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当前共找到 39972 篇文献，本页显示第 3501 - 3520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3501 | 2026-04-23 |
Exploring the common ferroptosis-related genes and molecular mechanisms in periodontitis and systemic sclerosis via integrated bioinformatics and experimental analysis
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1803091
PMID:42004467
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验分析，探索牙周炎和系统性硬化症之间共同的铁死亡相关基因和分子机制 | 首次使用双向孟德尔随机化分析评估牙周炎和系统性硬化症的潜在因果关系，并结合多种机器学习算法识别共享枢纽基因，同时进行体外实验验证 | 研究结果主要基于生物信息学分析和初步实验验证，需要进一步的机制和临床研究来确认 | 揭示牙周炎和系统性硬化症之间共同的铁死亡相关分子机制 | 牙周炎和系统性硬化症患者的数据集及铁死亡相关基因 | 生物信息学 | 牙周炎和系统性硬化症 | 双向孟德尔随机化分析、差异表达分析、WGCNA、机器学习算法（LASSO、SVM-RFE、随机森林）、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、调控网络分析、药物预测与分子对接、体外实验 | LASSO、SVM-RFE、随机森林 | 基因表达数据 | 从GEO数据库检索的牙周炎和系统性硬化症基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3502 | 2026-04-23 |
Machine learning approaches for biomarker discovery using single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1767362
PMID:42004563
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综述 | 本文全面概述了机器学习方法在单细胞RNA测序数据中用于生物标志物发现的研究现状 | 系统梳理了机器学习在单细胞转录组学生物标志物发现中的应用方法多样性，包括发现层级、监督学习算法选择、特征选择方法、分类指标和下游生物分析等多个维度 | 作为综述文章，未提出新的算法或进行实证数据验证，主要侧重于现有方法的归纳总结 | 为研究人员提供关于机器学习在单细胞RNA测序生物标志物发现领域的完整和详细理解 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3503 | 2026-04-23 |
A SUMOylation/immune-related gene signature predicts the prognosis and immunotherapy efficacy of patients with triple-negative breast cancer
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21139
PMID:42004699
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研究论文 | 本研究构建了一个结合SUMOylation和免疫相关基因的预后模型，用于预测三阴性乳腺癌患者的生存和免疫治疗效果 | 首次将SUMOylation与免疫相关基因结合，利用机器学习方法构建预后模型，并验证了其预测免疫治疗疗效的能力 | 研究依赖于公共数据库数据，样本量有限，且模型需进一步外部验证 | 开发一个预测三阴性乳腺癌患者预后和免疫治疗疗效的生存预测模型 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞测序, qRT-PCR, IHC | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | RNA-seq数据, 临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌患者样本 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 3504 | 2026-04-23 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Potential Role of GZMK+ CD8+ T Cells in Cell Senescence of Triple-Negative Breast Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/4215646
PMID:42004980
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序揭示了GZMK+ CD8+ T细胞在三阴性乳腺癌细胞衰老中的潜在作用 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析，首次发现GZMK基因与三阴性乳腺癌风险的因果关系及其在免疫细胞互作网络中的关键角色 | 研究主要基于公共数据库的测序数据，功能实验仅在细胞系中进行，缺乏体内验证 | 阐明关键基因在细胞衰老和三阴性乳腺癌进展中的作用机制 | 三阴性乳腺癌样本中的免疫细胞（特别是GZMK+ CD8+ T细胞）和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 批量测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | 来自基因表达综合数据库的三阴性乳腺癌和衰老数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3505 | 2026-04-23 |
SPP1 as a Critical Regulator of Cardiac Cell Reprogramming Following Myocardial Infarction Through Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/3656018
PMID:42006146
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，并利用多种机器学习算法，识别了心肌梗死后心脏细胞重编程的关键调控基因SPP1，并初步验证了其促进细胞存活和释放心脏保护因子的功能 | 首次结合bulk和单细胞转录组数据，并系统性地应用26种不同的机器学习算法来识别心肌修复的关键调控基因，成功将SPP1鉴定为具有高预测能力（AUC = 0.896）的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 功能验证实验仅在H9c2心肌母细胞模型中进行，需要在更具生理相关性的系统（如动物模型或人源细胞）中进行验证，且研究结果有待在独立的临床队列中得到证实 | 阐明心肌梗死后心脏细胞重编程的分子机制，以寻找新的预后生物标志物和治疗靶点，促进心脏修复干预策略的发展 | 急性心肌梗死（AMI）患者的转录组数据，以及H9c2心肌母细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法（共26种） | 转录组数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量，但涉及AMI患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3506 | 2026-04-23 |
Multiomics Biomarkers for Differential Diagnosis of Pleural Effusion: Integration of Proteomic Markers and Single-Cell Transcriptomics
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5946608
PMID:42006152
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学生物标志物、单细胞转录组学和基因组突变分析，开发了一种用于胸腔积液鉴别诊断的多组学方法 | 首次将蛋白质组学生物标志物、单细胞转录组学免疫图谱和基因组突变分析整合到一个诊断框架中，揭示了疾病特异性免疫机制和突变驱动的治疗机会 | 研究为前瞻性队列但未进行外部验证，单细胞分析可能无法完全捕获所有细胞亚群 | 提高胸腔积液的鉴别诊断准确性并揭示其病理机制 | 564名接受内科胸腔镜检查的胸腔积液患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，靶向二代测序，蛋白质生物标志物检测 | NA | 单细胞转录组数据，基因组突变数据，蛋白质生物标志物数据 | 564例患者（炎症性95例，结核性299例，恶性170例） | NA | 单细胞RNA-seq，靶向NGS | NA | NA |
| 3507 | 2026-04-23 |
Metabolic reprogramming-associated genomic instability drives colorectal cancer progression via the UBXN1-NF-κB axis
2026, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/IWGB8367
PMID:42007143
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据集，系统探讨了结直肠癌中代谢重编程与拷贝数变异之间的关联，并识别了UBXN1作为潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上系统性地将代谢特征与基因组不稳定性联系起来，并利用机器学习算法验证了代谢特征对恶性状态的预测能力，识别出UBXN1作为关键调控节点 | 研究依赖于公开可用的单细胞数据集，可能受到数据批次效应和样本来源的限制，且功能验证主要在细胞层面进行，缺乏体内实验的深入验证 | 探究结直肠癌中代谢重编程与拷贝数变异之间的关联，并识别潜在的调控机制和治疗靶点 | 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据，重点关注上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 共识非负矩阵分解，机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 整合了四个公开可用的单细胞RNA测序数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3508 | 2026-04-23 |
Interrogation of glioma immune microenvironment identifies a non-canonical role for microglial Galectin-9 in tumor cell adhesion and phagocytosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1733688
PMID:41953006
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了胶质瘤相关小胶质细胞中Galectin-9在肿瘤细胞粘附和吞噬中的非经典作用 | 首次发现Galectin-9在小胶质细胞中调控胶质瘤细胞粘附和吞噬的功能，为胶质母细胞瘤免疫治疗提供了新靶点 | 研究样本量较小（18例患者），且主要基于体外共培养系统，体内验证不足 | 识别抗胶质瘤的髓系细胞效应因子，并探究其在肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质瘤患者肿瘤组织中的CD45阳性白细胞，包括小胶质细胞、树突状细胞和淋巴细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组学、光谱流式细胞术、免疫组织化学、Western blotting、共聚焦成像 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、图像数据 | 18例异柠檬酸脱氢酶（IDH）分层的胶质瘤患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3509 | 2026-04-23 |
cGAS inhibitor IMSB301 modifies interferon signalling in peripheral mononuclear cells of SAMHD1 genetic interferonopathy in vitro
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70090
PMID:42016148
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序评估了cGAS抑制剂IMSB301对SAMHD1基因突变患者外周血单个核细胞中干扰素信号通路的调节作用 | 首次在体外模型中验证了新型临床阶段cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病SAMHD1突变患者免疫细胞的特定干扰素信号通路抑制作用 | 研究仅基于单个患者样本，样本量有限，且为体外实验，未进行体内验证 | 评估cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病（Aicardi-Goutières综合征）患者免疫细胞干扰素信号通路的调节潜力 | SAMHD1双等位基因致病突变患者的PBMCs与年龄性别匹配的健康对照 | 单细胞组学 | 遗传性干扰素病（Aicardi-Goutières综合征） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SAMHD1突变患者和1例健康对照的PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3510 | 2026-04-23 |
Integration of single-cell and bulk transcriptomics reveals the association of manganese metabolism-related genes with prognosis and immune infiltration in lung adenocarcinoma
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70085
PMID:42016144
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，揭示了锰代谢相关基因与肺腺癌预后及免疫浸润的关联，并构建了一个基于9个基因的预后特征模型 | 首次整合单细胞RNA测序和TCGA数据系统研究锰代谢相关基因在肺腺癌中的预后价值，并验证了JQ1与PTMA抑制的协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和治疗指导价值 | 探究锰代谢相关基因在肺腺癌预后评估和免疫治疗中的潜在价值 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | Cox回归模型，LASSO回归 | 转录组数据 | TCGA数据库中的肺腺癌样本及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 3511 | 2026-04-23 |
Multi-Omics Analysis Reveals m7G Methylation-Related Genes May Be Involved in TGF-β Signaling-Mediated Anti-PD-L1 Response in Bladder Cancer
2026, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S583577
PMID:42016541
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，揭示了m7G甲基化相关基因可能通过调控TGF-β信号通路参与膀胱癌抗PD-L1免疫治疗的耐药过程 | 首次整合bulk、单细胞和空间转录组数据，结合机器学习，系统研究了m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的作用，并鉴定出关键基因NUDT10 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证仅限于体外细胞模型，缺乏体内实验和更大规模的临床队列验证 | 探究m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的潜在作用机制 | 膀胱癌 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学分析（转录组学、甲基化分析）、机器学习、siRNA转染、qRT-PCR、Western blot、免疫组化、CCK-8、伤口愈合实验 | 机器学习模型 | 转录组数据（bulk、单细胞、空间）、甲基化数据 | 来自多个公共数据库（TCGA、GEO、IMvigor210）的膀胱癌队列数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3512 | 2026-04-23 |
Long-Read Sequencing Reveals RNA Splicing Complexity in Human Diseases
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0052
PMID:42017050
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综述 | 本文综述了长读长RNA测序技术在揭示人类疾病中RNA剪接复杂性方面的应用与优势 | 强调了长读长RNA测序在无需转录本组装的情况下，精确解析外显子-内含子结构、可变剪接模式及非经典RNA加工事件的能力，并探讨了其与单细胞和空间转录组学的整合趋势 | 作为一篇综述文章，未涉及具体实验数据或样本量的局限性分析 | 概述长读长RNA测序的工作原理、技术创新及其在疾病研究中的应用，以推动疾病诊断和精准医学 | 人类疾病相关的转录组，特别是RNA剪接复杂性 | 自然语言处理 | NA | 长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 长读长RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3513 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083
PMID:38934409
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的异质性及相互作用 | 首次在斑马鱼视网膜再生中系统解析了Müller胶质细胞的两种静止亚型及其向激活状态或杆状前体细胞的转化，并鉴定了小胶质细胞的三种亚型及其动态变化，同时揭示了炎症通过Jak1-Stat3信号通路调控胶质细胞重编程的机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果向哺乳动物视网膜再生的直接转化仍需进一步验证 | 探究炎症在视网膜再生过程中如何调控Müller胶质细胞重编程 | 斑马鱼视网膜中的免疫细胞（特别是小胶质细胞）和Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | 视网膜损伤与再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及未损伤和损伤后的斑马鱼视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3514 | 2026-04-23 |
Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063
PMID:39101644
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞在动态发育过程中的不同演化路径和功能差异 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统解析了脊髓损伤后小胶质细胞与巨噬细胞的差异化演化轨迹，并识别了巨噬细胞中与促炎效应（整合素β2）和神经保护效应（制瘤素M通路）相关的关键分子机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床样本中得到验证；空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析细胞间相互作用的微观空间结构 | 阐明脊髓损伤后继发性损伤过程中小胶质细胞与巨噬细胞的动态变化及其在炎症反应中的不同作用 | 脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3515 | 2025-12-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a peripheral monocyte subpopulation and its interaction with atrial macrophages via the CCL3-CCR1 axis during atrial remodeling
2025-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3023-9
PMID:40833709
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3516 | 2026-04-23 |
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418351122
PMID:41118206
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISEE的新算法，用于建模单细胞数据集中的扰动响应，并应用于斑马鱼胚胎中ERK信号通路的研究 | 开发了DAISEE算法，能更有效地在复杂实验设计中分离单细胞扰动响应与混杂变异，并揭示了过激活信号通路在发育胚胎中诱导新基因表达状态的能力 | NA | 研究发育信号通路扰动对单细胞转录状态的影响 | 斑马鱼胚胎中的细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解框架 | 单细胞转录组数据 | 5小时龄斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3517 | 2026-04-23 |
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500161122
PMID:41118222
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了感觉神经元介导的CGRP信号在肉瘤进展中的驱动作用 | 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨癌中除疼痛感知外的调控功能，并利用化学遗传学方法验证了TrkA抑制对肉瘤生长和转移的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限，且干预策略的长期效果和临床转化需进一步评估 | 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控机制及潜在治疗靶点 | 小鼠骨肉瘤模型和人类骨肉瘤骨样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、多模态多组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3518 | 2026-04-23 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
|
研究论文 | 本研究揭示了急性髓系白血病（AML）微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能，导致免疫抑制和感染易感性增加 | 首次在非照射的宿主中使用中性粒细胞报告小鼠模型，结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选，系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路重塑中性粒细胞的表观遗传和功能 | 研究主要基于小鼠模型，虽然患者样本验证了类似生物学现象，但人类AML的异质性可能带来更复杂的调控机制 | 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响及其分子机制 | AML暴露的中性粒细胞（来自小鼠模型和AML患者） | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学、染色质重塑分析、基序发现、体外细胞因子筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据 | 临床前AML小鼠模型及AML患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3519 | 2026-04-23 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671333
PMID:40894744
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研究论文 | 本研究系统性地评估了整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）数据以改善批量RNA测序（bulk RNA-seq）反卷积性能的策略 | 首次系统性地比较了多种整合scRNA-seq和snRNA-seq数据的方法，并提出了针对不同场景的明确指导原则，包括基因过滤和条件变分自编码器（scVI）的应用 | 研究仅在四种组织类型中进行了验证，对于更广泛或更特殊的组织类型，方法的普适性有待进一步验证 | 提高批量RNA测序反卷积的准确性，特别是在缺乏完整scRNA-seq参考数据的情况下 | 批量RNA测序数据的细胞类型组成反卷积 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 条件变分自编码器（scVI），非条件变分自编码器，主成分分析 | RNA测序数据 | 四种不同的组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 3520 | 2026-04-23 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞的功能及其通过非经典Wnt信号调控增殖状态的动态过程 | 首次在Lgr5表达干细胞出现之前鉴定出Bmi1细胞作为功能性干细胞，并发现其通过非经典Wnt信号调控增殖状态向慢周期状态的转变 | 研究主要基于小鼠模型，人类肠道发育中的类似机制仍需验证 | 探究肠道上皮发育过程中干细胞亚群的动态调控机制 | 小鼠肠道发育早期的Bmi1表达干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |