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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3381 | 2026-01-25 |
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003561
PMID:41208796
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研究论文 | 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴介导的线粒体生物合成抑制铁死亡,从而缓解主动脉夹层的治疗效果和机制 | 首次揭示了硒代蛋氨酸通过激活PGC-1α/NRF2/TFAM轴抑制铁死亡,从而减轻主动脉夹层的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床转化仍需进一步验证 | 探索硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其潜在分子机制 | 小鼠主动脉夹层模型和血小板衍生生长因子-BB诱导的血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞测序、转录组分析、小干扰RNA敲低技术 | 小鼠模型、细胞模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量,涉及小鼠模型和患者VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 3382 | 2026-01-25 |
Metformin Restores Mitochondrial Function and Neurogenesis in POLG Patient-Derived Brain Organoids
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417721
PMID:41355579
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC皮质类器官模拟POLG相关神经退行性疾病,并评估了二甲双胍在恢复线粒体功能和神经发生方面的治疗潜力 | 首次在POLG患者来源的脑类器官模型中,通过单细胞RNA-seq揭示不同神经元亚型的特异性脆弱性,并证明二甲双胍能恢复神经元身份、线粒体功能和代谢通路 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;治疗剂量和时间窗口需进一步优化;未涉及长期疗效和潜在副作用评估 | 探究二甲双胍对POLG相关线粒体功能障碍和神经发生损伤的治疗作用及机制 | POLG患者来源的诱导多能干细胞(iPSC)皮质类器官 | 神经科学 | 线粒体疾病 | 单细胞RNA-seq,功能测定(线粒体膜电位、质量、氧化应激),钙测量,非靶向代谢组学 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据,功能测定数据,代谢组数据 | 患者来源的iPSC皮质类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3383 | 2026-01-08 |
Spatial transcriptomics decodes the cellular landscape of plant-pathogen interaction
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02204-5
PMID:41495461
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3384 | 2026-01-25 |
Integrated analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing data reveals potential biomarkers and immune infiltrates associated with N7-methylguanosine in osteoarthritis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003571
PMID:41056007
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞RNA测序数据,揭示了与骨关节炎中N7-甲基鸟苷修饰相关的潜在生物标志物和免疫浸润特征 | 首次在骨关节炎中系统研究m7G修饰的作用,识别了四个关键m7G调节因子作为新型生物标志物,并探索了其与免疫浸润和软骨退化的关系 | 需要进一步实验来阐明骨关节炎的分子机制 | 识别与骨关节炎中m7G修饰相关的基因,并研究其诊断价值和免疫浸润特征 | 骨关节炎患者样本(106个OA样本) | 生物信息学 | 骨关节炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 无监督聚类分析 | RNA测序数据 | 106个骨关节炎样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3385 | 2026-01-25 |
Decoding the triglyceride-glucose index in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease: integrative insights from Mendelian randomization, cross-tissue transcriptomics, and spatial multi-omics
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003576
PMID:41056021
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、跨组织转录组学和空间多组学方法,揭示了甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的因果机制和分子驱动因素 | 首次采用多组学框架结合孟德尔随机化、转录组范围关联研究和空间转录组学,系统解析了TyG指数与MASLD之间的因果关系及组织特异性表达模式 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制了结果在其他人群中的普适性;空间转录组学数据来源于小鼠胚胎期,与人类成年期疾病状态存在差异 | 阐明甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病发展中的因果作用机制 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者及小鼠模型 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 孟德尔随机化, 转录组范围关联研究, 空间转录组学, 单细胞测序 | IVW, GSMR, JTI-PrediXcan, SMulTiXcan, FOCUS, FUSION, PoPS | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 基于UK Biobank的192个全基因组显著单核苷酸多态性 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 3386 | 2026-01-25 |
SPP1 in notochord cells modulates intervertebral disc degeneration through CD44 recognition by macrophages based on single-cell transcriptome analysis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003454
PMID:41065569
|
研究论文 | 本研究通过改进大鼠椎间盘压力模型,结合单细胞转录组分析,探讨了机械应力如何通过SPP1-CD44信号通路影响椎间盘退变 | 改进了大鼠椎间盘压力模型,并首次在单细胞水平揭示了机械应力下脊索细胞群的变化及SPP1-CD44信号通路在椎间盘退变中的作用 | 研究主要基于大鼠模型,人类数据验证部分依赖于公共数据库,缺乏直接的人类样本实验验证 | 探究机械应力导致椎间盘退变的分子机制 | 大鼠椎间盘组织及脊索细胞 | 单细胞转录组学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 手术组与假手术组大鼠椎间盘样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3387 | 2026-01-25 |
Spatial Transcriptomics Analysis of Macrophage-to-Myofibroblast Transition in Bronchiolitis Obliterans Following Hematopoietic Stem Cell Transplantation
2025-Dec-20, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2025.12.950
PMID:41429336
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的作用 | 首次在BO中应用空间转录组学技术,揭示了MMT在疾病发展中的贡献以及基因表达从炎症到纤维化的动态转变 | 样本量较小(3例BO患者,2例对照),且为回顾性研究 | 探究巨噬细胞向肌成纤维细胞转化是否参与造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎的发病机制 | 接受肺移植的BO患者的肺组织样本(n=3)以及肺癌患者的对照肺组织(n=2) | 空间转录组学 | 闭塞性细支气管炎 | 免疫荧光染色,空间转录组学 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据,图像数据 | 5例患者(3例BO,2例肺癌对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3388 | 2026-01-25 |
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67421-0
PMID:41397970
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研究论文 | 本研究提出了一种名为PASTA的空间通路表达插补方法,通过整合细胞类型和空间邻近性信息,提高空间转录组学数据中未测量基因表达的预测准确性 | PASTA方法首次将通路信息整合到空间基因表达插补过程中,利用细胞类型和空间邻近性假设,提升了预测的稳健性和生物学相关性 | NA | 开发一种计算方法来预测空间转录组学数据中未测量的基因表达,以克服靶向原位技术基因测量数量有限的障碍 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | PASTA(通路导向的空间基因插补方法) | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3389 | 2026-01-25 |
Characterization of T cell markers in endometrial carcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04289-y
PMID:41402657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别T细胞标志基因,并基于此构建了一个八基因预测模型,用于预测子宫内膜癌患者的预后及免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序数据与大量临床样本数据,构建了基于T细胞标志基因的子宫内膜癌预后预测模型,并验证了其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 开发子宫内膜癌的预后预测模型并探索其与免疫治疗的关系 | 子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 544例子宫内膜癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3390 | 2026-01-25 |
Single-cell transcriptomic profiling of eosinophils and airway immune cells in childhood asthma
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.034
PMID:40684957
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研究论文 | 本研究通过优化单细胞RNA测序方法,提高了儿童哮喘患者鼻灌洗样本中粒细胞(特别是嗜酸性粒细胞)的捕获效率,并揭示了不同哮喘表型下的细胞转录差异和亚群特征 | 采用10× Genomics Flex平台结合定制化数据处理流程,实现了粒细胞恢复的16倍以上提升,首次在组织样本中高效捕获嗜酸性粒细胞和中性粒细胞,并识别出与哮喘表型相关的独特亚群 | 研究仅基于鼻灌洗样本,可能无法完全代表下呼吸道或全身性炎症状态;样本量相对有限,且未涵盖所有哮喘亚型或健康对照组 | 优化单细胞RNA测序技术以改善粒细胞(尤其是嗜酸性粒细胞)在组织样本中的捕获,并探索儿童哮喘的免疫细胞异质性和炎症机制 | 儿童哮喘患者的鼻灌洗样本中的嗜酸性粒细胞、中性粒细胞及其他免疫细胞和上皮细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 定制化数据处理流程(包括高级计算技术) | 单细胞转录组数据 | 儿童哮喘患者的鼻灌洗样本(具体数量未在摘要中明确说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics Flex | 10× Genomics Flex平台结合定制化样本处理(如固定化以保持细胞质量) |
| 3391 | 2026-01-25 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术分析良性和恶性外周神经鞘瘤,揭示其空间和生物学异质性 | 首次将空间转录组学应用于外周神经鞘瘤,构建了空间细胞分化图谱,并整合了组织学特征和单细胞数据 | 作为一项试点研究,样本量有限,未来需要更大规模验证 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性,以改善其分类和诊断 | 福尔马林固定石蜡包埋的患病外周神经组织样本 | 数字病理学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学 | 空间聚类和加权相关网络分析 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3392 | 2026-01-25 |
Comparative single-cell lineage tracing identifies distinct adipocyte precursor dynamics in skin and inguinal fat
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.07.004
PMID:40744015
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序谱系追踪,比较了皮肤和腹股沟脂肪组织中脂肪前体细胞的动态差异 | 识别了未表征的未成熟前脂肪细胞群,揭示了脂肪前体细胞的不同分化潜能,并重新定义了皮肤脂肪组织中快速脂肪生成的细胞层次和分子机制 | NA | 比较皮肤和腹股沟脂肪组织中脂肪前体细胞的动态差异,以理解快速脂肪生成的机制 | 脂肪前体细胞(包括祖细胞和前脂肪细胞) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3393 | 2026-01-25 |
SETDB1 ensures the continuity of embryonic to adult neural stem cells through metabolic alterations in the dentate gyrus
2025-Jul-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424315122
PMID:40699919
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研究论文 | 本研究揭示了SETDB1通过调控代谢状态,确保胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞(aNSCs)的连续性,防止其分化为星形胶质细胞 | 发现SETDB1通过靶向线粒体复合物成分COX6B2调控氧化磷酸化,从而控制aNSCs命运,防止星形胶质细胞分化 | NA | 探究胚胎神经祖细胞如何过渡为成年神经干细胞,同时避免星形胶质细胞命运,以维持aNSCs池 | 齿状回发育过程中的胚胎神经祖细胞和成年神经干细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3394 | 2026-01-25 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,识别出FAM189A2作为肺癌的关键预后基因 | 结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,构建了一个八基因LASSO-Cox风险模型,并在多个独立队列中验证,首次将FAM189A2鉴定为肺癌的潜在肿瘤抑制基因和生物标志物 | 研究样本量相对较小(13个原发性肺癌肿瘤),且主要基于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证 | 探究肺癌恶性细胞状态与患者预后及治疗脆弱性的关联,并开发预后风险模型 | 肺癌肿瘤组织及匹配的正常肺组织细胞,以及外部验证队列中的肺癌患者数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | LASSO-Cox风险模型 | 转录组数据 | 13个原发性肺癌肿瘤及匹配正常组织(48,149个细胞),外加多个外部验证队列(GSE131907、TCGA-LUAD、GSE30219、GSE31210) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3395 | 2026-01-25 |
Decoding HSP90AA1-driven inflammatory signaling in the uveal melanoma microenvironment: an integrated analysis at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1730622
PMID:41567202
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研究论文 | 本研究通过整合计算生物学筛选与单细胞分辨率分析,解码了HSP90AA1作为葡萄膜黑色素瘤炎症和免疫微环境关键调节因子的作用 | 首次在单细胞分辨率下系统解析了HSP90AA1在葡萄膜黑色素瘤微环境中的表达谱和功能,揭示了其通过调控NF-κB、STAT3等炎症信号通路影响肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨HSP90AA1抑制剂的具体治疗策略 | 识别和验证介导葡萄膜黑色素瘤炎症与免疫信号转导的关键分子调节因子,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境中的细胞群体,特别是恶性细胞、CD8+ T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,siRNA敲低,体外功能实验,体内异种移植模型 | 网络计算筛选模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3396 | 2026-01-25 |
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomics identifies factors related to immunosuppressive microenvironment to predict unfavorable prognosis in inflammatory breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727590
PMID:41567210
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞转录组数据,识别了与免疫抑制微环境相关的因子,以预测炎性乳腺癌的不良预后 | 结合bulk和单细胞转录组学分析,揭示了GZMB和SPP1作为炎性乳腺癌中免疫抑制相关预后生物标志物的潜在作用,并明确了浆细胞样树突状细胞在重塑免疫抑制微环境中的关键角色 | 免疫组化分析的样本量极小,可能影响结果的可靠性 | 探究炎性乳腺癌肿瘤微环境的异质性及细胞间通讯,识别与免疫抑制微环境和不良预后相关的生物标志物 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序, 免疫组化 | WGCNA | 转录组数据, 图像数据 | 未明确具体样本数量,但提及免疫组化分析基于极小的样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3397 | 2026-01-25 |
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1710582
PMID:41568005
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综述 | 本文综述了肌少症的组学研究,从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用,并提出了一个双层的“共性-特异性”框架 | 提出了一个双层的“共性-特异性”框架来解释肌少症的病理机制,并针对慢性肝病共病背景提出了“多弱信号协同累积”假说 | 目前组学研究结果多为相关性,对临床转化构成挑战,未来需要从静态分析转向动态机制解析 | 系统梳理肌少症的分子机制,并特别关注其在慢性肝病共病背景下的病理网络扰动 | 肌少症,以及慢性肝病相关的肌少症 | NA | 老年病 | 多组学技术 | NA | NA | 整合了10项肌少症组学研究和6项慢性肝病相关肌少症研究 | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 3398 | 2026-01-25 |
BMP4 dose dictates lineage specification bias in human periodontal ligament stem cells
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1738051
PMID:41568233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外功能实验,系统探究了BMP4剂量如何调控人牙周膜干细胞向成骨和肌腱谱系的分化 | 首次在单细胞水平揭示了BMP4剂量依赖性调控人牙周膜干细胞谱系分化的双相动力学机制,并明确了BMP受体在成骨和肌腱分化中的特异性作用 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内验证;样本量相对有限;未探讨其他可能影响分化的协同因子 | 探究BMP4剂量对人牙周膜干细胞谱系分化的调控机制,以优化基于PDLSC的牙周再生治疗策略 | 人牙周膜干细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序,体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,体外实验数据 | 未明确具体样本数量,但涉及人牙周膜干细胞亚群分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3399 | 2026-01-25 |
Growth Hormone Alleviates Atherosclerosis Through Regulating the Activity of PI3K/AKT Pathway: Insights From Single-Cell Sequence and Mechanism Exploration
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/9710652
PMID:41089172
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了生长激素通过调节PI3K/AKT通路活性缓解动脉粥样硬化的机制 | 结合单细胞RNA测序数据与机制探索,首次系统揭示了生长激素通过PI3K/AKT通路在动脉粥样硬化中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;体外实验使用ox-LDL模拟损伤,可能与体内复杂环境存在差异 | 探究生长激素对动脉粥样硬化的影响及其分子机制 | 小鼠动脉血管平滑肌细胞、C57BL/6和ApoE-/-小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 液相色谱-质谱联用, 蛋白质印迹分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组学数据, 基因表达数据 | 小鼠动脉组织样本(包括健康与动脉粥样硬化组织),具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3400 | 2026-01-24 |
CPE/HYOU1 axis-activated Hippo-YAP signaling pathway suppresses PANoptosis to facilitate osteosarcoma progression
2026-Feb-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218121
PMID:41213463
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,识别了与PANoptosis相关的骨肉瘤预后生物标志物,并揭示了CPE/HYOU1轴通过激活Hippo-YAP信号通路抑制PANoptosis以促进骨肉瘤进展的机制 | 首次将CPE/HYOU1轴与Hippo-YAP信号通路及PANoptosis抑制联系起来,揭示了其在骨肉瘤进展中的新调控机制 | 研究主要基于公开转录组数据,实验验证在体外和体内进行,但未涉及大规模临床队列验证 | 识别骨肉瘤中与PANoptosis相关的预后生物标志物并阐明其下游调控机制 | 骨肉瘤细胞、巨噬细胞、成骨细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、bulk RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、Western blot、异种移植肿瘤实验 | 预后特征模型 | 转录组数据 | 基于公开单细胞和bulk转录组数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |