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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3541 | 2026-02-14 |
Crosstalk between tumor and microenvironment: Insights from spatial transcriptomics
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.009
PMID:39271263
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综述 | 本文综述了肿瘤与微环境之间的相互作用,重点关注空间转录组学技术在解析肿瘤异质性、进化及克隆状态中的应用 | 整合空间转录组学技术视角,系统阐述肿瘤异质性驱动因素及肿瘤-微环境动态互作机制 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献总结 | 探讨肿瘤异质性、进化及克隆状态的驱动因素,并分析肿瘤与微环境的相互作用 | 肿瘤组织及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3542 | 2026-02-14 |
Deep learning-based multimodal spatial transcriptomics analysis for cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.08.001
PMID:39271260
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书本章节 | 本章探讨了深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的整合应用 | 将深度学习与多模态空间转录组学结合,为癌症诊断和治疗提供全面且可操作的见解,代表了肿瘤学向更精准和个性化方向的范式转变 | NA | 推进癌症诊断、治疗规划和精准医学 | 癌症生物学,包括肿瘤异质性、微环境相互作用和治疗反应 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学,多模态数据分析 | 卷积神经网络 | 多模态数据(包括基因组、蛋白质组、影像和临床数据) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3543 | 2026-02-14 |
Current computational methods for spatial transcriptomics in cancer biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.006
PMID:39271268
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综述 | 本文综述了当前在癌症生物学中用于空间转录组学的计算方法 | NA | NA | 回顾和总结空间转录组学在癌症生物学中的计算分析方法 | 空间转录组学数据及其在癌症研究中的应用 | 计算生物学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3544 | 2026-02-14 |
Data enhancement in the age of spatial biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.008
PMID:39271267
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综述 | 本文综述了空间转录组学与其他数据类型(如单细胞转录组学和详细组织染色图像)整合的计算方法,旨在克服当前空间转录组学技术在分辨率或同时分析基因数量方面的限制 | 深入探讨了整合空间转录组学与互补数据源的计算方法,以克服现有技术在分辨率或基因分析数量上的局限,并强调了这些方法在癌症生物学理解中的革命性潜力 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据或新算法开发,主要聚焦于现有挑战和解决方案的概述 | 旨在通过整合空间转录组学与其他数据类型,提升对细胞异质性和微环境的理解,特别是在癌症等复杂疾病中 | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、详细组织染色图像 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞转录组学、组织染色 | NA | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3545 | 2026-02-14 |
Integrated multi-omics single cell atlas of the human retina
2023-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3471275/v1
PMID:38014002
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研究论文 | 本文构建了一个综合多模态的人类视网膜细胞图谱,整合了转录组和染色质可及性数据 | 首次整合了大规模多模态单细胞数据,揭示了超过110种细胞类型,并精细映射了GWAS和eQTL变异 | NA | 创建全面的人类视网膜细胞图谱以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 约240万个细胞,来自55名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3546 | 2026-02-13 |
T cell populations are negatively correlated with natural killer and macrophage cell populations in aspirate samples of peripheral lymphadenopathies
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2624191
PMID:41606824
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结核病患者肉芽肿淋巴结细针穿刺样本,揭示了细胞组成、感染细胞识别及细胞间通讯网络 | 首次在结核病肉芽肿淋巴结穿刺样本中应用单细胞RNA测序技术,同时检测宿主细胞转录组和结核分枝杆菌RNA,实现感染细胞的单细胞水平识别 | 样本量较小(19例患者),个体间细胞亚群丰度差异较大,穿刺样本可能无法完全代表整个淋巴结的细胞组成 | 解析结核病肉芽肿淋巴结的细胞组成特征和细胞间通讯网络 | 结核病患者的肉芽肿淋巴结细针穿刺样本 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19例结核病患者的淋巴结穿刺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3547 | 2026-02-13 |
Machine learning identifies key cells and therapeutic targets during ferroptosis after spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00037
PMID:39104165
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了脊髓损伤后铁死亡过程中的关键细胞类型和治疗靶点,并验证了潜在药物的疗效 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,利用随机森林和LASSO算法识别关键铁死亡基因,并在单细胞水平揭示了铁死亡与巨噬细胞/小胶质细胞状态转变的关系,最后通过动物模型验证了环己酰亚胺的治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库的测序数据,动物模型验证仅在小鼠T8脊髓损伤模型中进行,需要进一步临床验证 | 探究脊髓损伤后铁死亡的细胞机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤后的铁死亡过程及相关细胞类型 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, LASSO | 基因表达数据 | 来自GSE47681、GSE5296和GSE162610数据集的测序样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3548 | 2026-02-13 |
RBAD: The first database dedicated alterations of blood RNA in individuals with Alzheimer's disease and their clinical relevance
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01165
PMID:40145964
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研究论文 | 本研究开发了首个专注于阿尔茨海默病患者血液RNA变化的数据库RBAD,并利用该数据库分析了血液RNA特征与临床相关性 | 首次建立了专门针对阿尔茨海默病血液RNA变化的数据库,整合了多物种和多类型RNA测序数据,并进行了大规模比较分析 | 研究主要基于现有数据集的整合分析,缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探究阿尔茨海默病患者血液RNA变化及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者和模型小鼠的血液样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, microRNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 1468个血液样本(包括人类和小鼠研究) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, microRNA-seq | NA | NA |
| 3549 | 2026-02-13 |
Single-cell RNA sequencing of the post-spinal cord injury dorsal root ganglia in cynomolgus monkeys: Elucidation of the cellular immune microenvironment of the central nervous system
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00974
PMID:40145972
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,首次全面描绘了食蟹猴脊髓损伤后背根神经节(DRG)的细胞免疫微环境,并重点解析了巨噬细胞亚群在其中的作用 | 首次在食蟹猴脊髓损伤模型中,通过单细胞RNA测序对背根神经节进行全面的转录组分析,鉴定了11个巨噬细胞亚群,并揭示了它们通过特定配体-受体对(如SPP1-CD44)与微胶质细胞互作,从而调控轴突再生的新机制 | 研究基于单一的食蟹猴脊髓挫伤模型,样本量有限,且为横断面研究,未能动态追踪损伤后不同时间点的细胞变化 | 阐明脊髓损伤后背根神经节免疫细胞微环境的变化,探究其是否以及如何促进轴突再生 | 食蟹猴的中胸段脊髓挫伤模型中的背根神经节和脊髓组织 | 数字病理 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3550 | 2026-02-13 |
Modulation of mitochondrial dysfunction: Mechanisms and strategies for the use of natural products to treat stroke
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00016
PMID:40618255
|
综述 | 本文综述了天然产物通过调节线粒体功能障碍治疗脑卒中的机制与策略 | 系统总结了天然产物通过多靶点调控线粒体功能障碍(包括生物合成、动力学平衡、自噬、抗凋亡、氧化应激调节和细胞间线粒体转运)来发挥神经保护作用的机制,并提出了整合单细胞测序和类器官模型等新技术进行深入研究的方向 | 天然产物的成分复杂性导致标准化困难,跨区域临床数据不足,且缺乏长期安全性评估 | 探讨利用天然产物靶向线粒体功能障碍以预防和治疗脑卒中的机制与策略 | 天然产物及其在脑卒中(包括缺血性和出血性卒中)模型中的线粒体靶向作用 | NA | 脑卒中 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3551 | 2026-02-13 |
Heterogeneity of the adult mammalian forebrain neurogenic ependyma: A comprehensive cellular map
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00789
PMID:40819302
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,全面绘制了成年小鼠前脑室管膜表面的细胞图谱,揭示了其细胞组成的异质性 | 首次在成年哺乳动物前脑室管膜表面识别出12种不同的细胞亚型,并详细描述了CD133+和CD133-细胞群的组成,为解决关于成年神经干细胞存在的长期争议提供了新的细胞学基础 | 研究仅基于小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证;研究聚焦于侧脑室侧壁的室管膜表面,其他脑区的室管膜异质性可能未被涵盖 | 阐明成年哺乳动物前脑室管膜的细胞组成异质性,并探讨其与成年神经干细胞争议的关系 | 成年小鼠前脑侧脑室侧壁的室管膜表面细胞 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫细胞化学分析 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了成年小鼠侧脑室侧壁的整体铺片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3552 | 2026-02-13 |
Integrating bulk and single-cell transcriptome profiling to uncover diagnostic biomarkers and regulatory mechanisms of oxidative stress in spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00693
PMID:41673791
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研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组数据,揭示了脊髓损伤中氧化应激相关的诊断生物标志物及其调控机制 | 整合人类血液样本与小鼠脊髓组织的批量及单细胞转录组数据,首次系统揭示了氧化应激相关基因在脊髓损伤不同阶段的动态表达模式及跨物种生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证;小鼠模型与人类脊髓损伤的病理机制可能存在物种差异 | 揭示脊髓损伤中氧化应激相关基因的表达调控机制,并寻找诊断生物标志物与潜在治疗药物 | 人类血液样本与小鼠脊髓组织 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 转录组测序、免疫荧光、定量PCR | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 来自GEO数据库的人类血液样本与小鼠脊髓组织数据(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3553 | 2026-02-13 |
Bufei formula attenuates airway mucus hypersecretion in COPD through inhibition of TRIM56-mediated ITGB4 ubiquitination
2026-Apr-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121215
PMID:41580166
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研究论文 | 本研究探讨了补肺方通过抑制TRIM56介导的ITGB4泛素化来减轻慢性阻塞性肺疾病气道黏液高分泌的机制 | 首次揭示了补肺方活性组分BFF-4通过靶向TRIM56并抑制其介导的ITGB4泛素化,从而调控MUC5AC表达的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化效果有待进一步验证;分子对接预测的小分子相互作用需要实验证实 | 阐明传统中药补肺方治疗慢性阻塞性肺疾病气道黏液高分泌的具体分子机制 | 香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型、香烟烟雾提取物诱导的气道上皮细胞 | 基础医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | DARTS技术、Co-IP-MS、单细胞测序、分子对接 | 动物疾病模型、细胞模型 | 蛋白质组学数据、单细胞测序数据、分子对接数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3554 | 2026-02-13 |
Temporal transcriptomic profiling of bone autograft healing reveals dynamic immune, vascular, and osteogenic programs
2026-Apr, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117771
PMID:41478392
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研究论文 | 本研究通过时序转录组分析揭示了骨自体移植愈合过程中动态的免疫、血管和成骨程序 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术,在小鼠骨膜介导的自体移植模型中系统描绘了14天内移植相关组织的分子和细胞程序动态变化,并发现了供体来源细胞稀少而宿主来源细胞类型转换的现象,提示了愈合过程中活跃的神经血管互作 | 研究基于小鼠模型,结果在人体中的适用性有待验证;观察时间限于14天内,长期愈合过程未涵盖 | 阐明驱动早期骨自体移植整合的分子和细胞程序 | 小鼠骨膜介导的自体移植模型中的移植相关组织 | 数字病理 | 骨科疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3555 | 2026-02-13 |
The role of insulin-like growth factor binding proteins in TGF-β1-induced fibroblast-myofibroblast transition during endometriosis fibrosis
2026-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112362
PMID:41520746
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)在子宫内膜异位症纤维化过程中TGF-β1诱导的成纤维细胞-肌成纤维细胞转化(FMT)中的作用 | 首次定义了IGFBPs在子宫内膜异位症纤维化中的作用,并发现IGFBP6是一种潜在的抗纤维化因子和治疗靶点 | NA | 研究IGFBPs在子宫内膜异位症相关纤维化中TGF-β1诱导的FMT过程中的作用 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜组织及异位子宫内膜基质细胞(EcESCs) | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3556 | 2026-02-13 |
Integrated methylome and hydroxymethylome analysis identifies CAMK2G, NFATC4, and SFRP2 as TET1-regulated drivers of odontoblastic differentiation in human dental pulp cells
2026-Apr, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.117775
PMID:41534676
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研究论文 | 本研究通过整合甲基组和羟甲基组分析,揭示了TET1调控的CAMK2G、NFATC4和SFRP2作为人牙髓细胞成牙本质分化的关键驱动因子 | 首次在全基因组水平描绘了人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态,并识别出TET1通过5hmC修饰调控的新表观遗传驱动因子 | 研究主要基于体外细胞模型,未在体内验证这些驱动因子的功能 | 阐明人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态及TET1介导的调控机制 | 人牙髓细胞 | 表观遗传学 | 牙科疾病 | 微阵列、hMeDIP-seq、scRNA-seq | NA | 基因组DNA甲基化数据、羟甲基化数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3557 | 2026-02-13 |
Zebrafish neural regeneration: mechanistic insights into human nervous system repair
2026-Mar-05, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了斑马鱼在神经再生研究中的关键发现,强调了其在模拟人类神经退行性疾病和指导治疗策略中的转化意义 | 整合了斑马鱼在视网膜、脊髓和大脑中神经再生的多系统机制,并引入了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9等先进技术来解析再生过程中的细胞状态和调控网络 | 作为一篇综述文章,未涉及原始实验数据,且斑马鱼与人类在生理和病理上存在差异,其发现直接转化至临床应用仍需进一步验证 | 解码脊椎动物中枢神经系统的再生机制,以指导人类神经修复的治疗策略 | 斑马鱼(Danio rerio)作为研究模型,聚焦于其视网膜、脊髓和大脑的神经再生过程 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9, 谱系追踪, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3558 | 2026-02-13 |
Spatially resolved single-cell analysis of transcriptomic changes linked with neuropathic pain in human neuromas
2026-Mar-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003907
PMID:41553171
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研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学,在单细胞分辨率下分析了人类三叉神经和神经瘤的转录组景观,揭示了与神经病理性疼痛相关的细胞和分子变化 | 首次在人类三叉神经和神经瘤中结合单细胞分辨率与空间信息进行分析,并发现了HLA-A在神经病理性疼痛中的新作用 | 样本量相对较小,且研究主要集中于三叉神经损伤,结论在其他类型神经损伤中的普适性有待验证 | 探究与神经病理性疼痛相关的分子机制和细胞组成变化 | 人类三叉神经和神经瘤组织 | 空间转录组学 | 神经病理性疼痛 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及人类三叉神经和神经瘤组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3559 | 2026-02-13 |
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2026.01.005
PMID:41672640
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在Alport综合征小鼠模型中发现了早期上调的Tnfsf15基因,并证明其在疾病早期具有减轻蛋白尿和限制肾小球损伤的保护作用 | 首次在Alport综合征早期阶段,通过单细胞RNA测序技术揭示了Tnfsf15基因在肾小球细胞(尤其是足细胞)中的早期上调现象,并通过基因敲除实验证实了其保护性功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中得到验证;且机制研究尚不深入,Tnfsf15的具体作用通路有待进一步阐明 | 探究Alport综合征早期分子变化,寻找潜在的保护性因子以理解疾病发生机制 | Col4a5 G5X Alport综合征小鼠模型,重点关注肾小球细胞(特别是足细胞) | 单细胞组学 | 肾脏疾病(Alport综合征) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因敲除技术 | NA | 单细胞转录组数据 | Alport小鼠模型在5周龄(发病前)和8周龄(发病早期)的肾小球样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3560 | 2026-02-13 |
[Impact of bone metastasis on the prognosis of lung adenocarcinoma patients treated with third-generation EGFR-TKIs and the underlying mechanisms]
2026-Feb-12, Zhonghua yi xue za zhi
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研究论文 | 本研究评估了骨转移对接受一线第三代EGFR-TKI治疗的肺腺癌患者预后的影响,并通过单细胞RNA测序探索了骨转移导致EGFR-TKI耐药的潜在机制 | 首次结合大规模临床回顾性分析与单细胞RNA测序技术,系统揭示了骨转移肺腺癌患者对第三代EGFR-TKI预后不佳的免疫微环境机制,并构建了基于免疫调控基因的预后评分模型 | 研究为回顾性分析,存在选择偏倚;单细胞测序样本量较小(n=4);验证队列样本量有限 | 评估骨转移对第三代EGFR-TKI治疗肺腺癌患者预后的影响,并探索其耐药机制 | EGFR突变晚期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO-Cox回归模型 | 临床数据,单细胞转录组数据 | 临床队列370例患者(161例有骨转移,209例无骨转移);单细胞测序4个样本(2个原发肺肿瘤,2个骨转移灶);TCGA训练队列41例;亚洲验证队列93例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |