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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3401 | 2025-10-06 |
An adeno-associated virus gene therapy strategy for anti-obesity treatment by nanocarrier-based delivery systems
2025-Jul-21, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03595-5
PMID:40685368
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研究论文 | 本研究通过纳米载体递送AAV基因疗法增强肠道内分泌细胞中Scg2表达,探索抗肥胖治疗新策略 | 开发了能够长期粘附肠道上皮的交联纳米颗粒载体系统,首次证明Scg2在调节代谢激素GLP-1和PYY分泌中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索通过基因疗法治疗代谢紊乱和肥胖的新方法 | 无菌小鼠、常规饲养小鼠、高脂饮食小鼠和ob/ob基因型小鼠 | 基因治疗 | 肥胖症 | 单细胞转录组分析、多组学分析、AAV基因递送 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3402 | 2025-10-06 |
Differential expression pattern of CC chemokine receptor 7 guides precision treatment of hepatocellular carcinoma
2025-Jul-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02308-6
PMID:40685403
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研究论文 | 本研究通过分析CC趋化因子受体7在肝细胞癌中的差异表达模式,指导肝癌精准治疗 | 首次揭示肿瘤细胞来源与基质细胞来源的CCR7表达具有相反效应,并发现VEGF-C通过激活淋巴管生成和CCL21/CCR7轴促进三级淋巴结构形成 | 临床前研究结果需要进一步临床试验验证 | 探索肝细胞癌微环境中CCR7的差异表达模式及其对精准治疗的指导意义 | 肝细胞癌患者组织和细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 组织芯片、空间转录组、单细胞测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 图像、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
3403 | 2025-10-06 |
Exploring Immunogenetic Mechanisms in Parkinson's Disease Using Single-Cell Transcriptomics and Mendelian Randomization
2025-Jul-21, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法探索帕金森病的免疫遗传机制 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示帕金森病中免疫细胞浸润和转录调控的新机制 | 受限于人群异质性和因果关系推断的挑战 | 探究帕金森病的免疫遗传机制 | 帕金森病患者和对照组的免疫细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3404 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing uncovers abnormal Sertoli-cell elevation and testicular niche impairment in the transfemales's testis
2025-Jul-20, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01445-3
PMID:40685388
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示跨性别女性睾丸中支持细胞异常增多和睾丸微环境损伤的机制 | 首次在跨性别女性睾丸中发现支持细胞数量异常增加及β-连环蛋白核转位现象 | 样本量有限,未涵盖所有年龄段的跨性别女性 | 研究性别肯定激素治疗对睾丸细胞组成和分子通路的影响 | 跨性别女性睾丸组织细胞 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 实时定量PCR, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 约49,385个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3405 | 2025-10-06 |
CXCL12/CXCR4 modulates macrophage efferocytosis to induce glomerular crescent formation and fibrosis via ELMO1/DOCK180/RAC1 signaling in ANCA-associated glomerulonephritis
2025-Jul-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05750-5
PMID:40682610
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研究论文 | 本研究揭示CXCL12/CXCR4信号轴通过调控巨噬细胞胞葬作用促进ANCA相关性肾小球肾炎新月体形成和纤维化的机制 | 首次阐明内皮细胞与单核/巨噬细胞间通过CXCL12/CXCR4信号轴建立特异性分子对话机制,发现ELMO1/DOCK180/RAC1信号通路介导的胞葬作用在疾病进展中的关键作用 | 未明确说明样本规模和具体实验模型的局限性 | 探究ANCA相关性肾小球肾炎中单核细胞募集和巨噬细胞极化的调控机制 | ANCA相关性肾小球肾炎患者样本、单核细胞、巨噬细胞、肾小球内皮细胞 | 分子病理学 | ANCA相关性肾小球肾炎 | 单细胞测序、蛋白相互作用分析、体外实验、体内实验 | EAV模型 | 单细胞测序数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3406 | 2025-10-06 |
Cardiomyocyte OTUD1 drives diabetic cardiomyopathy via directly deubiquitinating AMPKα2 and inducing mitochondrial dysfunction
2025-Jul-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61901-z
PMID:40683882
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研究论文 | 本研究揭示了去泛素化酶OTUD1通过直接去泛素化AMPKα2诱导线粒体功能障碍,从而驱动糖尿病心肌病的分子机制 | 首次发现OTUD1是AMPK的直接调控去泛素化酶,并揭示了OTUD1-AMPK信号轴在糖尿病心肌病中的关键作用 | 研究主要聚焦于雄性小鼠模型,缺乏雌性动物验证;临床转化价值需进一步验证 | 探究去泛素化酶OTUD1在糖尿病心肌病发病中的作用及调控机制 | 1型和2型糖尿病雄性小鼠模型及心肌细胞 | 分子生物学 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,蛋白相互作用分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白互作数据,生理功能数据 | 糖尿病小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3407 | 2025-10-06 |
Multi-cohort analysis identifies a blood-based immune transcriptomic signature for early lung cancer detection
2025-Jul-19, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01043-z
PMID:40684032
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研究论文 | 通过多队列分析识别出基于血液的免疫转录组特征用于肺癌早期检测 | 首次通过大规模多队列血液转录组meta分析识别出6个基因组成的肺癌特征,该特征主要来源于髓系细胞,在肿瘤相关巨噬细胞和成纤维细胞中表达更高 | 需要进一步临床验证和开发 | 开发基于血液的肺癌早期检测方法 | 肺癌患者、健康对照和其他疾病患者的血液样本 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 诊断分类器 | 转录组数据 | 发现阶段:432例肺癌,8154例健康对照,14187例其他疾病;验证阶段:371名受试者(172例肺癌),454名Framingham研究受试者(42例肺癌);单细胞数据:1,022,063个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
3408 | 2025-10-06 |
From preneoplastic lesion to heterogenous tumor: recent insights into hepatoblastoma biology and therapeutic opportunities
2025-Jul-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02405-8
PMID:40684183
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综述 | 本文综述了肝母细胞瘤生物学特征的最新发现及治疗机会 | 整合单细胞RNA测序、多组学、空间转录组学和功能基因组学筛选揭示肿瘤异质性机制 | NA | 总结肝母细胞瘤生物学特征以推进治疗策略 | 小儿肝母细胞瘤细胞、肿瘤相关细胞类型及遗传依赖性 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学, 空间转录组学, 功能基因组学筛选 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
3409 | 2025-10-06 |
GeneSurfer enables transcriptome-wide exploration and annotation of gene co-expression modules in 3D spatial transcriptomics data
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112713
PMID:40678514
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研究论文 | 开发了GeneSurfer交互式界面,用于探索3D空间转录组数据中局部基因共表达模式 | 首个设计用于在大规模数据集中探索局部基因共表达模式的交互式分析工具 | NA | 开发空间转录组数据中基因共表达模式的探索和注释工具 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
3410 | 2025-10-06 |
Bering: joint cell segmentation and annotation for spatial transcriptomics with transferred graph embeddings
2025-Jul-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60898-9
PMID:40681510
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研究论文 | 提出Bering图深度学习模型,利用转录本共定位关系进行空间转录组学的联合细胞分割和分子注释 | 首次提出利用转录本共定位关系进行联合噪声感知细胞分割和分子注释的图深度学习模型,构建预训练模型并通过迁移学习和自蒸馏实现高精度分割 | 未明确说明模型在特定组织类型或技术平台上的局限性 | 解决空间转录组学中细胞分割和注释的准确性问题 | 2D和3D空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图深度学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3411 | 2025-10-06 |
The pro-cancer and immunosuppressive activity of macrophage-transformed cancer-associated fibroblasts in oral squamous cell carcinoma
2025-Jul-18, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.027
PMID:40684939
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研究论文 | 本研究揭示了口腔鳞状细胞癌中巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)的存在及其通过CXCL10途径促进肿瘤进展和免疫抑制的机制 | 首次在口腔鳞状细胞癌中证实巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的存在,并阐明其通过CXCL10促进髓源性抑制细胞归巢和功能的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步深入 | 探究巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的起源、功能特征及其在口腔鳞状细胞癌中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化细胞 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 流式细胞术, 假时序分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据, 流式细胞数据 | 口腔鳞状细胞癌病理切片、同种异体移植肿瘤和皮下肿瘤模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3412 | 2025-10-06 |
Machine learning assisted immune profiling of COPD identifies a unique emphysema subtype independent of GOLD stage
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112966
PMID:40687815
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研究论文 | 通过机器学习辅助的免疫分析识别出独立于GOLD分期的独特肺气肿亚型 | 首次结合多组学技术和机器学习算法识别出与肺气肿严重程度相关的独特免疫亚型 | 样本量未明确说明,需要进一步验证研究 | 探索COPD免疫特征与疾病异质性的关系 | 慢性阻塞性肺疾病患者 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 流式细胞术,细胞因子分析,单细胞转录组学,空间转录组学,机器学习算法 | 机器学习算法 | 细胞数据,分子数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | NA |
3413 | 2025-10-06 |
Single cell immune profiling in ankylosing spondylitis reveals resistance of CD8+ T cells to immune exhaustion
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112715
PMID:40687839
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了强直性脊柱炎中CD8+ T细胞对免疫耗竭的抵抗机制 | 发现强直性脊柱炎滑膜液中存在克隆扩增的细胞毒性T细胞亚群,这些细胞虽表达抑制性受体但保持效应功能,并下调典型耗竭标志物 | NA | 探究强直性脊柱炎中细胞毒性T细胞的免疫耗竭抵抗机制 | 强直性脊柱炎患者的滑膜液中的细胞毒性T细胞 | 单细胞生物学 | 强直性脊柱炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3414 | 2025-10-06 |
Gastric cancer adapts high lipid microenvironment via suppressing PPARG-FABP1 axis after arriving in the lymph node
2025-Jul-17, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103759
PMID:40694956
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研究论文 | 本研究探讨胃癌细胞在淋巴结转移过程中通过抑制PPARG-FABP1轴适应高脂微环境的机制 | 首次揭示胃癌细胞通过下调PPARγ-FABP1轴抑制花生四烯酸摄取从而避免铁死亡的适应性机制 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析,缺乏体内功能验证实验 | 研究胃癌细胞在淋巴结转移过程中的脂代谢重编程机制 | 胃癌细胞和淋巴结转移微环境 | 癌症代谢研究 | 胃癌 | 非靶向脂质组学测序,RNA测序,单细胞测序,透射电镜,ChIP-qPCR | NA | 脂质组数据,转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,脂质组学 | NA | NA |
3415 | 2025-10-06 |
Cluster-independent multiscale marker identification in single-cell RNA-seq data using localized marker detector (LMD)
2025-Jul-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08485-y
PMID:40670619
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研究论文 | 提出一种名为LMD的新工具,用于在单细胞RNA-seq数据中识别局部基因标记 | 开发了基于细胞-细胞亲和图的扩散动力学评分方法,能够以多分辨率和细粒度方式识别细胞群体特异性基因标记 | NA | 开发更准确的单细胞RNA-seq数据标记基因识别方法 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图扩散算法 | 基因表达数据 | 十个单细胞RNA测序数据集,包括小鼠骨髓和毛囊真皮凝集数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3416 | 2025-10-06 |
Pan-Cancer Spatial Profiling Reveals Conserved Subtypes and Niches of Cancer-Associated Fibroblasts
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2181
PMID:40440095
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研究论文 | 通过泛癌空间分析识别出四种保守的癌症相关成纤维细胞亚型及其空间生态位 | 首次基于空间邻域信息进行CAF亚型的从头发现,将空间组织确立为CAF异质性的定义轴 | NA | 建立空间背景与CAF身份之间的联系,重新定义CAF分类框架 | 多种癌症类型中的癌症相关成纤维细胞 | 计算生物学 | 多种癌症 | 单细胞空间多组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间多组学 | NA | NA |
3417 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals PAX5-mediated naïve B cell differentiation defect in severe adenoid hypertrophy
2025-Jul-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114675
PMID:40675241
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示严重腺样体肥大中PAX5介导的幼稚B细胞分化缺陷 | 首次在单细胞分辨率下揭示腺样体肥大中B细胞分化受阻的分子机制,发现PAX5异常高表达导致幼稚B细胞积累 | 样本量有限,未进行功能验证实验,机制研究不够深入 | 探究腺样体肥大的分子机制和细胞组成特征 | 儿科腺样体肥大患者的腺体组织样本 | 单细胞组学 | 腺样体肥大 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 45,917个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3418 | 2025-10-06 |
Interleukin-27-producing cells in gram-negative neonatal sepsis display diverse phenotypes and functions in the liver
2025-Jul-14, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlaf026
PMID:40682363
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了革兰氏阴性新生儿败血症中肝脏IL-27产生细胞的表型和功能多样性 | 首次在单细胞水平解析新生儿败血症中IL-27产生细胞的异质性及其功能特征 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究新生儿败血症中IL-27产生细胞的特性及其在免疫失调中的作用 | 新生IL-27p28eGFP报告基因小鼠和表达荧光素酶的K1荚膜大肠杆菌 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,全动物成像 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3419 | 2025-10-06 |
NeuN expression in health and disease: A histological perspective on neuronal heterogeneity
2025-Jul-11, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-18-965
PMID:40697072
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综述 | 从组织学角度探讨NeuN表达在健康和疾病状态下的神经元异质性 | 提出NeuN不应被视为二元标记物,而是神经元状态的动态指标,并建议采用多标记策略和空间转录组学等分子工具 | NA | 综述NeuN表达模式、分子调控机制及其对研究和诊断的意义 | 神经元核抗原(NeuN/Rbfox3)及其在不同神经元类型和病理条件下的表达 | 神经病理学 | 神经退行性疾病 | 免疫组织化学, 空间转录组学, RNA测序 | NA | 组织学数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |
3420 | 2025-10-06 |
SpaDCN: Deciphering Spatial Functional Landscape from Spatially Resolved Transcriptomics by Aligning Cell-Cell Communications
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402111
PMID:39962819
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研究论文 | 提出一种名为SpaDCN的空间动态图卷积网络框架,通过整合细胞间通讯和基因表达数据来识别空间功能区域 | 首次将细胞间通讯动态与基因表达在空间背景下对齐,采用动态图卷积在节点图和边图之间切换传播 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病背景下的适用性限制 | 从空间分辨转录组数据中解析空间功能景观 | 空间分辨转录组数据中的细胞和组织结构 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间分辨转录组技术 | 动态图卷积网络 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |