单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3501	2025-04-27	Melatonin treatment increases skin microbiota-derived propionic acid to alleviate atopic dermatitis 2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.019 PMID:39579877	research paper	研究揭示了褪黑激素通过调节皮肤微生物群及其代谢产物丙酸来缓解特应性皮炎（AD）的机制	首次发现褪黑激素通过皮肤微生物群/丙酸/GPR43/FABP5轴缓解AD，揭示了褪黑激素作为皮肤微生物群调节剂的新角色	研究主要基于小鼠模型和HaCaT细胞，人类临床验证尚待进行	探究褪黑激素治疗通过改变皮肤微生物群组成缓解AD的机制	特应性皮炎（AD）小鼠模型和HaCaT细胞	皮肤微生物组学	特应性皮炎	16S-rRNA测序、皮肤微生物移植、短链脂肪酸定量检测、转录组和单细胞测序分析、定量RT-PCR、Western blotting、Cell Counting Kit-8检测	小鼠AD模型	微生物组数据、转录组数据、单细胞测序数据、蛋白质表达数据	AD小鼠模型和HaCaT细胞系
3502	2025-04-27	Aged hippocampal single-cell atlas screening unveils disrupted neuroglial system in postoperative cognitive impairment 2025-Mar, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14406 PMID:39540334	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了老年小鼠海马神经胶质系统在术后认知障碍中的失调机制及其潜在治疗靶点	首次构建老年海马单细胞图谱，揭示了术后认知障碍中神经胶质系统紊乱的多细胞机制及右美托咪定的治疗潜力	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	阐明术后认知障碍中神经胶质相互作用的调控机制及潜在治疗靶点	老年小鼠海马神经胶质系统（神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞）	神经科学	术后认知障碍	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	老年小鼠海马组织样本（具体数量未说明）
3503	2025-04-27	Investigating biological nitrogen fixation via single-cell transcriptomics 2025-Feb-25, Journal of experimental botany IF:5.6Q1 DOI:10.1093/jxb/erae454 PMID:39563004	综述	本文综述了单细胞转录组学在研究根瘤共生分子机制中的应用及关键发现	利用单细胞转录组学揭示了根瘤共生过程中的保守转录程序和新基因，为工程化非豆科作物提供了新见解	NA	探索可持续替代氮肥的途径，特别是通过工程化根瘤共生过程	豆科植物（如Medicago truncatula、Lotus japonicus和Glycine max）的根瘤共生过程	植物分子生物学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
3504	2025-04-27	Chronic inflammation deters natural killer cell fitness and cytotoxicity in myeloid leukemia 2025-Feb-25, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024014592 PMID:39571169	research paper	该研究探讨了慢性炎症如何影响自然杀伤细胞（NK细胞）在髓系白血病中的适应性和细胞毒性	揭示了TNFα诱导的炎症信号在抑制NK细胞功能中的关键作用，并提出了通过靶向Cish或TNFα来恢复NK细胞功能的潜在治疗策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本数量有限，需要进一步验证	研究髓系白血病微环境对NK细胞功能的影响及其机制	NK细胞在髓系白血病中的功能变化	免疫学	慢性髓系白血病（CML）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	嵌合BCR::ABL1+ CML小鼠模型	基因表达数据	小鼠模型和来自健康供体及未治疗CML患者的血浆样本
3505	2025-04-27	Mapping of the T-cell Landscape of Biliary Tract Cancer Unravels Anatomic Subtype-Specific Heterogeneity 2025-Feb-17, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1173 PMID:39570809	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，揭示了胆道癌不同解剖亚型中T细胞的特异性分布及其异质性	首次在单细胞和空间水平上详细描绘了胆道癌不同亚型的T细胞多样性，并发现了与免疫治疗相关的特异性免疫特征	样本量相对较小（16名患者的36个样本），可能影响结果的普遍性	探索胆道癌不同亚型中T细胞的特异性分布，以发现潜在的精准免疫治疗策略	胆道癌患者的CD3+ T细胞	数字病理学	胆道癌	单细胞RNA测序, T细胞受体测序	NA	RNA测序数据, 病理切片图像	16名患者的36个样本和355张病理切片
3506	2025-04-27	A platform for multimodal in vivo pooled genetic screens reveals regulators of liver function 2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.11.18.624217 PMID:39605605	研究论文	开发了一种结合成像和测序的多模态方法，用于构建大规模基因型-表型图谱，以研究小鼠肝脏中数百种基因扰动的影响	结合成像和单细胞测序技术，构建多模态基因型-表型图谱，揭示肝脏功能的遗传调控机制	研究仅针对小鼠肝脏，结果可能不直接适用于其他器官或人类	解析复杂细胞和组织表型的遗传调控基础	小鼠肝脏中的数百种基因扰动	机器学习	NA	成像和单细胞测序	NA	图像和基因表达数据	小鼠肝脏中的数百种基因扰动
3507	2025-04-27	Epitope Tagging with Genome Editing in Mice Reveals That the Proton Channel OTOP1 Is Apically Localized and Not Restricted to Type III "Sour" Taste Receptor Cells 2025-Feb-05, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience DOI:10.1523/JNEUROSCI.1560-24.2024 PMID:39592233	research paper	通过在小鼠中进行基因组编辑和表位标记，揭示了质子通道OTOP1的顶端定位及其在味觉受体细胞中的广泛分布	首次通过基因组编辑和表位标记技术揭示了OTOP1在味觉受体细胞中的顶端定位，并发现其不仅限于III型味觉受体细胞	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚待验证	探究质子通道OTOP1在味觉受体细胞中的定位和分布	小鼠的味觉受体细胞	分子生物学	NA	基因组编辑、表位标记、高分辨率成像、scRNA-seq	NA	图像数据、基因表达数据	雄性和雌性HA-OTOP1小鼠
3508	2025-04-27	Characteristics of a CCL21 Gene-Modified Dendritic Cell Vaccine Utilized for a Clinical Trial in Non-Small Cell Lung Cancer 2025-Feb-04, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1 DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0435 PMID:39559833	research paper	本文报道了一种CCL21基因修饰的树突状细胞疫苗在非小细胞肺癌临床试验中的特性研究	首次全面表征了CCL21-DC疫苗，并探究了制造过程中多种因素的影响	研究样本量较小，仅为I期临床试验数据	评估CCL21基因修饰的树突状细胞疫苗在非小细胞肺癌治疗中的潜力	非小细胞肺癌患者	肿瘤免疫治疗	非小细胞肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	I期临床试验样本（具体数量未提及）
3509	2025-04-27	Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia 2025-Feb, Leukemia & lymphoma IF:2.2Q3 DOI:10.1080/10428194.2024.2422833 PMID:39496597	综述	本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病（AML）研究中的应用及其对理解疾病异质性的贡献	探讨了单细胞测序技术如何揭示AML的遗传和功能异质性，特别是在白血病干细胞、克隆演变和可测量残留病（MRD）监测方面的应用	未提及具体的技术实施难点或数据解读的局限性	提高对急性髓系白血病（AML）异质性的理解，并探讨单细胞测序技术在临床实践中的应用潜力	急性髓系白血病（AML）及其相关的白血病干细胞、克隆演变和可测量残留病（MRD）	数字病理	白血病	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
3510	2025-04-27	CD137 Protein Expression Pattern Determines the Functional Role of Galectin-9 in Colorectal Cancer 2025-Feb, Molecular carcinogenesis IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mc.23838 PMID:39503215	研究论文	本研究通过分析结直肠癌单细胞测序数据，开发了一种新的临床预后工具，并探索了LGALS9基因作为潜在治疗靶点的作用	基于13个关键基因构建了结直肠癌预后评分系统（SDRS），并发现LGALS9在结直肠癌中的作用可能依赖于CD137的表达	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	开发结直肠癌的预后工具并探索LGALS9基因的治疗潜力	结直肠癌患者和小鼠模型	数字病理学	结直肠癌	单细胞测序技术	Scissor算法	单细胞测序数据	NA
3511	2025-04-27	COMPREHENSIVE CHARACTERIZATION OF CYTOKINES IN PATIENTS UNDER EXTRACORPOREAL MEMBRANE OXYGENATION: EVIDENCE FROM INTEGRATED BULK AND SINGLE-CELL RNA SEQUENCING DATA USING MULTIPLE MACHINE LEARNING APPROACHES 2025-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.) DOI:10.1097/SHK.0000000000002425 PMID:39503329	研究论文	通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，结合多种机器学习方法，全面表征了接受体外膜氧合（ECMO）治疗患者中细胞因子的表达模式及其潜在生物学过程	首次整合批量与单细胞RNA测序数据，应用多种机器学习算法构建了细胞因子相关基因（CRG）分类器，并揭示了关键细胞因子与免疫细胞及分子通路的关联机制	研究依赖于公共数据库和医院队列数据，可能存在样本选择偏差，且未进行实验验证	探究ECMO治疗期间细胞因子的表达特征及其对患者的潜在影响	接受ECMO治疗的患者	机器学习	心血管疾病	批量RNA测序, 单细胞RNA测序	SVM, RF, Lasso, XGBoost, ANN	RNA测序数据	三个ECMO支持数据集（两个批量RNA测序和一个单细胞RNA测序）
3512	2025-04-27	Inorganic pyrophosphatase 1: a key player in immune and metabolic reprogramming in ankylosing spondylitis 2025-Feb, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-024-00308-0 PMID:39511317	研究论文	本文通过孟德尔随机化和单细胞测序技术，探讨了无机焦磷酸酶1（PPA1）在强直性脊柱炎（AS）免疫和代谢重编程中的关键作用	首次通过孟德尔随机化和单细胞测序技术，揭示了PPA1在AS中通过影响CD8+记忆T细胞和阿魏酸硫酸盐代谢参与细胞免疫的新机制	样本量较小（仅3例AS患者和3例对照），需要更大规模的研究验证	探索强直性脊柱炎的免疫和代谢重编程机制	强直性脊柱炎患者的免疫细胞和代谢物	免疫代谢	强直性脊柱炎	孟德尔随机化（MR）、10×单细胞测序、表达数量性状位点（eQTL）分析	NA	单细胞测序数据、代谢组数据	3例AS患者和3例对照的椎体骨髓血样本
3513	2025-04-27	Mouse Bladder Smooth Muscle Lack the Functional Active NMDAR 2025-Feb, Neurourology and urodynamics IF:1.8Q3 DOI:10.1002/nau.25631 PMID:39552551	研究论文	本研究探讨了N-甲基-D-天冬氨酸受体（NMDARs）在膀胱平滑肌（BSM）功能中的作用及其作为治疗膀胱过度活动症潜在靶点的可能性	首次通过多方法验证了膀胱平滑肌中缺乏功能性NMDARs，挑战了现有关于NMDAR抑制治疗膀胱过度活动症的作用机制	研究主要基于小鼠模型，人类膀胱平滑肌的发现需要进一步验证	探究NMDARs在膀胱平滑肌功能中的作用及其治疗潜力	小鼠和人类的膀胱平滑肌	NA	膀胱过度活动症	肌动描记术、钙成像、单细胞RNA测序、免疫荧光染色	NA	生理数据、基因表达数据、影像数据	未明确说明样本数量，涉及小鼠和人类膀胱组织
3514	2025-04-27	PD-L1 promotes tumor metastasis by regulating the infiltration of FGFBP2(+)Tm cells in colorectal cancer 2025-Feb, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-024-03223-w PMID:39558101	研究论文	本研究探讨了PD-L1通过调节FGFBP2(+)Tm细胞的浸润促进结直肠癌肿瘤转移的机制	首次揭示了PD-L1通过减少CXCL9和CXCL10的分泌抑制记忆T细胞浸润，并发现FGFBP2(+)Tm细胞在肿瘤转移中的作用	研究主要基于小鼠模型和临床样本，人类样本的验证仍需进一步扩大	探究PD-L1在结直肠癌转移中的作用机制	结直肠癌患者和小鼠模型	肿瘤免疫学	结直肠癌	单细胞测序、小鼠转移模型	小鼠转移模型	临床样本数据、实验数据	包括外周血、淋巴结、结肠息肉、原发肿瘤和肝转移样本
3515	2025-04-27	E2F1 Promotes the Occurrence of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma and Serves as a Prognostic Biomarker 2025-Feb, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-024-05097-w PMID:39565537	research paper	本研究探讨了E2F转录因子1（E2F1）在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的生物学功能及预后价值	通过结合转录组和单细胞测序数据，构建了基于E2F1表达水平的风险模型，并探索了高表达细胞群与其他细胞群的相互作用通路	研究主要依赖于公共数据库数据，缺乏独立验证队列	探索E2F1在HNSCC中的生物学功能及其作为预后生物标志物的潜力	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者	生物信息学	头颈部鳞状细胞癌	转录组测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Lasso-Cox回归模型，nomogram模型	基因表达数据，单细胞数据	TCGA和GEO数据库中的HNSCC患者样本
3516	2025-04-27	The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis 2025-Feb, Kidney international IF:14.8Q1 DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021 PMID:39566842	研究论文	本研究探讨了内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的关键作用	发现STING是肾小管细胞内质网应激的重要上游激活因子，并揭示了STING与PERK的物理相互作用	研究主要基于小鼠模型，人类数据有限	阐明内质网应激在肾脏疾病中的激活机制和作用	慢性肾脏病患者和小鼠模型的肾脏组织	肾脏病学	肾脏疾病	转录组学分析	小鼠模型	转录组数据	慢性肾脏病患者样本和多种小鼠模型（顺铂、单侧输尿管梗阻、叶酸和TFAM敲除小鼠）
3517	2025-04-27	Integrated analysis and systematic characterization of the regulatory network for human germline development 2025-Feb, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.005 PMID:39571792	研究论文	通过整合多组学数据，研究人类原始生殖细胞（PGCs）发育的调控网络	构建了人类PGC数据库（hPGCdb），鉴定了调控生殖细胞命运的关键转录因子和调控网络，并验证了部分关键因子在生殖细胞发育中的重要作用	由于人类PGC发育过程的复杂性，部分调控机制仍未被完全揭示	揭示人类原始生殖细胞发育的调控机制	人类原始生殖细胞（PGCs）	生物信息学	NA	RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPRi敲低	NA	多组学数据	581个RNA-seq样本、54个ATAC-seq样本、45个ChIP-seq样本和69个单细胞RNA-seq样本
3518	2025-04-27	TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease 2025-Feb, Kidney international IF:14.8Q1 DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026 PMID:39571905	研究论文	该研究揭示了TRAIL通过死亡受体5（DR5）诱导足细胞PANoptosis（凋亡、焦亡和坏死性凋亡）在糖尿病肾病（DKD）中的作用机制	首次发现TRAIL/DR5信号通路在DKD足细胞PANoptosis中的关键自分泌作用，并验证了DR5抑制剂在缓解DKD中的潜在治疗价值	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床样本数量有限（仅3例正常和3例DKD样本）	探究TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞损伤中的作用机制	糖尿病肾病患者的足细胞、培养的人足细胞、高脂饮食和链脲佐菌素诱导的肥胖糖尿病小鼠	肾脏病学	糖尿病肾病	scRNA-seq（单细胞RNA测序）、siRNA沉默、重组蛋白处理、基因过表达	动物模型（小鼠）和细胞模型	基因表达数据、病理学数据	3例正常人肾脏样本和3例DKD患者肾脏样本（人类）；未明确说明小鼠数量
3519	2025-04-27	A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis 2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202406971 PMID:39574316	研究论文	本研究通过蛋白质组学和单细胞转录组学的整合分析，揭示了神经梅毒中Toll样/NF-κB信号通路在CNS损伤中的作用	首次发现单核细胞来源的巨噬细胞是神经梅毒患者CNS中对Tp炎症反应的关键细胞，并验证了外周血炎症细胞可能通过破坏血脑屏障导致神经损伤	研究样本量未明确说明，体外脑类器官模型的临床相关性有待进一步验证	探究梅毒螺旋体诱导的神经梅毒中炎症介导脑损伤的机制	神经梅毒患者的CNS组织、外周血及体外培养的脑类器官	神经免疫学	神经梅毒	蛋白质组学、单细胞转录组学	体外脑类器官模型	蛋白质组数据、转录组数据	NA
3520	2025-04-27	High CD44 expression and enhanced E-selectin binding identified as biomarkers of chemoresistant leukemic cells in human T-ALL 2025-Feb, Leukemia IF:12.8Q1 DOI:10.1038/s41375-024-02473-7 PMID:39580584	研究论文	本文研究了T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）中化疗耐药细胞的生物标志物，重点关注CD44高表达和E-选择素结合增强的特性	首次在人类T-ALL中鉴定出Ki67CD44化疗耐药白血病细胞（CLCs），并发现其与E-选择素结合的关联	样本量相对较小（39例人类T-ALL样本），需要更大规模研究验证	探索T-ALL化疗耐药机制，寻找预后分层和治疗新靶点	人类T-ALL细胞，特别是化疗耐药的白血病细胞（CLCs）	血液肿瘤学	白血病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	39例人类T-ALL样本