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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3421 - 3440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3421 | 2025-10-06 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and insights in Oryza sativa response to environmental stresses
2025-Jul-19, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10836-1
PMID:40682700
|
综述 | 系统综述了2017-2024年间单细胞RNA测序技术在水稻环境胁迫响应研究中的应用与进展 | 首次针对水稻单细胞RNA测序研究进行系统性总结，填补了该领域综述空白 | 仅涵盖2017-2024年间的研究，且专注于水稻单一物种 | 探讨单细胞RNA测序技术在水稻环境胁迫响应研究中的应用价值 | 水稻(Oryza sativa)及其根、叶、花、种子等组织 | 植物生物学 | 环境胁迫(低氮、高盐、缺铁、褐飞虱侵害) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), ATCT-seq, snRNA-seq, Stereo-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3422 | 2025-10-06 |
Sceptic: pseudotime analysis for time-series single-cell sequencing and imaging data
2025-Jul-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03679-3
PMID:40676652
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研究论文 | 提出一种用于时间序列单细胞数据的监督式伪时间分析方法Sceptic | 开发基于支持向量机的监督式伪时间分析方法，显著提高预测准确性并适用于多种单细胞数据类型 | NA | 解决现有单细胞伪时间分析方法预测准确性低且难以泛化到不同数据类型的问题 | 时间序列单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据和显微镜图像数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、显微镜成像 | 支持向量机(SVM) | 单细胞测序数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞成像 | NA | NA |
| 3423 | 2025-10-06 |
EDNRB2 regulates fate, migration, and maturation of hair cell precursors in regenerating avian auditory epithelium explants
2025-Jul-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502713122
PMID:40627393
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研究论文 | 本研究揭示了EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中对前体细胞命运、迁移和成熟的关键调控作用 | 首次发现EDNRB2信号通路在鸟类毛细胞再生过程中特异性调控前体细胞的迁移和成熟过程 | 研究基于体外培养的鸟类听觉上皮组织，与体内生理环境存在差异 | 阐明EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生中的具体功能机制 | 鸡基底乳头听觉上皮组织 | 发育生物学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序，RNA测序，组织学评估 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 鸡胚胎听觉上皮外植体培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3424 | 2025-10-06 |
Phenotypic heterogeneity and plasticity in colorectal cancer metastasis
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100881
PMID:40393458
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示结直肠癌转移过程中的表型异质性与可塑性调控机制 | 首次发现具有再生和炎症表型的中间态癌细胞群体，并鉴定AP-1和NF-κB作为关键转录调控因子 | 未明确说明样本量具体数值，调控机制验证需进一步实验证实 | 探究结直肠癌转移过程中表型异质性的调控因素和外在信号 | 原发性和转移性结直肠癌患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 3425 | 2025-10-06 |
SpaLinker identifies phenotype-associated spatial tumor microenvironment features by integrating bulk and spatial sequencing data
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100893
PMID:40480216
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研究论文 | 开发SpaLinker集成框架，通过整合空间转录组和bulk RNA-seq数据识别与表型相关的肿瘤微环境空间特征 | 首创表型驱动的计算框架，整合空间和bulk测序数据，在分子、细胞和组织结构三个层面解析空间分辨的肿瘤微环境 | 空间测序样本的临床注释数据稀缺 | 建立空间特征与临床表型的定量关联 | 肿瘤微环境空间特征 | 空间转录组学 | 泛癌种 | 空间转录组测序，bulk RNA-seq | 计算框架 | 空间转录组数据，bulk RNA-seq数据 | 多种肿瘤空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3426 | 2025-10-06 |
Integrin β1 activity controls colony morphology during human pluripotent stem cell state transitions
2025-Jul-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102538
PMID:40541174
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研究论文 | 本研究揭示了整合素β1在调控人类多能干细胞状态转换过程中对集落形态的关键作用 | 首次发现整合素β1活性通过调节细胞骨架和ERK信号通路控制多能干细胞状态转换过程中的集落形态重组 | 研究仅限于体外细胞模型，未涉及体内验证 | 探究整合素β1在调控人类诱导多能干细胞naive样和primed状态转换中的作用机制 | 人类诱导多能干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析, 功能分析 | NA | 基因表达数据, 形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3427 | 2025-10-06 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 提出了一种基于基因组语言模型的无参考框架spRefine，用于空间转录组数据的去噪和插补 | 利用基因组语言模型联合去噪和插补空间转录组数据，无需参考数据，提高了数据整合的鲁棒性 | NA | 解决空间转录组数据高噪声和基因测量缺失的问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学 | 深度学习框架，基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3428 | 2025-10-06 |
PROFET Predicts Continuous Gene Expression Dynamics from scRNA-seq Data to Elucidate Heterogeneity of Cancer Treatment Responses
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.662030
PMID:40631077
|
研究论文 | 开发PROFET计算框架从稀疏采样的单细胞RNA测序数据重建连续基因表达动态轨迹 | 提出基于Lipschitz正则化梯度流和神经力匹配的粒子流方法，首次实现从静态单细胞数据推断连续非线性基因表达动态 | 方法依赖于时间戳样本的可用性，在极稀疏采样情况下性能可能受限 | 研究癌症治疗响应异质性，特别是激素受体阳性乳腺癌对帕博西尼的治疗反应 | 小鼠和人类单细胞RNA测序数据，包括帕博西尼耐药乳腺癌细胞系和患者来源数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络，梯度流模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3429 | 2025-10-06 |
HMBOX1 reverses autophagy mediated 5-fluorouracil resistance through promoting HACE1-induced ubiquitination and degradation of ATG5 in colorectal cancer
2025-07, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2477443
PMID:40126194
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研究论文 | 本研究揭示了HMBOX1通过促进HACE1介导的ATG5泛素化降解逆转结直肠癌中自噬介导的5-氟尿嘧啶耐药机制 | 首次发现HMBOX1-HACE1-ATG5轴在调控结直肠癌化疗耐药中的关键作用，阐明了转录因子通过调控E3泛素连接酶影响自噬的新机制 | 研究主要基于细胞和临床组织验证，缺乏动物模型在体验证；临床样本量有限 | 探究HMBOX1在结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药中的作用机制 | 结直肠癌细胞系和临床组织样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 免疫染色, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 临床病理数据 | 结直肠癌患者组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学 | NA | NA |
| 3430 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analysis revealed cellular heterogeneity of glycosyltransferases in cervical cancer, and identified GALNT3-negative epithelial cells as a protective factor: a retrospective cohort study based on public database
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002520
PMID:40387729
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性，发现GALNT3阴性上皮细胞是保护性因素 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性，鉴定出GALNT3阴性上皮细胞作为保护因子 | 基于公共数据库的回顾性队列研究，需要进一步实验验证 | 探索糖基转移酶在宫颈癌中的作用机制 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 基于公共数据库的回顾性队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3431 | 2025-10-06 |
Evaluation of tumor pseudocapsule using computed tomography-based radiomics in pancreatic neuroendocrine tumors to predict prognosis and guide surgical strategy: a cohort study
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002511
PMID:40395025
|
研究论文 | 本研究通过CT影像组学评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态，以预测预后并指导手术策略 | 首次结合CT影像组学和机器学习术前识别假包膜状态，为小胰腺神经内分泌肿瘤的手术方式选择提供依据 | 单中心回顾性研究，样本量有限，需要外部验证 | 评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态对预后的影响并指导手术决策 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 医学影像分析 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序，CT影像组学分析 | 机器学习模型 | 医学影像，临床病理数据，单细胞测序数据 | 475例胰腺神经内分泌肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3432 | 2025-10-06 |
Potential of SPHK1 as a prognostic marker and therapeutic target in colorectal cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002506
PMID:40434736
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验分析探讨SPHK1在结直肠癌中的预后标志物和治疗靶点潜力 | 首次通过孟德尔随机化方法证实鞘磷脂水平与结直肠癌风险的因果关系，并结合单细胞RNA测序分析SPHK1与免疫浸润的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模临床验证 | 研究SPHK1在结直肠癌进展中的作用机制及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,多重荧光免疫组化,细胞迁移/侵袭/凋亡实验 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 90例结直肠癌组织和对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3433 | 2025-10-06 |
Microbiome Single Cell Atlases Generated with a Commercial Instrument
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409338
PMID:40462354
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研究论文 | 本文介绍了EASi-seq方法，通过改造商业单细胞测序平台实现对微生物的高通量单细胞基因组测序 | 首次将商业单细胞测序仪器成功应用于微生物单细胞基因组测序，开发了配套生物信息学流程 | 未明确说明方法在特定微生物类型或复杂环境样本中的适用性限制 | 开发适用于微生物的单细胞基因组测序方法 | 人类和环境微生物组中的单个微生物细胞 | 微生物组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组序列数据 | 每次运行可测序数万个微生物 | Mission Bio | 单细胞基因组测序 | Tapestri | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |
| 3434 | 2025-10-06 |
Identification of an immunomodulatory lncRNA signature associated with immune cell reprogramming in high-grade glioma
2025-Jul, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00919-3
PMID:40527978
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研究论文 | 本研究通过识别与高级别胶质瘤免疫细胞重编程相关的免疫调节性长链非编码RNA特征，揭示了其在肿瘤免疫微环境形成中的作用 | 首次在高级别胶质瘤中系统鉴定与免疫抑制和促炎性肿瘤微环境相关的lncRNA特征，并通过单细胞和空间转录组学揭示其细胞类型特异性和空间分布特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；机制研究尚不深入 | 探索lncRNAs在高级别胶质瘤免疫微环境形成中的作用机制 | 高级别胶质瘤肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 脑肿瘤/胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 转录组分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 两种小鼠模型(RCAS-PDGFb和RCAS-BRAF V600E)及GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3435 | 2025-10-06 |
Bidirectional mendelian randomization and single-cell sequencing reveal T cell-mediated causal links between COPD and lung adenocarcinoma
2025-Jul-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002448
PMID:40676822
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研究论文 | 通过双向孟德尔随机化和单细胞测序技术揭示T细胞介导的慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的因果关系 | 首次结合双向孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术探索COPD与肺腺癌之间的因果机制 | 研究样本量有限，仅关注了CD4+T细胞亚群，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探索慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的潜在关系和作用机制 | COPD和肺腺癌患者的CD4+T细胞亚群 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 来自COPD和肺腺癌患者外周血样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3436 | 2025-10-06 |
Mapping Genetic Associations With Functional Brain Area Alterations in Schizophrenia and Implications for Cortical Development
2025-Jul, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70688
PMID:40685676
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研究论文 | 本研究通过脑功能区域灰质体积变化与遗传因素关联分析，探索精神分裂症患者大脑皮层发育异常的潜在机制 | 首次系统性地将精神分裂症患者灰质体积变化定位到特定Brodmann脑功能区域，并结合GWAS和单细胞RNA测序技术揭示相关基因在皮层发育中的动态表达模式 | 样本量相对有限（194名患者和330名对照），且主要基于台湾人群，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别精神分裂症患者特定脑功能区域的灰质体积变化及其遗传基础，探索相关基因在皮层发育中的作用 | 精神分裂症患者和健康对照者的大脑灰质体积变化及遗传变异 | 神经影像遗传学 | 精神分裂症 | T1加权MRI、全基因组关联分析（GWAS）、单细胞RNA测序、原位杂交 | GWAS分析、单细胞转录组分析 | 脑影像数据、遗传数据、基因表达数据 | 194名精神分裂症患者和330名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3437 | 2025-10-06 |
Dissecting Sex-Specific Pathology in K18-hACE2 Transgenic Mice Infected With Different SARS-CoV-2 Variants
2025-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70506
PMID:40686017
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研究论文 | 本研究通过分析感染不同SARS-CoV-2变异株的K18-hACE2转基因小鼠，揭示性别特异性病理差异 | 首次系统比较不同SARS-CoV-2变异株（614G、Delta、Omicron）在转基因小鼠模型中引发的性别特异性病理差异 | 研究局限于K18-hACE2转基因小鼠模型，结果需在人类中进一步验证 | 解析COVID-19病理中性别差异与SARS-CoV-2变异株特异性关系 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织和鼻腔组织 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学，免疫组织化学，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，细胞浸润数据，细胞因子数据 | 年龄匹配的雌性和雄性K18-hACE2转基因小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3438 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analysis reveals novel targets in benign schwannoma using machine learning
2025-Jun-21, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过机器学习辅助的转录组和单细胞分析识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物，并构建疾病评估预测模型 | 首次识别出ANGPTL1、IL17RC、LTBR、OLR1和TGFBR1五个新型免疫相关生物标志物在良性神经鞘瘤中的功能作用 | 预测模型的曲线下面积仅为0.67，模型性能有待进一步提升 | 识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物并构建疾病评估预测模型 | 良性神经鞘瘤患者转录组数据和NF2基因敲除小鼠模型 | 机器学习 | 神经鞘瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM,Random Forest | 转录组数据 | GSE108524数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3439 | 2025-10-06 |
Immune reconstitution following allogeneic hematopoietic cell transplantation and CAR-T therapy: dynamics, determinants, and directions
2025-Jun, Best practice & research. Clinical haematology
DOI:10.1016/j.beha.2025.101634
PMID:40701740
|
综述 | 总结异基因造血细胞移植和CAR-T治疗后免疫重建的动态过程、影响因素及优化策略 | 系统比较allo-HCT与CAR-T治疗后的免疫重建特征，提出个性化监测和治疗策略 | NA | 探讨免疫重建的动态过程及其对临床结果的影响 | 接受异基因造血细胞移植和CAR-T治疗的患者 | NA | 血液系统疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3440 | 2025-10-06 |
High-resolution comparative single-cell transcriptomics of doublesex-expressing neurons reveals evolutionary conservation and diversity of sexual circuits in Drosophila
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652433
PMID:40654601
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较分析果蝇属中表达doublesex基因的神经元，揭示性行为神经回路在进化中的保守性和多样性 | 首次在多个果蝇物种中系统比较性决定基因表达神经元的单细胞转录组，揭示细胞类型作为独立进化单元的特性 | 研究主要关注doublesex表达神经元，可能未涵盖所有参与性行为的神经元类型 | 探究神经回路在进化过程中的细胞和分子组成变化机制 | 果蝇属多个物种中表达doublesex基因的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个果蝇物种的雄性个体，包括一个物种的雌性数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |