单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3541	2025-03-19	Advances and global trends of precancerous lesions of gastric cancer: A bibliometric analysis 2025-Mar-15, World journal of gastrointestinal oncology IF:2.5Q3 DOI:10.4251/wjgo.v17.i3.102111 PMID:40092937	综述	本文通过文献计量学方法，全面回顾了胃癌前病变（PLGC）的研究现状，分析了发展趋势和研究热点	利用文献计量学工具（如VOSviewer、CiteSpace等）对2004年至2023年间发表的PLGC相关研究进行了系统分析，揭示了研究热点和未来方向	研究主要基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献，且未深入探讨具体研究方法的局限性	全面回顾胃癌前病变的研究现状，分析发展趋势和研究热点，为未来研究提供指导	胃癌前病变（PLGC）相关研究	文献计量学	胃癌	单细胞测序、空间分辨分析、多组学方法、人工智能、机器学习	NA	文献数据	4097篇文章
3542	2025-03-19	Functional and molecular single-cell analyses implicate PRDM14 in the initiation of B cell leukemia in mice 2025-Mar-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93043-z PMID:40087379	研究论文	本文通过单细胞功能与分子分析，探讨了PRDM14在小鼠B细胞白血病起始中的作用	揭示了PRDM14通过非特异性DNA结合激活致癌途径，并促使细胞向自我更新的B-1样表型发展，从而启动癌症的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类癌症中验证	探讨PRDM14在B细胞白血病起始中的分子机制	小鼠T细胞淋巴母细胞白血病/淋巴瘤模型中的Prdm14表达细胞	分子生物学	白血病	质谱流式细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序	小鼠模型	单细胞RNA测序数据、质谱流式细胞术数据	小鼠骨髓样本
3543	2025-03-19	Macrophage-derived SPP1 exacerbate myocardial injury by interacting with fibroblasts in viral myocarditis 2025-Mar-14, Biology direct IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13062-025-00621-2 PMID:40087693	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和体外共培养实验，研究了病毒性心肌炎（VMC）急性期巨噬细胞衍生的SPP1对心肌损伤的影响	揭示了Spp1+巨噬细胞在VMC急性期自我招募的机制，并发现巨噬细胞衍生的SPP1通过促进成纤维细胞高表达Ccl2/Ccl7加剧心肌免疫损伤	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨病毒性心肌炎的免疫致病机制	小鼠心脏中的巨噬细胞和成纤维细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	CVB3诱导的VMC小鼠模型
3544	2025-03-19	Combination therapy with Chicoric acid and PD-1/PD-L1 blockade improves the immunotherapy response in patient-derived ovarian cancer xenograft model 2025-Mar-14, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02146-7 PMID:40087780	研究论文	本研究探讨了Chicoric acid（CA）与PD-1/PD-L1阻断联合治疗在卵巢癌患者来源的异种移植模型中的免疫治疗效果	首次将CA与PD-1/PD-L1阻断联合应用于卵巢癌治疗，并发现CA能增强免疫细胞对卵巢癌细胞的抗肿瘤能力	研究仅限于患者来源的异种移植模型，未进行临床试验验证	开发新的有效治疗策略以改善难治性卵巢癌的免疫治疗效果	难治性卵巢癌患者来源的异种移植模型	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，免疫组化	患者来源的异种移植模型（PDX）	单细胞RNA测序数据，免疫组化数据	15个样本中的158,734个细胞
3545	2025-03-19	Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury 2025-Mar-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413253 PMID:40087815	研究论文	本文研究了PAD2通过瓜氨酸化NF-κB p65调控巨噬细胞极化在急性肺损伤中的作用，并开发了一种基于金纳米颗粒的靶向治疗策略	发现NF-κB p65上的新瓜氨酸化位点R171，并开发了一种新型纳米药物用于选择性递送PAD2抑制剂到M1极化巨噬细胞	研究主要基于PA诱导的急性肺损伤模型，未涉及其他类型的肺损伤	探索PAD2在巨噬细胞极化中的作用及其在急性肺损伤中的治疗潜力	巨噬细胞、急性肺损伤模型	生物医学	急性肺损伤	单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学	NA	RNA测序数据、蛋白质组数据	未明确提及具体样本数量
3546	2025-03-19	Exosome-mediated effects of BRCA1 on cardiovascular artery disease 2025-Mar-13, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-09996-4 PMID:40080209	研究论文	本研究探讨了源自M1巨噬细胞的外泌体（Exo）中BRCA1对冠状动脉疾病（CAD）的影响	揭示了BRCA1在M1巨噬细胞外泌体中对心肌细胞凋亡和平滑肌细胞行为的调控作用，为CAD治疗提供了新的分子靶点	研究中未详细探讨BRCA1-Exo对其他类型细胞的影响，且样本量可能有限	研究BRCA1在M1巨噬细胞外泌体中对CAD进展的影响	M1巨噬细胞、心肌细胞、平滑肌细胞	心血管疾病	冠状动脉疾病	单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析（WGCNA）	NA	RNA-seq数据	NA
3547	2025-03-19	Single-cell spatial transcriptomics unravels cell states and ecosystems associated with clinical response to immunotherapy 2025-Mar-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-011308 PMID:40081939	研究论文	本研究利用单细胞空间转录组学技术，系统解析了肿瘤微环境（TME）的复杂性，特别是细胞异质性和空间相互作用，并探讨了它们对免疫治疗效果的集体影响	首次在单一患者群体中应用单细胞空间转录组学技术，揭示了TME中细胞组成和空间组织对免疫治疗临床反应的双重重要性	研究样本量较小，仅包括20个预处理vHSIL病变，且结果需要在更广泛的肿瘤类型中进一步验证	探讨肿瘤微环境中的细胞异质性和空间相互作用如何影响免疫治疗的临床反应	接受免疫治疗肿瘤特异性肽疫苗治疗的外阴高级别鳞状上皮内病变（vHSIL）患者	数字病理学	外阴高级别鳞状上皮内病变	单细胞空间转录组学	NA	单细胞转录组数据	20个预处理vHSIL病变
3548	2025-03-19	Artificial intelligence-driven integration of single-cell RNA sequencing and transcriptome analysis to decipher APOE's role in gastric cancer prognosis and therapy 2025-Mar-13, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02100-6 PMID:40082390	研究论文	本研究利用人工智能驱动的单细胞RNA测序和转录组分析，探索了胃肿瘤微环境，并识别了新的预后标志物和治疗靶点	结合人工智能技术，首次揭示了APOE在胃癌中的免疫抑制作用及其通过M2巨噬细胞极化促进肿瘤进展的机制	研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仍需进一步扩展	探索胃癌的肿瘤微环境，识别新的预后标志物和治疗靶点	胃癌患者的单细胞RNA测序和转录组数据	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组分析	AI增强的分析方法	RNA测序数据	胃癌患者的单细胞RNA测序和转录组数据集
3549	2025-03-19	TIMM23 overexpression drives NSCLC cell growth and survival by enhancing mitochondrial function 2025-Mar-13, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07505-3 PMID:40082395	研究论文	本文探讨了TIMM23在非小细胞肺癌（NSCLC）细胞生长和存活中的作用，通过增强线粒体功能来促进肿瘤发展	首次揭示了TIMM23在NSCLC中的过表达与不良临床结果之间的强相关性，并通过实验验证了TIMM23对线粒体功能及肿瘤细胞生长的影响	研究主要基于体外和动物模型，尚未在人体临床试验中验证TIMM23作为治疗靶点的效果	研究TIMM23在NSCLC中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力	非小细胞肺癌（NSCLC）细胞	癌症生物学	肺癌	单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、shRNA沉默	NA	RNA测序数据、蛋白质表达数据	多个原代/已建立的NSCLC细胞系及裸鼠皮下NSCLC异种移植模型
3550	2025-03-19	A single-cell network approach to decode metabolic regulation in gynecologic and breast cancers 2025-Mar-13, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-025-00506-0 PMID:40082472	研究论文	本研究采用单细胞网络方法，解析妇科和乳腺癌中的代谢调控机制	利用单细胞RNA测序数据，构建癌症特异性蛋白质-蛋白质相互作用网络和基因调控网络，揭示代谢调控的关键变化	NA	理解妇科和乳腺癌中代谢异质性及其调控机制，以开发个性化治疗策略	妇科和乳腺癌细胞	生物信息学	妇科癌症, 乳腺癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	单细胞RNA测序数据	NA
3551	2025-03-19	Mesothelioma cell heterogeneity identified by single cell RNA sequencing 2025-Mar-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92542-3 PMID:40082554	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了间皮瘤细胞的异质性，揭示了不同来源的间皮瘤细胞具有独特的基因特征	首次使用单细胞RNA测序技术探索循环间皮瘤细胞的异质性，并识别了不同亚群的独特基因特征	研究主要基于小鼠模型，结果在人类间皮瘤中的适用性尚需进一步验证	研究间皮瘤细胞的异质性及其对疾病进展和治疗的影响	间皮瘤细胞，包括细胞培养、腹腔灌洗液和循环肿瘤细胞	数字病理学	间皮瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	小鼠模型中的间皮瘤细胞
3552	2025-03-19	Impdh1 was identified as a key protein promotes diabetic vasculopathy by intervention of vascular endothelial cell pyroptosis 2025-Mar-13, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3 DOI:10.1186/s12872-025-04604-z PMID:40082765	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，识别出Impdh1作为促进糖尿病血管病变的关键蛋白，并通过抑制血管内皮细胞焦亡来保护主动脉内皮细胞	首次将Impdh1识别为与糖尿病血管病变相关的焦亡关键分子，并验证了其在抑制内皮细胞焦亡和炎症中的作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探讨糖尿病血管病变的分子机制，特别是焦亡在内皮细胞中的作用	糖尿病小鼠模型和血管内皮细胞	生物医学	糖尿病血管病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、实时定量逆转录PCR（qRT-PCR）、免疫组化（IHC）、免疫荧光（IF）染色、细胞划痕实验、细胞计数试剂盒-8（CCK-8）实验、管形成实验、酶联免疫吸附测定（ELISA）	NA	RNA测序数据、免疫组化和免疫荧光图像数据	糖尿病小鼠模型和体外培养的血管内皮细胞
3553	2025-03-19	Single-cell transcriptomic analyses reveal heterogeneity and key subsets associated with survival and response to PD-1 blockade in cervical squamous cell carcinoma 2025-Mar-13, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-025-03725-x PMID:40082876	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了宫颈鳞状细胞癌（CSCC）肿瘤微环境的异质性及其与生存和PD-1阻断治疗反应相关的关键细胞亚群	首次在CSCC中通过单细胞RNA测序结合TCGA数据，识别了10种主要细胞类型和35个基质及免疫细胞亚群，并发现PCLAF+ TAEpis与CD8+ T细胞数量、患者生存率及抗PD-1治疗反应呈负相关	研究样本量有限，且主要基于单中心数据，需要更大规模的多中心研究验证	探讨CSCC肿瘤微环境的异质性及其对PD-1阻断治疗反应的影响	宫颈鳞状细胞癌（CSCC）患者肿瘤组织中的细胞	数字病理	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据、TCGA数据	50,649个细胞
3554	2025-03-19	Basal cell adhesion molecule (BCAM) promotes mesothelial-to-mesenchymal transition and tumor angiogenesis through paracrine signaling 2025-Mar-13, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02128-9 PMID:40082910	研究论文	本文研究了基底细胞粘附分子（BCAM）在卵巢癌（OC）进展中的作用，特别是其通过旁分泌信号促进间皮细胞向间充质细胞转化（MMT）和肿瘤血管生成	揭示了BCAM通过诱导细胞因子分泌促进MMT和肿瘤血管生成的新功能，这些功能在OC转移的不同阶段可能发挥重要作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探讨BCAM在OC转移中的作用机制及其潜在的治疗靶点	卵巢癌细胞、间皮细胞、小鼠模型	肿瘤生物学	卵巢癌	亲和蛋白质组学、bulk和单细胞RNA测序、活细胞和多光子显微镜、生化功能体外实验	小鼠肿瘤模型	蛋白质组数据、RNA测序数据、显微镜图像	NA
3555	2025-03-19	MuCST: restoring and integrating heterogeneous morphology images and spatial transcriptomics data with contrastive learning 2025-Mar-13, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01449-1 PMID:40082941	研究论文	本文提出了一种名为MuCST的多模态对比学习方法，用于整合空间转录组学数据，包括去噪、异质性消除和兼容特征学习	MuCST方法通过对比学习整合多模态空间转录组学数据，能够准确识别空间域，并适用于多种数据集平台	NA	开发一种灵活的多模态对比学习方法，用于整合空间转录组学数据，以更好地理解生物机制	空间转录组学数据，包括空间位置、组织学图像和转录组数据	生物信息学	NA	对比学习	MuCST	图像、空间位置数据、转录组数据	NA
3556	2025-03-19	Myeloid Fatty Acid Metabolism Activates Neighboring Hematopoietic Stem Cells to Promote Heart Failure With Preserved Ejection Fraction 2025-Mar-12, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.124.070248 PMID:40071347	研究论文	本文探讨了心力衰竭伴射血分数保留（HFpEF）中髓系脂肪酸代谢对邻近造血干细胞激活的作用及其对系统性炎症和心脏舒张功能障碍的促进作用	发现了HFpEF患者外周血造血干细胞增多的现象，并揭示了髓系脂肪酸代谢在其中的关键作用	研究主要基于动物模型和体外实验，临床样本的验证仍需进一步研究	研究HFpEF的病理机制，特别是炎症和代谢在其中的作用	HFpEF患者样本和动物模型	心血管疾病	心力衰竭	流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、碳标记	高脂饮食和高血压小鼠模型	RNA测序数据、质谱数据	患者样本和动物模型
3557	2025-03-19	Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis 2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.03.06.641843 PMID:40093090	研究论文	本研究探讨了在动脉粥样硬化形成过程中，紊乱血流（d-flow）和高胆固醇血症条件下内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞的重编程	首次验证了d-flow和高胆固醇血症共同作用下内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞的重编程，并提供了单细胞RNA测序和免疫组化染色证据	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中完全验证	研究动脉粥样硬化形成过程中内皮细胞的重编程机制	小鼠的颈动脉内皮细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组化染色	NA	单细胞RNA测序数据，免疫组化数据	95只小鼠，98,553个单细胞
3558	2025-03-19	Dynamic responses to rejection in the transplanted human heart revealed through spatial transcriptomics 2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.28.640852 PMID:40093136	研究论文	本研究利用基于图像的空间转录组学在亚细胞分辨率下对纵向人类心脏活检样本进行分析，以表征62名成人和儿童心脏移植受者在组织学诊断的排斥反应期间和之后的转录异质性	首次在亚细胞分辨率下应用空间转录组学技术，揭示了心脏移植排斥反应期间的转录异质性，并识别了与长期预后相关的基因	研究样本量相对较小（62名受者），且主要依赖于组织学诊断的排斥反应，可能存在诊断变异性的问题	研究心脏移植后排斥反应的分子表型，以分层治疗反应并改善移植后的短期和长期结果	62名成人和儿童心脏移植受者	数字病理学	心血管疾病	空间转录组学	NA	图像	62名心脏移植受者
3559	2025-03-19	Identification and Validation of Four Serum Biomarkers With Optimal Diagnostic and Prognostic Potential for Gastric Cancer Based on Machine Learning Algorithms 2025-Mar, Cancer medicine IF:2.9Q2 DOI:10.1002/cam4.70659 PMID:40084401	研究论文	本研究通过机器学习和多种生物信息学分析方法，识别并验证了四种具有最佳诊断和预后潜力的胃癌血清生物标志物	结合LASSO回归和随机森林算法，从TCGA和GEO数据库中识别出18个关键基因，并进一步验证了四种具有临床实用性的生物标志物	研究依赖于公共数据库数据，实验验证样本量可能有限	识别和验证胃癌的诊断和预后生物标志物	胃癌患者血清样本	机器学习	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-PCR、ELISA	LASSO回归、随机森林（RF）	基因表达数据、血清样本数据	TCGA和GEO数据库中的胃癌样本
3560	2025-03-19	Altered Arginine Metabolism Affects Proliferation and Radiosensitivity of Keloids 2025-Mar, Experimental dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/exd.70077 PMID:40095415	研究论文	本文通过代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序数据，研究了瘢痕疙瘩中精氨酸和脯氨酸代谢的改变及其对细胞增殖和放射敏感性的影响	首次通过多组学整合分析揭示了瘢痕疙瘩中精氨酸和脯氨酸代谢的上调，并发现精氨酸剥夺疗法（ADT）可以抑制瘢痕疙瘩来源的成纤维细胞增殖并增强其放射敏感性	研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证	探讨瘢痕疙瘩中细胞代谢与生物学行为之间的关系，以发现新的治疗策略	瘢痕疙瘩及其邻近皮肤组织	代谢组学	瘢痕疙瘩	代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序	NA	代谢组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据	瘢痕疙瘩及邻近皮肤组织样本