单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3421 - 3440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3421 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Aquaporin-Mediated Carbon Nanosol-Induced Growth Promotion of Plants
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504459
PMID:40305768
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了水通道蛋白介导的碳纳米溶胶促进植物生长的机制 | 首次在单细胞水平解析碳纳米材料对植物生长的促进作用机制，发现细胞类型特异性响应和水通道蛋白的关键作用 | 研究仅针对烟草根系，未验证其他植物物种；突变体验证仅限于tip1;1和tip2;1 | 探究碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制 | 烟草根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,897个细胞，13种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3422 | 2025-10-06 |
PP1A Modulates the Efficacy of Lenvatinib Plus ICIs Therapy by Inhibiting Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501730
PMID:40344394
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研究论文 | 本研究揭示了PP1A通过抑制铁死亡调控肝细胞癌对乐伐替尼联合免疫检查点抑制剂治疗疗效的机制 | 首次发现PP1A通过去磷酸化Keap1第104位点破坏Keap1-Nrf2相互作用，从而抑制铁死亡并促进免疫逃逸 | 机制研究主要基于细胞和动物实验，需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌对乐伐替尼联合免疫治疗耐药的分子机制 | 肝细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 转录组分析、铁死亡代谢物分析、单细胞测序、共培养实验 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3423 | 2025-10-06 |
Immune-Vascular Synergy: A Photodynamic Hydrogel Activating ALDH2 to Combat Inflammation and Enhance Angiogenesis in Diabetic Wound Healing
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202500391
PMID:40364604
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研究论文 | 开发了一种光动力水凝胶，通过激活ALDH2减少中性粒细胞胞外诱捕网形成并促进血管生成，用于糖尿病伤口愈合 | 首次将ALDH2激活与免疫-血管双重调节策略相结合，直接靶向免疫调节与血管再生的相互作用机制 | NA | 解决糖尿病感染性伤口治疗中持续性感染、免疫反应受损和血管化不足等多重挑战 | 糖尿病伤口组织、中性粒细胞、巨噬细胞、内皮细胞 | 生物医学工程 | 糖尿病伤口 | 单细胞测序分析 | NA | 临床标本测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3424 | 2025-10-06 |
MatriCom, a single-cell RNA-sequencing data mining tool to infer cell-extracellular matrix interactions
2025-Jul-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.263927
PMID:40501363
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研究论文 | 开发了一个名为MatriCom的单细胞RNA测序数据挖掘工具，用于推断细胞与细胞外基质之间的相互作用 | 创建了包含超过25,000个经过整理的基质组相互作用的独特数据库MatriComDB，并开发了首个能够从scRNA-Seq数据推断ECM组分间以及不同细胞群与ECM间通讯的工具 | NA | 开发一个能够从单细胞RNA测序数据推断细胞外基质相互作用的数据挖掘工具 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞外基质组分和细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46个健康成人组织的scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3425 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics of stricturing Crohn's disease highlights a fibrosis-associated network
2025-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02225-y
PMID:40562913
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了克罗恩病纤维化相关的关键细胞网络和空间组织结构 | 首次将单细胞和空间转录组学技术配对应用于克罗恩病狭窄病变研究，揭示了炎症成纤维细胞与淋巴滤泡等关键细胞群体的空间共定位模式 | 样本量相对有限（61个样本，31名患者），且仅针对克罗恩病狭窄病变进行研究 | 阐明克罗恩病纤维化狭窄病变的转录组和细胞网络特征 | 克罗恩病患者和非炎症性肠病患者的肠道组织样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 61个样本（来自21名克罗恩病患者和10名非炎症性肠病患者） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3426 | 2025-10-06 |
Atlas of amnion development during the first trimester of human pregnancy
2025-Jul, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01696-9
PMID:40659869
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研究论文 | 通过单细胞转录组学绘制人类妊娠早期羊膜发育图谱，揭示其细胞组成和相互作用 | 首次在人类妊娠早期系统鉴定羊膜主要细胞类型和亚型，发现上皮-间质和上皮-免疫细胞转化过程 | 研究仅关注妊娠早期，未涵盖整个妊娠期羊膜发育过程 | 阐明人类羊膜在妊娠早期的发育机制和细胞相互作用 | 人类妊娠早期羊膜组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3427 | 2025-10-06 |
Leveraging hypoxia-related genes signature for predicting the prognosis of bladder cancer
2025-Jun-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-118
PMID:40687655
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研究论文 | 本研究开发了一种基于缺氧相关基因的膀胱癌预后风险预测模型 | 构建了包含JUN、MYC、EGFR和SLC2A1四个基因的新型预后风险模型，并首次结合单细胞测序数据分析基因在膀胱癌发育轨迹中的表达变化 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探索缺氧相关基因在膀胱癌中的功能作用并建立预后预测模型 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、实时定量PCR(qRT-PCR)、单细胞测序 | 预后风险模型 | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3428 | 2025-10-06 |
A pre-menopausal single-cell atlas for ovarian drug discovery
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660779
PMID:40666883
|
研究论文 | 构建了一个绝经前女性单细胞图谱资源，用于卵巢生物学研究和药物靶点发现 | 首次创建专注于绝经前女性的多组织单细胞图谱，系统比较卵巢细胞转录组特征并识别潜在药物靶点 | 样本来源相对有限，未包含绝经后女性组织进行对比 | 建立绝经前女性单细胞图谱资源，支持卵巢生物学研究和避孕药物靶点发现 | 绝经前女性的14种组织样本，包括卵巢组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 511,365个细胞，来自14种组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3429 | 2025-10-06 |
MHCIIhiLYVE1loCCR2hi Interstitial Macrophages Promote Medial Fibrosis in Pulmonary Arterioles and Contribute to Pulmonary Hypertension
2025-Jun-20, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326173
PMID:40357547
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研究论文 | 本研究揭示了MHCIIhiLYVE1loCCR2hi间质巨噬细胞通过WNT11/PCP通路促进肺动脉中膜纤维化并导致肺动脉高压的机制 | 首次鉴定出MHCIIhiLYVE1loCCR2hi间质巨噬细胞亚群在肺动脉中膜纤维化中的关键作用，并阐明其通过WNT11/平面细胞极性通路促进肺动脉平滑肌细胞向成纤维细胞样表型转化的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限，且未涉及其他肺动脉高压亚型的验证 | 探究间质巨噬细胞浸润与肺动脉纤维化在肺动脉高压中的关联机制 | 特发性肺动脉高压患者肺组织样本、实验性肺动脉高压动物模型、间质巨噬细胞和肺动脉平滑肌细胞 | 病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,组织学分析,细胞共培养,转基因动物实验 | NA | 基因表达数据,组织图像数据,细胞表型数据 | 特发性肺动脉高压患者和实验动物肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3430 | 2025-10-06 |
Dissecting the liver inflammation ecosystem identifies annexin A1 as a pro-resolving target for liver failure
2025-Jun-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001427
PMID:40560812
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研究论文 | 本研究通过多组学技术解析慢加急性肝衰竭的免疫微环境，发现膜联蛋白A1可作为促进炎症消退的治疗靶点 | 首次系统描绘ACLF肝脏免疫图谱，发现CCL4+中性粒细胞亚群驱动持续炎症，并鉴定ANXA1-FPR1轴作为关键负反馈机制 | 临床样本量有限，机制研究主要依赖体外实验和动物模型 | 解析慢加急性肝衰竭的免疫特征并寻找治疗靶点 | 慢加急性肝衰竭患者肝脏组织及免疫细胞 | 数字病理 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | ACLF患者与对照组的肝脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 3431 | 2025-10-06 |
Serum amyloid A1-induced intrahepatic regulatory T-cell dysfunction drives autoimmune hepatitis progression
2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001419
PMID:40489740
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现自身免疫性肝炎中肝内调节性T细胞功能失调，并揭示血清淀粉样蛋白A1通过Toll样受体2介导这一过程 | 首次揭示肝内Treg细胞在AIH中功能失调的具体机制，发现SAA1通过TLR2通路损害Treg功能，并提出靶向SAA1的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类AIH中Treg功能失调机制需进一步验证 | 探究自身免疫性肝炎中调节性T细胞功能失调的机制及治疗策略 | 小鼠模型中的调节性T细胞和自身免疫性肝炎病理过程 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序，流体动力学转染，AAV介导的基因治疗 | FoxP3-DTR/eGFP转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据，病理学数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 3432 | 2025-10-06 |
Deficient FANCL Predisposes Endothelial Damage: A New Therapeutic Target for Pulmonary Hypertension
2025-Jun-06, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202408-1655OC
PMID:40479584
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研究论文 | 本研究揭示了FANCL缺陷通过导致内皮细胞DNA损伤和BMP/TGF-β信号通路失衡促进肺动脉高压(PAH)的机制 | 首次发现FANCL缺陷可自发诱发PAH，并证明靶向修复FANCL可成为PAH治疗新策略 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床转化需进一步验证 | 阐明FA通路、DNA损伤与PAH之间的相互作用机制 | FANCL基因敲除小鼠、PAH患者肺标本和肺动脉内皮细胞、原代培养肺微血管内皮细胞 | 分子病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、基因敲除、腺相关病毒基因过表达、转录组分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 患者肺标本和内皮细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3433 | 2025-10-06 |
A single-cell spatial chart of the airway wall reveals proinflammatory cellular ecosystems and their interactions in health and asthma
2025-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02161-3
PMID:40399607
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研究论文 | 本研究应用单细胞空间转录组学揭示了健康与哮喘状态下气道壁的细胞空间分布图谱，发现了促炎性细胞生态系统及其相互作用 | 首次绘制了气道壁的单细胞空间图谱，揭示了健康与哮喘中存在于特定空间微环境中的促炎性细胞生态系统及其独特机制 | NA | 揭示气道壁在健康和哮喘状态下的细胞空间组织特征及促炎性细胞生态系统的相互作用机制 | 健康与哮喘患者的气道壁组织样本 | 空间转录组学 | 哮喘 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 3434 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analyses reveal the mechanism of mitochondrial activity in erectile dysfunction
2025-Jun, Sexual medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1093/sexmed/qfaf049
PMID:40689149
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示线粒体活性在勃起功能障碍中的机制 | 首次在单细胞水平系统表征ED的细胞景观，发现成纤维细胞和内皮细胞中线粒体异质性与ED的关联 | 样本代表性有限且缺乏直接实验验证 | 研究线粒体功能对细胞异质性的影响 | 勃起功能障碍患者样本 | 单细胞组学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,993个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3435 | 2025-10-06 |
Preterm birth increases susceptibility to hyperglycemia induced glomerular alterations in male mice
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00103-5
PMID:40442182
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研究论文 | 本研究探讨早产如何增加雄性小鼠在高血糖条件下肾小球和肾小管损伤的易感性 | 首次揭示早产通过破坏内皮细胞-足细胞相互作用增加糖尿病肾病易感性的机制 | 仅使用雄性小鼠模型，未研究雌性个体的反应 | 确定早产对高血糖暴露后肾脏健康的影响 | CD-1品系早产(19天孕龄)和足月产(20天孕龄)雄性小鼠 | 肾脏病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,分子生物学技术,成像技术 | 小鼠糖尿病模型 | 基因表达数据,组织图像,生理参数 | 早产和足月产雄性小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3436 | 2025-10-06 |
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537364
PMID:37131803
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研究论文 | 提出D-SPIN计算框架，从多重单细胞RNA测序数据构建基因调控网络模型 | 开发能处理数千种不同扰动条件的单细胞mRNA-seq数据的概率建模框架 | NA | 揭示细胞信息处理和生理控制原理 | 基因调控网络和细胞状态分布 | 计算生物学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 概率模型 | 单细胞RNA测序数据 | 数千种不同扰动条件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3437 | 2025-10-06 |
Quantification of single cell-type-specific alternative transcript initiation
2025-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.29.651292
PMID:40654755
|
研究论文 | 开发了一种名为TSRdetector的新型生物信息学方法，用于检测不同组织、细胞类型或疾病中基因转录起始区域使用的显著变化 | 首个专门设计用于在单细胞类型水平分析基因转录起始区域差异使用的生物信息学工具 | 方法验证仅限于肾脏疾病、B细胞分化和多能性转换等特定生物学场景 | 探索不同组织和细胞类型中基因转录起始区域的选择性激活机制 | 人类肾脏细胞、小鼠B细胞、人类胚胎干细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 生物信息学算法 | RNA测序数据 | 多个数据集（包括健康与糖尿病患者肾脏、小鼠B细胞分化、人类ESC多能性转换） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | 10x Chromium | 10x单核RNA测序 |
| 3438 | 2025-10-06 |
Neural signaling contributes to heart formation and growth in the invertebrate chordate, Ciona robusta
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651085
PMID:40654768
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研究论文 | 本研究揭示神经肽速激肽与经典Wnt信号通路共同调控海鞘心肌细胞祖细胞增殖的机制 | 首次在无脊椎脊索动物中发现神经元通过速激肽信号直接调控心脏发育，并鉴定出心肌祖细胞的两种空间亚群 | 研究仅限于海鞘模型，在脊椎动物中的普适性仍需验证 | 探究神经信号在心脏发育和生长调控中的作用机制 | Ciona robusta（海鞘）成年个体的心脏组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因敲除, 药理学抑制 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3439 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis to Investigate the Role of Ferroptosis in Ischemic Stroke and the Molecular Mechanisms of Immune Checkpoints
2025-05, World neurosurgery
IF:1.9Q2
DOI:10.1016/j.wneu.2025.123908
PMID:40118372
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序和转录组分析，研究铁死亡在缺血性脑卒中中的作用及免疫检查点的分子机制 | 首次结合单细胞转录组数据和机器学习算法识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因，并探索其与免疫细胞浸润的关联 | 研究基于单一数据集GSE247474，需要更多独立队列验证 | 识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因，探索其分子机制和早期诊断价值 | 星形胶质细胞和T细胞亚群 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | Lasso回归, 支持向量机 | 单细胞转录组数据 | GSE247474数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3440 | 2025-10-06 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.019
PMID:39755116
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研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽通过加速细胞周期促进植物再生的分子机制 | 首次发现谷胱甘肽在细胞G1期出现瞬时核内峰值，并通过缩短G1期加速细胞分裂和重编程 | 研究仅限于拟南芥根系，尚未在其他植物或组织中验证 | 探究细胞周期在细胞重编程过程中的作用机制 | 拟南芥根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |