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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 3401 - 3420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3401 | 2026-02-15 |
TGFβ signaling promotes cell cycle progression and resistance to the CDK4/6 inhibitor palbociclib through SOX4 transcriptional modulation in breast cancer cells
2026-Feb-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08435-4
PMID:41639049
|
研究论文 | 本研究揭示了TGFβ信号通过SOX4转录调控促进乳腺癌细胞周期进程和CDK4/6抑制剂帕博西尼耐药的新机制 | 首次发现TGFβ通过诱导SMAD3与SOX4的相互作用，激活细胞周期和DNA损伤应答通路，从而促进乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性 | 研究主要基于细胞系模型和3D培养系统，体内验证和临床相关性需要进一步研究 | 解析TGFβ信号在乳腺癌进展中的时空调控机制及其对靶向治疗耐药的影响 | 人乳腺上皮细胞系（MCF-10A及其HRAS转化型）和原发性乳腺癌肿瘤样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 染色质可及性分析、转录组分析、单细胞RNA测序 | 3D细胞培养模型 | 基因组、转录组、单细胞转录组数据 | 等基因细胞系模型（MCF-10A及其HRAS转化型）和原发性乳腺癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3402 | 2026-02-15 |
STransfer: a transfer learning-enhanced graph convolutional network for clustering spatial transcriptomics data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag049
PMID:41601194
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研究论文 | 本文提出了一种名为STransfer的迁移学习框架，结合图卷积网络和正点互信息，用于聚类空间转录组数据，以捕获局部和全局空间依赖性 | STransfer通过迁移学习将标记切片的知识迁移到相邻未标记切片，提高了聚类准确性并减少了手动标注成本，同时引入了基于注意力的模块融合多图特征 | NA | 开发一种增强空间转录组数据聚类的方法，以更好地捕获空间结构并处理多切片数据集中的相似性 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3403 | 2026-02-15 |
Multimodal foundation transformer models for multiscale genomics
2026-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02918-6
PMID:41326819
|
综述 | 本文探讨了基于Transformer的模型在整合和分析多尺度基因组学数据（包括基因组序列、单细胞转录组学和空间数据）中的最新进展和应用 | 提出了将Transformer模型分为三个层级的分类框架，并展望了利用交叉注意力机制整合异质模态的模块化‘超级Transformer’架构设计 | 讨论了模型在标记化、可解释性和可扩展性方面面临的挑战 | 为在多尺度、多模态基因组学中利用Transformer模型提供资源和技术路线图 | 多尺度生物数据，包括基因组序列、单细胞转录组学和空间数据 | 机器学习 | NA | NA | Transformer, 大型语言模型 | 基因组序列, 单细胞转录组数据, 空间数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3404 | 2026-02-15 |
SpaceBar enables single-cell-resolution clone tracing with imaging-based spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02968-w
PMID:41413345
|
研究论文 | SpaceBar是一种方法，能够在标准成像空间转录组学流程中同时实现克隆追踪和空间基因表达分析 | 开发了SpaceBar方法，通过96个合成条形码序列组合标记细胞，解决了成像空间转录组学与随机条形码克隆追踪方法不兼容的问题 | NA | 实现在复杂组织环境中同时检测克隆和空间驱动因素 | 细胞 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 成像空间转录组学 | NA | NA |
| 3405 | 2026-02-15 |
Bridging the dimensional gap from planar spatial transcriptomics to 3D cell atlases
2026-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02969-9
PMID:41476112
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SpatialZ的计算框架，用于从平面空间转录组学数据生成虚拟切片，从而构建密集的三维细胞图谱 | 开发了SpatialZ框架，能够独立于特定空间技术的基因覆盖限制，在单细胞分辨率下生成虚拟切片，填补了实验测量切片之间的间隙，实现了从稀疏二维切片到密集三维细胞图谱的转换 | 未明确提及具体的技术限制或数据依赖性，可能依赖于输入数据的质量和覆盖范围 | 解决从平面空间转录组学数据构建全面三维细胞图谱的挑战，以更好地理解连续器官组织和空间分子景观 | 小鼠大脑半球（基于BRAIN Initiative Cell Census Network数据）和人类乳腺癌组织（基于成像质谱流式数据） | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，成像质谱流式 | 计算框架（SpatialZ） | 空间转录组学数据，成像质谱流式数据 | 超过3800万个细胞（来自小鼠大脑半球三维图谱） | NA | 空间转录组学，成像质谱流式 | NA | NA |
| 3406 | 2026-02-15 |
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-Feb, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00672-6
PMID:41484377
|
研究论文 | 本研究揭示了果蝇卵泡细胞中胰岛素受体活性激增通过上调CrebA驱动卵黄生成的作用机制 | 首次在果蝇卵泡细胞中观察到胰岛素受体活性的阶段性激增，并发现该激增受母体高糖饮食干扰；揭示了CrebA作为胰岛素信号阶段特异性效应的关键执行者，将胰岛素信号与卵泡细胞分泌能力提升直接联系起来；证明了胰岛素-FoxO-CrebA调控轴在人类颗粒细胞中的保守性 | 研究主要基于果蝇模型，虽然证明了调控轴在人类细胞中的保守性，但在哺乳动物体内的生理功能验证仍需进一步研究；单细胞RNA-seq分析聚焦于特定发育阶段，对更广泛的发育动态覆盖有限 | 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞发育和卵黄生成过程中的作用机制 | 果蝇卵泡细胞，人类颗粒细胞 | 发育生物学，细胞信号转导 | NA | 单细胞RNA-seq，相分离报告系统 | NA | 基因表达数据，信号活性数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及果蝇卵泡细胞单细胞测序及人类细胞验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3407 | 2026-02-15 |
Single-cell omics in investigating the effect of CAFs with KRAS overexpression on the malignant progression of anaplastic thyroid cancer
2026-Feb-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000001334
PMID:41486477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞在促进未分化甲状腺癌恶性进展中的作用机制 | 首次在单细胞水平上解析了未分化甲状腺癌中成纤维细胞亚群KRAS的表达特征，并明确了Fib_KRAS+这一特异性亚群在ATC中的存在及其功能 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证；样本量未明确说明；KRAS抑制剂BI-2865的具体作用机制需进一步探究 | 揭示KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞对未分化甲状腺癌恶性生物学行为的影响 | 未分化甲状腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、癌旁组织成纤维细胞 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3408 | 2026-01-10 |
Revealing high-resolution spatial metagenes from spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01848-x
PMID:41507531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3409 | 2026-02-15 |
Microenvironmental niches dictate divergent fibroblast fates in reversible versus progressive lung fibrosis
2026-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106142
PMID:41619352
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，比较了不同间质性肺病中微环境对成纤维细胞命运的调控机制 | 首次在疾病原位比较了不同间质性肺病表型中特异性细胞微环境如何塑造成纤维细胞命运，揭示了可逆修复与进行性纤维化之间的转换机制 | 研究主要基于体外实验验证，体内微环境的复杂性可能未被完全模拟 | 探究间质性肺病中成纤维细胞行为决定疾病结局的机制，特别是可逆修复与进行性纤维化之间的转换 | 人外周肺组织样本，包括对照组、机化性肺炎、结缔组织病相关间质性肺病和特发性肺纤维化患者 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学，单细胞RNA测序，免疫荧光，体外细胞培养 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，图像数据 | 未明确指定样本数量，但包括对照组、OP、CTD-ILD和IPF患者的外周肺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | High-Definition Visium空间转录组学平台 |
| 3410 | 2026-02-15 |
A Field-Friendly, Non-Toxic Fixative for Integrated Morphological and Molecular Research in Non-Model Invertebrates
2026-Feb, Ecology and evolution
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/ece3.73006
PMID:41675138
|
研究论文 | 本文评估了一种名为KINFix的无毒酒精基固定剂，用于非模式无脊椎动物的形态学和分子研究，包括电子显微镜、RNA保存和单细胞RNA测序 | 开发了一种新型无毒固定剂KINFix，能同时保存组织形态、蛋白质和核酸，适用于野外研究和单细胞RNA测序应用 | 固定条件可能需要针对不同物种和组织进行优化 | 评估KINFix固定剂在非模式无脊椎动物中用于形态学和分子研究的适用性 | 来自不同螺旋动物门的四种无脊椎动物物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、电子显微镜 | NA | 图像、RNA序列数据 | 四种无脊椎动物物种，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3411 | 2026-02-15 |
Integrated single-cell and transcriptomic analysis of CD8+CD101+TIM3+ T cells in hepatocellular carcinoma: implications for tumor microenvironment and prognostic modeling
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1639
PMID:41674942
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组学分析，揭示了肝细胞癌中CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化机制及其在肿瘤微环境中的作用，并构建了一个预后模型 | 首次在肝细胞癌中系统研究了CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化轨迹及其与肿瘤微环境的相互作用，并基于此构建了一个新的预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库和单细胞测序数据，缺乏体内实验验证；预后模型在验证队列中的表现略低于训练队列 | 探究肝细胞癌中特定T细胞亚群的功能、分化机制及其对免疫治疗和预后的影响 | 肝细胞癌组织中的CD8+CD101+TIM3+ T细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | Cox回归模型，LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据，临床数据，转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3412 | 2026-02-15 |
Prognostic value of palmitoylation-regulated mechanisms in glioblastoma: integrated multi-omics analysis via least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression and single-cell sequencing
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1953
PMID:41674962
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和单细胞测序，系统探讨了棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值 | 结合LASSO回归和单细胞RNA测序分析，识别出与患者总生存期显著相关的核心基因，并揭示了它们在关键致癌通路中的富集和异质表达模式 | 研究主要基于公共数据库（如TCGA和GTEx）的转录组数据，可能未涵盖所有临床或分子亚型，且功能验证仅限于细胞系实验 | 系统研究棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义 | 胶质母细胞瘤组织和正常脑组织 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序、LASSO回归、Kaplan-Meier生存分析 | LASSO回归 | RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA和GTEx数据库的胶质母细胞瘤与正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3413 | 2026-02-15 |
Single-cell analysis reveals the prognostic role of immune escape in the colorectal cancer microenvironment
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1466
PMID:41674966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型，揭示了其在预后和免疫治疗中的潜在作用 | 首次系统性地对结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型进行新型分类，并利用CellChat和伪时序分析探索其细胞间相互作用和分化途径 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要通过多重免疫组化等技术进一步验证，且样本量可能有限 | 探索结直肠癌中免疫逃逸相关亚型的新型分类，阐明其机制，并评估其对免疫治疗和预后的价值 | 结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型，包括癌症相关成纤维细胞、CD8+ T细胞、巨噬细胞和B细胞等 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | 非负矩阵分解聚类, CellChat, 伪时序分析, SCENIC, Cox比例风险回归, Kaplan-Meier生存分析 | 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3414 | 2026-02-15 |
Single-patient single-cell RNA sequencing reveals neuroendocrine predominance and immunosuppression in small-cell lung cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1674
PMID:41674970
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小细胞肺癌患者的肿瘤组织，揭示了神经内分泌细胞占主导和免疫抑制的肿瘤微环境特征 | 首次在单患者水平使用scRNA-seq深入解析SCLC的瘤内异性和免疫微环境，并识别BEX1和MAP1b作为新的治疗靶点 | 研究仅基于单个患者样本，结果需在更大队列中验证；BEX1和MAP1b的临床实用性尚待后续研究确认 | 表征小细胞肺癌的瘤内异性和免疫抑制肿瘤微环境，并探索潜在治疗靶点 | 小细胞肺癌患者的原发肿瘤组织及相邻非癌组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SCLC患者的原发肿瘤和相邻非癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3415 | 2026-02-15 |
Key genes and pathway differences between serrated polyps and conventional adenomas: insights from multi-omics
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-2138
PMID:41674976
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了锯齿状息肉与传统腺瘤在关键细胞类型和基因上的差异 | 首次整合CRC GWAS数据与单细胞测序，识别出锯齿状特异性细胞（SSC）作为CRC遗传风险的关键上皮细胞群，并鉴定出六个稳健的风险基因 | NA | 探究锯齿状息肉和传统腺瘤恶性转化过程中的关键细胞类型和基因 | 结直肠癌（CRC）中的锯齿状息肉和传统腺瘤 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, GWAS, TWAS, 精细定位, 孟德尔随机化 | scPagwas, SMR | 基因组, 转录组, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3416 | 2026-02-15 |
Novel fatty acid metabolism-related molecular subtyping and prognostic signature for breast cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1424
PMID:41674979
|
研究论文 | 本研究开发了一种与脂肪酸代谢相关的基因预后模型，用于乳腺癌的风险分层和预后预测 | 首次整合十种机器学习方法构建脂肪酸代谢相关基因预后模型，并结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析验证模型基因的功能和空间表达模式 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 | 识别与脂肪酸代谢相关的有效生物标志物，以改善乳腺癌患者的风险分层和治疗选择 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，基因表达分析 | CoxBoost，随机生存森林 | 基因表达数据 | 1,217名乳腺癌患者（TCGA数据库），26名乳腺癌患者（单细胞RNA测序数据） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 3417 | 2026-02-15 |
GNAL-driven calcium signaling reshapes the spatiotemporal immune landscape in ER+ breast cancer: causal insights and prognostic implications
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1796
PMID:41674994
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和空间转录组学，系统探讨了GNAL在ER+乳腺癌中的生物学功能、分子机制及预后相关性，揭示了其通过钙信号和干细胞样分化调控肿瘤免疫微环境的时空重塑 | 首次系统研究GNAL在ER+乳腺癌中的作用，结合因果推断、单细胞和空间分析，构建了多组学预后模型，并发现GNAL通过MIF-CD74轴招募B细胞 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证GNAL的具体调控机制 | 探究GNAL在ER+乳腺癌内分泌抵抗中的生物学功能、分子机制及预后价值 | ER+乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 分子对接 | 多组学预后模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA和GEO队列中的多个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3418 | 2026-02-15 |
Integrating multi-omic QTLs and predictive models reveals regulatory architectures at immune related GWAS loci in CD4+ T cells
2026-Jan-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.27.26344979
PMID:41646693
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和染色质可及性的多组学QTL映射与深度学习预测模型，揭示了CD4+ T细胞中免疫相关GWAS位点的调控架构 | 结合多组学QTL映射与基于染色质可及性训练的深度学习预测模型，系统解析遗传变异的调控效应 | 仅有一小部分经验检测到的molQTLs被预测模型发现，深度学习方法仅覆盖4.7%的GWAS位点 | 解析遗传变异在复杂性状中的调控机制，特别是免疫相关GWAS位点的功能解释 | CD4+ T细胞 | 机器学习 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA-seq, 染色质可及性分析, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA-seq数据, 染色质可及性数据 | 362名捐赠者的CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3419 | 2026-02-15 |
CD8a antibody-functionalized biomimetic red blood cell membrane ectosomes delivering C646 reverse CD8⁺ T Cell exhaustion via H3K18la histone delactylation in gastric cardia adenocarcinoma
2026-Jan-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03957-z
PMID:41612336
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向CD8⁺ T细胞的仿生纳米囊泡，用于递送表观遗传抑制剂C646，以逆转胃贲门腺癌中CD8⁺ T细胞的功能耗竭 | 开发了CD8a抗体功能化的仿生红细胞膜外囊泡（CD8a-NVEs）作为靶向递送平台，并首次揭示了乳酸驱动的H3K18乳酰化（H3K18la）在CD8⁺ T细胞耗竭中的关键作用，以及通过p300抑制剂C646进行表观遗传重编程的新策略 | 研究主要在临床前模型中进行，其安全性和有效性在人体中的验证尚需进一步临床试验 | 通过靶向表观遗传重编程逆转肿瘤微环境中CD8⁺ T细胞的功能耗竭，以增强胃贲门腺癌的免疫治疗效果 | 胃贲门腺癌（GCA）肿瘤微环境中的CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学，纳米生物技术 | 胃贲门腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），表观遗传分析 | 仿生纳米递送系统（CD8a-NVEs） | 单细胞转录组数据，体外和体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3420 | 2026-02-15 |
Transcriptional signature of induced neurons differentiates virologically suppressed people with HIV from people without HIV
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190445
PMID:41324907
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研究论文 | 本研究利用参与者来源的直接诱导神经元（iNs）建模HIV感染者的神经元生物学和损伤，通过转录组分析识别出区分病毒抑制的HIV感染者与非感染者的基因特征 | 首次使用iNs模型保留供体年龄和疾病相关特征，揭示了HIV相关神经认知障碍的潜在机制，包括IFI27上调及FOXL2NB-FOXL2-LINC01391表达降低与神经认知损伤的关联 | 样本量较小（仅6名HIV感染者和7名非感染者），且仅基于体外iNs模型，可能无法完全反映体内大脑环境的复杂性 | 探究病毒抑制的HIV感染者神经认知障碍的分子机制 | HIV感染者与非感染者的诱导神经元（iNs） | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，免疫细胞化学，电生理记录 | 诱导神经元（iNs）模型 | 转录组数据，图像数据，电生理数据 | 6名病毒抑制的HIV感染者和7名匹配的非感染者 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |