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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3461 | 2026-05-05 |
Phase separation of TRNAU1AP protein sustains selenoprotein translation and promotes glioblastoma tumorigenesis
2026-May-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag097
PMID:42080969
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研究论文 | 本研究揭示了TRNAU1AP蛋白通过相分离维持硒蛋白翻译并促进胶质母细胞瘤肿瘤发生的机制 | 首次阐明TRNAU1AP蛋白通过相分离与EEFSEC形成复合体,增强sec-tRNAsec结合促进硒蛋白翻译,并揭示IGF2BP3通过m⁶A依赖的转录稳定上调TRNAU1AP表达的新机制 | 未提及 | 探究TRNAU1AP在胶质母细胞瘤中的功能和调控机制 | 胶质母细胞瘤干细胞和人类GBM组织样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 蛋白质免疫印迹、免疫组化、基因表达谱分析、蛋白质组学、空间转录组学、RNA免疫沉淀、多聚核糖体分析、多组学分析 | NA | 图像、文本 | 人类GBM组织样本和公开数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学用于分析TRNAU1AP介导的硒蛋白合成调控 |
| 3462 | 2026-05-05 |
CSF1R modulates megakaryopoiesis by targeting RUNX1 in immune thrombocytopenia
2026-May-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288511
PMID:41414965
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CSF1R在免疫性血小板减少症中通过靶向RUNX1调控巨核细胞生成的机制 | 首次发现CSF1R作为巨核细胞生成的先前未被识别的调控因子,并验证其作为ITP潜在治疗靶点的可行性 | 基于单个初诊ITP患者的骨髓样本进行scRNA-seq分析,可能限制结果的泛化性 | 阐明免疫性血小板减少症中巨核细胞功能障碍的分子机制 | ITP患者骨髓细胞及巨核细胞、健康对照样本、ITP小鼠模型 | 数字病理学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例初诊ITP患者(scRNA-seq);多个临床样本(流式验证);小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3463 | 2026-05-05 |
Single-cell transcriptomics of chicken ovarian cancer identifying immune subsets with prognostic implications
2026-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106582
PMID:41687260
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建了鸡卵巢癌的单细胞图谱,并鉴定了具有预后意义的免疫亚群 | 首次构建了产蛋鸡卵巢组织的单细胞转录组图谱,验证了鸡作为卵巢癌模型的跨物种保守性,并发现了两个主导性细胞毒性CD8+ T细胞亚群的基因特征在人类卵巢癌数据集中具有相反的预后作用 | 研究仅基于110周龄产蛋鸡的卵巢组织,样本年龄和数量可能有限,且未涉及早期发病机制的动态追踪 | 利用产蛋鸡自然发生的卵巢癌模型,在单细胞水平解析其细胞异质性和肿瘤相关变化,并评估其与人类卵巢癌的跨物种保守性 | 110周龄产蛋鸡的卵巢组织(包括正常和卵巢癌样本) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 110周龄产蛋鸡的卵巢组织样本(包含正常和卵巢癌样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3464 | 2026-05-05 |
Insights into speckled eggs provided by single-cell transcriptomics in high-yield laying hens
2026-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106581
PMID:41687261
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研究论文 | 通过单细胞转录组学解析高产蛋鸡蛋壳斑点现象的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术构建蛋壳斑点相关子宫组织的细胞图谱,鉴定出10种细胞类型及其特异分子特征,揭示斑点组中SPP1基因在所有细胞类型中下调以及WNT、SPP1和BMP介导的细胞增殖分化通路受抑制等新发现 | 未明确说明研究的局限性 | 探究高产蛋鸡蛋壳斑点的遗传结构及其对蛋壳品质的影响机制 | 高产蛋鸡子宫组织细胞 | 单细胞转录组学 | 禽类经济性状相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两组鸡群(根据蛋壳斑点率分组),具体样本数未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics 单细胞RNA测序平台 |
| 3465 | 2026-05-05 |
Deciphering the Impact of RAC1-SPTAN1 in ARPKD Cystogenesis Using Multifaceted Models
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524001
PMID:41742835
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研究论文 | 利用多面模型揭示RAC1-SPTAN1在常染色体隐性遗传多囊肾病囊肿形成中的影响 | 首次发现SPTAN1(一种细胞骨架血影蛋白)作为RAC1激活和囊肿病理的关键调控因子,并通过多面模型(类器官芯片、转基因小鼠和患者样本)验证,还通过单细胞RNA测序鉴定SLC8A1作为区分人肾远端/连接小管与集合管的标志物 | 未明确提及研究局限性 | 探究RAC1-SPTAN1在ARPKD囊肿形成中的机制,并开发潜在治疗策略 | 常染色体隐性遗传多囊肾病囊肿形成机制 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、类器官芯片、CRISPR激活 | NA | 图像、转录组数据 | 患者肾样本、类器官芯片模型、转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3466 | 2026-05-05 |
Defocus coding and transcriptomic remodeling in the mouse myopic retina
2026-May-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00011.2026
PMID:41910002
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研究论文 | 通过全细胞记录和单细胞RNA测序,研究小鼠视网膜在离焦状态下如何感知信号并转化为生长调节基因信号 | 首次揭示水平细胞而非AII无长突细胞对光学离焦有响应,并发现多巴胺能无长突细胞在聚焦图像时最兴奋,高模糊时受抑制,同时展示了透镜诱导近视视网膜中细胞类型特异性的基因表达重塑 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证,且透镜诱导近视可能不完全代表自然近视过程 | 阐明视网膜如何感知聚焦与离焦信号并将其转化为调节生长的基因信号 | 小鼠视网膜中的水平细胞、AII无长突细胞和多巴胺能无长突细胞 | 分子生物学 | 近视 | 全细胞记录, 单细胞RNA测序 | NA | 电生理记录数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜细胞,具体样本数未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3467 | 2026-05-05 |
Deciphering functional intra-tumoral heterogeneity in BRAFV600E-driven mouse thyroid cancer reveals EMT trajectory and metabolic remodeling
2026-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03742-8
PMID:41935217
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌,揭示功能性瘤内异质性、上皮-间充质转化轨迹及代谢重塑 | 首次在BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌模型中,利用单细胞RNA测序解析恶性甲状腺细胞的转录异质性和层级演化轨迹,并发现二甲双胍可减少最恶性亚群,同时揭示p53缺失通过代谢可塑性促进恶性转化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体样本中进行充分验证;p53缺失的影响仅在体外分析中验证,体内机制需进一步研究 | 解析BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌中恶性细胞的功能异质性和演化轨迹,为靶向上皮-间充质转化(EMT)的治疗提供理论基础 | BRAFV600E驱动的小鼠甲状腺癌细胞及类器官培养系统 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年发病的自发性小鼠甲状腺癌模型(BRAFV600E驱动)及类器官培养样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 3468 | 2026-05-05 |
Dimethyl fumarate attenuates subcutaneous adipose tissue inflammation in psoriasis
2026-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2026.119343
PMID:41962229
|
研究论文 | 本研究探究了富马酸二甲酯对银屑病患者皮下脂肪组织炎症的缓解作用及机制 | 首次联合空间转录组、批量RNA测序及体外模型,揭示富马酸二甲酯通过抑制NF-κB信号通路减轻银屑病皮下脂肪组织炎症 | 样本量小(6例患者)且缺乏长期随访数据 | 探究富马酸二甲酯治疗银屑病时对皮下脂肪组织炎症的影响及潜在机制 | 银屑病患者的皮下脂肪组织,以及鼠3T3-L1脂肪细胞和人脂肪细胞分化模型 | 数字病理学 | 银屑病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 6名中重度斑块型银屑病患者(其中4名进行脂肪活检) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学分析公开数据 |
| 3469 | 2026-05-05 |
Evidence of off-target probe binding affecting 10x Genomics Xenium gene panels compromise accuracy of spatial transcriptomic profiling
2026-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107070
PMID:42065925
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研究论文 | 通过开发离线探针追踪工具(OPT),验证10x Genomics Xenium平台存在脱靶结合,并评估其对空间转录组分析准确性的影响 | 首次系统评估Xenium探针的脱靶结合现象,开发OPT工具通过多参考基因组比对预测脱靶位点,并结合正交实验验证其生物学效应 | 仅使用乳腺癌数据集验证,未涵盖其他组织类型;脱靶预测依赖参考基因组的完整性和注释质量 | 评估探针型空间转录组技术中脱靶结合对基因表达谱准确性的影响 | 10x Genomics Xenium技术的探针结合特异性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 序列比对算法 | 基因表达数据 | 1个乳腺癌肿瘤块样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium, Visium CytAssist, 3'单细胞RNA-seq | Xenium人类乳腺基因面板、Visium CytAssist空间转录组、3'单细胞RNA-seq |
| 3470 | 2026-05-05 |
Niacin promotes motor function recovery after spinal cord injury via Hcar2-dependent microglia immunometabolic regulation
2026-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70683
PMID:42068080
|
研究论文 | 探讨烟酸通过Hcar2依赖的小胶质细胞免疫代谢调控促进脊髓损伤后运动功能恢复的作用 | 首次发现Hcar2作为脊髓损伤后小胶质细胞中保守的代谢检查点,通过免疫代谢重编程将促炎表型转化为抗炎表型,并用烟酸激活Hcar2来改善运动功能恢复 | 未明确说明主要局限性,但依赖小鼠和猕猴模型,体外实验使用BV2细胞系,可能不完全反映人类病理过程 | 研究Hcar2在脊髓损伤中的作用及其通过烟酸激活对运动功能恢复的影响 | 小鼠和恒河猴的脊髓损伤模型,以及LPS诱导的BV2小胶质细胞模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫荧光染色,Western印迹,实时聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 公开的小鼠和恒河猴单细胞RNA测序数据集,小鼠体内模型和BV2细胞体外模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3471 | 2026-05-05 |
Excitatory neurons and astrocytes-specific dysregulation and aberrant interactions are vulnerable to FCDI as suggested by single-cell spatial transcriptomics
2026-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70673
PMID:42068085
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学分析,揭示FCDI中兴奋性神经元和星形胶质细胞的特异性失调及异常相互作用 | 构建了FCDI患者致癫痫皮层的单细胞空间转录组图谱,首次识别CBLN2highEx-1亚群在神经元过度兴奋和皮层发育中的潜在作用,并发现了兴奋性神经元与星形胶质细胞间的异常信号通路和空间共定位模式 | 样本量较小(仅3例FCDI患者和3例对照),且未提及验证队列或功能实验的直接因果证据 | 探索FCDI的分子机制,特别是兴奋性神经元和星形胶质细胞的失调及其细胞间通讯异常 | FCDI患者的致癫痫皮层组织和相对正常的皮层对照组织 | 数字病理学 | 局灶性皮质发育不良I型(癫痫相关神经发育障碍) | 单核RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质印迹, 免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 3例FCDI患者和3例对照的皮层组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3472 | 2026-05-05 |
Integrated Single-Cell Whole-Genome Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal Intratumoral Heterogeneity in Ovarian Cancer
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0795
PMID:42007974
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研究论文 | 本研究通过单细胞全基因组测序和空间转录组学分析揭示了卵巢癌的瘤内异质性 | 首次整合单细胞全基因组测序与空间转录组学,从基因组和转录组两个层面解析卵巢癌瘤内异质性,并发现基因组不稳定性驱动的克隆异质性与可塑性 | 仅纳入五例晚期初治原发性上皮性卵巢癌样本,样本量较小;研究未涉及肿瘤微环境对异质性的影响 | 探究卵巢癌中由基因组不稳定性驱动的瘤内异质性及其对疾病复发和治疗失败的影响 | 五例晚期初治原发性上皮性卵巢癌(包括高级别浆液型和透明细胞型)样本 | 基因组学, 空间转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞DNA测序数据, 空间转录组数据 | 5例卵巢癌组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 3473 | 2026-05-05 |
Normalization choice drives biological interpretation in single-cell RNA-seq cancer studies: A systematic benchmarking of 465 computational pipelines
2026-May-01, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 系统比较单细胞RNA-seq数据分析中不同计算流程对生物学解释的影响 | 引入生物不一致性评分(BDS)来量化标记基因解释在不同分析流程中的变化,发现归一化方法选择对生物学解释的影响大于聚类算法选择,且高聚类一致性的流程可能识别出高达86%不同的标记基因 | 未提及具体局限性 | 评估单细胞RNA-seq数据分析中计算流程选择对肿瘤研究生物学结论的影响 | 3个癌症数据集,涵盖超过43.4万个细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过43.4万个细胞(来自3个癌症数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3474 | 2026-05-05 |
Unraveling the role of non-coding RNAs in Parkinson's disease: Molecular mechanisms and therapeutic insights
2026-Apr-30, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106963
PMID:42067182
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综述 | 本文系统总结了非编码RNA(miRNA、lncRNA和circRNA)在帕金森病发病机制中的分子调控作用,并探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 整合了从单细胞测序和多组学数据中发现的非编码RNA细胞特异性失调模式,并提出了基于ncRNA的分子分层和靶向治疗策略 | 未涉及非编码RNA在帕金森病中直接用于临床治疗的验证数据,也缺乏跨病理阶段的纵向研究支持 | 阐明非编码RNA在帕金森病中的分子机制及其作为早期诊断和治疗靶点的潜力 | 帕金森病患者脑组织中的非编码RNA(miRNA、lncRNA和circRNA)及其调控网络 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 3475 | 2026-05-05 |
Kidney Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Contribute to Myeloid Development and Pathology in Lupus Nephritis
2026-Apr-28, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70201
PMID:42047318
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研究论文 | 探讨肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎中对髓系发育和病理的贡献 | 首次证明肾脏中的造血干细胞和祖细胞参与髓外造血,并通过局部髓系细胞扩增促进狼疮性肾炎进展 | 主要基于小鼠模型,人源样本分析有限,可能需要进一步验证临床相关性 | 研究髓外造血和肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用 | 狼疮性肾炎小鼠模型(MRL/lpr和TLR7激动剂诱导)及患者尿液样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、免疫染色、过继转移实验 | NA | 序列数据、图像数据 | 两种小鼠模型及狼疮性肾炎患者尿液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于肾脏和骨髓祖细胞分析 |
| 3476 | 2026-05-05 |
scSketch: Interactive Sketch-based Trajectory Exploration and Pathway-Aware Analysis of Single-Cell Data
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718997
PMID:42079097
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研究论文 | scSketch是一个交互式工具,允许用户通过草图轨迹探索单细胞数据中的基因表达梯度并进行通路感知分析 | 首次允许用户通过绘制轨迹交互式探索单细胞数据,并在迭代探索中保持统计有效性和生物学可解释性,同时自动计算基因-轨迹相关性并应用在线错误发现率控制 | NA | 开发一个能够交互式探索单细胞数据中轨迹假设并保持统计有效性和生物学可解释性的工具 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达梯度及细胞状态转变过程 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3477 | 2026-05-05 |
Interpreting and Validating a Deep Learning Model Predictive of Spatial Morphologic-Molecular Patterns in Lung Adenocarcinoma, Using Ground Truth Immunohistochemistry Images
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.719723
PMID:42079136
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研究论文 | 开发并验证了深度学习模型XpressO-Lung,该模型利用常规H&E染色的全切片图像预测肺腺癌中空间形态-分子模式,并通过免疫组化在外部临床样本中验证 | 首次实现通过常规病理切片预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性,无需空间转录组学技术,且模型具有可解释性 | 训练样本仅来自TCGA的200例肺腺癌病例,可能存在选择偏倚;预测基因数量有限;AUC范围0.64-0.92,部分基因预测性能中等 | 开发可解释的深度学习模型,通过学习组织形态与批量转录组数据的关联,在常规病理切片上预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性 | 肺腺癌肿瘤组织及其微环境中的空间基因表达模式 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | 可解释深度学习模型 | 图像 | 200例TCGA肺腺癌病例用于训练,外部验证集来自Dartmouth Health的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3478 | 2026-05-05 |
Single-cell profiling reveals epithelial and immune responses in BK polyomavirus-infected human kidney biopsies
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198227
PMID:41818285
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BK多瘤病毒感染人肾活检组织中的上皮和免疫反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示BK病毒感染不同阶段(病毒滴度上升期和消退期)中肾小管上皮细胞和免疫细胞的动态分子变化 | 横断面研究设计无法观察纵向动态变化,且体外细胞培养模型未能完全模拟体内代谢适应和免疫反应 | 阐明BK多瘤病毒感染导致肾损伤的分子机制,为临床管理提供新见解 | 肾移植活检组织中的上皮细胞和免疫细胞 | 机器学, 数字病理学 | BK病毒性肾病,肾移植并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未感染者对照和BK病毒感染两个阶段(病毒滴度上升期和消退期)的肾移植活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3479 | 2026-05-05 |
Spatial proteomic mapping of the human and mouse retina using IBEX
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.204535
PMID:42018650
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研究论文 | 使用IBEX技术生成人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱 | 将抗体解离选项与化学漂白相结合,实现同一宿主物种抗体的灵活使用,并将其与超分辨率成像耦合,揭示了视网膜细胞群体和外界膜的超微结构特征 | NA | 绘制人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱,并探究外界膜的结构组成 | 人和小鼠视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 多重免疫组织化学 IBEX | NA | 图像 | 健康人和野生型小鼠视网膜,以及Crb1rd8小鼠模型 | NA | 空间蛋白质组学 | NA | IBEX 超分辨率成像 |
| 3480 | 2026-05-05 |
FOSL2 regulates endothelial cell state and chromatin accessibility in systemic sclerosis pulmonary vascular remodeling
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189107
PMID:42018656
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研究论文 | 探究FOSL2在系统性硬化症肺部血管重塑中调控内皮细胞状态和染色质可及性的作用 | 首次通过多组学数据、转基因小鼠模型和深度学习模型ChromBPNet,揭示FOSL2在系统性硬化症相关肺动脉高压中调控内皮细胞表型的关键机制 | 未明确说明研究限制 | 阐明FOSL2在系统性硬化症肺部血管病变中对内皮细胞表型和染色质可及性的调控机制 | 系统性硬化症合并间质性肺病和肺动脉高压患者肺部组织、Fosl2转基因小鼠、Sugen/缺氧及缺氧处理小鼠、原代血管内皮细胞 | 数字病理学 | 血管疾病, 肺病, 自身免疫病 | 多组学分析、单细胞RNA测序、深度学习模型 | ChromBPNet | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 系统性硬化症患者肺部样本及多种小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |