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当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 3441 - 3460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3441 | 2026-04-28 |
A spatial expression atlas of the adult human proximal small intestine
2024-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07793-3
PMID:39112711
|
研究论文 | 利用空间转录组学、空间蛋白质组学和单分子荧光原位杂交技术，重建了成人近端小肠的综合空间表达图谱，揭示了沿隐窝-绒毛轴的区域化表达和细胞类型分布 | 首次在成人近端小肠中系统描绘了沿隐窝-绒毛轴的基因表达空间异质性，发现迁移性肠上皮细胞从绒毛底部脂滴组装和铁吸收向顶端乳糜微粒合成和铁释放的转变，并揭示绒毛顶端细胞具有促免疫原性特征 | 未明确提及具体局限性 | 重建成人近端小肠的空间表达图谱，解析隐窝-绒毛轴的基因表达和细胞类型空间异质性 | 成人近端小肠组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学， 空间蛋白质组学， 单分子荧光原位杂交 | NA | 空间基因表达数据， 空间蛋白质表达数据 | 成人近端小肠组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学， 单分子荧光原位杂交 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台， 单分子荧光原位杂交技术 |
| 3442 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of lacrimal gland in GVHD mouse model
2024-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.04.006
PMID:38703817
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示GVHD小鼠模型泪腺的转录景观 | 首次构建GVHD小鼠泪腺细胞图谱，发现Lrg1高表达上皮细胞新亚群，并描绘细胞间通信网络 | 仅基于小鼠模型，需在人类样本中验证；部分转录结果通过免疫荧光验证，缺乏功能实验 | 研究GVHD小鼠模型中泪腺细胞群的全局转录表达谱，揭示眼表GVHD的发病机制 | GVHD小鼠模型的泪腺细胞 | 转录组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | GVHD小鼠模型泪腺细胞（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3443 | 2026-04-28 |
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02136-7
PMID:38228679
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研究论文 | 揭示急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞被炎症性募集的机制 | 首次证明健康造血干细胞和祖细胞在低白血病浸润时即主动参与骨髓微环境炎症反应，并识别出AML来源的纳米级胞外囊泡是触发该炎症反应的关键因素 | 未明确讨论样本量大小及临床验证结果 | 探究急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞是否主动参与炎症传播及其机制 | 急性髓系白血病小鼠模型中的健康造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立同源小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3444 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-04, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞微环境及潜在发病机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析翼状胬肉的细胞异质性，发现免疫成纤维细胞、EMT上皮细胞和活化血管内皮细胞等新亚群，并揭示巨噬细胞与ACKR1+活化血管内皮细胞的相互作用在疾病发展中的关键作用 | 需要进一步的体内外实验验证单细胞测序发现的细胞间相互作用机制，且样本量有限 | 探究翼状胬肉的发病机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者及正常对照者的结膜组织细胞 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 45605个细胞（来自翼状胬肉患者和正常对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3445 | 2026-04-28 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
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研究论文 | 通过人类神经网络模型揭示ALS和FTLD中NPTX2的病理作用 | 首次利用iCoMoNSCs衍生的长寿命功能性神经网络iNets模拟TDP-43蛋白病，并鉴定出NTPX2作为TDP-43关键调控靶点，阐明其在神经毒性中的直接作用 | 未提及明确的局限性 | 研究TDP-43病理在神经退行性疾病中的出现机制及后果 | 诱导多能干细胞衍生的神经干细胞及其分化形成的神经网络 | 自然语言处理 | 肌萎缩侧索硬化症、额颞叶变性 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 患者样本（肌萎缩侧索硬化症和额颞叶变性患者） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3446 | 2026-04-28 |
Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07015-2
PMID:38326622
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研究论文 | 循环髓系来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中的作用 | 首次揭示外周髓系细胞特异性蛋白酶MMP8在应激易感性和抑郁症中通过直接浸润脑区影响细胞外空间和神经生理的机制 | 未明确MMP8从外周进入脑实质的具体分子途径，且研究主要基于小鼠模型，人类数据仅涉及血清水平检测 | 探究外周免疫系统改变如何通过特定分子影响中枢神经系统功能和压力相关行为 | 人类重度抑郁症患者血清样本及慢性社交挫败应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质组学数据 | 人类患者血清样本与小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于免疫细胞高维表型分析 |
| 3447 | 2026-04-28 |
Temporal recording of mammalian development and precancer
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572260
PMID:38187699
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研究论文 | 利用NSC-seq分子时钟记录哺乳动物发育和癌前病变的细胞事件时序 | 首次开发并验证了一种多用途单细胞CRISPR平台NSC-seq，将分子时钟与细胞状态和谱系信息相结合，实现了对细胞事件时序和克隆性的精准记录 | 未提及具体局限性，但可能包括对CRISPR编辑效率的依赖性以及人类癌前样本分析中的样本代表性 | 开发一种能够记录细胞事件时序和克隆性的分子时钟方法，并应用于哺乳动物发育和癌前病变的研究 | 小鼠胚胎、小鼠腺瘤、人结肠癌前病变 | 数字病理学 | 结肠癌前病变 | NSC-seq（单细胞CRISPR平台）、单细胞多组学分析 | 分子时钟模型 | 单细胞RNA测序数据、克隆分析数据 | 116个单细胞RNA测序数据集和418个人类息肉 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | 10x Chromium | NSC-seq平台 |
| 3448 | 2026-04-28 |
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06549-9
PMID:37730992
|
研究论文 | 该论文通过转基因雪貂模型定义了肺部离子细胞的多样性和功能 | 首次在鼬科动物中建立条件性遗传模型，揭示人类与小鼠间进化保守的肺部离子细胞功能及亚型 | NA | 阐明肺部离子细胞在气道中的生物学功能及其在囊性纤维化中的作用 | 转基因雪貂模型（FOXI1-Cre::ROSA-TG, FOXI1-KO, FOXI1-Cre::CFTR）及囊性纤维化雪貂 | 自然语言处理 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组学、谱系追踪、条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3449 | 2026-04-28 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
|
研究论文 | 开发LRT框架，整合单细胞RNA测序与单细胞T细胞受体测序数据，研究克隆分化异质性 | 首次提出综合计算框架LRT，整合scRNA-seq和scTCR-seq数据，揭示克隆分化轨迹异质性，弥补单一方法在T细胞克隆分析中的不足 | 研究未涉及其他免疫细胞类型或更大范围的数据验证 | 探索克隆分化轨迹异质性，提供综合分析方法 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞（急性淋巴性脉络丛脑膜炎病毒感染样本） | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 3450 | 2026-04-28 |
Unsupervised cell functional annotation for single-cell RNA-seq
2022-Sep-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276609.122
PMID:35764397
|
研究论文 | 开发了一种无监督的细胞功能注释方法UNIFAN，用于单细胞RNA测序数据 | UNIFAN是一种同时进行聚类和注释的神经网络方法，利用已知基因集来确定聚类，显著优于传统聚类方法 | 可能依赖已知基因集的完整性和准确性，未提及在未知细胞类型或复杂组织中的性能 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型分配的准确性和可解释性 | 人类和小鼠的scRNA-seq数据集，来自多个不同器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 人类和小鼠scRNA-seq数据集，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3451 | 2026-04-27 |
A machine learning-driven framework integrating cell death and senescence signatures for multi-target drug design and immunotherapy optimization in ovarian cancer
2026-Apr-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01448-4
PMID:42034671
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研究论文 | 利用机器学习整合细胞死亡与衰老特征，建立多靶点药物设计和免疫治疗优化的预测框架，并在卵巢癌中验证 | 首次将非凋亡性细胞死亡与衰老通路整合为一个可预测的机器学习模型（CDSLS），并结合多组学分析和人工智能靶向药物设计，为卵巢癌多靶点治疗和免疫治疗优化提供新策略 | 部分关键基因的功能验证仅限于RB1，其他潜在靶点未深入探索；模型在临床转化前需更多独立大规模队列验证 | 构建基于机器学习的多靶点药物设计与免疫治疗优化框架，用于卵巢癌精准治疗 | 卵巢癌患者样本（n=1858）及免疫治疗数据集 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、多组学分析、人工智能靶向化合物预测 | 机器学习模型（CDSLS） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 1858例卵巢癌患者样本（多队列汇总）及免疫治疗数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3452 | 2026-04-27 |
Identification of synovial lymphatic system in the temporomandibular joint and their roles in arthritis and pain
2026-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72400-0
PMID:42034638
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研究论文 | 鉴定颞下颌关节中的滑膜淋巴系统及其在关节炎和疼痛中的作用 | 首次在颞下颌关节中发现滑膜淋巴系统，并揭示其功能障碍驱动关节炎和疼痛的机制 | 主要基于小鼠模型，人类组织样本有限，可能需进一步验证临床相关性 | 研究颞下颌关节中淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 | 颞下颌关节滑膜淋巴系统 | 数字病理学 | 颞下颌关节炎 | 单细胞RNA测序, 组织透明化, 三维体积成像, 功能遗传学 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | 使用了遗传报告小鼠和人类组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3453 | 2026-04-27 |
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08807-w
PMID:42034645
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量DNA测序，揭示了乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的异质性，并鉴定了GABRB3和NRXN1作为脑转移潜能的候选调节因子 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了乳腺癌脑转移的肿瘤免疫微环境，发现循环TAMs和组织驻留TAMs分别呈现M1样和M2样表型，并鉴定了与脑转移相关的神经相关肿瘤细胞亚型和反复突变 | 样本量较小（7例患者进行单细胞测序，47例进行批量DNA测序），且功能验证仅在异种移植模型中进行，需进一步在更大队列和临床研究中验证 | 探索乳腺癌脑转移的分子机制，特别是肿瘤免疫微环境和转移性肿瘤细胞的异质性 | 乳腺癌脑转移患者 | 单细胞生物学 | 乳腺癌脑转移 | 单细胞RNA测序、批量DNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、DNA突变数据 | 7例患者（scRNA-seq）和47例患者（批量DNA测序） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量DNA-seq | NA | NA |
| 3454 | 2026-04-27 |
PW1+ cells give rise to cardiac adipocytes during development and myofibroblasts following injury
2026-Apr-25, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05035-z
PMID:42035143
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研究论文 | 本研究利用遗传谱系追踪和单细胞RNA测序，揭示了PW1+细胞在心脏发育过程中分化为脂肪细胞，并在心肌梗死后分化为肌成纤维细胞的双重潜能 | 首次证明PW1+细胞在心脏中具有干细胞特性，可分别贡献于心脏脂肪细胞和肌成纤维细胞的形成，为心脏脂肪生成和纤维化机制提供了新见解 | 尚未明确PW1+细胞分化的具体分子调控机制，以及其在其他心脏病理条件下的作用 | 探究PW1+细胞在心脏中的干细胞特性及其在发育和损伤后的分化潜能 | 小鼠心脏中的PW1+细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3455 | 2026-04-27 |
Integrator subunit IntS11 orchestrates the temporal dynamics of neural lineage progression in Drosophila
2026-Apr-25, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01578-z
PMID:42035222
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研究文章 | 利用果蝇模型揭示Integrator亚基IntS11通过转录调控细胞周期基因和维持长3'UTR异构体来协调神经谱系进展的时间动态 | 首次发现IntS11作为神经谱系进展的阶段特异性调控因子，通过转录控制细胞周期基因维持神经母细胞增殖，并通过维持长3'UTR异构体稳定分化程序 | 未提及具体局限性，可能包括需要进一步在哺乳动物模型中验证 | 探究IntS11在神经谱系进展中的具体调控功能 | 果蝇神经母细胞及其后代细胞 | 数字病理学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序，ChIP-qPCR，FUCCI分析，活体成像，MARCM | NA | 基因表达数据 | 果蝇幼虫脑样本，具体数量未在摘要中给出 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3456 | 2026-04-27 |
Pathway-level somatic mutation burden reflects diffuse genomic accumulation rather than selective transcriptional disruption in ovarian serous carcinoma: Evidence from bulk, spatial, and multi-region genomic analyses
2026-Apr-24, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2026.04.010
PMID:42034009
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研究论文 | 通过分析批量、空间和多区域基因组数据，探讨卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷与转录通路活性的关系，发现TMB增加反映弥散性基因组积累而非选择性转录通路破坏 | 首次在多尺度基因组数据（批量、空间、多区域）中系统验证TMB与转录通路活性的关系，并揭示染色质重塑通路在TMB增加和上皮细胞区隔中优先突变 | 研究统计效能有限，无法检测到TMB与通路活性的微小关联；仅基于单一癌症类型进行分析 | 明确卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷增加是否驱动选择性转录通路破坏或反映弥散性基因组积累 | 卵巢浆液性癌患者的肿瘤样本（包括CPTAC-GDC队列84例、Gray Foundation空间转录组队列43例、MSK SPECTRUM多区域基因组队列42例） | 机器学习 | 卵巢浆液性癌 | 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | 基因表达数据, 突变数据, 空间转录组数据 | 共169例患者（CPTAC-GDC 84例、Gray Foundation 43例、MSK SPECTRUM 42例） | NanoString, Illumina | 空间转录组学, 批量RNA测序 | GeoMx Digital Spatial Profiler, NovaSeq | GeoMx空间转录组平台用于原位基因表达分析，Illumina NovaSeq用于全外显子组测序 |
| 3457 | 2026-04-27 |
Type I interferon drives T cell responses to amyloid beta in the central nervous system
2026-Apr-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72262-6
PMID:42026067
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了APP23转基因小鼠模型中中枢神经系统淀粉样蛋白病理进展过程中，T细胞从依赖于微胶质细胞转变为介导神经炎症的免疫微环境动态变化，并发现I型干扰素驱动CD8+ T细胞对β-淀粉样蛋白的应答 | 首次在单细胞水平揭示淀粉样蛋白病理晚期T细胞显著增加及其围绕Aβ斑块的聚集现象，鉴定出表达干扰素刺激基因的CD8+ T细胞亚群，并阐明其通过CXCL10-CXCR3轴招募非ISG T细胞的机制 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证范围有限；未深入探讨T细胞亚群的功能异质性及长期效应 | 研究中枢神经系统淀粉样蛋白病理中适应性免疫系统（特别是T细胞）的动态变化及其调控机制 | APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | APP23转基因小鼠模型及人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理组织样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 3458 | 2026-04-27 |
Intragraft clonal expansion of cytotoxic CD8+ and CD4+ T cells in antibody-mediated kidney transplant rejection
2026-Apr-23, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.03.012
PMID:42034201
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示了抗体介导的肾移植排斥反应中细胞毒性CD8+和CD4+ T细胞的克隆扩增现象 | 首次在抗体介导的排斥反应中系统证实CD4+和CD8+细胞毒性T细胞的克隆扩增，挑战了传统AMR与TCMR的二元分类框架 | 样本量有限（仅16例单细胞测序），且未涉及功能验证实验 | 探索抗体介导的肾移植排斥反应中T细胞的克隆性和空间组织特征 | 肾移植活检组织中的CD4+和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | RNA-seq, 单细胞RNA/TCR测序, 多重免疫染色 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 空间蛋白组数据 | 192例批量转录组、16例单细胞RNA/TCR测序、18例和75例多重免疫染色 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3459 | 2026-04-27 |
Adversarial validation of in silico perturbation profiles for intelligence-associated genes in human prefrontal cortex
2026-Apr-21, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于Geneformer模型对与智力相关的21个基因在人类前额叶皮层中的计算机扰动进行对抗性验证 | 提出了一个可复现的对抗性验证框架，用于评估基础模型的计算机扰动结果，并揭示了表达水平混杂因素会显著放大原始扰动信号 | 研究在供体层面统计效力不足（n=3，估计效力约27%），推荐至少20个供体；交叉模型一致性受标记化问题限制 | 建立标准化对抗性验证框架，评估基础模型在计算机基因扰动中的可靠性，并检验智力相关基因的细胞类型特异性机制 | 人类背外侧前额叶皮层（DLPFC）单细胞RNA-seq数据中的21个智力相关基因 | 自然语言处理 | 智力相关疾病 | 单细胞RNA测序 | Geneformer, scGPT | 单细胞RNA-seq表达数据 | 3个供体的500个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3460 | 2026-04-27 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Apr-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101346
PMID:41895263
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研究论文 | 本研究评估了整合单细胞和单细胞核数据集以改善批量RNA-seq反卷积的策略，并提出了最佳实践方法 | 首次系统比较了多种整合策略（包括基于主成分的潜在偏移、条件和非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤）在提升单细胞核RNA-seq参考数据反卷积准确性的效果，并推荐了优先使用scRNA-seq及跨模态DEG过滤的方法 | 研究仅基于四种组织类型进行基准测试，可能未涵盖所有组织类型；跨模态DEG过滤需要配对的scRNA-snRNA细胞类型信息，实际应用中可能受限于数据可用性 | 评估并改进单细胞核RNA-seq数据作为批量RNA-seq反卷积参考的准确性 | 四种组织类型（具体未列出）的scRNA-seq和snRNA-seq数据；真实的脂肪组织批量样本 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | 条件/非条件scVI（单细胞变分推断） | 基因表达数据 | 四种组织的scRNA-seq和snRNA-seq数据集；真实的脂肪组织批量样本（具体数量未说明） | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | NA |