本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3461 | 2026-02-17 |
Dysregulated TGFβ-ERK Signaling Drives Aberrant Extracellular Matrix Production in Noonan Syndrome-Associated Pulmonary Valve Stenosis
2026-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.700032
PMID:41648231
|
研究论文 | 本研究利用人iPSC瓣膜分化平台,揭示了Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄中TGFβ-ERK信号失调驱动细胞外基质异常产生的分子机制 | 首次建立人iPSC瓣膜分化平台模拟NS相关PVS,结合单细胞转录组学和磷酸化蛋白质组学揭示TGFβ信号通路异常激活是导致ECM病理改变的核心机制 | 研究样本量有限(仅两个NS婴儿瓣膜组织验证),iPSC模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 阐明Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄的分子发病机制 | CRISPR编辑的iPSC衍生的瓣膜间质细胞亚型(纤维层和海绵层VICs),NS婴儿的狭窄肺动脉瓣组织 | 发育生物学与疾病建模 | 先天性心脏病(肺动脉瓣狭窄) | iPSC分化、CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学(质谱)、组织病理学分析 | 人iPSC疾病模型 | 单细胞转录组数据、磷酸化蛋白质组数据、组织病理图像 | CRISPR编辑的多种基因型iPSC系,两个NS婴儿的肺动脉瓣组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3462 | 2026-02-17 |
Multimodal single-cell and spatial profiling reveals altered T cell-mediated immunity and B-cell follicular architecture in non-metastatic lymph nodes of patients with aggressive non-small cell lung cancer
2026-Jan-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.12.25343268
PMID:41646724
|
研究论文 | 本研究通过多模态单细胞和空间分析,揭示了侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中T细胞介导的免疫和B细胞滤泡结构的改变 | 首次结合CITE-seq、scRNA-seq和成像质谱流式细胞术,在侵袭性NSCLC患者的非转移性区域淋巴结中识别出免疫抑制微环境和B细胞滤泡结构异常 | 样本量较小(36个淋巴结来自11名患者),且仅针对非转移性淋巴结进行研究,可能未涵盖转移性淋巴结的免疫特征 | 探究侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中的免疫失调机制 | 非小细胞肺癌患者的区域淋巴结 | 数字病理学 | 肺癌 | CITE-seq, scRNA-seq, 成像质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、空间成像数据 | 36个淋巴结来自11名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3463 | 2026-02-17 |
Uniform pre-processing of bacterial single-cell RNA-seq
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692398
PMID:41648409
|
研究论文 | 本文介绍了一种针对细菌单细胞RNA测序数据的统一预处理方法,通过改进kallisto-bustools工具套件以适应细菌基因组的特性 | 将原本用于真核生物scRNA-seq的kallisto-bustools工具套件进行优化,使其能够处理细菌的操纵子结构和更短的基因长度分布,实现了细菌scRNA-seq数据的高效准确量化 | 未明确说明该方法在具体细菌种类或实验条件下的性能限制,也未与其他预处理方法进行广泛比较 | 开发一种统一、高效的细菌单细胞RNA测序数据预处理方法,以促进微生物单细胞转录组学的标准化分析 | 细菌单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3464 | 2026-02-17 |
Defects in tissue-resident macrophages lead to smaller eardrums and abnormal neurovascular networks with increased middle-ear infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699360
PMID:41648196
|
研究论文 | 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞在耳鼓膜发育和神经血管网络形成中的关键作用 | 首次发现耳鼓膜组织驻留巨噬细胞的异质性来源,并证明其缺失会导致耳鼓膜变小、神经血管网络异常及中耳感染风险增加 | NA | 探究组织驻留巨噬细胞在耳鼓膜发育和先天免疫保护中的作用 | 小鼠耳鼓膜组织驻留巨噬细胞 | 单细胞测序 | 中耳感染 | 命运图谱、单细胞RNA测序、巨噬细胞耗竭 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3465 | 2026-02-17 |
Spatiotemporal transcriptomic and metabolomic landscapes of wild soybean seed development reveal regulatory mechanisms of nutrient accumulation
2026-Jan-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101580
PMID:41169047
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和代谢组学,解析了野生大豆种子发育中期细胞分化和营养积累的时空动态机制 | 首次在野生大豆中整合空间转录组学和代谢组学,揭示了胚胎中背腹侧薄壁细胞在蛋白质和脂质代谢途径上的空间差异,并鉴定出关键调控基因GsMAPK23-4 | 研究仅聚焦于野生大豆种子发育中期阶段,未涵盖整个发育过程,且功能验证仅基于敲除突变体 | 揭示野生大豆种子发育过程中细胞分化和营养积累的时空调控机制,以提升大豆产量和品质 | 野生大豆(Glycine soja)种子 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 未明确指定样本数量,但基于野生大豆种子发育中期阶段 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3466 | 2026-02-17 |
Quantifying uncertainty in RNA velocity
2026-Jan-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujag018
PMID:41693613
|
研究论文 | 本文提出了一种贝叶斯分层模型来估计RNA速度,通过结合马尔可夫链蒙特卡洛和共识方法进行全贝叶斯推断,实现了校准良好的不确定性量化 | 首次在RNA速度估计中引入时间依赖性转录速率和非平凡初始条件,并讨论了模型参数的可识别性,包括潜在时间的较大值,这是以往未涉及的 | 模型可能仍受限于单细胞RNA测序数据的固有噪声和稀疏性,且计算复杂度较高 | 量化单细胞RNA测序数据中RNA速度的不确定性,以提取更可靠的动态信息 | 小鼠胚胎干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯分层模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3467 | 2026-02-17 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Regulatory Functions of Copines Family Genes in Testicular Cancer Progression
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组数据,揭示了Copines家族基因在睾丸癌不同细胞亚群中的表达模式及其通过调控PI3K-Akt信号通路和细胞周期驱动癌症进展的潜在分子机制 | 首次在单细胞水平上系统分析Copines家族基因在睾丸癌中的表达和调控功能,并识别出关键信号通路如PI3K-Akt,为精准治疗提供了新靶点 | 研究基于单细胞转录组数据,未进行实验验证,且样本量未明确说明,可能限制结论的普适性 | 探究Copines家族基因在睾丸癌细胞亚群中的表达模式及其调控癌症进展的机制 | 睾丸癌的单细胞转录组数据,包括NK/T细胞、肿瘤细胞、B细胞和巨噬细胞等亚群 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、差异表达分析、功能富集分析、伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3468 | 2026-02-17 |
Prognostic Value and Immune Characterization of Genes Associated with Childhood Acute Leukemia applying Single-Cell RNA Sequencing
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和批量转录组数据,识别儿童急性淋巴细胞白血病中的关键B细胞亚群和分子标志物,并构建预后风险模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别cALL中与增殖相关的B细胞C2亚群,并基于四个标记基因构建具有高预测精度的预后模型 | 研究样本量较小(仅2名cALL患者和3名健康对照),且仅针对B细胞起源的cALL,未涵盖其他亚型 | 探究儿童急性淋巴细胞白血病的免疫特征,并开发预后预测模型 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者及健康儿童的骨髓样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | RNA测序数据 | 2名cALL患者和3名健康儿童的骨髓样本(单细胞数据),511名cALL样本(批量数据) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3469 | 2026-02-17 |
Oral immunotherapy directs systemic transcriptomic changes in children with hen's egg allergy
2025-Dec, Asian Pacific journal of allergy and immunology
IF:2.3Q3
DOI:10.12932/AP-011124-1965
PMID:40544372
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了儿童鸡蛋过敏患者口服免疫治疗前后的系统免疫表型和转录组变化 | 首次在儿童鸡蛋过敏口服免疫治疗中应用单细胞RNA测序技术,揭示了治疗相关的系统免疫细胞转录组变化和T细胞亚群动态 | 样本量较小(16名儿童),且仅分析了治疗前后的两个时间点,缺乏长期随访数据 | 探究鸡蛋过敏儿童的系统免疫表型及口服免疫治疗期间的转录组变化 | 被诊断为鸡蛋过敏的3-12岁儿童 | 自然语言处理 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16名鸡蛋过敏儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3470 | 2026-02-17 |
Decoding Dendritic Cell Subtypes via Integrated Radiogenomics: A Stacked Ensemble Model for Predicting Immunotherapy Response in NSCLC
2025-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501990R
PMID:41160086
|
研究论文 | 本研究开创了一个整合单细胞RNA测序、影像组学和深度学习的多模态框架,用于解码树突状细胞介导的非小细胞肺癌抗PD-1治疗反应机制 | 首次将单细胞转录组学、影像组学和深度学习通过堆叠集成学习模型相结合,用于预测NSCLC免疫治疗反应,并识别出六个与树突状细胞亚型相关的关键标志基因 | 研究样本量有限,且结果需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 预测非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂(抗PD-1)的治疗反应 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本(来自应答者和无应答者) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,影像组学分析,机器学习 | LSTM, ResNet50, 堆叠集成学习模型 | 单细胞转录组数据,临床数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3471 | 2026-02-17 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
|
研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化分析、单细胞转录组数据整合及神经病理学验证,揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关联,并识别出小胶质细胞中CTSH-GRN-TMEM106B和TREM2-IL-34相关网络在疾病发生发展中的潜在作用 | 采用双向孟德尔随机化框架,结合单细胞转录组数据和神经病理学验证,系统性地建立了外周血浆/脑脊液蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关联,并构建了与小胶质细胞功能相关的蛋白互作网络 | 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析,虽然进行了神经病理学验证,但仍需进一步的功能实验来证实这些蛋白网络在AD中的具体分子机制 | 阐明外周生物标志物与阿尔茨海默病中枢神经系统之间的因果关联及潜在机制 | 阿尔茨海默病患者及对照个体的血浆蛋白、脑脊液蛋白、大脑蛋白质组数据以及前额叶皮层单细胞转录组数据 | 生物信息学与计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光,蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,遗传数据,组织图像数据 | 分析涉及734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种大脑蛋白,并使用AD患者死后脑组织样本进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3472 | 2026-02-17 |
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178304
PMID:41167410
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中类凋亡相关基因的图谱,并分析了其与预后及免疫微环境的关系,同时通过实验验证了关键调控因子TNK2的功能 | 首次在骨肉瘤中系统描绘类凋亡相关基因的图谱,揭示了其与预后和免疫微环境的关联,并通过单细胞RNA测序和功能实验验证了TNK2在类凋亡调控中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,实验验证部分仅限于细胞功能学实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 | 阐明骨肉瘤中类凋亡相关基因的分子特征及其对预后和免疫微环境的影响,识别关键调控因子 | 骨肉瘤患者队列(TARGET和GSE21257数据集)及骨肉瘤细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、细胞功能实验(增殖、活力、迁移实验) | LASSO-Cox回归模型、共识聚类 | 基因表达数据(RNA-seq)、单细胞RNA测序数据 | TARGET和GSE21257两个患者队列(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3473 | 2026-02-17 |
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178258
PMID:41101682
|
综述 | 本文综述了将抗菌药物、双硫仑和二甲双胍重新用于癌症治疗的潜力,并探讨了RNA测序在揭示其作用机制和指导临床转化中的关键作用 | 系统性地将多种抗菌药物与双硫仑、二甲双胍并列,探讨其抗癌重定位的共性机制,并强调利用转录组学(尤其是单细胞和空间转录组学)来弥合机制认知差距并指导精准治疗 | 临床转化结果参差不齐,面临药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境成分等关键挑战,且除二甲双胍外,其他候选药物的临床前和临床研究数据相对有限 | 探讨药物重定位用于癌症治疗的潜力,并阐明RNA测序技术在理解药物作用机制和指导临床转化中的应用 | 抗菌药物(阿奇霉素、克拉霉素、氯碘羟喹、氯喹、多西环素、红霉素、伊维菌素、替加环素)、双硫仑和二甲双胍 | 自然语言处理 | 癌症 | RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3474 | 2026-02-17 |
Enhanced Production of Lipid Mediators in Plasma and Activation of DNA Damage Pathways in PBMCs Are Correlated With the Severity of Ancestral SARS-CoV-2 Infection
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403195R
PMID:40322970
|
研究论文 | 本研究通过分析PBMCs和血浆样本,揭示了特定脂质介质及其合成基因的上调与SARS-CoV-2感染严重程度的相关性 | 首次将血浆脂质代谢物谱、PBMCs的转录组学数据与鼻咽部单细胞基因表达数据相结合,系统性地关联了脂质炎症介质、DNA损伤通路激活与COVID-19疾病严重程度 | 样本量较小(PBMCs分析仅20例),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究遗传因素和脂质代谢物在严重SARS-CoV-2感染中的作用机制 | 感染与未感染SARS-CoV-2的患者外周血单核细胞(PBMCs)、血浆及鼻咽拭子样本 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 脂肪酸组学分析, 单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | PBMCs/血浆:10例感染患者 + 10例未感染患者;鼻咽拭子:58例健康与COVID-19参与者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3475 | 2026-02-17 |
Dissection of Gαs and Hedgehog signaling crosstalk reveals therapeutic opportunities to target adenosine receptor 2b in Hedgehog-dependent tumors
2025-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639530
PMID:40060632
|
研究论文 | 本研究通过组织学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs信号通路失活驱动的基底细胞癌(BCC)与经典Hedgehog SMO驱动肿瘤的相似性,并提出了靶向腺苷2B受体作为潜在治疗策略 | 首次发现Gαs通路失活可导致SMO独立的致癌Hedgehog信号,并证明激活Gαs偶联的腺苷2B受体能抑制Hedgehog信号和肿瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型和人类BCC突变分析,临床转化潜力需进一步验证 | 探索Gαs与Hedgehog信号串扰在基底细胞癌中的作用,寻找新的治疗靶点 | 小鼠BCC样肿瘤和人类基底细胞癌 | 肿瘤生物学 | 基底细胞癌 | 组织学分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3476 | 2026-02-17 |
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13206183
PMID:39458132
|
综述 | 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合征之间的共同联系,并提出了利用组学平台进行未来研究的建议 | 首次提出将组学技术(如空间转录组学、蛋白质组学)应用于研究mTOR通路在唐氏综合征相关阿尔茨海默病中的作用,采用无偏倚方法揭示病理机制 | 目前尚未实际应用组学技术分析mTOR通路与DS-AD的关联,机制研究尚不充分 | 探讨mTOR通路在阿尔茨海默病与唐氏综合征共同病理机制中的作用,并推动未来跨组学研究 | 阿尔茨海默病和唐氏综合征的分子病理机制,特别是mTOR通路及其上游调控因子 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3477 | 2026-02-17 |
Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-10-17, Viruses
DOI:10.3390/v16101623
PMID:39459954
|
研究论文 | 开发了一种基于激活诱导标记(AIM)的检测方法,用于识别、分选并分析丙型肝炎病毒(HCV)特异性T细胞,以进行单细胞RNA测序研究 | 该方法不依赖于MHC多聚体,能够高灵敏度检测稀有的抗原特异性T细胞,并适用于不同MHC匹配的研究对象 | 研究仅基于一名受试者进行验证,样本量较小,且未在更大队列中评估方法的普适性 | 开发一种用于识别和分离HCV特异性T细胞的方法,以进行单细胞转录组分析 | HCV特异性T细胞(包括CD4和CD8 T细胞) | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、激活诱导标记(AIM)检测、T细胞受体(TCR)分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 一名受试者(具体数量未明确说明,但基于单例分析) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3478 | 2026-02-17 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学、高分辨率活体成像和短期谱系标记与干预技术,揭示了小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)迁移的分子基础及其与转录状态的紧密关联 | 首次结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组学和活体成像技术系统解析AVE迁移的动态过程,发现AVE的瞬时性特征及其迁移过程中基因表达的异质性,并鉴定出信号素信号通路对正常迁移的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,人类胚胎中的保守性有待验证;技术整合虽全面但可能未覆盖所有调控层面 | 阐明小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)独特迁移行为及其限制原条形成的分子机制 | 小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)及周围内脏内胚层(VE)细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 高分辨率活体成像, 晶格光片显微镜, 短期谱系标记 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 活体成像视频 | 未明确样本数量的小鼠胚胎VE细胞(迁移前及迁移期间) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3479 | 2026-02-17 |
Molecular portraits of patients with intrahepatic cholangiocarcinoma who diverge as rapid progressors or long survivors on chemotherapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330748
PMID:37758326
|
研究论文 | 本研究通过分析肝内胆管癌患者化疗前的分子特征,预测其对化疗的反应差异,并揭示了肿瘤-髓系细胞相互作用在先天化疗耐药中的关键作用 | 首次基于化疗前诊断活检的转录组特征,区分出化疗快速进展者与长期生存者,并发现该特征源于肿瘤-髓系细胞动态失衡,与肝微环境密切相关 | 研究样本量有限,且为回顾性分析,需要在前瞻性队列中进一步验证和开发该转录组特征 | 预测晚期肝内胆管癌患者对化疗的获益差异,并阐明先天化疗耐药的分子基础 | 晚期肝内胆管癌患者的诊断活检组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全转录组测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 一组基线特征可比的晚期肝内胆管癌患者(包括快速进展者和长期生存者) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | GeoMx | 靶向数字空间分析平台 |
| 3480 | 2026-02-17 |
Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection
2024-02-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01290-y
PMID:38317183
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了高致病性慢病毒感染引发延迟、广泛且持续的炎症反馈环路,从而驱动疾病进展的免疫机制 | 利用遗传相似但毒力不同的SIV变体感染猪尾猕猴模型,结合纵向单细胞转录组学和细胞间通讯技术,首次系统阐明了慢病毒致病性差异的免疫基础,并识别出CXCL10和CXCL16作为关键炎症驱动因子 | 研究基于非人灵长类动物模型,结果向人类HIV感染的直接转化需谨慎;单细胞技术可能无法完全捕获所有免疫细胞亚群或低丰度信号 | 探究慢病毒(如HIV/SIV)致病性差异的免疫机制,特别是宿主与病毒因素如何影响炎症反应和疾病进展 | 猪尾猕猴感染遗传相似但毒力不同的猴免疫缺陷病毒(SIV)变体 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞转录组学,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 猪尾猕猴队列的纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |