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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3521 | 2025-11-05 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.02.530774
PMID:39803528
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研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合方法,从基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的生物物理模型相结合,通过可解释的稀疏线性回归模型将离子通道基因表达与生物物理模型参数直接关联 | 面临数学模型与实验数据不匹配的挑战,模型验证依赖于多模态Patch-seq数据的质量和完整性 | 建立基因表达与皮层神经元类型生理特性之间的联系机制 | 多种皮层细胞类型的神经元 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学, Patch-seq, 模拟推理 | Hodgkin-Huxley模型, 稀疏线性回归模型 | 多模态电生理和基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3522 | 2025-11-05 |
A second wave of Notch signaling diversifies the intestinal secretory lineage
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603542
PMID:39071399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小肠中罕见分泌细胞CHEs的命运特化机制 | 发现Notch信号通路在分泌谱系中发生第二波激活以特化CHEs细胞群体 | CHEs细胞在大鼠和人类中存在但小鼠中缺失,限制了部分实验模型的适用性 | 探究小肠分泌细胞谱系多样化的分子机制 | 大鼠和人类小肠中的C FTR高表达细胞(CHEs) | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3523 | 2025-11-05 |
GZMK+CD8+ T cells Target A Specific Acinar Cell Type in Sjögren's Disease
2024-Jul-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3601404/v2
PMID:38196575
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析健康与疾病状态下的人类小唾液腺,揭示了干燥综合征中特定腺泡细胞被靶向的机制 | 首次发现新型浆黏液腺泡细胞类型,并鉴定出GZMK+CD8+ T细胞特异性靶向其中一类腺泡细胞的免疫机制 | 未明确说明样本数量和技术平台的详细配置信息 | 解析干燥综合征的发病机制和细胞靶向特性 | 人类小唾液腺组织 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3524 | 2025-11-05 |
Early events marking lung fibroblast transition to profibrotic state in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-21, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02419-0
PMID:37085855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学识别了特发性肺纤维化中成纤维细胞向促纤维化状态转变的早期事件 | 首次发现核糖体蛋白全局下调和铜结合蛋白显著上调标志着IPF转变,并识别了新的过渡性成纤维细胞亚群 | 研究样本量有限,且主要关注成纤维细胞而忽略了其他细胞类型在疾病进展中的作用 | 探究特发性肺纤维化中成纤维细胞从正常向促纤维化状态转变的早期分子事件 | 健康对照和IPF患者肺组织中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序,免疫荧光检测 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像 | 健康对照和IPF患者肺组织样本(上下肺叶) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3525 | 2025-11-04 |
Short-chain fatty acids regulate T cell heterogeneity to alleviate recurrent spontaneous abortion
2025-Dec, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70155
PMID:40759431
|
研究论文 | 本研究探讨肠道微生物源性短链脂肪酸通过调节T细胞异质性改善复发性流产的机制 | 首次揭示短链脂肪酸通过GPR43受体调控CD4+ T细胞分化在复发性流产中的作用机制,并开发了结肠靶向短链脂肪酸纳米递送系统 | 动物模型与人类病理生理存在差异,临床转化需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢产物短链脂肪酸在复发性流产免疫耐受中的作用 | 复发性流产患者和小鼠模型 | 免疫学 | 复发性流产 | 单细胞测序, 16S rDNA测序, 粪便微生物移植, 分子生物学方法 | NA | 单细胞数据, 微生物组数据 | 复发性流产患者和小鼠模型 | NA | 单细胞测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 3526 | 2025-11-04 |
Cytotoxic CD8+ T Cells Downregulate GPX4 to Promote Ferroptosis in Melanoma That Drives Antitumor Immunity
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1952
PMID:40828991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD8+ T细胞通过下调GPX4促进黑色素瘤铁死亡,从而驱动抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示CD8+ T细胞通过直接接触下调GPX4表达诱导肿瘤细胞铁死亡的新机制 | 主要基于小鼠模型,人类数据验证仍需进一步研究 | 探究铁死亡在抗肿瘤免疫中的作用机制 | 小鼠黑色素瘤模型和人类黑色素瘤样本 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成功和不成功免疫反应的小鼠黑色素瘤样本及人类黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3527 | 2025-11-04 |
Identification of a CD138-Negative Therapy-Resistant Subpopulation in Multiple Myeloma with Vulnerability to Splicing Factor Inhibition
2025-Nov-03, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-24-0340
PMID:40890913
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别多发性骨髓瘤中CD138阴性的耐药亚群及其对剪接因子抑制的敏感性 | 发现CD138阴性多发性骨髓瘤细胞中存在耐药亚群,并首次揭示该亚群对剪接通路抑制具有特异性脆弱性 | 研究样本量有限,耐药机制需进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤治疗抵抗的分子机制 | 从患者骨髓中纯化的原代多发性骨髓瘤细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, VDJ靶向测序, CRISPR/Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3528 | 2025-11-04 |
Depletion of Sorcs3 Activates Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells by Modulating Key Signaling Pathways
2025-Nov-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509151
PMID:41178446
|
研究论文 | 通过敲除Sorcs3基因激活小鼠胚胎干细胞全能性并揭示相关信号通路机制 | 首次发现Sorcs3缺失可诱导胚胎干细胞获得全能性状态,并阐明Tfap2c基因和特定信号通路在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型,尚未在人类细胞中验证 | 建立可持续的全能性干细胞并研究其调控机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 基因敲除、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3529 | 2025-11-04 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2025-Nov-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓干细胞分化过程中血管生成先于神经生成的时间顺序 | 首次在单细胞水平证明牙髓干细胞在体内分化时血管生成先于神经生成的时间顺序 | 研究样本量有限,且仅在免疫缺陷小鼠模型中进行验证 | 探究人牙髓干细胞的分化机制和时序 | 人牙髓干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 动物移植模型 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3530 | 2025-11-04 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2025-Nov-03, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
|
研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架识别原发性震颤的高置信度候选基因,并评估计算预测与实验验证之间的差异 | 开发了整合多组学数据的计算框架,提出了原发性震颤的皮质假说,揭示了计算预测与实验验证之间的关键差距 | 在死后小脑组织中未发现显著差异表达,计算预测与实验验证存在不一致 | 识别原发性震颤的效应基因以阐明疾病机制并开发靶向治疗 | 原发性震颤患者和对照组的基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 孟德尔随机化, 共表达网络分析, 空间转录组学 | 多阶段计算框架 | 基因组数据, 转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3531 | 2025-11-04 |
Clinical application of single-cell RNA sequencing in disease and therapy
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70512
PMID:41169094
|
综述 | 系统概述单细胞RNA测序技术在疾病机制研究和临床应用中的进展 | 整合单细胞与空间转录组技术,结合人工智能和机器学习算法分析大数据 | 存在技术挑战和数据分析障碍 | 探讨单细胞RNA测序在疾病研究和精准医疗中的应用 | 人类疾病中的体细胞进化、生物标志物发现和药物开发 | 自然语言处理 | 多种疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3532 | 2025-11-02 |
Parental Specific Expression by scRNA-Seq Reveals HaWRKY40 Contributing to Heterosis of Sunflower
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70266
PMID:41170640
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3533 | 2025-11-04 |
Integrated analysis identifies CD276 in fibroblasts as a malignancy predictor and regulator of neutrophil infiltration in hepatoblastoma
2025-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000826
PMID:41171428
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研究论文 | 本研究通过整合分析发现成纤维细胞中的CD276是肝母细胞瘤恶性程度的预测因子和中性粒细胞浸润的调节因子 | 首次系统表征CD276在肝母细胞瘤中的表达谱,发现其在癌相关成纤维细胞中高表达,并揭示其通过调节CXCL2调控中性粒细胞浸润的新机制 | 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要更多临床验证 | 探究免疫检查点配体CD276在肝母细胞瘤中的临床意义及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 肝母细胞瘤患者组织和细胞,小鼠模型 | 生物信息学,肿瘤免疫学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,多重免疫组织化学,去卷积分析,相关性分析 | 逻辑回归模型,风险评分模型,列线图 | RNA-seq数据,单细胞RNA-seq数据,图像数据 | 肝母细胞瘤患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3534 | 2025-11-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a metastasis-associated PCSK1+ neuroendocrine subpopulation in pancreatic neuroendocrine tumors
2025-Nov, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70084
PMID:40817830
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现胰腺神经内分泌肿瘤中与转移相关的PCSK1+神经内分泌亚群 | 首次在胰腺神经内分泌肿瘤中鉴定出富含于肝转移灶的PCSK1+神经内分泌亚群,并揭示其高拷贝数变异负荷、低分化潜能和独特的转录调控特征 | 基于公开数据库的回顾性分析,样本量有限(27个样本),需要后续实验验证机制 | 探索胰腺神经内分泌肿瘤中神经内分泌细胞的异质性及其与转移的关系 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者组织样本(包括癌旁正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | 单细胞组学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 伪时间轨迹分析, 转录调控网络分析, 细胞间通讯分析 | CytoTRACE2, Monocle3, SCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 27个样本(包括正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3535 | 2025-11-04 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
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研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理学的空间框架,用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理学整合,在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因风险模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究,样本量较小(5个膀胱肿瘤标本),需要更大规模研究验证 | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱肿瘤组织标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全切片图像, 基因表达数据 | 5个膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3536 | 2025-11-04 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-Oct-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
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研究论文 | 本研究通过整合基因组关联分析、单细胞转录组学和空间转录组学,揭示了STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次整合GWAS、单细胞和空间转录组学数据,发现STK24作为新的凋亡相关基因在LUAD中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索肺腺癌的遗传机制和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | GWAS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习算法, 预后模型 | 基因组数据, 转录组数据, 空间位置数据 | 来自FinnGen、IEU OpenGWAS、GWAS Catalog和GEO数据库的多中心样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3537 | 2025-11-04 |
Ex vivo lung-organoid model for aberrant basaloid cell induction and activation
2025-Oct-30, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00396-z
PMID:41168897
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研究论文 | 本研究开发了一种离体小鼠肺类器官模型,用于诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞 | 开发了首个能够诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞的离体肺类器官模型,并识别出两种不同的ABC亚群 | 研究基于小鼠模型,与人类疾病可能存在差异;模型验证仍需进一步临床相关性研究 | 研究肺纤维化中异常基底样细胞的诱导机制和功能 | 小鼠肺类器官和异常基底样细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,细胞-细胞相互作用分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3538 | 2025-11-04 |
Advancements in Personalized Medicine for Leukemia: Integrating Genetic, Transcriptomic, and Artificial Intelligence Insights
2025-Oct-29, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
综述 | 探讨遗传学、转录组学和人工智能在白血病精准医疗中的整合应用与进展 | 整合多组学数据与人工智能算法推动白血病个性化治疗策略的优化 | 存在克隆进化、遗传异质性和治疗耐药性等挑战 | 推进白血病精准医疗发展 | 白血病患者 | 自然语言处理 | 白血病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3539 | 2025-11-04 |
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2025-Oct-28, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202561
PMID:41147439
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研究论文 | 评估II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 | 首次通过临床试验和动物实验证实II型5α-还原酶抑制剂能促进TURP术后伤口修复,并揭示其通过减轻纤维化和炎症的作用机制 | 样本量相对有限(87例患者,12只比格犬),随访时间较短(6个月) | 研究II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 | BPH患者和比格犬动物模型 | 医学研究 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验,组织学分析 | NA | 临床数据,分子标记数据,组织学数据 | 87例BPH患者(47例治疗组,42例安慰剂组),12只比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3540 | 2025-11-04 |
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.669778
PMID:40832237
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研究论文 | 通过单细胞条形码和转录组分析揭示肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态及IFNγ信号的关键作用 | 开发MetTag单细胞追踪技术,首次发现早期播散克隆具有IFNγ依赖的转移适应机制 | 研究主要聚焦腹膜转移模型,其他转移器官的普适性需进一步验证 | 解析肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态和分子决定因素 | 播散性肿瘤细胞(DTCs)和转移微环境 | 单细胞组学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9筛选,RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 腹水和转移灶组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |