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当前共找到 39758 篇文献，本页显示第 3481 - 3500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3481 | 2026-04-17 |
Ensemble of Time-Evolving SASP Gene Sets Identifies IGFBP7 and CDKN1A as a Potential Marker Pair for Senescent Fibroblast Subpopulations Across Tissues
2026-Mar-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27073012
PMID:41977201
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，通过构建随时间演化的SASP基因集集成，识别出IGFBP7和CDKN1A作为跨组织衰老成纤维细胞亚群的潜在标志物对 | 构建了反映SASP基因表达时间动态的基因集集成框架，并首次鉴定出IGFBP7和CDKN1A作为跨多种人体组织衰老成纤维细胞的通用上调标志物对 | 研究主要基于WI-38人肺成纤维细胞系数据，在体内组织的验证仍需进一步扩展 | 表征衰老相关分泌表型（SASP）的异质性，并开发改进的衰老细胞检测方法 | 人肺、皮肤和眼组织中的衰老成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因集集成分析框架 | 单细胞转录组数据 | WI-38人肺成纤维细胞系及公共单细胞数据集（肺、皮肤、眼组织） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3482 | 2026-04-17 |
Ochratoxin A and Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Exploring Potential Molecular Links Through Network Toxicology and Machine Learning
2026-Mar-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27072971
PMID:41977161
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研究论文 | 本研究结合网络毒理学、机器学习和分子对接技术，系统探讨了赭曲霉毒素A与透明细胞肾细胞癌之间的潜在分子联系 | 首次整合网络毒理学、机器学习（glmBoost+RF模型）和单细胞转录组分析，系统识别了OTA暴露与ccRCC关联的核心基因和分子通路 | 研究主要基于生物信息学分析和预测，缺乏体内或体外实验验证；样本来源为公共数据库，可能存在批次效应 | 探索赭曲霉毒素A（OTA）与透明细胞肾细胞癌（ccRCC）发生发展的潜在分子机制 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）相关的基因表达数据及OTA的预测靶基因 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 网络毒理学、机器学习、分子对接、差异表达分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞转录组分析 | glmBoost + RF（特征选择与分类器的序列组合模型） | 基因表达数据（转录组数据） | 基于两个GEO数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 转录组测序 | NA | NA |
| 3483 | 2026-04-17 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Salivary Epithelial Cells Reveals Large-Scale Dysregulation in Bitter Taste Dysfunction
2026-Mar-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27072953
PMID:41977143
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析唾液上皮细胞，揭示了长期COVID患者苦味功能障碍的大规模分子失调机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究长期COVID患者的唾液上皮细胞，揭示苦味功能障碍与细胞骨架动力学、味觉细胞-神经突触组装及微生物防御标志物下调的关联 | 研究样本可能有限，且未明确因果关系，主要基于相关性分析 | 阐明长期COVID患者苦味功能障碍的细胞和分子基础 | 长期COVID患者的唾液上皮细胞 | 数字病理学 | 长期COVID | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3484 | 2026-04-17 |
Hyperinnervation inhibits organ-level regeneration in mammalian skin
2026-Mar-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.027
PMID:41864207
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研究论文 | 本研究探讨了哺乳动物皮肤器官水平再生的机制，发现产后伤口中成纤维细胞驱动的过度神经支配是再生的关键障碍 | 首次揭示产后伤口特异性成纤维细胞（PWF）通过Timp1、Cxcl12和Ccl7基因导致过度神经支配，从而抑制器官水平再生，并证明通过减少神经支配可恢复再生能力 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及人类皮肤再生，且具体分子通路机制有待进一步阐明 | 探究哺乳动物皮肤器官水平再生的调控机制及产后再生能力丧失的原因 | 小鼠胚胎及产后皮肤伤口愈合过程，包括上皮、间充质、神经元和血管组织 | 发育生物学与再生医学 | 皮肤损伤与再生障碍 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及胚胎和产后不同时间点的皮肤伤口 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3485 | 2026-04-17 |
Glioma-Immune crosstalk in the tumor microenvironment: mechanistic insights and therapeutic translation
2026-Mar-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03239-0
PMID:41817826
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综述 | 本文综述了胶质瘤肿瘤微环境中胶质瘤细胞与免疫细胞之间的动态相互作用，探讨了其对肿瘤进展、治疗反应的影响以及治疗转化的意义 | 强调了空间转录组学和蛋白质组学在揭示胶质瘤分子区域异质性方面的进展，并指出从诊断到复发过程中肿瘤微环境的演变是预测免疫治疗反应的关键挑战 | 当前研究主要集中于肿瘤相关巨噬细胞，对其他免疫细胞亚群的研究尚不充分，且标准疗法对免疫细胞动态的重塑及其在治疗抵抗中的作用仍未完全阐明 | 深入理解胶质瘤肿瘤微环境中肿瘤与免疫的相互作用机制，以指导更有效的个性化免疫治疗策略的开发 | 胶质瘤（特别是胶质母细胞瘤）及其肿瘤微环境中的免疫细胞（如调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞） | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3486 | 2026-03-07 |
Identification and validation of prognostic genes associated with M2 macrophage and heme metabolism in lung adenocarcinoma through bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Mar-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04742-6
PMID:41787185
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3487 | 2026-04-17 |
FFAR4 negatively regulates colorectal cancer growth via blocking oxidative phosphorylation
2026-Mar-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07942-4
PMID:41787450
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研究论文 | 本研究探讨了FFAR4在结直肠癌中的抑制作用，通过多组学方法发现FFAR4表达降低与不良预后相关，并通过激活FFAR4抑制肿瘤生长，机制涉及线粒体呼吸和细胞代谢的调控 | 首次将FFAR4鉴定为结直肠癌的关键候选基因，并揭示其通过阻断氧化磷酸化负调控肿瘤生长的机制，为结直肠癌的诊断和治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证有限，且未深入探讨FFAR4在不同亚型结直肠癌中的异质性作用 | 阐明FFAR4在结直肠癌中的功能及其作为诊断生物标志物和治疗策略的潜力 | 结直肠癌组织、CRC细胞系和MC38同基因肿瘤模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、转录组学、免疫荧光、代谢分析、细胞外通量分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、代谢数据 | 临床CRC组织样本、CRC细胞系、MC38小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3488 | 2026-04-17 |
A hormetic transcriptional program coregulates invasion, proliferation and dormancy to define metastatic potential
2026-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70242-4
PMID:41781391
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研究论文 | 本文通过整合空间转录组学与单细胞基因表达及染色质谱分析，揭示了转录因子Prrx1作为扩散主调控因子的作用，并探讨了其表达水平与转移潜能之间的非线性关系 | 发现Prrx1通过调节侵袭、增殖和休眠程序，以非线性方式影响转移潜能，揭示了转移能力在细胞离开原发肿瘤时已预设 | 研究主要基于乳腺癌临床前模型和队列，可能不适用于其他癌症类型，且具体分子机制需进一步验证 | 探究决定癌症转移能力和其获取时间的因素 | 人类乳腺癌队列和临床前模型中的癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 单细胞基因表达谱, 染色质谱分析 | NA | 转录组数据, 染色质数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3489 | 2026-04-17 |
From Immunobiology to Clinical Application: Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Melanoma
2026-Mar-03, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm16030147
PMID:41893014
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综述 | 本文是一篇关于肿瘤浸润淋巴细胞在黑色素瘤中的生物学作用、预后预测价值以及基于TIL的过继细胞疗法应用的叙述性综述 | 系统性地整合了TIL生物学、预后标志物作用及TIL-ACT疗法在晚期黑色素瘤中的应用现状与未来方向，特别是在免疫检查点抑制剂失败后的治疗策略 | 作为一篇叙述性综述，其结论基于现有文献的综合分析，而非原始数据研究，可能存在发表偏倚 | 综述肿瘤浸润淋巴细胞在黑色素瘤免疫生物学中的作用及其向临床应用（特别是过继细胞疗法）的转化 | 黑色素瘤患者、肿瘤浸润淋巴细胞、基于TIL的过继细胞疗法 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、显微镜检查 | NA | 文本（文献数据） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3490 | 2026-04-17 |
Oncolytic HSV-1-Mediated JAG1 Blockade Induces Glioma Senescence-Associated Secretory Phenotype to Increase Macrophage Activation and Cetuximab-Mediated Senolysis
2026-Mar-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1402
PMID:41411618
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研究论文 | 本研究开发了一种拮抗JAG1的溶瘤HSV-1病毒（OD-0J1），并揭示了其通过诱导胶质瘤细胞衰老、改变肿瘤微环境中的巨噬细胞表型，并与西妥昔单抗联合增强抗肿瘤疗效的机制 | 首次将溶瘤病毒与JAG1阻断策略结合，并发现诱导的细胞衰老表型可被西妥昔单抗靶向清除，为联合治疗提供了新思路 | 研究主要在临床前动物模型中进行，其人体有效性和安全性尚需进一步验证 | 探究JAG1介导的信号在胶质瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中的作用，并开发新的联合治疗策略 | 胶质瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、溶瘤HSV-1病毒工程改造体 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、激酶组分析、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据、细胞表型数据 | 无胸腺裸鼠和人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3491 | 2026-04-17 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术，揭示了宫颈癌中代谢与免疫相互作用的分子机制，并探索了苦参碱的潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术，系统性地构建了宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络，并探索了天然产物苦参碱的多靶点抗肿瘤机制 | 苦参碱的具体作用机制尚未完全明确，体外实验和分子对接结果仅为初步验证，需要进一步的体内实验和临床研究证实 | 阐明宫颈癌的分子机制，评估苦参碱干预的潜力，为宫颈癌治疗提供新的研究方向和治疗靶点 | 宫颈癌组织、TCGA数据库中的宫颈癌数据、苦参碱 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序、空间转录组、生物信息学分析、分子对接、体外实验 | CIBERSORT算法、ESTIMATE算法 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组 | NA | NA |
| 3492 | 2026-04-17 |
Integrative bioinformatics-machine learning-experimental validation identifies shared immunomodulatory targets in psoriasis and psoriatic arthritis and deciphers allicin's therapeutic mechanism
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04777-6
PMID:41408482
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学、机器学习与实验验证，识别了银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，并揭示了蒜素（allicin）的治疗机制 | 整合了多组学数据、机器学习算法（随机森林和LASSO）、单细胞RNA测序分析以及反向药物筛选，首次系统性地识别了CXCL10、ISG15和IFI27作为银屑病和银屑病关节炎的共有免疫治疗靶点，并通过分子对接、动力学模拟和实验验证了蒜素通过抑制NF-κB信号通路调控这些靶点的治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证部分可能受样本量和体外实验模型的限制，蒜素在体内的药效和安全性仍需进一步临床研究证实 | 识别银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，预测潜在治疗药物，并验证其作用机制 | 银屑病和银屑病关节炎患者的转录组数据、免疫相关基因、候选药物蒜素及其活性成分蒜素 | 生物信息学, 机器学习 | 银屑病, 银屑病关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机森林, LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3493 | 2026-04-17 |
Multimodal bioinformatic analyses of genome-scale expression beyond gene-centric differential expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag152
PMID:41978384
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综述 | 本文综述了基因组规模基因表达分析的概念和方法学进展，超越传统的病例对照比较和基因中心差异表达分析 | 强调使用转录组和多模态组学数据阐明基因表达多样机制，包括基因共表达和调控网络推断、上下文特异性网络模型及机器学习方法 | 作为综述文章，未进行原始研究，主要总结现有进展，未提出具体实验验证 | 提高对先进网络分析的认识并鼓励其应用，以探索基因表达调控的多因素性质 | 基因组规模基因表达数据，包括转录组和多模态组学数据 | 生物信息学 | NA | 转录组学、多模态组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习方法、网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 3494 | 2026-04-17 |
BCRInsight: an antibody language model to decode biological signals from BCR sequences
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag154
PMID:41978383
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研究论文 | 本文介绍了BCRInsight，一种基于Transformer架构和表型感知对比学习的抗体特异性预训练语言模型，用于从B细胞受体序列中解码生物信号 | BCRInsight整合了Transformer架构与表型感知对比学习，通过自监督学习从8000万个人类BCR序列中学习生物上下文表示，实现了在多个下游任务中的最先进性能，并展示了基于注意力的结构可解释性 | 未明确提及具体限制，但暗示单细胞测序的可扩展性和成本仍是主要障碍，且传统生物信息学方法难以建模抗体序列中的高阶非线性语义依赖 | 解码B细胞受体序列中嵌入的复杂序列语义，以阐明免疫动态并加速抗体发现 | 人类B细胞受体序列，包括健康、肿瘤和病毒感染状态下的单细胞免疫队列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | Transformer | 序列数据 | 8000万个人类BCR序列 | NA | NA | NA | NA |
| 3495 | 2026-04-17 |
Analysis of microsatellite instability intensity in single-cell resolution with scMnT reveals tumor heterogeneity in colorectal cancer
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag156
PMID:41978385
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scMnT的生物信息学方法，用于在单细胞分辨率下识别微卫星不稳定（MSI）细胞并量化MSI强度，揭示了结直肠癌中MSI强度的异质性及其与免疫治疗反应的相关性 | 首次在单细胞水平上量化MSI强度，突破了传统二元分类的局限，揭示了MSI在肿瘤内的异质性连续谱 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性，尚未在更大规模或更多癌种中进行验证 | 开发单细胞水平的MSI强度量化方法，探究MSI异质性在结直肠癌中的临床意义 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生物信息学分析方法（scMnT） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3496 | 2026-04-17 |
GDSim: accurate simulation for single-cell transcriptomes based on the guided diffusion model
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag163
PMID:41978379
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研究论文 | 本文提出了一种基于引导扩散模型的新型深度生成网络GDSim，用于准确模拟单细胞转录组数据 | 首次利用标签引导的扩散模型来捕获scRNA-seq数据中复杂的基因表达依赖关系，生成的模拟数据能紧密反映原始数据的真实分布 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据不足的问题，为下游分析提供高质量的模拟数据 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成网络，扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3497 | 2026-04-17 |
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69346-8
PMID:41667485
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研究论文 | 本文介绍了Seq-Scope-X技术，一种结合组织膨胀与测序的空间转录组学方法，实现了亚微米级分辨率的全转录组和蛋白质组分析 | 通过组织物理膨胀技术，将Seq-Scope的空间分辨率提升至亚微米级，突破了传统测序空间转录组学的光学分辨率限制，并首次在单细胞水平解析核质区室转录组差异 | 文中未明确说明技术应用的样本类型限制、通量限制或数据处理的复杂性 | 开发超高分辨率空间多组学技术，用于研究细胞结构、功能和疾病机制 | 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏以及人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及多种组织类型（肝、脑、结肠、脾、扁桃体） | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 基于Seq-Scope的改进平台，整合组织膨胀技术，支持亚微米级分辨率的全转录组和数百种抗体标记的蛋白质组分析 |
| 3498 | 2026-04-17 |
transFusion: a novel comprehensive platform for integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag059
PMID:41645434
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研究论文 | 本文介绍了一个名为transFusion的新型网络平台，专门用于整合分析单细胞RNA测序和10× Visium空间转录组学数据 | transFusion平台提供了12项关键功能，包括细胞间依赖性分析、配体-受体共表达识别与可视化以及空间多模态梯度变异模式分析，实现了对多模态数据的最全面有效整合 | 平台主要针对10× Visium数据，可能不适用于其他空间转录组技术，且需要进一步验证在更广泛数据集上的适用性 | 开发一个能够有效整合多模态数据并最大化空间信息利用的端到端分析平台，以解决当前空间转录组学分析中的挑战 | 单细胞RNA测序数据和10× Visium空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 10× Visium空间转录组技术 |
| 3499 | 2026-04-17 |
Engineering and evaluation of precision-glycosylated clickable albumin nanoplatform for targeting the tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.123973
PMID:41355949
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研究论文 | 本文开发了一种精确糖基化的可点击白蛋白纳米平台（CAN-DGIT），用于靶向肿瘤微环境，并结合空间转录组学评估纳米颗粒与TME的相互作用 | 通过精确控制糖基化程度和类型，实现了白蛋白纳米颗粒的可编程生物分布和细胞类型靶向，并创新性地整合PET成像与空间转录组学进行机制映射 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类临床试验；糖基化类型和靶向机制的普适性需进一步验证 | 开发一种精确糖基化的纳米药物递送平台，以选择性靶向肿瘤微环境并评估其相互作用 | 白蛋白纳米颗粒、糖基化配体（甘露糖、半乳糖、葡萄糖）、4T1肿瘤小鼠模型 | 纳米医学 | 肿瘤 | 点击化学、MALDI-TOF质谱、UV-vis光谱、PET成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 健康小鼠和4T1肿瘤小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3500 | 2026-04-17 |
Identification and validation of SUMOylation-related key genes for osteoarthritis through integration of single-cell, bulk RNA sequencing and animal model experiments
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1779874
PMID:41987786
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和动物模型实验，识别并验证了与骨关节炎相关的SUMOylation关键基因 | 首次结合单细胞测序、批量测序和动物模型，系统识别了骨关节炎中SUMOylation相关的关键基因和细胞类型 | 样本量相对较小，动物模型仅使用大鼠，且未深入探讨关键基因的具体作用机制 | 检测和验证骨关节炎中SUMOylation相关基因的关键作用 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，差异表达分析，PPI网络，机器学习，ROC曲线，免疫浸润分析，药物预测 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 三个公共数据集（GSE51588, GSE55235, GSE152805）和大鼠模型（三个OA和三个假手术样本） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |