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当前共找到 34325 篇文献，本页显示第 3381 - 3400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3381 | 2025-10-16 |
Distinct tumor architectures and microenvironments for the initiation of breast cancer metastasis in the brain
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.015
PMID:39270646
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研究论文 | 本研究揭示了不同类型乳腺癌脑转移的独特肿瘤结构和微环境特征 | 发现TNBC和HER2+乳腺癌在脑转移过程中形成不同的肿瘤结构，并引发差异性的阿尔茨海默病相关小胶质细胞反应 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类组织样本，需要更大规模临床验证 | 理解乳腺癌脑转移的早期定植机制 | 三阴性乳腺癌和HER2+乳腺癌的脑转移过程 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织样本数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3382 | 2025-10-16 |
scEMB: Learning context representation of genes based on large-scale single-cell transcriptomics
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614685
PMID:39386549
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研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度学习模型scEMB，用于从大规模单细胞转录组数据中学习基因的上下文表示 | 提出创新的分箱策略整合多平台数据，同时保留基因表达层次和细胞类型特异性，在批次整合、聚类和细胞类型注释等下游任务中表现优于现有模型 | NA | 从大规模单细胞转录组数据中挖掘复杂的基因-基因关系 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞转录组数据 | 超过3000万个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3383 | 2025-10-16 |
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-Feb-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.013
PMID:38086373
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑皮层中表达生长抑素的抑制性神经元在发育过程中的分化轨迹 | 首次发现SST+抑制性神经元在胚胎阶段就分为长程投射神经元和两种中间神经元类型，并遵循不同的发育轨迹 | 研究仅针对小鼠模型，且中间神经元的多样性可能在出生后早期继续完善 | 探究大脑皮层抑制性神经元的发育多样性和分化机制 | 小鼠大脑皮层中表达生长抑素(SST+)的抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3384 | 2025-10-16 |
A Novel Prognostic Pyroptosis-Related Gene Signature Correlates to Oxidative Stress and Immune-Related Features in Gliomas
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/4256116
PMID:36778205
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研究论文 | 构建并验证了一个基于焦亡相关基因的胶质瘤预后模型 | 首次将焦亡相关基因与胶质瘤预后关联，并构建了包含9个基因的预后特征 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发胶质瘤预后预测工具并探索潜在治疗靶点 | 胶质瘤患者和U87胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，LASSO-Cox回归，Kaplan-Meier分析，KEGG/GO富集分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和CGGA队列的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3385 | 2025-10-16 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类与小鼠在中间神经元发育过程中共享保守的转录调控程序 | 首次在人类胚胎脑组织中系统表征神经节隆起区域的细胞多样性，并发现与啮齿类动物相似的转录调控机制 | 研究仅关注胚胎发育阶段，未涉及成年期神经元功能验证 | 探究人类GABA能神经元发育的转录调控机制及其进化保守性 | 人类胚胎脑组织中的神经节隆起区域细胞 | 神经科学 | 自闭症、精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胚胎脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3386 | 2025-10-15 |
Exploring the Epidemiology and Molecular Mechanisms of Riboflavin Against Chronic Kidney Disease Based on Data Mining, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2025 Nov-Dec, Journal of the American Nutrition Association
IF:6.8Q1
DOI:10.1080/27697061.2025.2509900
PMID:40435123
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研究论文 | 本研究通过数据挖掘、单细胞RNA测序和分子对接探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及分子机制 | 首次结合流行病学调查、单细胞RNA测序和分子对接技术系统揭示核黄素通过调节炎症因子和信号通路预防慢性肾脏病的机制 | 研究主要基于公共数据库和回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及其分子作用机制 | 慢性肾脏病患者及核黄素作用靶点 | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 数据挖掘, 逻辑回归模型, 限制性立方样条 | 逻辑回归模型, 中介分析模型 | 流行病学调查数据, 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | 美国国家健康与营养调查数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3387 | 2025-10-15 |
T cell-mediated SIV dissemination into the CNS: a single-cell transcriptomic analysis
2025-May-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6537361/v1
PMID:40386405
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD4+细胞毒性样T细胞在SIV病毒进入中枢神经系统的关键作用 | 首次在急性SIV感染期发现同时表达髓系和淋巴系基因的独特脑细胞簇，并鉴定CD4+细胞毒性样T细胞是病毒进入中枢神经系统的主要媒介 | 研究仅基于三只急性感染猕猴，样本量较小，且为动物模型研究 | 表征急性感染期间脑淋巴细胞的作用及CD4+T细胞表型在SIV传播至中枢神经系统中的功能 | 急性SIV感染的恒河猴脑部和血液细胞 | 单细胞转录组学 | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 三只急性SIV感染恒河猴的脑部和血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3388 | 2025-10-15 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the mechanism of action of a novel antioxidant polyphenol nanoparticle loaded with STAT3 agonist in mediating cardiomyocyte ferroptosis to ameliorate age-related heart failure
2025-Mar-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03317-x
PMID:40158134
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探究了负载STAT3激动剂的抗氧化多酚纳米颗粒通过介导心肌细胞铁死亡改善年龄相关性心力衰竭的作用机制 | 开发了新型抗氧化多酚纳米颗粒PN@Col，首次结合单细胞RNA测序和AUCell分析揭示STAT3在心力衰竭中的关键作用，并验证其通过减轻氧化应激和铁死亡改善心脏功能 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；样本规模有限 | 探究新型纳米颗粒治疗剂对年龄相关性心力衰竭的治疗效果及作用机制 | 心肌细胞、老年心力衰竭小鼠模型 | 单细胞多组学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、AUCell分析、细胞实验、动物实验 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 老年心力衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3389 | 2025-10-15 |
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643710
PMID:40166238
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研究论文 | 本研究探讨LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调节MHC-I和树突状细胞激活以增强头颈鳞癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现LSD1抑制通过激活H3K4me2与MHC-I直接相互作用的新机制，并阐明其在CXCL9-CXCR3轴介导的抗肿瘤免疫中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 阐明LSD1在头颈鳞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞癌小鼠模型、人源化小鼠模型、人类头颈鳞癌细胞系、外周血单核细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型、细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 小鼠模型、人类细胞系和TCGA数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3390 | 2025-10-15 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.05.592608
PMID:38766132
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研究论文 | 提出一种基于Transformer的自监督空间域检测工作流程CellTransformer，用于小鼠大脑精细区域发现 | 开发了新颖的编码器-解码器架构CellTransformer，能够分层学习组织特征，并实现多百万细胞数据集的扩展分析 | NA | 解决器官尺度空间转录组数据分析中的关键瓶颈，实现精细组织空间域的检测 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，自监督学习 | Transformer，编码器-解码器架构 | 空间转录组数据 | 900万细胞，200多个组织切片，4只小鼠 | NA | 空间转录组学，MERFISH，Slide-seqV2 | NA | NA |
| 3391 | 2025-10-15 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定滑液中的常驻滑膜巨噬细胞，探讨其在滑膜屏障完整性评估和炎症性关节炎中的作用 | 首次在人类滑液中鉴定常驻滑膜巨噬细胞，并建立新型体外组织块模型验证发现 | 研究未明确这些细胞在滑膜屏障破坏后是否持续或引发慢性炎症 | 研究常驻滑膜巨噬细胞在滑液中的存在及其与滑膜屏障完整性的关联 | 人类滑液样本和滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | 体外组织块模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3392 | 2025-10-15 |
Unsupervised multi-scale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2024-Dec-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5671748/v1
PMID:39764102
|
研究论文 | 开发了一种无监督多尺度聚类方法，用于识别单细胞转录组数据中的细胞类型和亚型层次结构 | 构建稀疏细胞-细胞相关性网络，以无监督方式在多尺度分辨率下识别细胞类型和亚型 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中的细胞聚类方法，以揭示更精细的细胞景观结构 | 单细胞转录组数据中的细胞类型和亚型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度聚类 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3393 | 2025-10-15 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612751
PMID:39314376
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术验证了骨髓微环境中不同空间区室对炎症的反应差异 | 首次结合scRNA-seq和流式细胞术系统验证了骨髓中央区和骨内膜区7个关键基质细胞群体，并揭示了I型干扰素反应特异性影响中央区基质细胞的炎症表型 | 研究主要基于小鼠模型，人类骨髓微环境的可比性仍需验证 | 探究炎症对造血干细胞和骨髓微空间区室的调控机制 | 小鼠骨髓中的造血干细胞/祖细胞（HSPC）和基质细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 多个小鼠品系的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3394 | 2025-10-15 |
FlyBase: updates to the Drosophila genes and genomes database
2024-05-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad211
PMID:38301657
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研究论文 | 介绍果蝇数据库FlyBase的最新开发进展和功能更新 | 新增单细胞RNA测序数据、改进功能信息展示、更新直系同源分析流程、新增化学报告功能以及加强科普资源 | NA | 维护和更新果蝇基因组数据库资源 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)基因和基因组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、功能注释数据、化学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3395 | 2025-10-15 |
Differential detection workflows for multi-sample single-cell RNA-seq data
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572043
PMID:38187695
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研究论文 | 开发用于单细胞转录组数据中差异检测分析的工作流程 | 提出差异检测(DD)概念，关注基因在样本或细胞中被检测到的平均比例差异，而非传统差异基因表达(DE)的平均表达量差异 | NA | 建立联合评估差异基因表达和差异检测的统一工作流程 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3396 | 2025-10-12 |
CITEViz: interactively classify cell populations in CITE-Seq via a flow cytometry-like gating workflow using R-Shiny
2024-Apr-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05762-1
PMID:38566005
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研究论文 | 开发了一个名为CITEViz的R-Shiny应用，用于通过流式细胞术样门控工作流程交互式分类CITE-Seq数据中的细胞群体 | 首个能够处理多组学测序数据集并允许用户交互式门控细胞的工具，无需编写冗余代码指定门边界 | 仅适用于经过Seurat处理的CITE-Seq数据，功能相对基础 | 简化CITE-Seq数据中的细胞群体分类流程 | 外周血单个核细胞CITE-Seq数据集 | 生物信息学 | NA | CITE-Seq, 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, CITE-Seq | NA | NA |
| 3397 | 2025-10-12 |
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42749
PMID:37997621
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研究论文 | 本研究探讨了表达程序性死亡配体1的巨噬细胞在关节炎中对关节的保护作用 | 首次揭示PD-L1+巨噬细胞通过表达MerTK和IL-10在关节炎中发挥保护作用，并在人类和小鼠滑膜中得到验证 | 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 研究PD-L1在滑膜中的保护作用及其在关节炎中的机制 | 小鼠模型和人类滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 流式细胞术, 逆转录聚合酶链反应, 单细胞RNA测序 | 胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型和人类滑膜样本（健康个体和类风湿关节炎患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3398 | 2025-10-12 |
A transcriptional response to replication stress selectively expands a subset of Brca2-mutant mammary epithelial cells
2023-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40956-w
PMID:37626143
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研究论文 | 本研究揭示了BRCA2突变乳腺上皮细胞在复制压力下通过转录反应选择性扩增激素受体阴性管腔细胞的机制 | 首次发现BRCA2杂合突变乳腺器官在复制压力下通过激活特定转录反应选择性扩增HR-管腔细胞，并鉴定出Tspan8和Thrsp基因在此过程中的关键作用 | 研究主要基于乳腺器官模型，需要在体内环境中进一步验证这些发现 | 探究BRCA2突变如何影响乳腺上皮亚群在复制压力下的行为 | Brca2突变乳腺器官和乳腺上皮细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | CyTOF质谱流式,scRNA-seq单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 野生型和Brca2突变乳腺器官 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 3399 | 2025-10-11 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
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综述 | 系统总结单细胞测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用，揭示脑细胞异质性与疾病发病机制 | 整合单细胞转录组、表观基因组和空间转录组数据，阐明疾病轨迹和细胞通讯网络 | NA | 通过单细胞测序技术深入理解阿尔茨海默病的发病机制 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3400 | 2025-10-11 |
Reduced Availability of Essential Amino Acids Disrupts Differentiation of Anorexigenic POMC Neurons in the Fetal Rat Hypothalamus
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05201-z
PMID:40681826
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研究论文 | 本研究探讨妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育的影响，特别是对调节食欲和能量平衡的神经元群体形成的影响 | 首次揭示必需氨基酸减少通过mTOR信号通路和表观遗传机制选择性破坏ISL1前体细胞向POMC神经元分化 | 仅研究了特定发育窗口期，需要进一步研究其他发育阶段 | 探究宫内生长受限与长期代谢紊乱风险的机制联系 | 妊娠期蛋白质限制的大鼠模型及其胎儿下丘脑发育 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, EdU标记, 免疫组织化学, RNAscope, mTOR信号分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 甲基化数据 | 妊娠15天和17天的大鼠胎儿下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |