RNA测序、WGCNA、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、单细胞RNA测序、伪时间分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
3576 | 2025-02-13 |
Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02530-0
PMID:39614111
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scAtlasVAE的深度学习模型,用于整合大规模单细胞RNA测序数据并进行跨图谱比较,构建了一个广泛的人类CD8 T细胞图谱 | 开发了scAtlasVAE模型,能够整合大规模单细胞RNA测序数据,构建了包含1,151,678个细胞的人类CD8 T细胞图谱,揭示了不同细胞亚型之间的联系及其表型和功能转变 | NA | 研究人类CD8 T细胞在炎症和癌症中的克隆景观和动态变化 | 人类CD8 T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | VAE(变分自编码器) | 单细胞RNA测序数据 | 1,151,678个细胞,来自961个样本,涵盖68项研究和42种疾病条件 |
3577 | 2024-12-01 |
Human CD8+ T cell map with single-cell transcriptome and TCR information
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02529-7
PMID:39614112
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3578 | 2024-12-01 |
Publisher Correction: Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02570-6
PMID:39614113
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3579 | 2025-02-13 |
Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408852
PMID:39630006
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研究论文 | 本研究通过删除单个基因Pdzk1,在胚胎干细胞(ESCs)中建立了全能性 | 首次通过删除Pdzk1基因在胚胎干细胞中实现全能性,突破了胚胎和胚胎外组织之间的屏障 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞,尚未在人类细胞中验证 | 探索胚胎干细胞的全能性扩展及其分化潜能 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析,bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
3580 | 2025-02-13 |
SYISL Knockout Promotes Embryonic Muscle Development of Offspring by Modulating Maternal Gut Microbiota and Fetal Myogenic Cell Dynamics
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410953
PMID:39680624
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研究论文 | 本研究探讨了SYISL基因敲除如何通过调节母体肠道微生物群和胎儿肌源性细胞动态来促进胚胎肌肉发育 | 揭示了SYISL基因敲除通过改变母体肠道微生物群组成和提高胚胎血清中的丁酸水平,进而通过丁酸-HDAC-H3K9ac/H3K27ac途径调节肌肉生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类或其他动物模型中进行验证 | 探讨SYISL基因敲除对胚胎肌肉发育的影响及其机制 | 小鼠胚胎 | 生物医学 | 肌肉疾病 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确提及具体样本数量 |