单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 3521 - 3540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3521 | 2026-01-18 |
Single-cell sequencing-based analysis of CD4 + T-cell and B-cell heterogeneity in patients with lupus nephritis
2026-Jan-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02277-3
PMID:41540405
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3522 | 2026-02-15 |
Analysis of cranial tenocyte heterogeneity reveals a role for Wnt signaling in tendon attachments
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205047
PMID:41582829
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼胚胎头部结缔组织，揭示了肌腱细胞在胚胎发育过程中的空间和功能异质性，并确定了Wnt信号在肌腱附着模式形成中的作用 | 首次在胚胎发育中识别出肌腱细胞和韧带细胞的亚群，并发现Wnt信号通路在肌腱附着模式形成中的新功能 | 研究基于斑马鱼胚胎模型，结果在哺乳动物或人类中的适用性需进一步验证 | 探究肌腱和韧带发育的遗传机制，特别是肌腱细胞异质性和附着模式的形成 | 斑马鱼胚胎头部的结缔组织，包括肌腱细胞和韧带细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），组合原位分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，原位表达数据 | 斑马鱼胚胎头部结缔组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3523 | 2026-02-15 |
Recent Advances in Single-Cell Analysis of Atherosclerotic Plaque Biology
2026-Jan-15, JMA journal
IF:1.5Q2
DOI:10.31662/jmaj.2025-0397
PMID:41676784
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的最新进展，揭示了斑块内免疫细胞的异质性和空间组织 | 利用单细胞和空间转录组学技术，首次在动脉粥样硬化斑块中识别出多种先前未知的免疫细胞亚群（如TREM2泡沫样巨噬细胞亚群和CD163巨噬细胞亚群，包括血红蛋白刺激的巨噬细胞[M(Hb)]表型），并揭示了斑块内免疫细胞的空间特异性炎症生态位和纤维帽动态 | 本文为综述文章，未直接进行实验研究，因此未涉及具体的技术平台或样本量细节，且依赖于现有研究的局限性 | 总结单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的应用，以推动对动脉粥样硬化发病机制的理解和精准免疫治疗策略的开发 | 动脉粥样硬化斑块，特别是斑块内的免疫细胞（如巨噬细胞和T细胞） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3524 | 2026-02-15 |
Unveiling personalised targets of PD-1 blockade hyperprogression in a cervical adenocarcinoma via longitudinal single-cell and spatial monitoring
2026-Jan-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01270-4
PMID:41530529
|
研究论文 | 本研究通过纵向单细胞和空间转录组学分析，揭示了一例宫颈腺癌患者在PD-1阻断治疗后出现超进展疾病的个性化分子机制 | 首次在单个宫颈腺癌病例中，通过纵向整合单细胞RNA测序、T细胞受体分析和空间转录组学，实时揭示了PD-1阻断后超进展疾病的适应性机制，并提出了LAG3和IGF1R作为潜在治疗靶点 | 研究仅基于单个病例，结果需要更大样本量的队列研究进行验证 | 探究宫颈腺癌患者对PD-1免疫检查点抑制剂产生超进展反应背后的分子和细胞机制 | 一例接受抗PD-1免疫治疗后出现超进展疾病的宫颈腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 1例宫颈腺癌患者（纵向监测） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3525 | 2026-02-15 |
Using Spatial Transcriptomics to Identify a Diagnostic Molecular Signature Associated with Reversible Dental Pulpitis
2026-Jan-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7955718/v1
PMID:41646399
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析牙髓炎样本，旨在识别与可逆性牙髓炎相关的诊断性分子特征，以改进牙髓状态的分类和诊断 | 首次应用空间转录组学（Visium-CytAssist-V2）于牙髓组织，揭示了可逆与不可逆牙髓炎之间共享的分子特征，并强调了免疫-成纤维细胞相互作用在疾病进展中的关键作用 | 样本量较小（仅4个牙髓组织），可能限制结果的普遍性和统计效力 | 研究牙髓炎的转录组谱，识别炎症亚型，并改进传统的可逆/不可逆分类框架 | 人类牙髓组织，包括健康牙髓、可逆性牙髓炎和不可逆性牙髓炎样本 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 4个牙髓组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium-CytAssist-V2 |
| 3526 | 2026-02-15 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2026-Jan-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68257-4
PMID:41519914
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组，并揭示了转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子，并阐明其作为雄激素受体靶基因，在肾上腺性别二态性和脂质稳态中的多功能调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾上腺中的HHEX功能尚未验证；雄激素诱导脂噬的具体分子通路仍需进一步探索 | 探究维持肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞异质性和应激响应能力的分子机制 | Sf1-Cre; Rosa报告基因小鼠的肾上腺皮质类固醇生成谱系细胞 | 单细胞组学 | 肾上腺功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用遗传工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3527 | 2026-02-15 |
Genital herpes shedding episodes associate with altered spatial organization and activation of mucosal immune cells
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197491
PMID:41252205
|
研究论文 | 本研究探讨了HSV-2感染期间病毒脱落对宫颈阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 | 首次结合空间转录组学、流式细胞术和免疫荧光成像，系统揭示了活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重编程和激活状态变化 | 研究为横断面设计，无法确定观察到的免疫变化与病毒脱落之间的因果关系；样本量虽大但可能未涵盖所有临床亚群 | 探究HSV-2感染对宫颈阴道黏膜免疫的影响机制 | HSV-2血清阳性和阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 | 空间转录组学 | 生殖器疱疹 | 流式细胞术、免疫荧光成像、可溶性免疫因子分析、空间转录组学 | NA | 组织样本、血液样本、空间转录组数据、成像数据 | 232名参与者（包括HSV-2血清阳性和阴性个体） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3528 | 2026-02-15 |
Fecal microbiota transplantation promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in patients with recurrent Clostridioides difficile
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195678
PMID:41252206
|
研究论文 | 本研究通过分析复发性艰难梭菌感染患者在接受粪菌移植治疗前后的样本，揭示了FMT通过促进结肠上皮细胞增殖和2型免疫反应来发挥治疗作用的机制 | 首次结合空间转录组学和单细胞基因集分析，明确了FMT诱导的基因表达变化定位于结肠上皮，并揭示了IL-33和双调蛋白在介导增殖通路激活中的潜在作用 | 样本量较小（n=16），随访时间较短（2个月），且缺乏长期疗效和机制验证数据 | 探究粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染的分子和免疫学机制 | 复发性艰难梭菌感染患者（n=16）和健康对照的结肠活检组织、血浆、外周血单个核细胞及粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 感染性疾病（艰难梭菌感染） | 高通量测序、流式细胞术免疫分型、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、微生物组数据、免疫表型数据 | 16名rCDI患者及健康对照 | NA | 空间转录组学, 单细胞基因集分析 | NA | NA |
| 3529 | 2026-02-15 |
Spatial transcriptomics reveals immune-stromal crosstalk within the synovium of patients with juvenile idiopathic arthritis
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198074
PMID:41269758
|
研究论文 | 本研究利用亚细胞分辨率空间转录组学技术，解析了活动性幼年特发性关节炎患者滑膜组织中免疫细胞与基质细胞的空间组织与相互作用 | 开发了新的空间共定位分析流程，首次在JIA滑膜中揭示了NOTCH信号介导的内皮细胞-成纤维细胞相互作用、CXCL9/CXCR3信号轴调控的巨噬细胞-CD8+ T细胞互作，并鉴定了JIA特有的细胞状态 | 研究样本仅来自活动期患者，缺乏疾病不同阶段或治疗后的纵向比较数据 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的空间分子结构及细胞间相互作用网络 | 活动性幼年特发性关节炎患者的滑膜组织样本 | 空间转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 空间转录组测序 | 空间共定位分析流程 | 空间转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率空间转录组分析 |
| 3530 | 2026-02-15 |
Cellular immune endophenotypes separating early and late-onset myasthenia gravis
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199679
PMID:41307955
|
研究论文 | 本研究通过多模态技术（包括深度光谱流式细胞术和单细胞测序）区分了早发型和晚发型重症肌无力的细胞免疫表型，识别了三种主要淋巴细胞群体的差异 | 首次应用深度光谱流式细胞术和单细胞测序技术，揭示了早发型和晚发型重症肌无力在黏膜相关恒定T细胞、初始CD8+ T细胞和经典NK细胞频率上的显著差异，并实现了90%准确率的亚型预测 | 研究基于两个独立队列，但样本量可能有限，且未详细探讨免疫衰老机制与疾病进展的因果关系 | 区分早发型和晚发型重症肌无力的细胞免疫表型，以改进临床分类 | 重症肌无力患者的淋巴细胞群体 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 深度光谱流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 细胞表型数据, 测序数据 | 两个独立队列的患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3531 | 2026-02-15 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191990
PMID:41480746
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，构建了甲状腺癌进展的图谱，并识别了与预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次在混合WDTC/ATC组织病理学样本中，结合单细胞和空间转录组学技术，系统性地描绘了甲状腺癌的进化过程，并鉴定出POSTN+肌成纤维细胞癌症相关成纤维细胞（myCAFs）这一与侵袭性肿瘤细胞密切相关的预后亚型 | 样本量相对有限（81个单细胞样本和28个空间转录组肿瘤），且主要基于转录组数据，可能未涵盖其他分子层面的变化 | 理解甲状腺癌在儿童和成人中的进化机制，并识别与疾病进展和预后相关的关键细胞亚群 | 甲状腺癌样本，包括分化良好的甲状腺癌（WDTC）、间变性甲状腺癌（ATC）、罕见的混合WDTC/ATC肿瘤以及儿童弥漫性硬化性甲状腺癌 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，bulk RNA测序 | NA | 转录组数据，空间数据 | 423,733个细胞来自81个样本，28个肿瘤进行空间转录组分析，5个大型bulk RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3532 | 2026-02-15 |
VISTA uncovers missing gene expression and spatial-induced information for spatial transcriptomic data analysis
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09479-6
PMID:41507434
|
研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的模型，通过整合单细胞RNA测序和亚细胞空间转录组学数据，预测空间转录组数据中未测量的基因表达 | VISTA结合了变分推断、几何深度学习和不确定性量化，首次实现了在空间转录组数据中准确预测未测量基因表达，并支持多种下游分析 | 未明确提及模型在处理高度异质性组织或大规模数据集时的具体限制 | 克服空间转录组技术基因覆盖有限的缺陷，提升空间转录组数据的解释性和应用价值 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3533 | 2026-02-15 |
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.101475
PMID:41317903
|
研究论文 | 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法，以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 | 通过伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据，揭示转录和翻译响应的时间差异，如即时转录组响应和延迟蛋白质组表达 | NA | 整合单细胞转录组和蛋白质组数据，构建全面的转录-翻译图谱，以理解缺氧应激下的细胞表型 | 单细胞样本（在缺氧条件下采集的纵向样本） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学（质谱分析） | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 3534 | 2026-02-15 |
TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, and CCT5: Predictive of Survival and Immunotherapy Resistance in Hepatocellular Carcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/1465989
PMID:41674779
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组分析，构建了一个基于衰老相关基因的预后模型，用于预测肝细胞癌患者的生存和免疫治疗反应 | 整合单细胞RNA测序和转录组数据，识别并验证了一个由八个基因（TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, CCT5）组成的衰老相关基因特征，该特征可作为预测HCC预后和免疫治疗耐药性的稳健工具 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证主要在细胞系中进行，缺乏体内模型或大规模前瞻性临床队列的验证 | 识别肝细胞癌中与衰老相关的基因特征，构建预后模型以预测患者生存和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞，特别是自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，qRT-PCR，CCK-8，伤口愈合实验，Transwell实验 | LASSO Cox回归风险模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的样本，共识别了80,997个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3535 | 2026-02-15 |
Gut Microbiota-Derived Metabolites Regulate CASP3 and Neuroimmune Pathways in Multiple Sclerosis: An Integrative Multiomics Study
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3572399
PMID:41674923
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、机器学习和单细胞转录组分析，揭示了肠道菌群代谢物通过调节CASP3及神经免疫通路在多发性硬化症中的作用 | 首次将网络药理学、机器学习（SHAP方法）和单细胞转录组分析结合，识别出CASP3作为肠道菌群代谢物的核心靶点，并通过孟德尔随机化验证因果关系 | 研究结果需要进一步的实验验证来确认机制和转化潜力 | 探究肠道菌群代谢物在多发性硬化症发病机制中的作用，识别潜在治疗靶点 | 多发性硬化症相关的差异表达基因、肠道菌群代谢物及其靶点 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 网络药理学、机器学习、单细胞转录组分析、孟德尔随机化、分子对接 | 机器学习模型（未指定具体类型，但使用了SHAP方法） | 转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 3536 | 2026-02-15 |
Causal Association Between Plasma Proteins and Pericarditis: A Mendelian Randomization Study With Therapeutic Target Identification
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4659271
PMID:41674924
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了血浆蛋白与心包炎之间的因果关系，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次利用大规模血浆蛋白组GWAS数据，结合孟德尔随机化方法系统评估了血浆蛋白与心包炎的因果关联，并整合了单细胞RNA测序分析和分子对接技术来识别潜在治疗靶点和化合物 | 研究人群仅限于欧洲血统个体，可能限制了结果在其他人群中的普适性；孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量，可能存在残留混杂或水平多效性 | 评估血浆蛋白与心包炎之间的因果关系，并探索潜在的治疗靶点 | 35,559名欧洲血统个体的遗传和血浆蛋白数据，以及心包炎的遗传关联数据 | 生物信息学与遗传流行病学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接 | 逆方差加权中位数法、方差加权法、MR-Egger回归 | 遗传变异数据、血浆蛋白定量数据、单细胞基因表达数据 | 35,559名欧洲血统个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3537 | 2026-02-15 |
Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701978
PMID:41676158
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个可解释的机器学习模型，用于识别乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌的预后和治疗生物标志物 | 首次结合多种机器学习算法构建了与免疫细胞浸润、趋化因子表达和肿瘤突变负荷相关的乳酸化相关特征，并实验验证了枢纽基因SUSD3的作用 | NA | 探究乳酸化在乳腺癌发生发展中的作用，并开发用于预测恶性进展和免疫逃逸的风险模型 | 乳腺癌 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、空间转录组学 | 多种机器学习算法组合 | 基因组数据、转录组数据 | 来自公共数据库（TISCH、TCGA、GEO）的大量数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3538 | 2026-02-15 |
Integrated single-cell analysis with experimental validation reveals ANXA2 as a therapeutic target for ferroptosis in inflammatory bowel disease
2026, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/IQQX1658
PMID:41676267
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析与实验验证，揭示了ANXA2作为炎症性肠病中铁死亡的关键治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与实验验证，识别出ANXA2作为IBD中铁死亡的核心靶点，并验证其在体外和体内模型中的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证有限，且铁死亡机制在IBD中的具体通路仍需进一步探索 | 识别与炎症性肠病中铁死亡相关的潜在治疗靶点 | 炎症性肠病（IBD）患者和DSS诱导的IBD小鼠模型中的结肠组织细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR，Western blotting，流式细胞术，ELISA，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据，蛋白质表达数据 | 28,974个细胞（来自GSE134809数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3539 | 2026-02-15 |
Utilisation of spatial methodologies for the investigation of the tumour microenvironment
2026, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.10.012
PMID:41688158
|
综述 | 本章节为研究人员提供了关于空间转录组学技术的实用指南，重点介绍了三种主流平台及其在肿瘤微环境研究中的应用 | 系统比较了Merscope、CosMx和Xenium三种前沿空间转录组学平台的原理与差异，并提供了从样本制备到数据分析的详细实验方案与实用技巧 | 作为技术指南章节，未报告新的实验数据或临床验证结果，主要基于现有技术和作者经验进行总结 | 为研究人员提供实施空间转录组学技术的实用指导，以促进肿瘤微环境表征和精准肿瘤学研究 | 肿瘤微环境中的空间组织特征，特别是巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞等免疫细胞的分布与相互作用 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、多重成像 | NA | 空间转录组数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Merscope, CosMx, Xenium | 三种主流空间转录组学分析平台 |
| 3540 | 2026-02-15 |
Bronchial epithelial transcriptome reveals dysregulated interferon and inflammatory responses to rhinovirus in exacerbation-prone pediatric asthma
2025-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197711
PMID:41217821
|
研究论文 | 本研究通过器官型支气管上皮细胞培养，结合bulk和单细胞转录组学及靶向蛋白分析，揭示了易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染的过度干扰素和炎症反应机制 | 首次在易加重型儿童哮喘患者中，通过单细胞转录组学揭示了细胞类型特异性（特别是非纤毛细胞）对鼻病毒感染的过度反应，并发现基线干扰素刺激基因表达降低是易感性的可调节因果决定因素 | 研究基于体外器官型培养模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本量可能有限；未涉及长期临床结局验证 | 探究易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染易感性的宿主因素和分子机制 | 来自特征明确的哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮细胞培养物 | 数字病理学 | 哮喘 | bulk转录组学, 单细胞转录组学, 靶向蛋白分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮细胞培养物（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |