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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3501 - 3520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3501 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mechanisms of radioresistance and immune escape in recurrent nasopharyngeal carcinoma
2025-Jul-21, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02253-8
PMID:40691404
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示复发性鼻咽癌的放疗抵抗和免疫逃逸机制 | 首次在复发性鼻咽癌中发现特异性MCAM癌症相关成纤维细胞通过胶原IV-ITGA2-FAK-AKT轴促进放疗抵抗，并揭示CD8 ZNF683细胞功能及CD47-SIRPα免疫检查点机制 | 样本量相对有限（24名患者的39个肿瘤），需要进一步验证研究 | 探究复发性鼻咽癌放疗抵抗和免疫逃逸的分子机制 | 鼻咽癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 24名患者的39个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3502 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals CD34+CD90+ endothelial cells promote tumor metastasis in gallbladder cancer
2025-Jul-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01040-2
PMID:40681742
|
研究论文 | 通过单细胞分析鉴定出促进胆囊癌转移的CD34+CD90+内皮细胞亚群 | 首次在胆囊癌中发现具有EndoMT特性的CD34+CD90+内皮细胞亚群，并证实其通过TGF-β信号通路促进肿瘤转移 | 未明确说明样本数量和研究人群特征 | 探究肿瘤内皮细胞在胆囊癌转移中的作用机制 | 胆囊癌患者的内皮细胞和肿瘤细胞 | 单细胞分析 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3503 | 2025-10-06 |
Using machine learning to discover DNA metabolism biomarkers that direct prostate cancer treatment
2025-Jul-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11457-1
PMID:40681784
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法，发现DNA代谢基因在前列腺癌预后和治疗中的生物标志物作用 | 首次系统性地整合转录组数据、单细胞RNA测序和机器学习模型，揭示DNA代谢基因在前列腺癌免疫微环境和治疗反应中的关键作用 | 研究主要基于TCGA队列数据，需要更多独立队列验证；样本量相对有限 | 探索DNA代谢基因在前列腺癌进展、免疫调节和治疗反应中的作用机制 | 前列腺癌患者样本和正常细胞 | 机器学习 | 前列腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 基因富集分析 | CoxBoost算法, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA队列和外部验证数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 3504 | 2025-10-06 |
SCNT: an R package for data analysis and visualization of single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jul-18, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06209-x
PMID:40681987
|
研究论文 | 开发了一个用于单细胞和空间转录组数据分析和可视化的R软件包 | 整合了Seurat和ggplot2等工具，支持Seurat与H5ad格式的无缝转换，提供高分辨率空间可视化功能 | 目前支持的ST平台有限，多组学数据整合功能有待加强 | 解决单细胞和空间转录组数据分析与可视化的挑战 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | 公共PBMC数据集, Visum和Visium HD人类肾脏组织数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Visium, Visium HD | 10x Visium, 10x Visium HD |
| 3505 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing technology was employed to construct a risk prediction model for genes associated with pyroptosis and ferroptosis in lung adenocarcinoma
2025-Jul-18, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03323-5
PMID:40682067
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了肺腺癌中焦亡和铁死亡相关基因的风险预测模型 | 首次在单细胞水平系统分析肺腺癌中焦亡相关基因的表达模式，并构建了结合焦亡和铁死亡基因的七基因预后模型 | 未在文中明确说明研究局限性 | 系统阐明肺腺癌中不同细胞类型焦亡的特征和预后价值 | 肺腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, qPCR | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 临床信息 | GSE189357单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3506 | 2025-10-06 |
STHD: probabilistic cell typing of single spots in whole transcriptome spatial data with high definition
2025-Jul-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03608-4
PMID:40682076
|
研究论文 | 提出STHD方法用于全转录组空间转录组学中单点的概率性细胞分型 | 结合计数统计与邻域正则化的机器学习模型，能够以高分辨率预测亚细胞点位的细胞类型身份 | NA | 解决空间转录组数据高稀疏性和高维度带来的计算挑战，实现精确的细胞分型 | 空间转录组学中的单点细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 全转录组空间转录组学 | 机器学习模型（结合计数统计与邻域正则化） | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3507 | 2025-10-06 |
SNRPB/CCNB1 axis promotes hepatocellular carcinoma progression and cisplatin resistance through enhancing lipid metabolism reprogramming
2025-Jul-18, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03463-y
PMID:40682115
|
研究论文 | 本研究揭示了SNRPB通过FOXM1-CCNB1轴调控脂质代谢重编程促进肝细胞癌进展和顺铂耐药的新机制 | 首次发现SNRPB/CCNB1轴通过增强脂质代谢重编程驱动肝癌进展和化疗耐药 | NA | 探索SNRPB在肝细胞癌进展和化疗耐药中的分子机制 | 肝细胞癌患者样本和细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, ChIP, Co-IP, 代谢分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 多个队列的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3508 | 2025-10-06 |
Integrative spatial omics reveals distinct tumor-promoting multicellular niches and immunosuppressive mechanisms in Black American and White American patients with TNBC
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61034-3
PMID:40675986
|
研究论文 | 本研究通过整合空间组学技术揭示了非裔美国人和白人三阴性乳腺癌患者中不同的肿瘤促进多细胞生态位和免疫抑制机制 | 首次使用成像质谱流式技术和空间转录组学整合方法，系统比较不同种族TNBC患者的肿瘤微环境特征 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究三阴性乳腺癌种族差异的生物学机制 | 自我认同为非裔美国人和白人三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学 | NA | 空间多组学数据,图像数据 | 非裔美国人和白人TNBC患者队列 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 3509 | 2025-10-06 |
Inhibition of Glutamine Metabolism Attenuates Tumor Progression Through Remodeling of the Macrophage Immune Microenvironment
2025-Jul-13, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400738
PMID:40653724
|
研究论文 | 本研究通过开发谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083，探索其在重塑巨噬细胞免疫微环境及抑制肿瘤进展中的作用 | 开发了在癌组织中特异性生物激活的谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083，并首次系统揭示其通过双重机制（直接靶向肿瘤细胞和重塑巨噬细胞免疫微环境）发挥抗肿瘤作用 | 研究仅使用小鼠肿瘤模型，尚未进行人体临床试验；对谷氨酰胺代谢影响其他免疫细胞的具体机制尚未完全阐明 | 评估谷氨酰胺代谢抑制对肿瘤进展和免疫微环境的影响 | 两种免疫系统完整的小鼠癌症模型和体外骨髓来源的巨噬细胞 | 癌症免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小鼠肿瘤模型及体外巨噬细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3510 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal individual and cooperative effects of trisomy 21 and GATA1s on hematopoiesis
2025-Jul-04, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102577
PMID:40680731
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示21三体综合征和GATA1s对造血过程的个体及协同效应 | 首次结合等基因hiPSCs、原代人胎儿/新生儿细胞和单细胞转录组学，解析T21和GATA1s在造血发育中的独立与协同作用 | 研究主要聚焦早期造血祖细胞，对晚期分化阶段和体内功能验证需进一步探索 | 解析21三体综合征和GATA1s突变在造血发育过程中的独立与协同作用机制 | 人类诱导多能干细胞、原代人胎儿和新生儿造血祖细胞 | 单细胞生物学 | 唐氏综合征相关血液疾病 | 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | 多种遗传背景的造血祖细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3511 | 2025-10-06 |
Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours
2025-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08952-w
PMID:40335695
|
研究论文 | 本研究通过鉴定蓝斑核周围异质性GABA能神经元群体，揭示了其对觉醒状态和探索行为的调控机制 | 首次在蓝斑核树突场发现转录组、空间分布和功能多样的GABA能神经元群体，并阐明其通过调节LC放电模式控制全局觉醒水平 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究局部神经调节输入如何控制蓝斑核功能及其对觉醒行为的调控机制 | 小鼠蓝斑核及周围区域的神经元群体 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 病毒追踪技术，单细胞RNA测序，空间转录组学，神经环路研究方法 | NA | 基因表达数据，空间分布数据，神经电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 3512 | 2025-10-06 |
Dynamic WT1 expression during gastrulation specifies peritoneal smooth muscle fate independently of mesothelial fate
2025-Jul-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204332
PMID:40554754
|
研究论文 | 本研究揭示了WT1在小鼠原肠胚形成过程中动态表达，独立于间皮细胞命运指定腹膜平滑肌细胞谱系 | 首次发现WT1在原肠胚形成阶段表达，并独立于间皮细胞形成过程指定血管平滑肌和内脏平滑肌细胞命运 | 研究仅聚焦于小鼠胚胎发育早期阶段，尚未验证在人类或其他物种中的保守性 | 探究WT1在胚胎发育过程中对平滑肌细胞谱系特化的作用机制 | 小鼠胚胎发育过程中的WT1表达细胞和平滑肌前体细胞 | 发育生物学 | 发育异常疾病 | 他莫昔芬诱导遗传谱系追踪、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | 小鼠胚胎（E7.5-E12.5阶段） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3513 | 2025-10-06 |
Alevin-fry-atac enables rapid and memory frugal mapping of single-cell ATAC-seq data using virtual colors for accurate genomic pseudoalignment
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf234
PMID:40662809
|
研究论文 | 本文介绍了alevin-fry-atac工具，该工具通过虚拟颜色技术实现单细胞ATAC-seq数据的快速且内存高效的处理 | 提出了一种改进的伪比对方案，通过将参考基因组分割为'虚拟颜色'（重叠的固定最大范围区域），解决了大基因组参考序列的伪比对挑战 | NA | 开发快速、内存高效的单细胞ATAC-seq数据处理工具 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 伪比对算法 | 基因组测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞ATAC-seq | Cell Ranger ATAC | 单细胞ATAC-seq分析流程 |
| 3514 | 2025-10-06 |
Prediction of gene regulatory connections with joint single-cell foundation models and graph-based learning
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf217
PMID:40662821
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研究论文 | 提出一种结合单细胞基础模型和图学习的基因调控链接预测框架scRegNet | 首次将大规模预训练的单细胞基础模型与联合图学习方法相结合用于基因调控网络推断 | 需要依赖已知的转录因子-DNA结合数据进行监督学习 | 解决单细胞RNA测序数据中基因调控链接预测问题 | 基因调控网络和转录因子-DNA相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基础模型, 图学习 | 基因表达数据 | 七个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3515 | 2025-10-06 |
ARTEMIS integrates autoencoders and Schrödinger Bridges to predict continuous dynamics of gene expression, cell population, and perturbation from time-series single-cell data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf218
PMID:40662824
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研究论文 | 提出ARTEMIS生成模型，整合变分自编码器和薛定谔桥来预测基因表达、细胞群体和扰动的连续动态 | 将变分自编码器与不平衡扩散薛定谔桥结合，首次在连续潜空间中重建细胞轨迹并估计时间依赖性细胞死亡率 | 基于单时间点快照数据推断连续动态，可能受限于数据稀疏性和技术噪声 | 从时间序列单细胞数据重建细胞轨迹、揭示基因表达动态和恢复细胞群体变化 | 胰腺β细胞分化、斑马鱼胚胎发生、癌细胞上皮间质转化过程 | 单细胞数据分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE), 薛定谔桥, 随机微分方程(SDEs) | 单细胞基因表达数据 | 三个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3516 | 2025-10-06 |
Transcriptome assembly at single-cell resolution with Beaver
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf236
PMID:40662838
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研究论文 | 开发了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图组织个体组装，采用动态规划算法搜索全长转录本，并整合两个随机森林模型准确估计候选转录本在单个细胞中的表达可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计，未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 解决单细胞分辨率下全长转录本重建的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 3517 | 2025-10-06 |
Biallelic Mutations in the Otogelin-Like Gene (OTOGL) Associated With Congenital Non-Syndromic Sensorineural Hearing Loss in a Chinese Family
2025-Jul, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.70122
PMID:40682330
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研究论文 | 通过全外显子测序在中国家庭中发现OTOGL基因双等位基因突变与非综合征性先天性听力损失相关 | 首次在中国家庭中鉴定出OTOGL基因复合杂合突变(p.Ile34Val和p.Phe319del)与先天性听力损失的关联 | 研究仅针对单个中国家庭，OTOGL基因突变谱和功能相关性仍需进一步研究 | 探索OTOGL基因突变与非综合征性感觉神经性听力损失的遗传机制 | 患有不明原因听力损失的中国家庭成员 | 遗传学 | 听力损失 | 全外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 1个中国家庭(先证者为6岁男孩) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3518 | 2025-10-06 |
T Cells Enhance Tissue Complexity and Function to Study Fibrosis in 3D Skin-Like Tissue Models
2025-Jul, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1177/19373341251360742
PMID:40690724
|
研究论文 | 本研究开发了含有T细胞的3D皮肤样组织模型，用于研究纤维化疾病中T细胞的作用机制 | 首次在3D皮肤样组织中整合自体T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞，并通过单细胞RNA测序鉴定T细胞亚群 | 模型仍需进一步验证其在其他器官纤维化研究中的适用性 | 研究T细胞在组织纤维化发病机制中的作用 | 硬皮病患者的血液来源T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞 | 组织工程 | 硬皮病、特发性肺纤维化、肝纤维化、肾纤维化 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、组织分析 | 3D组织工程模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织形态数据 | 硬皮病患者来源的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3519 | 2025-10-06 |
Isolation of mitochondrial mutation-specific T cell receptors
2025-Jun-30, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf139
PMID:40587813
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研究论文 | 本研究首次成功分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性T细胞受体 | 首次报道了从健康供体中分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性TCRs，证明了线粒体突变也可作为肿瘤新抗原来源 | 研究中存在一些生物学障碍需要考虑，且仅针对HLA-A*0201等位基因进行了筛选 | 探索肿瘤线粒体DNA突变是否能够产生被T细胞受体识别的新抗原 | 肿瘤线粒体DNA非同义突变及其对应的T细胞受体 | 免疫学 | 多种肿瘤类型 | 单细胞测序，表位预测算法，TCR验证 | NA | 基因组数据，肽段筛选数据 | 38种肿瘤类型的3,798个非同义单核苷酸突变，10名HLA-A*0201纯合子健康供体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3520 | 2025-10-06 |
Iterative transcription factor screening enables rapid generation of microglia-like cells from human iPSC
2025-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59596-3
PMID:40494892
|
研究论文 | 开发了一种迭代高通量单细胞转录因子筛选方法，用于快速将人类iPSC分化为小胶质细胞样细胞 | 提出迭代转录因子筛选方法，可在4天内通过六个转录因子将iPSC分化为小胶质细胞样细胞，并开发了新的计算方法构建基因调控网络 | NA | 开发高效的人类iPSC向特定细胞类型分化的方法 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)和小胶质细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，转录因子扰动实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |