单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3441	2025-03-22	Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response 2024-01-12, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930 PMID:38215193	研究论文	本文研究了胸腺再生机制，特别是通过ILC2介导的2型免疫反应中胸腺绒毛细胞和成纤维细胞的作用	揭示了胸腺绒毛细胞和成纤维细胞通过激活2型免疫反应在胸腺再生中的新角色	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探讨胸腺再生的机制，特别是非T细胞的胸腺造血细胞的作用	小鼠胸腺细胞，特别是ILC2、胸腺绒毛细胞和成纤维细胞	免疫学	NA	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型
3442	2025-03-22	Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche 2024-01-05, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152 PMID:38181095	研究论文	本文探讨了皮肤中调节性T细胞（Treg）在维持毛囊干细胞（HFSC）生态位免疫特权中的作用	开发了一种技术，将基因重组限制在皮肤中的调节性T细胞，揭示了皮肤Treg通过高亲和力IL-2受体表达在细胞外方式中保护HFSC生态位的机制	研究主要集中在皮肤中的Treg，未涉及其他非淋巴器官中的免疫耐受机制	研究皮肤中调节性T细胞在维持毛囊干细胞生态位免疫特权中的作用	皮肤中的调节性T细胞和毛囊干细胞生态位	免疫学	脱发症	基因重组技术、空间转录组学	NA	基因表达数据、空间转录组数据	NA
3443	2025-03-22	Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0298133 PMID:38363768	研究论文	本研究探讨了clusterin (CLU)在调控von Willebrand因子(VWF)中的作用，特别是在von Willebrand病(VWD)中的影响	首次通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析识别CLU作为VWF的潜在调控因子，并使用siRNA和CRISPR-Cas9技术在人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)中进行验证	研究未发现CLU敲低对Weibel-Palade小体(WPBs)的数量或大小有显著影响，且未探讨CLU在其他类型细胞中的作用	研究CLU在VWF调控中的作用，特别是在VWD中的机制	人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)	分子生物学	von Willebrand病	siRNA, CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据, 蛋白质水平数据	人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)
3444	2025-03-22	Early human lung immune cell development and its role in epithelial cell fate 2023-12-15, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adf9988 PMID:38100545	研究论文	本文研究了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育及其对上皮细胞命运的影响	首次系统性地描述了人类胚胎和胎儿肺免疫细胞的发育过程，并探讨了免疫细胞在肺上皮细胞成熟中的作用	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序，体内实验的证据尚不充分	探讨人类肺发育过程中免疫细胞的作用及其对上皮细胞命运的影响	人类胚胎和胎儿肺免疫细胞及上皮细胞	发育生物学	NA	scRNA-seq, smFISH, 免疫组织化学	NA	单细胞RNA测序数据, 图像数据	人类胚胎和胎儿肺组织样本
3445	2025-03-22	p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression 2023-Jul, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06253-8 PMID:37468633	研究论文	本文探讨了p53在肺腺癌（LUAD）抑制中的作用，特别是通过调控肺泡1型（AT1）细胞分化来抑制LUAD的发展	揭示了p53通过调控细胞状态，特别是促进AT1细胞分化来抑制LUAD的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类LUAD中的具体机制仍需进一步验证	研究p53在肺腺癌（LUAD）抑制中的具体机制	肺腺癌（LUAD）细胞和小鼠模型	癌症研究	肺癌	RNA测序、ATAC测序、单细胞转录组分析	小鼠模型	基因表达数据、染色质重塑数据	使用表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠模型
3446	2025-03-22	Ornithine decarboxylase supports ILC3 responses in infectious and autoimmune colitis through positive regulation of IL-22 transcription 2022-Nov-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2214900119 PMID:36279426	研究论文	本文研究了第3组先天淋巴细胞（ILC3s）在感染性和自身免疫性结肠炎中通过正调控IL-22转录的机制	揭示了ILC3s通过多胺生物合成途径增强IL-22产生的新机制，并发现鸟氨酸脱羧酶（ODC1）在这一过程中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨ILC3s在感染性和自身免疫性结肠炎中的代谢适应及其对IL-22产生的影响	第3组先天淋巴细胞（ILC3s）	免疫学	结肠炎	单细胞RNA测序和代谢组学分析	NA	RNA测序数据和代谢组数据	小鼠模型
3447	2025-03-21	Single-cell RNA sequencing-guided engineering of mitochondrial therapies for intervertebral disc degeneration by regulating mtDNA/SPARC-STING signaling 2025-Jun, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.036 PMID:40104024	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据指导，开发了一种针对椎间盘退变的仿生疗法，并在动物模型中进行了验证	提出了线粒体移植作为一种新的治疗策略，并设计了具有抗氧化和抗炎活性的生物活性大分子，增强了治疗效果	研究主要基于动物模型，尚未在人类临床试验中验证其安全性和有效性	开发针对椎间盘退变的新型治疗方法	人类髓核组织和动物模型	数字病理	椎间盘退变	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	人类髓核组织和动物模型
3448	2025-03-21	Double-target magnetic stimulation attenuates oligodendrocyte apoptosis and oxidative stress impairment after spinal cord injury via GAP43 2025-Apr, The spine journal : official journal of the North American Spine Society DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.025 PMID:39701305	研究论文	本研究评估了双靶点（大脑和脊髓）磁刺激（DTMS）治疗对脊髓损伤（SCI）大鼠的功能恢复和神经回路改善的影响，并探讨了DTMS对胶质细胞调节的作用	揭示了DTMS通过调节GAP43在少突胶质细胞中的抗凋亡和抗氧化应激作用，促进少突胶质细胞的分支和成熟以及轴突再生，从而改善SCI后的神经回路功能	研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证	评估DTMS对脊髓损伤后功能恢复和神经回路改善的影响，并探讨其作用机制	脊髓损伤模型大鼠	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序、透射电子显微镜、Western blotting、免疫荧光染色、TUNEL染色、Annexin V-FITC凋亡试剂盒、脂质ROS试剂盒	NA	行为评估数据、组织染色数据、单细胞RNA测序数据	脊髓损伤模型大鼠
3449	2025-03-21	Trends in Research of Odontogenic Keratocyst and Ameloblastoma 2025-Apr, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241282256 PMID:39876078	综述	本文综述了牙源性角化囊肿（OKC）和成釉细胞瘤（AM）研究的最新进展和趋势	利用单细胞和空间组学技术深入理解OKC和AM的肿瘤微环境和细胞异质性，以及3D培养技术在AM亚型分析中的应用	尽管AM已有可靠的临床前模型，但OKC的可靠体外和体内模型仍然稀缺	探讨OKC和AM的生物学行为机制及其潜在治疗靶点	牙源性角化囊肿（OKC）和成釉细胞瘤（AM）	数字病理学	口腔颌面部疾病	单细胞组学、空间转录组学、3D培养技术、人工智能（机器学习和深度学习）	NA	NA	NA
3450	2025-03-21	SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis 2025-Apr, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331 PMID:40023001	研究论文	本研究探讨了SPRY1在皮肤老化中的作用，特别是其对巨噬细胞M1极化的影响，并探索其作为缓解皮肤老化和黑色素瘤治疗靶点的潜力	首次揭示了SPRY1在皮肤老化中的关键作用，特别是通过促进巨噬细胞M1极化加速皮肤老化，并发现其在黑色素瘤中的表达与患者生存率相关	研究主要基于体外实验，缺乏体内验证，未来需要进一步探索其调控网络	研究SPRY1在皮肤老化中的功能及其作为治疗靶点的潜力	RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞	生物信息学	黑色素瘤	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、基因转染、CCK-8实验、qRT-PCR、ROS和SOD活性测量	NA	基因表达数据、细胞实验数据	GTEx和GEO数据库中的数据集，以及RAW264.7和NIH/3T3细胞系
3451	2025-03-21	Islet single-cell transcriptomic profiling during obesity-induced beta cell expansion in female mice 2025-Mar-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112031 PMID:40104055	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术研究了肥胖诱导的雌性小鼠胰岛β细胞扩增过程中的分子机制	揭示了Xbp1和Myc在缓解未折叠蛋白反应（UPR）和刺激β细胞增殖中的协调转录机制	研究仅限于雌性小鼠，未涉及雄性小鼠或其他物种	探索肥胖诱导的β细胞增殖的分子机制，以寻找新的治疗靶点	雌性小鼠的胰岛β细胞	单细胞转录组学	糖尿病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	雌性KO小鼠的胰岛β细胞
3452	2025-03-21	De novo TANC2 variants caused developmental and epileptic encephalopathy and epilepsy 2025-Mar-20, Epilepsia IF:6.6Q1 DOI:10.1111/epi.18358 PMID:40110879	研究论文	本研究探讨了TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制	首次将TANC2基因与癫痫和发育性癫痫性脑病（DEE）关联起来，并通过果蝇模型和单细胞RNA测序验证了其功能	样本量较小，仅包括六例不相关的病例	探索TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制	癫痫患者和果蝇模型	遗传学	癫痫	外显子测序、单细胞RNA测序	果蝇模型	基因序列数据、RNA表达数据	六例不相关的癫痫患者
3453	2025-03-21	NKG2D-mediated cytotoxicity of CD4 cytotoxic T cells in multiple myeloma 2025-Mar-19, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025875 PMID:40106762	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了多发性骨髓瘤患者骨髓中CD4+ T细胞的细胞毒性作用及其与NKG2D的关系	发现了CD4+细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在多发性骨髓瘤患者中的显著增加和克隆扩展，并揭示了其通过NKG2D介导的细胞毒性作用	研究局限于多发性骨髓瘤患者，未涉及其他类型的癌症	探讨CD4+ T细胞在多发性骨髓瘤中的抗肿瘤免疫作用	多发性骨髓瘤患者的骨髓CD4+ T细胞	免疫学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序，T细胞受体测序	NA	RNA序列数据	多发性骨髓瘤患者骨髓样本
3454	2025-03-21	Identification of NETs-related genes as diagnostic biomarkers in ischemic stroke using RNA sequencing and single-cell analysis 2025-Mar-19, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2 DOI:10.1007/s00335-025-10117-z PMID:40107980	研究论文	本研究通过RNA测序和单细胞分析，识别了与缺血性中风相关的NETs相关基因，并评估了其作为诊断生物标志物的潜力	首次结合RNA测序和单细胞RNA测序技术，系统地研究了NETs在缺血性中风中的作用，并识别了新的生物标志物和治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	阐明NETs在缺血性中风进展中的作用，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点	小鼠脑组织样本	生物信息学	缺血性中风	RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据	小鼠脑组织样本
3455	2025-03-21	BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators 2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1 DOI:10.1161/JAHA.124.038286 PMID:40055864	研究论文	本文研究了BubR1在心脏发育中的作用，揭示了其通过促进心脏生成调节因子的表达来调控心脏发育的机制	首次揭示了BubR1在心脏发育中的关键作用，特别是其在心脏成熟和形态发生中的调控机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探讨BubR1在心脏发育中的分子机制及其对先天性心脏缺陷的影响	小鼠胚胎心脏	发育生物学	先天性心脏缺陷	单细胞RNA测序，轨迹分析，CellChat分析	NA	RNA测序数据	小鼠胚胎心脏样本
3456	2025-03-21	Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body 2025-Mar-18, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.92618 PMID:40100257	研究论文	本文介绍了在成年果蝇大脑和身体中应用空间转录组学的研究，旨在解决单核测序中丢失的空间信息问题	首次在成年果蝇中应用空间转录组学，成功定位了150种mRNA的空间位置，并发现了肌肉细胞中mRNA定位和转录多样性的新原则	研究中使用的基因面板是有限的，可能无法覆盖所有感兴趣的mRNA	解决单核测序中丢失的空间信息问题，并探索mRNA在细胞中的空间定位和转录多样性	成年果蝇的大脑和身体	空间转录组学	NA	空间转录组学，单核测序	NA	mRNA空间定位数据	成年果蝇的大脑和身体样本
3457	2025-03-21	Targeting HIF-2α in glioblastoma reshapes the immune infiltrate and enhances response to immune checkpoint blockade 2025-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-025-05642-8 PMID:40095115	研究论文	本文研究了HIF-2α在胶质母细胞瘤（GBM）中的免疫抑制作用，并探讨了HIF-2α抑制剂PT2385在调节肿瘤微环境（TME）中的应用	首次揭示了HIF-2α在GBM免疫抑制中的关键作用，并展示了HIF-2α抑制剂PT2385与免疫检查点阻断（ICB）联合使用的协同效应	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索HIF-2α在GBM免疫抑制中的作用及其抑制剂PT2385的潜在治疗效果	胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤微环境（TME）	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、流式细胞术	GL261小鼠GBM模型	RNA测序数据、流式细胞数据	未明确提及具体样本数量，但使用了GL261小鼠模型
3458	2025-03-21	Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast 2025-Mar-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57911-6 PMID:40097446	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了酵母在渗透适应过程中的转录动态，揭示了渗透响应程序的高度异质性及其对细胞适应策略的影响	首次系统地研究了酵母在渗透适应过程中转录异质性的分子机制及其对细胞适应策略的影响，并通过RNA条形码删除突变体分析确定了影响转录异质性的遗传因素	研究仅限于酵母模型，未涉及其他生物或更复杂的多细胞系统	揭示酵母在渗透适应过程中转录异质性的分子机制及其对细胞适应策略的影响	酵母细胞	分子生物学	NA	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	超过300个RNA条形码删除突变体
3459	2025-03-21	Unraveling shared diagnostic genes and cellular microenvironmental changes in endometriosis and recurrent implantation failure through multi-omics analysis 2025-Mar-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93146-7 PMID:40097519	研究论文	本研究通过整合转录组和单细胞测序数据，识别了子宫内膜异位症（EMs）和反复植入失败（RIF）之间的共享诊断基因和细胞微环境变化	首次通过多组学分析揭示了EMs和RIF之间的共享诊断基因和细胞微环境变化，并利用机器学习算法筛选出PDIA4和PGBD5作为共享诊断生物标志物	研究结果需要在更大的队列中进行验证，并进一步探索其治疗潜力	探索EMs和RIF之间的共享诊断基因和细胞微环境变化，以提供早期诊断和靶向治疗的新途径	子宫内膜异位症（EMs）和反复植入失败（RIF）	生物信息学	子宫内膜异位症	转录组测序、单细胞测序、机器学习算法（RF和XGBoost）、基因集富集分析（GSEA）、竞争性内源RNA（ceRNA）网络分析	Random Forest (RF)、XGBoost	转录组数据、单细胞测序数据	NA
3460	2025-03-21	Exploring mitochondrial and ferroptotic mechanisms for systemic lupus erythematosus biomarker identification and therapy 2025-Mar-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93872-y PMID:40097571	研究论文	本研究通过分析系统性红斑狼疮（SLE）的线粒体和铁死亡相关机制，探索了SLE的生物标志物识别和治疗方法	结合单细胞RNA测序、高维加权相关网络分析和机器学习算法，开发了高预测准确性的诊断模型，并提出了Doxorubicin可能通过影响诊断生物标志物发挥治疗作用的新见解	研究主要依赖于公开的微阵列数据集，可能受到数据质量和样本量的限制	探索系统性红斑狼疮的分子机制，开发有效的治疗策略	系统性红斑狼疮（SLE）患者	生物信息学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权相关网络分析（hdWGNCA）、机器学习算法、分子对接研究	预测诊断模型	基因表达数据	从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载的微阵列数据集