单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3441	2025-05-02	Single-cell transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and the potential roles of cancer stem cells and myCAFs in colorectal cancer liver metastasis and recurrence 2025-Mar-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217452 PMID:39805388	研究论文	通过单细胞转录组学揭示结直肠癌肝转移和复发中的肿瘤内异质性以及癌症干细胞和肌成纤维细胞样CAFs的潜在作用	首次在单细胞分辨率下揭示结直肠癌肝转移中的癌症干细胞样细胞群与肌成纤维细胞样CAFs之间的新型细胞互作机制	未明确验证FN1-CD44和GDF15-TGFBR2配体-受体对在肝转移过程中的具体功能机制	探究结直肠癌肝转移和复发的分子机制	结直肠癌原发灶和肝转移灶的肿瘤细胞及肿瘤微环境	单细胞组学	结直肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量（原发性和转移性结直肠癌组织样本）
3442	2025-05-02	Mannose Promotes β-Amyloid Pathology by Regulating BACE1 Glycosylation in Alzheimer's Disease 2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202409105 PMID:39807036	research paper	该研究探讨了甘露糖通过调节BACE1糖基化促进阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白病理的作用	揭示了甘露糖通过影响BACE1和Nicastrin的N-糖基化增强其蛋白稳定性，从而促进Aβ产生的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本数据有限	探究甘露糖在阿尔茨海默病病理进展中的作用机制	AD小鼠模型和AD患者血清样本	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、代谢组学分析	小鼠疾病模型	分子生物学数据、行为学数据	AD小鼠和AD患者血清样本（具体数量未明确说明）
3443	2025-05-02	New Multiomic Studies Shed Light on Cellular Diversity and Neuronal Susceptibility in Parkinson's Disease 2025-Mar, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society IF:7.4Q1 DOI:10.1002/mds.30097 PMID:39812497	研究论文	本文探讨了帕金森病中细胞多样性和神经元易感性的多组学研究	利用多组学方法（包括空间转录组学、表观基因组学和蛋白质组学）研究帕金森病，揭示了致病机制的新见解	未提及具体样本量或实验设计的局限性	研究帕金森病的致病机制和开发新型治疗方法	帕金森病患者和啮齿动物模型中的神经元和胶质细胞	数字病理学	帕金森病	单细胞RNA测序、空间转录组学、表观基因组学、蛋白质组学	NA	多组学数据	NA
3444	2025-05-02	Metabolic reprogramming in astrocytes prevents neuronal death through a UCHL1/PFKFB3/H4K8la positive feedback loop 2025-Feb-27, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01467-x PMID:40016338	研究论文	本研究探讨了星形胶质细胞代谢重编程在脊髓损伤(SCI)后通过UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路防止神经元死亡的机制	揭示了UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路在星形胶质细胞代谢重编程中的关键作用及其对神经元存活的保护机制	研究主要基于体外和动物模型，尚未在人体中进行验证	阐明星形胶质细胞代谢重编程在脊髓损伤后神经元保护中的作用机制	星形胶质细胞和神经元	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	NA
3445	2025-05-02	Anxiety-like behavior and altered hippocampal activity in a transgenic mouse model of Fabry disease 2025-Feb, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106797 PMID:39788162	research paper	该研究通过转基因法布里病小鼠模型，探讨了法布里病与焦虑样行为及海马功能异常之间的关系	首次结合行为学、转录组学、功能和形态学评估，揭示了法布里病小鼠海马区神经元和非神经元细胞群的转录和功能改变与焦虑样行为的关联	研究仅使用雄性小鼠，未探讨性别差异；结果主要基于小鼠模型，人类患者中的直接应用需进一步验证	探究法布里病神经精神症状的病理机制，特别是焦虑样行为与海马功能异常的关系	转基因法布里病小鼠模型	神经科学	法布里病	行为学测试（开放场地测试、Barnes迷宫）、单细胞测序、电生理记录	转基因小鼠模型	行为数据、转录组数据、电生理数据	未明确说明小鼠数量，但涉及多组学分析
3446	2025-05-02	Single-cell RNA sequencing of the spleen reveals differences in Salmonella typhimurium infection mechanisms between different chicken breeds 2025-Feb, Poultry science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.psj.2024.104669 PMID:39793244	研究论文	通过单细胞RNA测序技术比较了北京油鸡和科宝肉鸡在沙门氏菌感染后脾脏免疫反应的差异	首次对鸡脾脏进行单细胞转录组分析，并比较了不同品种鸡的免疫反应差异	研究仅针对两种鸡品种，结果可能不具有普遍性	探究不同品种鸡对沙门氏菌感染的免疫反应机制差异	北京油鸡和科宝肉鸡的脾脏CD45+免疫细胞	单细胞转录组学	沙门氏菌感染	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	54,487个细胞，来自两个鸡品种
3447	2025-05-02	Mechanisms and strategies of immunosenescence effects on non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment: A comprehensive analysis and future directions 2025-Feb, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.semcancer.2025.01.001 PMID:39793777	综述	本文全面分析了免疫衰老对非小细胞肺癌（NSCLC）治疗的影响机制及策略，并探讨了未来研究方向	深入探讨了免疫衰老在NSCLC中的作用机制，并提出了针对老年患者的免疫治疗优化策略	主要基于现有文献分析，缺乏实验数据验证	探讨免疫衰老对NSCLC治疗的影响及优化策略	非小细胞肺癌（NSCLC）患者，特别是老年患者	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞测序、CRISPR-Cas9	NA	文献数据	NA
3448	2025-05-02	Combined analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics reveals the expression patterns of lipid metabolism and ferroptosis in the immune microenvironment of metabolic-associated fatty liver disease 2025-Feb-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123377 PMID:39793853	研究论文	通过整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，研究脂质代谢和铁死亡在代谢相关脂肪性肝病（MAFLD）免疫微环境中的表达模式及其作用	首次整合多种测序技术揭示脂质代谢和铁死亡相关基因在MAFLD免疫微环境中的作用，并构建风险评估系统和预测模型	研究样本可能有限，且需要进一步实验验证基因功能	识别与铁死亡和脂质代谢相关的关键生物标志物，并探讨它们在MAFLD进展中的作用	代谢相关脂肪性肝病（MAFLD）患者的肝脏样本	数字病理学	代谢相关脂肪性肝病	单细胞RNA测序、bulk RNA测序、空间转录组学、WGCNA	预测模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
3449	2025-05-02	Spatial transcriptomic characterization of a Carnegie stage 7 human embryo 2025-Feb, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-024-01597-3 PMID:39794460	研究论文	利用空间转录组学技术分析了一个完整的人类胚胎在单细胞分辨率下的基因表达模式	首次在Carnegie第7阶段的人类胚胎中应用空间转录组学技术，揭示了中胚层亚型的早期特化和原始生殖细胞的位置	研究样本有限，仅分析了两个胚胎	增进对人类原肠胚形成阶段发育过程的理解	Carnegie第7阶段的人类胚胎	发育生物学	NA	空间转录组学(Stereo-seq), 免疫荧光验证	NA	空间转录组数据, 图像数据	2个人类胚胎(1个用于空间转录组分析,1个用于免疫荧光验证)
3450	2025-05-02	Single-cell RNA sequencing reveals intrahepatic signature related to pathobiology of duck hepatitis A virus type 3 (DHAV-3) infection 2025-Feb, Poultry science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.psj.2025.104798 PMID:39799860	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示了与鸭甲型肝炎病毒3型（DHAV-3）感染病理生物学相关的肝内特征	首次应用单细胞RNA测序技术分析DHAV-3易感和抗性鸭子的肝脏转录组，揭示了干扰素途径激活、Kupffer细胞的促炎表型及PLAC8等宿主因子在病毒感染中的作用	样本量相对较小（14只感染鸭子和4只健康对照），且仅关注了肝脏组织	解析DHAV-3感染鸭子的分子特征及其病理生物学机制	DHAV-3易感和抗性鸭子的肝脏细胞	基因组学	鸭病毒性肝炎	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	14只感染鸭子和4只健康对照鸭子的140万个肝脏细胞
3451	2025-05-02	Left superior cervical ganglia lymph node mimicry and its role in rat ventricular arrhythmias following myocardial infarction 2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England) DOI:10.1111/apha.14279 PMID:39803764	research paper	研究探讨了左颈上神经节（LSCG）在心肌梗死（MI）后心室心律失常（VAs）中的作用及其神经-心脏通讯的功能意义	揭示了LSCG在MI后心律失常和心脏炎症/功能中的参与机制，以及神经生长因子（NGF）在神经-免疫串扰中的桥梁作用	研究仅基于大鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究MI后LSCG对神经-心脏通讯的影响及其在心律失常中的作用	MI大鼠模型	心血管疾病	心血管疾病	RNA-seq, 空间转录组学, 定量PCR, 蛋白质印迹	NA	基因表达数据, 蛋白质数据	NA
3452	2025-05-02	Specialized pericyte subtypes in the pulmonary capillaries 2025-Feb, The EMBO journal DOI:10.1038/s44318-024-00349-1 PMID:39806101	research paper	该研究通过生物信息学分析和RNAscope技术，鉴定了Higd1b作为周细胞的独特基因标记，并揭示了肺和心脏中两种不同的Higd1b+周细胞亚型	发现Higd1b作为周细胞的独特基因标记，并生成Higd1b-CreERT2敲入小鼠系，揭示了两种功能不同的周细胞亚型	研究主要基于小鼠模型，人类周细胞的研究数据相对有限	探究周细胞在肺毛细血管中的生物学特性和功能	肺和心脏中的周细胞	细胞生物学	肺动脉高压	生物信息学分析, RNAscope, 单细胞RNA测序	Higd1b-CreERT2敲入小鼠	基因表达数据	小鼠模型和健康人肺周细胞
3453	2025-05-02	Promising Nanoparticles-Based Oral Therapy for Effective Inhibition of Hepatocellular Carcinoma with Portal Vein Tumor Thrombus 2025-Jan-29, Nano letters IF:9.6Q1 DOI:10.1021/acs.nanolett.4c05798 PMID:39808085	research paper	开发了一种基于纳米颗粒的口服疗法，用于有效抑制伴有门静脉癌栓的肝细胞癌	利用CaCO@PDA纳米颗粒封装多柔比星盐酸盐和低分子量肝素，靶向肿瘤血栓微环境，提高口服给药效率	NA	开发一种方便、简单、生物安全且提高患者依从性的口服药物递送系统，用于治疗伴有门静脉癌栓的肝细胞癌	肝细胞癌（HCC）患者，特别是伴有门静脉癌栓（PVTT）的患者	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
3454	2025-05-02	The chromatin remodeler ADNP regulates neurodevelopmental disorder risk genes and neocortical neurogenesis 2025-Jan-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2405981122 PMID:39808658	研究论文	研究染色质重塑子ADNP在神经发育障碍风险基因和新皮质神经发生中的作用	揭示了ADNP通过两步过程调控新皮质发育中上层神经元的产生，并定义了ADNP和Chd4调控的与神经发育障碍相关的风险基因网络	研究主要基于小鼠模型，人类神经发育障碍的机制可能有所不同	探究染色质重塑子ADNP在神经发育障碍中的作用机制	ADNP基因、ChAHP染色质重塑复合物、新皮质发育	神经生物学	神经发育障碍	单细胞转录组学、cut&run-seq、组织学方法	条件性突变小鼠模型	基因表达数据、染色质结合数据	NA
3455	2025-05-02	High cellular plasticity state of medulloblastoma local recurrence and distant dissemination 2025-Jan-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101914 PMID:39809264	研究论文	该研究通过单细胞/核RNA测序、单核转座酶可及染色质测序和空间转录组学分析，揭示了髓母细胞瘤复发和扩散过程中的细胞多样性和遗传特征	发现了一种名为'高细胞可塑性（HCP）'的亚群，该亚群在髓母细胞瘤进展过程中出现，并与复发相关	研究主要基于临床前模型，尚未在人类临床试验中验证	理解髓母细胞瘤复发和扩散的细胞多样性、染色体改变和生物动力学	髓母细胞瘤（SHH和Group_3亚组）的局部复发和扩散病灶	数字病理学	髓母细胞瘤	sc/snRNA-seq, snATAC-seq, 空间转录组学	NA	单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据、空间转录组数据	未明确说明样本数量，但涉及SHH和Group_3亚组的髓母细胞瘤样本
3456	2025-05-02	De novo root regeneration from leaf explant: a mechanistic review of key factors behind cell fate transition 2025-Jan-14, Planta IF:3.6Q1 DOI:10.1007/s00425-025-04616-1 PMID:39808280	综述	本文综述了从叶片外植体进行新生根再生的机制，重点探讨了细胞命运转变的关键因素	提出了更新的新生根再生模型，包括基因调控网络，并探讨了特殊细胞、活性氧、乙烯和茉莉酸在其中的作用	这些假设的特殊细胞的信号机制需要进一步研究，以完全理解新生根再生的机制	探讨新生根再生的细胞和分子框架，特别是在拟南芥叶片外植体中的应用	拟南芥叶片外植体	植物生物学	NA	单细胞测序	NA	转录组数据	NA
3457	2025-05-02	Single cell transcriptomics in blood of patients with chronic obstructive pulmonary disease 2025-Jan-14, BMC pulmonary medicine IF:2.6Q2 DOI:10.1186/s12890-024-03475-y PMID:39810158	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析慢性阻塞性肺疾病患者外周血中的基因表达差异	首次在慢性阻塞性肺疾病患者外周血中使用单细胞RNA测序技术，揭示了单核细胞/巨噬细胞中的基因表达差异	样本量较小（7名健康对照和8名COPD患者），可能影响结果的普遍性	研究慢性阻塞性肺疾病患者外周血中的基因表达差异	慢性阻塞性肺疾病患者和健康对照者的外周血单核细胞	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	7名健康对照和8名COPD患者的外周血样本
3458	2025-05-02	Single-cell transcriptomics unveils multifaceted immune heterogeneity in early-onset versus late-onset cervical cancer 2025-Jan-14, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1 DOI:10.1186/s12957-025-03654-z PMID:39810181	研究论文	通过单细胞转录组学分析，揭示了早发性和晚发性宫颈癌在免疫异质性方面的多重差异	首次在单细胞水平上比较了早发性和晚发性宫颈癌的免疫架构，揭示了两种亚型在免疫细胞表型和功能上的显著差异	样本量较小（仅4例EOCC和4例LOCC样本），可能影响结果的普遍性	探究早发性和晚发性宫颈癌的免疫异质性	早发性宫颈癌（EOCC）和晚发性宫颈癌（LOCC）患者的肿瘤组织	单细胞转录组学	宫颈癌	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	4例EOCC和4例LOCC样本
3459	2025-05-02	Metabolically activated and highly polyfunctional intratumoral VISTA+ regulatory B cells are associated with tumor recurrence in early-stage NSCLC 2025-Jan-14, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02209-2 PMID:39810191	research paper	该研究探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境（TME）中B细胞的表型、生物能量学及其与T细胞的相互作用	首次揭示了VISTA Bregs在NSCLC中的代谢活化和高度多功能性，及其与肿瘤复发的关联	研究样本量未明确提及，且机制研究仍需进一步验证	探究NSCLC中B细胞的表型特征、代谢状态及其与T细胞的相互作用	非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤微环境中的B细胞和T细胞	肿瘤免疫学	肺癌	多色流式细胞术、质谱流式细胞术、空间转录组学、靶向液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）	NA	细胞表型数据、代谢数据、空间转录组数据	NA
3460	2025-05-02	SenPred: a single-cell RNA sequencing-based machine learning pipeline to classify deeply senescent dermal fibroblast cells for the detection of an in vivo senescent cell burden 2025-Jan-14, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01418-0 PMID:39810225	研究论文	介绍了一种基于单细胞RNA测序的机器学习流程SenPred，用于分类深度衰老的皮肤成纤维细胞，以检测体内衰老细胞负担	开发了SenPred流程，利用单细胞转录组数据准确预测成纤维细胞衰老，特别是在3D培养条件下提高了体内衰老细胞的检测能力	模型仅适用于人类皮肤成纤维细胞的衰老检测，对肺成纤维细胞或全皮肤样本的衰老检测效果不佳	开发一个机器学习流程来准确检测和分类衰老的成纤维细胞	深度衰老的皮肤成纤维细胞	数字病理学	老年疾病	scRNA-seq	机器学习流程	单细胞转录组数据	2D和3D培养的深度衰老成纤维细胞的scRNA-seq数据