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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3521 - 3540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3521 | 2025-10-06 |
Leveraging multiple labeled datasets for the automated annotation of single-cell RNA and ATAC data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.043
PMID:40687986
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研究论文 | 提出JIND-Multi框架，用于在多个标注数据集间转移细胞类型标签，实现单细胞RNA和ATAC数据的自动注释 | 首个能同时处理scRNA-Seq和scATAC-Seq数据的多数据集标签转移框架，无需配对RNA数据即可注释ATAC数据 | 需要同类型标注数据，对罕见细胞类型的适应性未充分验证 | 开发单细胞数据自动注释方法，解决细胞图谱构建中的批次效应和注释一致性问题 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | JIND-Multi框架 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3522 | 2025-10-06 |
dandelionR: Single-cell immune repertoire trajectory analysis in R
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.047
PMID:40687995
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研究论文 | 开发了一个R包dandelionR，用于单细胞免疫组库轨迹分析 | 首个基于R语言的单细胞免疫组库轨迹分析工具，实现了VDJ特征空间构建和基于扩散映射与吸收马尔可夫链的轨迹分析 | 目前仅提供基础功能，可能缺乏Python版本中的一些高级特性 | 开发单细胞RNA测序和免疫组库测序整合分析的R语言工具 | 淋巴细胞发育研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | 扩散映射, 吸收马尔可夫链 | 基因表达数据, 免疫受体序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, scVDJ-seq | NA | NA |
| 3523 | 2025-10-06 |
Integrated multiomics analysis identifies PHLDA1+ fibroblasts as prognostic biomarkers and mediators of biological functions in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592416
PMID:40688078
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析开发了一个7基因风险模型，识别PHLDA1+成纤维细胞作为胰腺癌的预后生物标志物和生物学功能介质 | 首次构建了基于7个基因的mCAF相关风险模型，并发现PHLDA1在肿瘤-基质相互作用中的关键介导作用 | CAF亚型的预后和功能贡献仍需进一步深入理解 | 研究胰腺癌中癌症相关成纤维细胞亚型的预后价值和功能作用 | 胰腺癌患者和肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,共培养实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 3524 | 2025-10-06 |
S100A8/A9 in herpes zoster neuralgia: molecular mechanisms and therapeutic perspectives
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615638
PMID:40688076
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综述 | 本文系统阐述了S100A8/A9蛋白复合物在带状疱疹神经痛发病机制中的关键作用及治疗前景 | 首次系统揭示S100A8/A9通过TLR4/TNF信号通路调控神经炎症过程，并作为慢性疼痛转化的关键分子标志物 | 当前治疗策略存在局限性，需要更多临床验证 | 探讨S100A8/A9在带状疱疹神经痛发病机制中的作用及治疗潜力 | 带状疱疹相关神经性疼痛的分子机制 | 神经科学 | 带状疱疹神经痛 | 单细胞测序，多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | NA |
| 3525 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics uncover ELK4-mediated mechanisms in NDUFAB1+ tumor cells driving gastric cancer progression, metabolic reprogramming, and immune evasion
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1591123
PMID:40688093
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了ELK4介导的NDUFAB1+肿瘤细胞在胃癌进展、代谢重编程和免疫逃逸中的核心机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学识别出C1 NDUFAB1+胃癌细胞亚型，并发现其通过PARs信号通路与成纤维细胞和周细胞相互作用 | 研究主要基于体外实验验证，缺乏体内动物模型验证 | 探索胃癌肿瘤异质性及治疗抵抗机制，开发多靶点综合治疗策略 | 胃癌组织和细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外实验 | Seurat, Robust Cell Type Decomposition, CellChat, StLearn | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3526 | 2025-10-06 |
Key immune regulators in retinal ischemia-reperfusion injury via RNA sequencing
2025, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2025.07.06
PMID:40688775
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探索视网膜缺血再灌注损伤中的免疫细胞浸润和分子机制 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，首次系统鉴定RIRI中的关键免疫调节基因及其在特定免疫细胞中的表达 | 研究主要关注急性期RIRI，未涉及慢性阶段的免疫调节机制 | 探索视网膜缺血再灌注损伤的免疫调控机制并识别潜在治疗靶点 | 视网膜缺血再灌注损伤模型 | 生物信息学 | 视网膜疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | 差异基因表达分析, 加权基因共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3527 | 2025-10-06 |
Nanocoding: Lipid Nanoparticle Barcoding for Multiplexed Single-Cell RNA Sequencing
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.16.628827
PMID:39763829
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研究论文 | 本研究开发了一种基于脂质纳米颗粒的条形码技术Nanocoding，用于多重单细胞RNA测序 | 利用脂质纳米颗粒实现高密度条形码标记，将条形码载量提高10-100倍，且无需新型化学修饰 | NA | 开发更高效稳定的样本多重标记方法以解决scRNA-seq中的高成本和批次效应问题 | 培养细胞系、组织消化物中的异质性细胞、脾脏消化物、肥胖啮齿动物脂肪组织 | 单细胞测序技术 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6重条形码样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3528 | 2025-10-06 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析AAV基因治疗杜氏肌营养不良症患者的免疫细胞变化 | 首次在AAV基因治疗的DMD患者中结合单细胞RNA测序和TCR测序分析免疫反应，揭示了干扰素反应基因的诱导和T细胞克隆扩增模式 | 样本量较小（仅5名参与者），仅有一例发生血栓性微血管病 | 研究AAV基因治疗在DMD患者中引发的免疫反应机制 | 杜氏肌营养不良症患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，TCR序列数据 | 5名DMD患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3529 | 2025-10-06 |
Diverse NKT cells regulate early inflammation and neurological outcomes after cardiac arrest and resuscitation
2024-12-04, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq5796
PMID:39630883
|
研究论文 | 本研究通过分析心脏骤停患者的免疫细胞，发现多样NKT细胞与良好神经预后相关，并在小鼠模型中验证其神经保护作用 | 首次发现硫酸酯特异性dNKT细胞在心脏骤停后神经保护中的关键作用，并证明硫酸酯脂质治疗可改善神经功能 | 动物模型结果需要进一步临床验证，研究样本量有限 | 探索心脏骤停后神经损伤的免疫调节机制和潜在治疗策略 | 院外心脏骤停患者和小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大型OHCA患者队列和独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3530 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Tonsils Reveals Nicotine Enhances HIV-1-Induced NLRP3 Inflammasome and Mitochondrial Activation
2024-11-20, Viruses
DOI:10.3390/v16111797
PMID:39599911
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研究论文 | 通过人类扁桃体单细胞转录组学研究尼古丁增强HIV-1诱导的NLRP3炎症小体和线粒体激活机制 | 首次在人类扁桃体组织模型中揭示HIV-1感染与尼古丁暴露的协同作用机制，重点关注NLRP3炎症小体激活和线粒体功能 | 研究基于体外扁桃体组织模型，可能无法完全反映体内复杂免疫环境 | 探究HIV-1感染与尼古丁暴露对免疫细胞功能的协同影响机制 | 人类扁桃体组织外植体 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类扁桃体外植体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3531 | 2025-10-06 |
Exposure to BaA inhibits trophoblast cell invasion and induces miscarriage by regulating the DEC1/ARHGAP5 axis and promoting ubiquitination-mediated degradation of MMP2
2024-11-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.135594
PMID:39191013
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研究论文 | 本研究揭示了苯并[a]蒽通过调控DEC1/ARHGAP5轴和促进MMP2泛素化降解抑制滋养层细胞侵袭导致流产的机制 | 首次发现BaA通过表观遗传调控DEC1表达并鉴定ARHGAP5为DEC1直接靶基因，同时揭示BaA通过AhR激活MID1介导的MMP2泛素化降解新机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，人类样本验证仍需扩大样本量 | 探究BaA暴露导致复发性流产的分子机制 | 人绒毛外滋养层细胞(EVTs)和小鼠模型 | 生殖毒理学 | 复发性流产 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 人类绒毛组织和原代滋养层细胞，小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3532 | 2025-10-06 |
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618486
PMID:39464096
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研究论文 | 本研究通过BCR受体克隆表达和单细胞转录组学分析人类对GlcNAc表位的B细胞应答机制 | 首次揭示抗糖抗体通过使用私有抗体基因重排并在生发中心进行亲和力成熟的独特选择机制 | 研究主要关注GlcNAc表位，对其他糖类抗原的普适性需要进一步验证 | 解析人类抗糖抗体应答的免疫系统发育机制 | 人类B细胞及其抗体基因重排 | 免疫学 | NA | BCR受体克隆表达, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 抗体序列数据 | 人类队列研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3533 | 2025-10-06 |
Tumor editing suppresses innate and adaptive antitumor immunity and is reversed by inhibiting DNA methylation
2024-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01932-8
PMID:39169233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌肿瘤编辑如何抑制先天和适应性抗肿瘤免疫，并证明DNA甲基化抑制剂可逆转这一过程 | 首次在全基因组范围内无偏倚地识别早期肿瘤发生过程中的基因编辑，并发现DNA甲基化抑制剂可逆转免疫基因抑制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究肿瘤编辑对免疫监视的逃避机制及DNA甲基化抑制剂的治疗潜力 | 乳腺癌基因工程小鼠模型、乳腺肿瘤和黑色素瘤植入模型 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基因工程小鼠模型和植入肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3534 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analysis of mouse TRAMP cell lines and tumors provide insights into shared pathways and therapeutic targets
2024-Oct, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2024.100184
PMID:39175940
|
研究论文 | 通过比较TRAMP前列腺癌小鼠模型及其衍生细胞系的基因表达谱，揭示与肿瘤侵袭性相关的共享通路和潜在治疗靶点 | 首次系统比较TRAMP模型不同侵袭阶段（从原代细胞到TC2R骨转移模型）的转录组特征，并验证其与人类前列腺癌数据的相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索前列腺癌进展的分子机制并识别潜在治疗靶点 | TRAMP转基因小鼠模型、TRAMP-C2细胞系、TC2-Ras细胞系及肿瘤组织 | 转录组学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种TRAMP模型细胞系和肿瘤样本，包含人类数据集验证 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3535 | 2025-10-06 |
Lysosomal dysfunction-derived autophagy impairment of gingival epithelial cells in diabetes-associated periodontitis with altered protein acetylation
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111273
PMID:38950874
|
研究论文 | 本研究揭示了糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞溶酶体功能障碍通过改变蛋白质乙酰化导致自噬受损的分子机制 | 首次发现高糖环境下溶酶体功能障碍通过改变自噬-溶酶体通路相关蛋白的乙酰化水平导致自噬流阻塞 | 研究主要基于体外细胞实验，需要更多体内实验验证 | 探究糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞过度炎症反应的分子机制 | 人牙龈上皮细胞和临床牙龈上皮组织 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,组织图像 | 临床牙龈上皮组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 3536 | 2025-10-06 |
Machine Learning Uncovers Vascular Endothelial Cell Identity Genes by Expression Regulation Features in Single Cells
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609808
PMID:39253493
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研究论文 | 提出了一种名为SCIG的机器学习方法，用于在单细胞水平识别细胞身份基因 | 利用细胞身份基因独特的遗传序列特征（如顺式调控元件富集模式）和单细胞RNA-seq数据，无需与其他细胞比较即可识别细胞身份基因 | NA | 识别血管内皮细胞的身份基因，理解细胞分化和发育机制 | 人类内皮细胞图谱中的血管内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据，遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3537 | 2025-10-06 |
Dysregulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase in cancers: A comprehensive analysis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111198
PMID:38697449
|
研究论文 | 通过多组学分析探讨磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(PEPCK)在泛癌中的表达失调及其临床意义 | 首次在33种癌症类型中系统分析PEPCK两个亚型(PCK1和PCK2)的表达模式及其与临床预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于胶质母细胞瘤 | 阐明PEPCK在癌症发生发展中的作用机制及其临床价值 | 33种癌症类型的患者样本和胶质母细胞瘤细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析(重点关注胶质母细胞瘤) | 生物信息学分析、单细胞测序、体外实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据、突变数据 | TCGA数据库中33种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3538 | 2025-10-06 |
Blocking the MIR155HG/miR-155 axis reduces CTGF-induced inflammatory cytokine production and α-SMA expression via upregulating AZGP1 in hypertrophic scar fibroblasts
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111202
PMID:38729323
|
研究论文 | 本研究揭示了MIR155HG/miR-155/AZGP1轴在调控增生性瘢痕成纤维细胞中炎症因子产生和α-SMA表达的作用机制 | 首次发现CTGF通过磷酸化STAT3结合MIR155HG启动子刺激其表达，并阐明MIR155HG通过miR-155-5p/-3p靶向AZGP1调控瘢痕形成的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证 | 探究MIR155HG在增生性瘢痕纤维化中的作用机制 | 增生性瘢痕成纤维细胞(HSFBs) | 分子生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, western blotting, ELISA, 双荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 临床HS和正常皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 3539 | 2025-10-06 |
CXCR4-mediated neutrophil dynamics in periodontitis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111212
PMID:38719020
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨CXCR4在牙周炎中调控中性粒细胞动态的关键作用 | 首次系统揭示CXCR4通过调控中性粒细胞动态参与牙周炎发病的新机制 | 研究样本量有限，具体分子机制仍需进一步验证 | 鉴定牙周炎关键免疫相关致病基因并分析免疫细胞浸润特征 | 牙周组织转录组数据、临床样本和牙周炎小鼠模型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,蛋白互作网络分析 | LASSO回归模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | GEO数据库数据集、临床样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3540 | 2025-10-06 |
GeneSurfer Enables Transcriptome-wide Exploration and Functional Annotation of Gene Co-expression Modules in 3D Spatial Transcriptomics Data
2024-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602230
PMID:39005368
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研究论文 | 介绍GeneSurfer交互式工具，用于探索3D空间转录组数据中的基因共表达模块 | 开发首个用于大规模数据集局部基因共表达探索性分析的交互式界面，支持转录组范围的基因过滤、聚类和功能注释 | NA | 开发工具探索3D空间转录组数据中的局部基因共表达模式 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |