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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3461 - 3480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3461 | 2025-10-06 |
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618486
PMID:39464096
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研究论文 | 本研究通过BCR受体克隆表达和单细胞转录组学分析人类对GlcNAc表位的B细胞应答机制 | 首次揭示抗糖抗体通过使用私有抗体基因重排并在生发中心进行亲和力成熟的独特选择机制 | 研究主要关注GlcNAc表位，对其他糖类抗原的普适性需要进一步验证 | 解析人类抗糖抗体应答的免疫系统发育机制 | 人类B细胞及其抗体基因重排 | 免疫学 | NA | BCR受体克隆表达, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 抗体序列数据 | 人类队列研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3462 | 2025-10-06 |
Tumor editing suppresses innate and adaptive antitumor immunity and is reversed by inhibiting DNA methylation
2024-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01932-8
PMID:39169233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌肿瘤编辑如何抑制先天和适应性抗肿瘤免疫，并证明DNA甲基化抑制剂可逆转这一过程 | 首次在全基因组范围内无偏倚地识别早期肿瘤发生过程中的基因编辑，并发现DNA甲基化抑制剂可逆转免疫基因抑制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究肿瘤编辑对免疫监视的逃避机制及DNA甲基化抑制剂的治疗潜力 | 乳腺癌基因工程小鼠模型、乳腺肿瘤和黑色素瘤植入模型 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基因工程小鼠模型和植入肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3463 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analysis of mouse TRAMP cell lines and tumors provide insights into shared pathways and therapeutic targets
2024-Oct, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2024.100184
PMID:39175940
|
研究论文 | 通过比较TRAMP前列腺癌小鼠模型及其衍生细胞系的基因表达谱，揭示与肿瘤侵袭性相关的共享通路和潜在治疗靶点 | 首次系统比较TRAMP模型不同侵袭阶段（从原代细胞到TC2R骨转移模型）的转录组特征，并验证其与人类前列腺癌数据的相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索前列腺癌进展的分子机制并识别潜在治疗靶点 | TRAMP转基因小鼠模型、TRAMP-C2细胞系、TC2-Ras细胞系及肿瘤组织 | 转录组学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种TRAMP模型细胞系和肿瘤样本，包含人类数据集验证 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3464 | 2025-10-06 |
Lysosomal dysfunction-derived autophagy impairment of gingival epithelial cells in diabetes-associated periodontitis with altered protein acetylation
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111273
PMID:38950874
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞溶酶体功能障碍通过改变蛋白质乙酰化导致自噬受损的分子机制 | 首次发现高糖环境下溶酶体功能障碍通过改变自噬-溶酶体通路相关蛋白的乙酰化水平导致自噬流阻塞 | 研究主要基于体外细胞实验，需要更多体内实验验证 | 探究糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞过度炎症反应的分子机制 | 人牙龈上皮细胞和临床牙龈上皮组织 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,组织图像 | 临床牙龈上皮组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 3465 | 2025-10-06 |
Machine Learning Uncovers Vascular Endothelial Cell Identity Genes by Expression Regulation Features in Single Cells
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609808
PMID:39253493
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研究论文 | 提出了一种名为SCIG的机器学习方法，用于在单细胞水平识别细胞身份基因 | 利用细胞身份基因独特的遗传序列特征（如顺式调控元件富集模式）和单细胞RNA-seq数据，无需与其他细胞比较即可识别细胞身份基因 | NA | 识别血管内皮细胞的身份基因，理解细胞分化和发育机制 | 人类内皮细胞图谱中的血管内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据，遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3466 | 2025-10-06 |
Dysregulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase in cancers: A comprehensive analysis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111198
PMID:38697449
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研究论文 | 通过多组学分析探讨磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(PEPCK)在泛癌中的表达失调及其临床意义 | 首次在33种癌症类型中系统分析PEPCK两个亚型(PCK1和PCK2)的表达模式及其与临床预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于胶质母细胞瘤 | 阐明PEPCK在癌症发生发展中的作用机制及其临床价值 | 33种癌症类型的患者样本和胶质母细胞瘤细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析(重点关注胶质母细胞瘤) | 生物信息学分析、单细胞测序、体外实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据、突变数据 | TCGA数据库中33种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3467 | 2025-10-06 |
Blocking the MIR155HG/miR-155 axis reduces CTGF-induced inflammatory cytokine production and α-SMA expression via upregulating AZGP1 in hypertrophic scar fibroblasts
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111202
PMID:38729323
|
研究论文 | 本研究揭示了MIR155HG/miR-155/AZGP1轴在调控增生性瘢痕成纤维细胞中炎症因子产生和α-SMA表达的作用机制 | 首次发现CTGF通过磷酸化STAT3结合MIR155HG启动子刺激其表达，并阐明MIR155HG通过miR-155-5p/-3p靶向AZGP1调控瘢痕形成的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证 | 探究MIR155HG在增生性瘢痕纤维化中的作用机制 | 增生性瘢痕成纤维细胞(HSFBs) | 分子生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, western blotting, ELISA, 双荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 临床HS和正常皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 3468 | 2025-10-06 |
CXCR4-mediated neutrophil dynamics in periodontitis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111212
PMID:38719020
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨CXCR4在牙周炎中调控中性粒细胞动态的关键作用 | 首次系统揭示CXCR4通过调控中性粒细胞动态参与牙周炎发病的新机制 | 研究样本量有限，具体分子机制仍需进一步验证 | 鉴定牙周炎关键免疫相关致病基因并分析免疫细胞浸润特征 | 牙周组织转录组数据、临床样本和牙周炎小鼠模型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,蛋白互作网络分析 | LASSO回归模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | GEO数据库数据集、临床样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3469 | 2025-10-06 |
GeneSurfer Enables Transcriptome-wide Exploration and Functional Annotation of Gene Co-expression Modules in 3D Spatial Transcriptomics Data
2024-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602230
PMID:39005368
|
研究论文 | 介绍GeneSurfer交互式工具，用于探索3D空间转录组数据中的基因共表达模块 | 开发首个用于大规模数据集局部基因共表达探索性分析的交互式界面，支持转录组范围的基因过滤、聚类和功能注释 | NA | 开发工具探索3D空间转录组数据中的局部基因共表达模式 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3470 | 2025-10-06 |
Integration analysis of cell division cycle-associated family genes revealed potential mechanisms of gliomagenesis and constructed an artificial intelligence-driven prognostic signature
2024-07, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111168
PMID:38599441
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研究论文 | 本研究通过整合分析细胞分裂周期相关基因家族，揭示了胶质瘤发生的潜在机制并构建了人工智能驱动的预后特征 | 首次系统研究CDCA基因家族在胶质瘤中的作用，结合多组学分析和机器学习算法构建预后模型 | NA | 阐明CDCA基因家族成员在胶质瘤中的功能和作用机制 | 胶质瘤患者和胶质瘤细胞 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序，生物信息学分析 | 无监督聚类算法，十种机器学习算法 | 多组学数据 | 八个胶质瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | NA |
| 3471 | 2025-10-06 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
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研究论文 | 本研究通过发现MAP3K1基因的新型隐性变异与人类非综合征性耳聋DFNB128的关联，并利用小鼠模型验证其功能 | 首次发现MAP3K1基因隐性变异导致人类非综合征性耳聋，并通过计算模型预测其结构改变与表型的关系 | 研究仅基于一个近亲巴基斯坦家系，样本量有限 | 鉴定导致罕见形式耳聋的新致病基因 | 巴基斯坦近亲家系中的耳聋患者和小鼠耳蜗细胞 | 遗传学 | 耳聋 | 微阵列芯片, 外显子组测序, 单细胞转录组测序 | 计算结构建模 | 基因组数据, 转录组数据 | 一个巴基斯坦家系中的两个同胞群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3472 | 2025-10-06 |
Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells
2024-Apr, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2024.2402191
PMID:39299930
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示癌细胞对羟氯喹耐药的自噬无关转录机制 | 发现羟氯喹耐药主要通过转录可塑性而非自噬途径实现，识别了糖酵解、外泌作用和染色体凝聚/分离等新耐药机制 | 研究仅使用OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞两种细胞系，样本规模有限 | 探究癌细胞对羟氯喹耐药的分子机制 | OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞 | 多组学分析 | 卵巢癌,结直肠癌 | 全基因组筛选,正向遗传筛选,反向遗传筛选,CRISPR-Cas9,RNA-seq,外显子组测序,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | 两种癌细胞系，经过15次药物脉冲追踪处理 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 3473 | 2025-10-06 |
Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions
2024-01-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03159-6
PMID:38217002
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研究论文 | 开发了一种名为niche-DE的空间转录组数据分析方法，用于识别细胞类型特异性空间生态位相关基因 | 首次提出针对细胞-细胞相互作用驱动的局部基因表达变化的分析方法，并开发了配套的niche-LR方法揭示配体-受体信号机制 | NA | 识别空间转录组数据中由细胞间相互作用驱动的局部基因表达变化 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 适用于低分辨率点阵空间转录组数据以及单细胞或亚细胞分辨率数据 |
| 3474 | 2025-10-06 |
Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension
2024, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000539721
PMID:38972305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压小鼠模型中肾淋巴管内皮细胞的基因表达变化 | 首次在高血压模型中系统揭示肾淋巴管内皮细胞的转录组多样性增加和炎症反应特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 评估高血压条件下肾淋巴管内皮细胞的具体变化 | 小鼠肾组织中的CD31+和podoplanin+细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种高血压小鼠模型（血管紧张素II诱导型和盐敏感型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3475 | 2025-10-06 |
A single-cell transposable element atlas of human cell identity
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573568
PMID:38234829
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研究论文 | 开发了用于单细胞转座子元件位点水平分析的工具Stellarscope，并构建了人类PBMC中转座子元件表达的图谱 | 开发了能够将多重比对reads重新分配到特定基因组位点的工具，首次在单细胞水平系统构建了人类转座子元件表达图谱 | NA | 研究转座子元件在人类细胞身份识别中的作用 | 人类外周血单个核细胞(PBMC) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3476 | 2025-10-06 |
Multiomic analyses implicate a neurodevelopmental program in the pathogenesis of cerebral arachnoid cysts
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02238-2
PMID:36879130
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示神经发育程序在脑蛛网膜囊肿发病机制中的作用 | 首次采用系统水平的多组学方法整合三重外显子组测序、单细胞RNA测序和自然语言处理数据研究脑蛛网膜囊肿 | 研究结果为初步发现，需要在适当临床背景下进一步验证 | 阐明脑蛛网膜囊肿的发病机制 | 脑蛛网膜囊肿患者及其父母、人类大脑和小鼠脑膜组织 | 自然语言处理 | 脑蛛网膜囊肿 | 外显子组测序,单细胞RNA测序,自然语言处理 | 无监督聚类 | 基因组数据,转录组数据,医疗记录文本 | 617个患者-父母三重样本,152,898个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 3477 | 2025-10-06 |
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2588274/v1
PMID:36865182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性 | 首次使用基于贴片的scRNA-Seq对稀有再生神经元进行深度测序，发现抗氧化反应和线粒体生物合成在再生中的关键作用，并开发了再生分类器 | 仅对数百个表型鉴定的CST神经元进行测序，样本规模有限 | 探究皮质脊髓神经元再生能力的异质性机制 | 皮质脊髓神经元 | 单细胞基因组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，条件性基因敲除 | 监督分类方法(Garnett) | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的CST神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于贴片的单细胞RNA测序 |
| 3478 | 2025-10-06 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究通过人类扁桃体离体模型探索HIV-1感染在淋巴组织中诱导的特定转录组变化 | 首次在人类扁桃体离体模型中揭示HIV-1感染的CD4+ T细胞氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞的NLRP3炎症小体通路激活 | 研究基于离体模型，可能无法完全反映体内复杂环境；样本来源有限 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其与慢性炎症的关系 | 健康人类供体的扁桃体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类供体的扁桃体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3479 | 2025-10-06 |
Generation of human islet cell type-specific identity genesets
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29588-8
PMID:35440614
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学元分析构建人类胰岛细胞类型特异性基因集 | 开发了比现有基因集更能准确定义胰岛细胞身份的新型基因集，并展示了其在追踪细胞身份变化和揭示遗传机制方面的有效性 | NA | 开发可靠工具评估胰岛细胞身份，为基于细胞的糖尿病治疗提供支持 | 人类α细胞、β细胞、γ细胞和δ细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3480 | 2025-10-06 |
MUC1-C integrates type II interferon and chromatin remodeling pathways in immunosuppression of prostate cancer
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2029298
PMID:35127252
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研究论文 | 本研究揭示MUC1-C蛋白通过整合II型干扰素通路和染色质重塑机制促进前列腺癌免疫抑制 | 首次发现MUC1-C通过调控ARID1A/BAF和NuRD复合物协调II型干扰素通路与染色质重塑的机制关联 | 研究主要基于细胞模型和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明MUC1-C在前列腺癌免疫抑制中的分子机制 | 去势抵抗性前列腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |