单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3421 - 3440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3421 | 2025-10-06 |
Multi-cohort analysis identifies a blood-based immune transcriptomic signature for early lung cancer detection
2025-Jul-19, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01043-z
PMID:40684032
|
研究论文 | 通过多队列分析识别出基于血液的免疫转录组特征用于肺癌早期检测 | 首次通过大规模多队列血液转录组meta分析识别出6个基因组成的肺癌特征，该特征主要来源于髓系细胞，在肿瘤相关巨噬细胞和成纤维细胞中表达更高 | 需要进一步临床验证和开发 | 开发基于血液的肺癌早期检测方法 | 肺癌患者、健康对照和其他疾病患者的血液样本 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 诊断分类器 | 转录组数据 | 发现阶段：432例肺癌，8154例健康对照，14187例其他疾病；验证阶段：371名受试者（172例肺癌），454名Framingham研究受试者（42例肺癌）；单细胞数据：1,022,063个细胞 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3422 | 2025-10-06 |
From preneoplastic lesion to heterogenous tumor: recent insights into hepatoblastoma biology and therapeutic opportunities
2025-Jul-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02405-8
PMID:40684183
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综述 | 本文综述了肝母细胞瘤生物学特征的最新发现及治疗机会 | 整合单细胞RNA测序、多组学、空间转录组学和功能基因组学筛选揭示肿瘤异质性机制 | NA | 总结肝母细胞瘤生物学特征以推进治疗策略 | 小儿肝母细胞瘤细胞、肿瘤相关细胞类型及遗传依赖性 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学, 空间转录组学, 功能基因组学筛选 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3423 | 2025-10-06 |
GeneSurfer enables transcriptome-wide exploration and annotation of gene co-expression modules in 3D spatial transcriptomics data
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112713
PMID:40678514
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研究论文 | 开发了GeneSurfer交互式界面，用于探索3D空间转录组数据中局部基因共表达模式 | 首个设计用于在大规模数据集中探索局部基因共表达模式的交互式分析工具 | NA | 开发空间转录组数据中基因共表达模式的探索和注释工具 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3424 | 2025-10-06 |
Bering: joint cell segmentation and annotation for spatial transcriptomics with transferred graph embeddings
2025-Jul-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60898-9
PMID:40681510
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研究论文 | 提出Bering图深度学习模型，利用转录本共定位关系进行空间转录组学的联合细胞分割和分子注释 | 首次提出利用转录本共定位关系进行联合噪声感知细胞分割和分子注释的图深度学习模型，构建预训练模型并通过迁移学习和自蒸馏实现高精度分割 | 未明确说明模型在特定组织类型或技术平台上的局限性 | 解决空间转录组学中细胞分割和注释的准确性问题 | 2D和3D空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图深度学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3425 | 2025-10-06 |
The pro-cancer and immunosuppressive activity of macrophage-transformed cancer-associated fibroblasts in oral squamous cell carcinoma
2025-Jul-18, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.027
PMID:40684939
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研究论文 | 本研究揭示了口腔鳞状细胞癌中巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)的存在及其通过CXCL10途径促进肿瘤进展和免疫抑制的机制 | 首次在口腔鳞状细胞癌中证实巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的存在，并阐明其通过CXCL10促进髓源性抑制细胞归巢和功能的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步深入 | 探究巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的起源、功能特征及其在口腔鳞状细胞癌中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 流式细胞术, 假时序分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据, 流式细胞数据 | 口腔鳞状细胞癌病理切片、同种异体移植肿瘤和皮下肿瘤模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3426 | 2025-10-06 |
Machine learning assisted immune profiling of COPD identifies a unique emphysema subtype independent of GOLD stage
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112966
PMID:40687815
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研究论文 | 通过机器学习辅助的免疫分析识别出独立于GOLD分期的独特肺气肿亚型 | 首次结合多组学技术和机器学习算法识别出与肺气肿严重程度相关的独特免疫亚型 | 样本量未明确说明，需要进一步验证研究 | 探索COPD免疫特征与疾病异质性的关系 | 慢性阻塞性肺疾病患者 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 流式细胞术,细胞因子分析,单细胞转录组学,空间转录组学,机器学习算法 | 机器学习算法 | 细胞数据,分子数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 3427 | 2025-10-06 |
Single cell immune profiling in ankylosing spondylitis reveals resistance of CD8+ T cells to immune exhaustion
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112715
PMID:40687839
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了强直性脊柱炎中CD8+ T细胞对免疫耗竭的抵抗机制 | 发现强直性脊柱炎滑膜液中存在克隆扩增的细胞毒性T细胞亚群，这些细胞虽表达抑制性受体但保持效应功能，并下调典型耗竭标志物 | NA | 探究强直性脊柱炎中细胞毒性T细胞的免疫耗竭抵抗机制 | 强直性脊柱炎患者的滑膜液中的细胞毒性T细胞 | 单细胞生物学 | 强直性脊柱炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3428 | 2025-10-06 |
Gastric cancer adapts high lipid microenvironment via suppressing PPARG-FABP1 axis after arriving in the lymph node
2025-Jul-17, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103759
PMID:40694956
|
研究论文 | 本研究探讨胃癌细胞在淋巴结转移过程中通过抑制PPARG-FABP1轴适应高脂微环境的机制 | 首次揭示胃癌细胞通过下调PPARγ-FABP1轴抑制花生四烯酸摄取从而避免铁死亡的适应性机制 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析，缺乏体内功能验证实验 | 研究胃癌细胞在淋巴结转移过程中的脂代谢重编程机制 | 胃癌细胞和淋巴结转移微环境 | 癌症代谢研究 | 胃癌 | 非靶向脂质组学测序,RNA测序,单细胞测序,透射电镜,ChIP-qPCR | NA | 脂质组数据,转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,脂质组学 | NA | NA |
| 3429 | 2025-10-06 |
Cluster-independent multiscale marker identification in single-cell RNA-seq data using localized marker detector (LMD)
2025-Jul-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08485-y
PMID:40670619
|
研究论文 | 提出一种名为LMD的新工具，用于在单细胞RNA-seq数据中识别局部基因标记 | 开发了基于细胞-细胞亲和图的扩散动力学评分方法，能够以多分辨率和细粒度方式识别细胞群体特异性基因标记 | NA | 开发更准确的单细胞RNA-seq数据标记基因识别方法 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图扩散算法 | 基因表达数据 | 十个单细胞RNA测序数据集，包括小鼠骨髓和毛囊真皮凝集数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3430 | 2025-10-06 |
Pan-Cancer Spatial Profiling Reveals Conserved Subtypes and Niches of Cancer-Associated Fibroblasts
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2181
PMID:40440095
|
研究论文 | 通过泛癌空间分析识别出四种保守的癌症相关成纤维细胞亚型及其空间生态位 | 首次基于空间邻域信息进行CAF亚型的从头发现，将空间组织确立为CAF异质性的定义轴 | NA | 建立空间背景与CAF身份之间的联系，重新定义CAF分类框架 | 多种癌症类型中的癌症相关成纤维细胞 | 计算生物学 | 多种癌症 | 单细胞空间多组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间多组学 | NA | NA |
| 3431 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals PAX5-mediated naïve B cell differentiation defect in severe adenoid hypertrophy
2025-Jul-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114675
PMID:40675241
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示严重腺样体肥大中PAX5介导的幼稚B细胞分化缺陷 | 首次在单细胞分辨率下揭示腺样体肥大中B细胞分化受阻的分子机制，发现PAX5异常高表达导致幼稚B细胞积累 | 样本量有限，未进行功能验证实验，机制研究不够深入 | 探究腺样体肥大的分子机制和细胞组成特征 | 儿科腺样体肥大患者的腺体组织样本 | 单细胞组学 | 腺样体肥大 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 45,917个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3432 | 2025-10-06 |
Interleukin-27-producing cells in gram-negative neonatal sepsis display diverse phenotypes and functions in the liver
2025-Jul-14, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf026
PMID:40682363
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了革兰氏阴性新生儿败血症中肝脏IL-27产生细胞的表型和功能多样性 | 首次在单细胞水平解析新生儿败血症中IL-27产生细胞的异质性及其功能特征 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究新生儿败血症中IL-27产生细胞的特性及其在免疫失调中的作用 | 新生IL-27p28eGFP报告基因小鼠和表达荧光素酶的K1荚膜大肠杆菌 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,全动物成像 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3433 | 2025-10-06 |
NeuN expression in health and disease: A histological perspective on neuronal heterogeneity
2025-Jul-11, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-18-965
PMID:40697072
|
综述 | 从组织学角度探讨NeuN表达在健康和疾病状态下的神经元异质性 | 提出NeuN不应被视为二元标记物，而是神经元状态的动态指标，并建议采用多标记策略和空间转录组学等分子工具 | NA | 综述NeuN表达模式、分子调控机制及其对研究和诊断的意义 | 神经元核抗原(NeuN/Rbfox3)及其在不同神经元类型和病理条件下的表达 | 神经病理学 | 神经退行性疾病 | 免疫组织化学, 空间转录组学, RNA测序 | NA | 组织学数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |
| 3434 | 2025-10-06 |
SpaDCN: Deciphering Spatial Functional Landscape from Spatially Resolved Transcriptomics by Aligning Cell-Cell Communications
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402111
PMID:39962819
|
研究论文 | 提出一种名为SpaDCN的空间动态图卷积网络框架，通过整合细胞间通讯和基因表达数据来识别空间功能区域 | 首次将细胞间通讯动态与基因表达在空间背景下对齐，采用动态图卷积在节点图和边图之间切换传播 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病背景下的适用性限制 | 从空间分辨转录组数据中解析空间功能景观 | 空间分辨转录组数据中的细胞和组织结构 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间分辨转录组技术 | 动态图卷积网络 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3435 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Aquaporin-Mediated Carbon Nanosol-Induced Growth Promotion of Plants
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504459
PMID:40305768
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了水通道蛋白介导的碳纳米溶胶促进植物生长的机制 | 首次在单细胞水平解析碳纳米材料对植物生长的促进作用机制，发现细胞类型特异性响应和水通道蛋白的关键作用 | 研究仅针对烟草根系，未验证其他植物物种；突变体验证仅限于tip1;1和tip2;1 | 探究碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制 | 烟草根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,897个细胞，13种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3436 | 2025-10-06 |
PP1A Modulates the Efficacy of Lenvatinib Plus ICIs Therapy by Inhibiting Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501730
PMID:40344394
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研究论文 | 本研究揭示了PP1A通过抑制铁死亡调控肝细胞癌对乐伐替尼联合免疫检查点抑制剂治疗疗效的机制 | 首次发现PP1A通过去磷酸化Keap1第104位点破坏Keap1-Nrf2相互作用，从而抑制铁死亡并促进免疫逃逸 | 机制研究主要基于细胞和动物实验，需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌对乐伐替尼联合免疫治疗耐药的分子机制 | 肝细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 转录组分析、铁死亡代谢物分析、单细胞测序、共培养实验 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3437 | 2025-10-06 |
Immune-Vascular Synergy: A Photodynamic Hydrogel Activating ALDH2 to Combat Inflammation and Enhance Angiogenesis in Diabetic Wound Healing
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202500391
PMID:40364604
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研究论文 | 开发了一种光动力水凝胶，通过激活ALDH2减少中性粒细胞胞外诱捕网形成并促进血管生成，用于糖尿病伤口愈合 | 首次将ALDH2激活与免疫-血管双重调节策略相结合，直接靶向免疫调节与血管再生的相互作用机制 | NA | 解决糖尿病感染性伤口治疗中持续性感染、免疫反应受损和血管化不足等多重挑战 | 糖尿病伤口组织、中性粒细胞、巨噬细胞、内皮细胞 | 生物医学工程 | 糖尿病伤口 | 单细胞测序分析 | NA | 临床标本测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3438 | 2025-10-06 |
MatriCom, a single-cell RNA-sequencing data mining tool to infer cell-extracellular matrix interactions
2025-Jul-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.263927
PMID:40501363
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研究论文 | 开发了一个名为MatriCom的单细胞RNA测序数据挖掘工具，用于推断细胞与细胞外基质之间的相互作用 | 创建了包含超过25,000个经过整理的基质组相互作用的独特数据库MatriComDB，并开发了首个能够从scRNA-Seq数据推断ECM组分间以及不同细胞群与ECM间通讯的工具 | NA | 开发一个能够从单细胞RNA测序数据推断细胞外基质相互作用的数据挖掘工具 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞外基质组分和细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46个健康成人组织的scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3439 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics of stricturing Crohn's disease highlights a fibrosis-associated network
2025-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02225-y
PMID:40562913
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了克罗恩病纤维化相关的关键细胞网络和空间组织结构 | 首次将单细胞和空间转录组学技术配对应用于克罗恩病狭窄病变研究，揭示了炎症成纤维细胞与淋巴滤泡等关键细胞群体的空间共定位模式 | 样本量相对有限（61个样本，31名患者），且仅针对克罗恩病狭窄病变进行研究 | 阐明克罗恩病纤维化狭窄病变的转录组和细胞网络特征 | 克罗恩病患者和非炎症性肠病患者的肠道组织样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 61个样本（来自21名克罗恩病患者和10名非炎症性肠病患者） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3440 | 2025-10-06 |
Atlas of amnion development during the first trimester of human pregnancy
2025-Jul, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01696-9
PMID:40659869
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研究论文 | 通过单细胞转录组学绘制人类妊娠早期羊膜发育图谱，揭示其细胞组成和相互作用 | 首次在人类妊娠早期系统鉴定羊膜主要细胞类型和亚型，发现上皮-间质和上皮-免疫细胞转化过程 | 研究仅关注妊娠早期，未涵盖整个妊娠期羊膜发育过程 | 阐明人类羊膜在妊娠早期的发育机制和细胞相互作用 | 人类妊娠早期羊膜组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |