单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3401 - 3420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3401 | 2025-10-06 |
Integration of whole transcriptome spatial profiling with protein markers
2023-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01536-3
PMID:36593397
|
研究论文 | 开发了一种名为SPOTS的高通量空间转录组和蛋白质组同步分析技术 | 首次实现了空间转录组和蛋白质组的实验性整合，显著提高了信号分辨率和细胞聚类能力 | NA | 开发能够同时分析空间转录组和蛋白质组的技术方法 | 组织区域中的基因表达和蛋白质分布 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序, 蛋白质组分析 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | SPOTS | Spatial PrOtein and Transcriptome Sequencing (SPOTS) 高通量同步空间转录组和蛋白质分析平台 |
| 3402 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of human nasal mucosal IgE antibody secreting cells reveals a newly minted phenotype
2023-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.02.008
PMID:36931600
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类鼻黏膜IgE抗体分泌细胞，揭示其新近形成的表型特征 | 首次在过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中发现IgE抗体分泌细胞具有早期新生浆细胞表型特征 | 样本量较小（n=3），仅针对鼻息肉组织进行研究 | 探究过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻黏膜中IgE抗体分泌细胞的表型和功能特征 | 过敏性真菌性鼻窦炎患者的鼻息肉组织 | 单细胞组学 | 过敏性真菌性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序，Ig基因谱系分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者鼻息肉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3403 | 2025-10-06 |
T cell characteristics associated with toxicity to immune checkpoint blockade in patients with melanoma
2022-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01623-z
PMID:35027754
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析黑色素瘤患者外周血样本，发现与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 首次发现循环中活化的CD4记忆T细胞丰度和TCR多样性这两个治疗前因素与严重免疫相关不良事件的发生相关 | 样本量相对有限（共3个队列，n=27、26和18），需要更大规模研究验证 | 探索与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 接受抗PD-1单药或抗PD-1联合抗CTLA-4治疗的黑色素瘤患者 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 飞行时间质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序 | NA | 单细胞测序数据，质谱流式数据，RNA测序数据 | 93份治疗前和早期治疗血液样本，3个患者队列（n=27、26和18） | NA | 单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序，质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 3404 | 2025-10-06 |
POSTN is exclusively activated in cancer-associated fibroblasts and leads to unfavorable prognosis of patients with gastric cancer
2025-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2877
PMID:40692747
|
研究论文 | 本研究通过分析胃癌肿瘤微环境，发现POSTN在癌症相关成纤维细胞中特异性激活并与不良预后相关 | 首次揭示POSTN在胃癌CAFs中特异性高表达，并受YAP1/TEAD1共转录因子直接调控 | 研究主要基于公共数据库和免疫组化数据，需要进一步实验验证机制 | 探索胃癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的分子标志物及其在耐药性中的作用 | 胃癌患者肿瘤样本和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据,组织染色图像 | 内部队列胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3405 | 2025-10-06 |
Rethinking eco-evo studies of gene expression for non-model organisms in the genomic era
2025-Aug, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17378
PMID:38721834
|
综述 | 探讨基因组时代新技术对非模式生物基因表达研究的潜在影响 | 提出将长读长测序和单细胞RNA测序技术整合应用于生态基因组学研究的新视角 | NA | 评估新兴基因组技术对非模式生物基因表达研究的推动作用 | 非模式生物的基因表达研究 | 生态基因组学 | NA | 长读长测序, 单细胞RNA测序, 传统RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3406 | 2025-10-06 |
NFATc1 Fosters Allergic Contact Dermatitis Responses by Enhancing the Induction of IL-17-Producing CD8 Cells
2025-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.11.014
PMID:39733935
|
研究论文 | 本研究揭示NFATc1通过促进CD8+T细胞向Tc17细胞分化来增强过敏性接触性皮炎反应 | 首次发现NFATc1通过调控CD8+T细胞分化命运，促进Tc17细胞生成并加重过敏性接触性皮炎 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究NFATc1在过敏性接触性皮炎发病机制中的作用 | 小鼠CD8+T细胞和过敏性接触性皮炎模型 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 单细胞RNA测序，细胞极化实验，过继转移实验 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 野生型和Nfatc1条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3407 | 2025-10-06 |
Long-Term High-Fat Diet Affected Bone Marrow Microenvironment During Aging at Single-Cell Resolution
2025-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70276
PMID:40692664
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示长期高脂饮食对衰老过程中骨髓微环境的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明长期高脂饮食通过骨髓微环境加速衰老的机制，发现骨髓巨噬细胞中Chil3和Fabp4上调及Ptn-Sdc3、Cxcl12-Cxcr4轴等新型信号通路 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究长期高脂饮食如何通过影响骨髓微环境加速衰老过程 | 长期高脂饮食喂养的衰老小鼠模型及其骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | LHA小鼠模型的骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3408 | 2025-10-06 |
Generation of Porcine Blastoids from Embryonic Stem Cells
2025-Jul-25, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_651
PMID:40705202
|
研究论文 | 本研究开发了一种从猪胚胎干细胞生成类囊胚结构的方法 | 建立了首个猪胚胎干细胞来源的类囊胚三维两步分化策略 | NA | 开发大动物胚胎发育研究模型以加速育种进程 | 猪胚胎干细胞和类囊胚结构 | 发育生物学 | NA | 三维分化策略、单细胞转录组分析 | NA | 形态学数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3409 | 2025-10-06 |
Prognostic significance of somatic mutations in myeloid cells of men with chronic heart failure - interaction between loss of Y chromosome and clonal haematopoiesis
2025-Jul-24, European journal of heart failure
IF:16.9Q1
DOI:10.1002/ejhf.3778
PMID:40702883
|
研究论文 | 本研究探讨了男性慢性心力衰竭患者中Y染色体缺失和克隆性造血相关体细胞突变的预后意义 | 首次揭示了Y染色体缺失与DNMT3A/TET2突变在慢性心力衰竭中的协同作用及其对单核细胞促纤维化信号通路的影响 | 研究仅针对男性患者，样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 评估Y染色体缺失和克隆性造血突变在慢性心力衰竭患者中的预后价值 | 781名男性慢性心力衰竭患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因突变分析 | 预后分析模型 | 基因组数据，临床数据 | 781名男性慢性心力衰竭患者，包含验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3410 | 2025-10-06 |
Enhancing and accelerating cell type deconvolution of large-scale spatial transcriptomics slices with dual network model
2025-Jul-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf419
PMID:40704686
|
研究论文 | 提出一种基于双网络模型的快速细胞类型反卷积算法jMF2D，用于增强大规模空间转录组切片的细胞类型解析 | 通过联合学习细胞类型相似性网络来桥接scRNA-seq和空间转录组数据，提高细胞类型特征的准确性，同时节省约90%的运行时间 | NA | 开发快速准确的细胞类型反卷积算法以分析空间转录组数据 | 空间转录组切片中的细胞类型分布 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 非负矩阵分解，网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3411 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Murine Limbal Epithelia Reveals Gas1 as a Novel Stem/Progenitor Cell Marker for the Corneal Epithelium
2025-Jul-24, Cornea
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/ICO.0000000000003938
PMID:40704715
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术鉴定小鼠角膜缘上皮中Gas1作为角膜上皮干细胞/祖细胞的新型标志物 | 首次发现Gas1可作为角膜缘上皮干细胞的特异性表面标志物，为干细胞分离和富集提供新工具 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 鉴定角膜缘上皮干细胞的特异性标志物 | 小鼠角膜缘上皮细胞 | 单细胞测序 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 5-60周龄小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | SmartSeq-2 | SmartSeq-2单细胞转录组测序技术 |
| 3412 | 2025-10-06 |
Identification of shared pathogenetic mechanisms between endometriosis and RSA based on comprehensive bioinformatics analysis
2025-Jul-24, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03596-1
PMID:40705269
|
研究论文 | 通过生物信息学分析识别子宫内膜异位症和复发性流产之间的共同分子机制和关键基因FXYD1 | 首次发现FXYD1作为连接子宫内膜异位症和复发性流产的关键分子，通过单细胞RNA测序验证其在基质细胞和蜕膜细胞中的表达 | 研究主要基于公共数据库分析，需要进一步实验验证机制 | 探索子宫内膜异位症和复发性流产之间的共同分子机制 | 子宫内膜异位症和复发性流产患者样本 | 生物信息学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, ROC分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GSE7305和GSE165004数据集的样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3413 | 2025-10-06 |
Decellularized small intestinal hydrogel-encapsulated BMSCs attenuate dextran sulfate sodium-induced colitis in mice via immunomodulation and tissue repair
2025-Jul-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb00706b
PMID:40566954
|
研究论文 | 本研究开发了一种脱细胞小肠水凝胶递送系统，用于包裹大鼠骨髓间充质干细胞，通过免疫调节和组织修复缓解小鼠结肠炎 | 首次将脱细胞小肠水凝胶与骨髓间充质干细胞结合，通过直肠靶向给药治疗结肠炎，展现出优于传统PLGA-PEG-PLGA水凝胶的生物活性和治疗效果 | 需要进一步研究水凝胶与干细胞的相互作用机制，优化给药方案，并通过单细胞RNA测序阐明免疫调节机制 | 开发有效的炎症性肠病治疗策略 | 小鼠结肠炎模型和大鼠骨髓间充质干细胞 | 组织工程与再生医学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3414 | 2025-10-06 |
LineGRN: a line graph neural network for gene regulatory network inference
2025-Jul-23, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3591840
PMID:40699953
|
研究论文 | 提出一种基于线图神经网络的新框架LineGRN，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 通过线图转换构建高节点度主导的局部网络拓扑，更有效地捕捉基因对之间的关联模式并提升信息传播效率 | 未明确说明模型在处理超大规模基因网络时的计算效率问题 | 开发更准确的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络中的转录因子与靶基因相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3415 | 2025-10-06 |
Down-regulation of IGFBP2 mediates endometrial epithelial cells senescence in thin endometrium
2025-Jul-23, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf032
PMID:40700608
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现IGFBP2下调介导子宫内膜上皮细胞衰老是薄型子宫内膜的关键致病机制 | 首次在单细胞水平揭示IGFBP2通过PI3K/AKT信号通路调控PTEN活性影响P21积累介导细胞衰老的新机制 | 研究样本量有限，动物模型通过刮宫联合H2O2灌注建立可能与人类自然发病机制存在差异 | 探究薄型子宫内膜的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 薄型子宫内膜患者样本、人原代子宫内膜上皮细胞、Ishikawa细胞系、TE小鼠模型 | 单细胞生物学 | 妇科生殖疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3416 | 2025-10-06 |
Molecular mechanism of potently neutralizing human monoclonal antibodies against severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-Jul-22, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00533-25
PMID:40539781
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序从SFTS幸存者中分离出高效中和单克隆抗体，并验证其对SFTS病毒感染的防护效果 | 首次报道针对SFTS病毒Gn糖蛋白的超高中和活性人源单克隆抗体，并解析了抗体-抗原复合物的晶体结构 | 动物实验仅在鼠模型中进行，尚未开展人体临床试验 | 开发针对SFTS病毒的特异性抗病毒治疗方法 | SFTS病毒及其Gn糖蛋白 | 传染病学 | 发热伴血小板减少综合征 | 单细胞RNA-seq, X射线晶体学, 中和实验 | NA | 基因序列数据, 结构生物学数据 | 从SFTS幸存者中分离多个单克隆抗体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3417 | 2025-10-06 |
Integrative causal and single-cell analyses reveal genes responsive to endocrine disruptors driving human male infertility
2025-Jul-22, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118709
PMID:40700968
|
研究论文 | 通过整合因果分析和单细胞测序技术，揭示内分泌干扰物响应基因在男性不育症中的作用机制 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序，系统鉴定与内分泌干扰物相关的男性不育致病基因 | 研究主要基于遗传变异和基因表达数据，需要进一步实验验证具体的分子机制 | 探索内分泌干扰物通过调控基因表达导致男性不育的分子机制 | 人类睾丸组织及与男性不育相关的基因 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 共定位分析 | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 | 大规模cis-eQTL和GWAS数据集，包含人类睾丸组织单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3418 | 2025-10-06 |
Differential molecular signatures in response to CD19-CAR T cell therapy compared with conventional pharmacotherapy in systemic lupus erythematosus
2025-Jul-22, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.2132
PMID:40701862
|
研究论文 | 比较CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮中诱导的分子特征差异 | 首次系统比较CD19-CAR T细胞疗法与传统药物在SLE治疗中的分子机制差异，揭示CAR-T疗法特有的免疫通路抑制和代谢重编程特征 | 样本量有限（仅7例CAR-T治疗患者），单中心研究，需要更大规模验证 | 阐明CD19-CAR T细胞疗法在系统性红斑狼疮中的分子作用机制 | 系统性红斑狼疮患者 | 生物医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，功能分析，基因集富集分析 | NA | 基因表达数据，转录组数据 | 7例CD19-CAR T治疗患者，30例标准药物治疗缓解患者，31例利妥昔单抗/贝利木单抗/环磷酰胺治疗患者 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3419 | 2025-10-06 |
Systematic characterization of full-length RNA isoforms in human colorectal cancer at single-cell resolution
2025-Jul-22, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf049
PMID:40702779
|
研究论文 | 通过单细胞长读长RNA测序系统表征人类结直肠癌中的全长RNA亚型 | 首次在单细胞分辨率下使用高深度长读长scRNA-seq技术系统分析结直肠癌全长转录组，揭示了癌症细胞中广泛的亚型多样性和剪接改变 | 样本量相对有限（12名患者），需要更大规模验证 | 系统表征结直肠癌中全长RNA亚型的特征和功能 | 结直肠癌患者的结直肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3420 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial multiomics identifies heterogeneous xylem development driven by mechanical stress in Populus
2025-Jul-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.038
PMID:40701155
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术揭示了机械应力驱动的杨树木材异质性发育机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学技术，系统解析了正常木材和应力木材中纤维细胞的发育异质性 | 研究主要聚焦于杨树特定发育阶段，其他树种或发育阶段的普适性需要进一步验证 | 探究机械应力下木材形成的细胞发育异质性和分子调控机制 | 杨树正常木材、应力木材和对侧木材的纤维细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 代谢物数据, 蛋白质磷酸化数据 | 杨树正常木材、应力木材和对侧木材样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |