单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40356 篇文献，本页显示第 3461 - 3480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3461 | 2026-05-05 |
Multi-omics and machine learning reveal a critical mediator of PRKCA in quercetin-mediated protection against Sarcopenia
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158121
PMID:41936173
|
研究论文 | 本研究通过多组学和机器学习相结合的方法，揭示了槲皮素通过PRKCA-ERK信号通路在预防肌少症中的关键作用 | 首次整合NHANES人群数据、多组学分析和实验验证，系统阐明槲皮素通过PRKCA-ERK通路调节肌肉分化的分子机制，并利用机器学习识别槲皮素为肌少症的关键预测因子 | 未提及显著局限性 | 探究槲皮素及其调控的分子通路在肌少症预防中的作用机制 | 槲皮素、PRKCA基因、肌肉细胞分化 | 机器学习 | 肌少症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化 | LASSO, CatBoost, SHAP | 转录组数据, 基因组关联研究数据, 定量性状位点数据 | NHANES 2017-2018数据, 具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3462 | 2026-05-05 |
Shared and Distinct Genetic Factors Underlying Bile Acid Regulation and Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2026-Jun, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.70040
PMID:42076915
|
研究论文 | 通过对中国孕妇队列进行全基因组关联研究，揭示了胆酸调节和妊娠期肝内胆汁淤积症的共享和独特遗传因素 | 首次在东亚人群中通过GWAS发现CYP7A1和SLC39A9基因座与总胆酸水平及ICP显著关联，并整合单细胞RNA测序数据揭示肝细胞和中性粒细胞中的细胞特异性基因富集 | NA | 探究总胆酸水平和妊娠期肝内胆汁淤积症的遗传基础 | 中国孕妇队列中的13,357名孕妇 | 机器学习 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 13,357名中国孕妇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3463 | 2026-05-05 |
An m6A-programmed cell death signature predicts prognosis and identifies STK25 as a therapeutic target in colon adenocarcinoma
2026-Jun, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2026.15610
PMID:42077215
|
研究论文 | 基于m6A编程性细胞死亡特征构建结肠腺癌预后模型并识别治疗靶点STK25 | 首次整合m6A修饰与编程性细胞死亡（PCD）通路，构建21基因预后模型（MCDI），并发现STK25作为连接m6A修饰与凋亡调控的新治疗靶点 | 研究主要依赖公开数据集和体外实验，缺乏大规模临床验证和体内功能实验 | 开发基于m6A-PCD的预后模型并识别结肠腺癌潜在治疗靶点 | 结肠腺癌患者肿瘤样本及细胞系 | 机器学习 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 逆转录定量PCR, m6A甲基化RNA免疫沉淀, RNA免疫沉淀 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 公开数据集GSE132465和GSE205506，以及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3464 | 2026-05-05 |
From prediction to precision: Biomarker discovery and predictive modeling for personalized immune checkpoint blockade therapy
2026-May-15, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2026.116711
PMID:41930857
|
综述 | 讨论免疫检查点阻断疗法生物标志物发现、分子谱分析技术和计算方法的现状，以及结合预测建模实现精准免疫治疗的前景 | 系统整合单细胞和空间转录组学等高分辨率技术，揭示肿瘤微环境中细胞和分子动态，并探讨其在多模态生物标志物发现和预测建模中的应用潜力 | 未在文中直接说明局限性，但提及现有标志物准确性和泛化性不足（从上下文推断） | 总结ICB生物标志物现状、相关分子谱分析技术和计算方法，并展望结合分子谱分析与预测建模推进精准免疫治疗 | 免疫检查点阻断疗法相关生物标志物及其发现技术 | 机器学习 | 多种恶性肿瘤 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3465 | 2026-05-05 |
The Presence of CD11c+ B Cells with Potent Effector Memory Phenotype in Lung Adenocarcinoma Correlates with Overall Patient Survival
2026-May-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0635
PMID:41686183
|
研究论文 | 该研究发现肺腺癌中CD11c+ B细胞具有强效应记忆表型，且其存在与患者总生存期相关 | 首次在肺腺癌中发现CD11c+ B细胞作为独立的预后标志物，并揭示其通过分泌IL12、IL21和TNFα增强抗肿瘤免疫的机制 | 研究主要基于转录组数据和单细胞测序，缺乏功能性验证实验；样本仅限于治疗初治患者，未考虑治疗后的免疫变化 | 探究肿瘤浸润B淋巴细胞对肺腺癌预后影响及其免疫调节机制 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的CD11c+ B细胞及正常组织中的B淋巴细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA的8720例治疗初患者样本及GTEx的正常组织样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA和GTEx数据集使用Illumina平台进行转录组测序；单细胞RNA-seq未明确平台详情 |
| 3466 | 2026-05-05 |
Intratumoral Tertiary Lymphoid Structures Characterized by a B Cell-Related Signature Elicit Antitumor Effect through HAPLN3 in Hepatocellular Carcinoma
2026-May-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0758
PMID:41739581
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示B细胞相关特征的内肿瘤三级淋巴结构通过HAPLN3在肝细胞癌中发挥抗肿瘤效应 | 首次结合全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序，系统阐述肝细胞癌中三级淋巴结构的细胞特征和驱动机制，并鉴定出HAPLN3作为关键调控因子 | 研究基于单个队列，需进一步在更大样本和多中心验证；HAPLN3的免疫刺激机制在小鼠模型中验证，临床转化尚需更多证据 | 探究肝细胞癌中内肿瘤三级淋巴结构的细胞特征及其调控机制 | 339例不同三级淋巴结构分组的肝细胞癌患者肿瘤组织及小鼠模型 | 机器学习, 数字化病理 | 肝细胞癌 | 全外显子测序, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 基因组变异数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 339例肝细胞癌患者肿瘤样本及小鼠模型（原位小鼠模型） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 全外显子测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA-seq; Illumina NovaSeq用于批量RNA-seq和全外显子测序; 空间转录组学平台未具体指明 |
| 3467 | 2026-05-05 |
CDK14 is a critical regulator of haematopoietic stem and progenitor cell maintenance and post-transplantation proliferation
2026-May-04, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70562
PMID:42080702
|
研究论文 | 研究发现CDK14是维持造血干细胞和祖细胞稳态及移植后增殖的关键调控因子 | 首次揭示CDK14在造血系统中的作用，并通过遗传和药理学干预证明其维持生理性造血和促进移植后造血重建的功能 | 未明确说明局限性 | 探究CDK14在造血过程中的功能 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨髓样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3468 | 2026-05-05 |
Comprehensive Multi-Omics Profiling of Tertiary Lymphoid Structures Reveals Immunogenetic Landscapes and Prognostic Subtypes in Lung Adenocarcinoma
2026-May-03, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70120
PMID:42070266
|
研究论文 | 通过整合多组学策略构建三级淋巴结构相关预后模型，揭示肺腺癌的免疫遗传景观和预后亚型 | 首次利用孟德尔随机化识别与肺腺癌遗传相关的三级淋巴结构相关基因，并结合机器学习和单细胞RNA测序构建预后模型，提供了免疫遗传风险评估的新范式 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或外部验证不足 | 构建三级淋巴结构相关预后模型并阐明相关免疫遗传机制 | 肺腺癌患者的三级淋巴结构相关基因 | 机器学习 | 肺腺癌 | 孟德尔随机化, 机器学习, 单细胞RNA测序, 反转录定量聚合酶链反应 | 机器学习模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3469 | 2026-05-05 |
Spatiotemporal single-cell atlas of suture stem cell dynamics in craniosynostosis
2026-May-03, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-04987-6
PMID:42071254
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和Visium HD空间转录组学构建了颅缝早闭症小鼠模型中缝间充质干细胞动态的高分辨率时空图谱 | 首次整合单细胞RNA测序与2微米分辨率Visium HD空间转录组学，并结合基于形态分割和机器学习分类的SpatialCell方法，实现近单细胞空间分辨率解析 | 未明确提及潜在局限性 | 阐明颅缝早闭症中缝间充质干细胞的细胞动态和调控机制 | Fgfr2C342Y/+小鼠（模拟人类Crouzon综合征）及其野生型对照的冠状缝细胞 | 数字病理学 | 颅缝早闭症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习分类器 | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 三个关键发育阶段（E14.5、E18.5和P3）的Fgfr2C342Y/+小鼠和野生型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium HD | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium HD空间转录组学（2微米分辨率） |
| 3470 | 2026-05-05 |
Immune landscape characterization of neurofibromas with atypical features in Neurofibromatosis1 reveals PD-1 and the Tim-3/Galectin-9 pathway as potential therapeutic targets
2026-May-03, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02310-1
PMID:42071244
|
研究论文 | 通过免疫组化、单细胞RNA测序和NanoString技术，表征了NF1患者中具有非典型特征的神经纤维瘤的免疫景观，发现PD-1和Tim-3/Galectin-9通路是潜在治疗靶点 | 首次对非典型神经纤维瘤和ANNUBP的免疫微环境进行系统表征，揭示了免疫检查点PD-1和Tim-3/Galectin-9通路在控制恶性转化中的潜在作用 | 研究样本量可能有限，未提供具体样本数量；动物模型数据仅来自Prss56、Nf1、R26小鼠模型，可能无法完全代表人类肿瘤 | 研究NF1患者中非典型神经纤维瘤的免疫景观，探索潜在免疫治疗靶点 | NF1患者的皮肤神经纤维瘤、丛状神经纤维瘤、非典型神经纤维瘤/ANNUBP和恶性外周神经鞘瘤 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型 | 免疫组化、单细胞RNA测序、NanoString技术、多重免疫荧光、深度靶向DNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，包括NF1患者多个肿瘤类型的样本和Prss56、Nf1、R26小鼠模型衍生肿瘤 | NanoString | 单细胞RNA测序 | NanoString nCounter | NanoString nCounter平台进行转录组分析，10x Chromium单细胞RNA测序（小鼠模型） |
| 3471 | 2026-05-05 |
A posttranslational proteomic survey of a single anatomically preserved human 20-week postconception brain
2026-May-03, Journal of anatomy
IF:1.8Q2
DOI:10.1111/joa.70170
PMID:42071286
|
研究论文 | 对单个人类20周龄大脑的18个解剖区域进行总蛋白质组和翻译后修饰蛋白质组的深度分析，创建神经发育关键阶段的参考资源 | 首次对单个保存完好的20周龄人类大脑半球进行精细解剖，系统分析18个区域的总蛋白质组和翻译后修饰蛋白质组，并整合单细胞RNA测序数据预测配体-受体对 | 样本量有限，仅基于单个大脑半球；蛋白质组数据与公共单细胞RNA测序数据的整合可能受限于数据异质性 | 建立人类神经发育关键时期（20周龄）大脑的蛋白质组参考资源，揭示区域间蛋白质组差异和翻译后修饰特征 | 单个20周龄人类大脑半球中的18个解剖区域，包括软脑膜 | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学, 翻译后修饰分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 1个人类大脑半球，18个解剖区域 | NA | NA | NA | NA |
| 3472 | 2026-05-05 |
Phase separation of TRNAU1AP protein sustains selenoprotein translation and promotes glioblastoma tumorigenesis
2026-May-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag097
PMID:42080969
|
研究论文 | 本研究揭示了TRNAU1AP蛋白通过相分离维持硒蛋白翻译并促进胶质母细胞瘤肿瘤发生的机制 | 首次阐明TRNAU1AP蛋白通过相分离与EEFSEC形成复合体，增强sec-tRNAsec结合促进硒蛋白翻译，并揭示IGF2BP3通过m⁶A依赖的转录稳定上调TRNAU1AP表达的新机制 | 未提及 | 探究TRNAU1AP在胶质母细胞瘤中的功能和调控机制 | 胶质母细胞瘤干细胞和人类GBM组织样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 蛋白质免疫印迹、免疫组化、基因表达谱分析、蛋白质组学、空间转录组学、RNA免疫沉淀、多聚核糖体分析、多组学分析 | NA | 图像、文本 | 人类GBM组织样本和公开数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学用于分析TRNAU1AP介导的硒蛋白合成调控 |
| 3473 | 2026-05-05 |
CSF1R modulates megakaryopoiesis by targeting RUNX1 in immune thrombocytopenia
2026-May-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288511
PMID:41414965
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CSF1R在免疫性血小板减少症中通过靶向RUNX1调控巨核细胞生成的机制 | 首次发现CSF1R作为巨核细胞生成的先前未被识别的调控因子，并验证其作为ITP潜在治疗靶点的可行性 | 基于单个初诊ITP患者的骨髓样本进行scRNA-seq分析，可能限制结果的泛化性 | 阐明免疫性血小板减少症中巨核细胞功能障碍的分子机制 | ITP患者骨髓细胞及巨核细胞、健康对照样本、ITP小鼠模型 | 数字病理学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例初诊ITP患者（scRNA-seq）；多个临床样本（流式验证）；小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3474 | 2026-05-05 |
Single-cell transcriptomics of chicken ovarian cancer identifying immune subsets with prognostic implications
2026-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106582
PMID:41687260
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建了鸡卵巢癌的单细胞图谱，并鉴定了具有预后意义的免疫亚群 | 首次构建了产蛋鸡卵巢组织的单细胞转录组图谱，验证了鸡作为卵巢癌模型的跨物种保守性，并发现了两个主导性细胞毒性CD8+ T细胞亚群的基因特征在人类卵巢癌数据集中具有相反的预后作用 | 研究仅基于110周龄产蛋鸡的卵巢组织，样本年龄和数量可能有限，且未涉及早期发病机制的动态追踪 | 利用产蛋鸡自然发生的卵巢癌模型，在单细胞水平解析其细胞异质性和肿瘤相关变化，并评估其与人类卵巢癌的跨物种保守性 | 110周龄产蛋鸡的卵巢组织（包括正常和卵巢癌样本） | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 110周龄产蛋鸡的卵巢组织样本（包含正常和卵巢癌样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3475 | 2026-05-05 |
Insights into speckled eggs provided by single-cell transcriptomics in high-yield laying hens
2026-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106581
PMID:41687261
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学解析高产蛋鸡蛋壳斑点现象的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术构建蛋壳斑点相关子宫组织的细胞图谱，鉴定出10种细胞类型及其特异分子特征，揭示斑点组中SPP1基因在所有细胞类型中下调以及WNT、SPP1和BMP介导的细胞增殖分化通路受抑制等新发现 | 未明确说明研究的局限性 | 探究高产蛋鸡蛋壳斑点的遗传结构及其对蛋壳品质的影响机制 | 高产蛋鸡子宫组织细胞 | 单细胞转录组学 | 禽类经济性状相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两组鸡群（根据蛋壳斑点率分组），具体样本数未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics 单细胞RNA测序平台 |
| 3476 | 2026-05-05 |
Deciphering the Impact of RAC1-SPTAN1 in ARPKD Cystogenesis Using Multifaceted Models
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524001
PMID:41742835
|
研究论文 | 利用多面模型揭示RAC1-SPTAN1在常染色体隐性遗传多囊肾病囊肿形成中的影响 | 首次发现SPTAN1（一种细胞骨架血影蛋白）作为RAC1激活和囊肿病理的关键调控因子，并通过多面模型（类器官芯片、转基因小鼠和患者样本）验证，还通过单细胞RNA测序鉴定SLC8A1作为区分人肾远端/连接小管与集合管的标志物 | 未明确提及研究局限性 | 探究RAC1-SPTAN1在ARPKD囊肿形成中的机制，并开发潜在治疗策略 | 常染色体隐性遗传多囊肾病囊肿形成机制 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、类器官芯片、CRISPR激活 | NA | 图像、转录组数据 | 患者肾样本、类器官芯片模型、转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3477 | 2026-05-05 |
Defocus coding and transcriptomic remodeling in the mouse myopic retina
2026-May-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00011.2026
PMID:41910002
|
研究论文 | 通过全细胞记录和单细胞RNA测序，研究小鼠视网膜在离焦状态下如何感知信号并转化为生长调节基因信号 | 首次揭示水平细胞而非AII无长突细胞对光学离焦有响应，并发现多巴胺能无长突细胞在聚焦图像时最兴奋，高模糊时受抑制，同时展示了透镜诱导近视视网膜中细胞类型特异性的基因表达重塑 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证，且透镜诱导近视可能不完全代表自然近视过程 | 阐明视网膜如何感知聚焦与离焦信号并将其转化为调节生长的基因信号 | 小鼠视网膜中的水平细胞、AII无长突细胞和多巴胺能无长突细胞 | 分子生物学 | 近视 | 全细胞记录, 单细胞RNA测序 | NA | 电生理记录数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜细胞，具体样本数未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3478 | 2026-05-05 |
Deciphering functional intra-tumoral heterogeneity in BRAFV600E-driven mouse thyroid cancer reveals EMT trajectory and metabolic remodeling
2026-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03742-8
PMID:41935217
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌，揭示功能性瘤内异质性、上皮-间充质转化轨迹及代谢重塑 | 首次在BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌模型中，利用单细胞RNA测序解析恶性甲状腺细胞的转录异质性和层级演化轨迹，并发现二甲双胍可减少最恶性亚群，同时揭示p53缺失通过代谢可塑性促进恶性转化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体样本中进行充分验证；p53缺失的影响仅在体外分析中验证，体内机制需进一步研究 | 解析BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌中恶性细胞的功能异质性和演化轨迹，为靶向上皮-间充质转化（EMT）的治疗提供理论基础 | BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌细胞及类器官培养系统 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年发病的自发性小鼠甲状腺癌模型（BRAFV600E驱动）及类器官培养样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 3479 | 2026-05-05 |
Dimethyl fumarate attenuates subcutaneous adipose tissue inflammation in psoriasis
2026-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2026.119343
PMID:41962229
|
研究论文 | 本研究探究了富马酸二甲酯对银屑病患者皮下脂肪组织炎症的缓解作用及机制 | 首次联合空间转录组、批量RNA测序及体外模型，揭示富马酸二甲酯通过抑制NF-κB信号通路减轻银屑病皮下脂肪组织炎症 | 样本量小（6例患者）且缺乏长期随访数据 | 探究富马酸二甲酯治疗银屑病时对皮下脂肪组织炎症的影响及潜在机制 | 银屑病患者的皮下脂肪组织，以及鼠3T3-L1脂肪细胞和人脂肪细胞分化模型 | 数字病理学 | 银屑病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 6名中重度斑块型银屑病患者（其中4名进行脂肪活检） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学分析公开数据 |
| 3480 | 2026-05-05 |
Evidence of off-target probe binding affecting 10x Genomics Xenium gene panels compromise accuracy of spatial transcriptomic profiling
2026-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107070
PMID:42065925
|
研究论文 | 通过开发离线探针追踪工具（OPT），验证10x Genomics Xenium平台存在脱靶结合，并评估其对空间转录组分析准确性的影响 | 首次系统评估Xenium探针的脱靶结合现象，开发OPT工具通过多参考基因组比对预测脱靶位点，并结合正交实验验证其生物学效应 | 仅使用乳腺癌数据集验证，未涵盖其他组织类型；脱靶预测依赖参考基因组的完整性和注释质量 | 评估探针型空间转录组技术中脱靶结合对基因表达谱准确性的影响 | 10x Genomics Xenium技术的探针结合特异性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 序列比对算法 | 基因表达数据 | 1个乳腺癌肿瘤块样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium, Visium CytAssist, 3'单细胞RNA-seq | Xenium人类乳腺基因面板、Visium CytAssist空间转录组、3'单细胞RNA-seq |