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当前共找到 32476 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-11-09 |
Globotriaosylceramide Gb3 Influences Wound Healing and Scar Formation by Orchestrating Fibroblast Heterogeneity
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509733
PMID:40810720
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研究论文 | 本研究系统探讨了globotriaosylceramide (Gb3)通过调控成纤维细胞异质性影响伤口愈合和瘢痕形成的机制 | 发现了HEXB-Gb3-FGF2调控轴在成纤维细胞表型可塑性中的新作用机制 | 研究主要基于特定烧伤模型，在其他类型伤口中的适用性需进一步验证 | 阐明Gb3在皮肤再生过程中的功能作用及其调控机制 | 皮肤成纤维细胞、浅二度烧伤和深二度烧伤临床标本 | 单细胞组学 | 皮肤烧伤 | 单细胞RNA测序, 空间组学, 脂质组学, 组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据, 空间组学数据, 脂质组学数据, 组织学图像 | 临床烧伤标本（浅二度和深二度烧伤） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 322 | 2025-11-09 |
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-Nov, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02734-z
PMID:40817406
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组分析揭示了B细胞急性淋巴细胞白血病微环境中不同的基质细胞群体及其功能 | 首次在B-ALL患者中鉴定出两种不同的间充质基质细胞群体，并发现第三种成骨谱系细胞群体，揭示了这些细胞通过不同机制支持白血病细胞生存和化疗耐药 | 研究样本仅限于儿科B-ALL患者，未包括成人患者；样本量相对有限 | 解析B细胞急性淋巴细胞白血病骨髓微环境的细胞异质性和功能特性 | 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析,功能体外测定 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 323 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Redefines Macrophage Heterogeneity and Function in Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70107
PMID:41204881
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在皮肤伤口愈合研究中揭示巨噬细胞异质性和功能多样性的进展 | 通过单细胞测序技术系统揭示巨噬细胞在伤口愈合过程中的异质性、功能多样性及动态变化特征 | NA | 阐明巨噬细胞在皮肤伤口愈合过程中的细胞异质性和功能作用 | 皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-11-09 |
Multi-omics integrative analysis of the mechanisms linking environmental pollutant exposure to bladder cancer pathogenesis
2025-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119251
PMID:41110307
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示环境污染物暴露与膀胱癌发病机制之间的分子联系 | 首次通过整合多组学数据和孟德尔随机化分析，系统构建了环境-基因相互作用网络，识别出三个因果枢纽基因及其与34种高风险污染物的关联 | 研究主要基于现有数据库和队列数据，需要进一步实验验证污染物与基因相互作用的生物学机制 | 探究环境污染物暴露与膀胱癌发病的分子机制 | 膀胱癌相关基因和环境污染物 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学整合分析, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, 分子对接模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个膀胱癌队列的转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 325 | 2025-11-09 |
Deciphering the crucial role of IGF2BP3 in modulating stemness traits of salivary adenoid cystic carcinoma
2025-Oct-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03068-7
PMID:41082045
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研究论文 | 本研究系统阐明了IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌干细胞特性调控中的关键作用及机制 | 首次通过单细胞测序数据验证IGF2BP3与SACC干细胞特性的关联，并系统揭示其调控干细胞特性的分子机制 | 未明确IGF2BP3下游具体作用靶点及信号通路细节 | 探究IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌中的功能作用及调控机制 | 唾液腺腺样囊性癌细胞 | 癌症生物学 | 唾液腺腺样囊性癌 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2025-11-09 |
GreenCells: A comprehensive resource for single-cell analysis of plant lncRNAs
2025-Oct, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110678
PMID:40912654
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研究论文 | 开发了专门用于植物lncRNA单细胞分析的综合数据库GreenCells | 首个专门针对植物lncRNA的单细胞数据库，填补了现有植物单细胞转录组数据库主要关注蛋白编码基因的空白 | NA | 研究植物长非编码RNA在单细胞水平的表达和功能 | 8种植物物种的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含2177个lncRNA标记基因和68,869个蛋白编码标记基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2025-11-09 |
Targeting cell-state plasticity driven by FOXM1/CEBPB axis disrupts developmental heterogeneity and therapeutic resistance in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-01, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.09.022
PMID:41043722
|
研究论文 | 本研究揭示了FOXM1/CEBPB轴通过调控细胞状态可塑性驱动肝细胞癌发育异质性和治疗耐药性的机制 | 首次发现FOXM1/CEBPB轴作为主调控开关通过相互抑制和竞争下游网络控制细胞状态转换，并开发了靶向FOXM1的RNAi疗法 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌发育异质性和治疗耐药性的调控机制并开发靶向治疗策略 | 肝细胞癌患者样本、体外和体内模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、RNA干扰 | 自调控网络分析 | 基因表达数据 | 来自HCC患者的公共数据集和自建肝细胞分化模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2025-11-09 |
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
|
研究论文 | 提出Spatia多尺度生成与预测模型，用于整合细胞形态、基因表达和空间背景的空间转录组学分析 | 首个能够融合细胞形态、基因表达和空间背景的多尺度生成模型，通过交叉注意力和transformer模块实现单细胞到组织水平的统一表征 | 模型在49名供体、17种组织类型和12种疾病状态的数据集上验证，但未提及外部验证或临床应用的可行性 | 学习统一的、空间感知的表征，整合细胞形态、基因表达和空间背景 | 空间转录组学数据中的细胞、生态位和组织 | 数字病理学 | 多种疾病 | 空间转录组学 | Transformer, 扩散模型, 交叉注意力 | 图像, 基因表达数据 | 1700万细胞-基因对、100万生态位-基因对、1万组织-基因对，来自49名供体、17种组织类型和12种疾病状态 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 329 | 2025-11-09 |
Hdac1 as an early determinant of intermediate-exhausted CD8+ T cell fate in chronic viral infection
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502256122
PMID:40333757
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶1在慢性病毒感染中作为中间耗竭CD8+ T细胞命运早期决定因子的关键作用 | 首次发现Hdac1特异性调控抗原特异性中间耗竭T细胞的形成，并揭示其通过染色质可及性调控耗竭程序基因的双重功能 | T细胞亚群分化的表观遗传决定因素仍未完全阐明 | 探索慢性病毒感染中CD8+ T细胞耗竭亚群分化的表观遗传调控机制 | 慢性病毒感染模型中的CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | 慢性病毒感染 | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 330 | 2025-11-09 |
Interferon-induced activation of dendritic cells and monocytes by yellow fever vaccination correlates with early antibody responses
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2422236122
PMID:40333758
|
研究论文 | 本研究通过黄热病疫苗接种模型，揭示了树突状细胞和单核细胞早期干扰素激活状态与抗体反应的相关性 | 首次在单细胞水平系统描绘黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的早期先天免疫应答动态，并发现SIGLEC1/CD169作为敏感的生物标志物 | 研究仅关注早期免疫反应（28天内），未评估长期免疫记忆；样本时间点有限 | 阐明黄热病疫苗接种后早期先天免疫事件与保护性 immunity 生成的关系 | 人类血液树突状细胞和单核细胞亚群 | 免疫学 | 传染病 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 大型疫苗接种者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 331 | 2025-11-09 |
MFSD12 promotes proliferation, metastasis and invasion of hepatocellular carcinoma cells and its potential correlation with HAVCR2/LGALS9 immune checkpoint axis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681887
PMID:41194934
|
研究论文 | 本研究探讨MFSD12在肝细胞癌中的表达特征及其通过调控HAVCR2/LGALS9免疫检查点轴促进肿瘤进展的机制 | 首次系统揭示MFSD12在肝细胞癌中的特异性高表达及其双重作用机制：既促进肿瘤细胞增殖转移，又调控肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究MFSD12在肝细胞癌进展中的作用及其与免疫检查点的相关性 | 肝细胞癌细胞系和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化，siRNA干扰，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | 整合TCGA、GEO和ArrayExpress数据库的多组学数据 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2025-11-09 |
Revealing tissue architecture through the hypercomplex Fourier analysis of spatial transcriptomics data
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf191
PMID:41195088
|
研究论文 | 提出了一种使用四元数域离散傅里叶变换分析空间转录组学数据的新方法 | 首次将四元数表示应用于空间转录组学数据，将每个位置的转录组特征表示为三维向量，实现了多维ST数据的傅里叶分析 | 方法主要针对空间转录组学数据，对其他类型组学数据的适用性需要进一步验证 | 开发新的数学框架来分析和可视化空间转录组学数据 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 四元数域离散傅里叶变换 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Visium HD空间转录组平台 |
| 333 | 2025-11-09 |
Role of Monocyte/Macrophage-Associated Gene Ccl9 in Acute Myocardial Infarction Analysis: Based on Bulk and Single Cell RNA Sequencing Data
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S516092
PMID:41195292
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别了急性心肌梗死中单核/巨噬细胞相关基因，并重点探讨了Ccl9在调控M2巨噬细胞极化和减轻心肌细胞损伤中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据系统分析急性心肌梗死中的单核/巨噬细胞相关基因，并通过实验验证Ccl9在M2巨噬细胞极化和心肌保护中的新功能 | 研究主要基于公共数据库数据，动物和细胞实验样本量有限，需要进一步临床验证 | 探索急性心肌梗死中单核/巨噬细胞相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用机制 | 急性心肌梗死患者基因表达数据、AMI小鼠模型、原代小鼠心肌细胞和RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 细胞共培养 | t-SNE, 差异表达分析, 免疫浸润分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个GEO数据集(GSE163129, GSE158157, GSE23294)及动物实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 334 | 2025-11-09 |
Across the space: applications of spatial transcriptomic technology in healthy and diseased muscle
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1656918
PMID:41195339
|
综述 | 探讨空间转录组技术在健康和病变肌肉组织中的应用及其对细胞相互作用研究的推动作用 | 系统梳理空间转录组技术在肌肉研究中的创新应用，突破单细胞技术无法保留空间信息的局限 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据收集与分析 | 总结空间转录组技术在肌肉组织研究中的应用进展 | 骨骼肌组织中的细胞群体及其空间相互作用 | 空间转录组学 | 肌肉疾病 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 335 | 2025-11-09 |
Single-cell stimulus-response gene expression trajectories reveal the stimulus specificities of dynamic responses by single macrophages
2024-Nov-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.09.023
PMID:39413794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建单细胞基因表达轨迹，揭示了巨噬细胞对刺激的动态响应特异性 | 首次生成高分辨率时间序列单细胞RNA测序数据，并构建实时单细胞基因表达轨迹集合，揭示动态信息对巨噬细胞刺激响应特异性的重要贡献 | 技术限制可能影响单细胞可诱导基因表达动态的捕获能力 | 研究巨噬细胞对免疫威胁的基因表达动态响应机制 | 小鼠巨噬细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因表达轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | 针对六种刺激的巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2025-11-09 |
Cellular senescence in white matter microglia is induced during ageing in mice and exacerbates the neuroinflammatory phenotype
2023-06-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05027-2
PMID:37353538
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示白质小胶质细胞在衰老过程中发生细胞衰老，并加剧神经炎症表型 | 首次发现白质小胶质细胞在衰老和疾病模型中发生细胞衰老，并证实共生细菌促进衰老小胶质细胞积累 | 研究主要基于小鼠模型，人类中枢神经系统中的相关性尚需进一步验证 | 探讨中枢神经系统细胞衰老特征及其在神经功能障碍中的作用 | 小鼠脑部和脊髓中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 337 | 2025-11-08 |
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the functions of TREM2high macrophages and infarct border dynamics post-myocardial infarction
2025-Dec, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05317-9
PMID:40750734
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA测序，揭示了心肌梗死后TREM2高表达巨噬细胞的功能和梗死边缘区动态变化 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统解析心肌梗死后免疫细胞时空动态变化，并发现TREM2高表达巨噬细胞在组织修复中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限；技术方法复杂度高，数据分析存在一定主观性 | 探究心肌梗死后复杂细胞和分子动态变化机制 | 小鼠心肌梗死模型、AC16心肌细胞、THP-1来源的M2巨噬细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序,RT-qPCR,Western blot,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术 | Milo,Monocle2,CellPhoneDB,NicheNet,SCENIC | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠心肌梗死模型和缺血再灌注模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2025-11-08 |
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70421
PMID:41200753
|
研究论文 | 本研究揭示CD29高表达调节性T细胞通过促进细胞粘附驱动代谢功能障碍相关脂肪肝病恶性转化为肝癌的机制 | 首次发现CD29高表达Tregs亚群在MASLD恶性转化中的关键作用，并证实靶向CD29可抑制这一过程 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究调节性T细胞在MASLD向HCC恶性转化过程中的作用机制 | MASLD小鼠模型及其中T淋巴细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，体外功能实验 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | MASLD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 339 | 2025-11-08 |
Elucidating cardiomyocyte state transitions in zebrafish heart development using transcriptome dynamics
2025-Nov-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152736
PMID:41110187
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型分析心脏发育过程中的转录组动态，揭示了心肌细胞状态转变的关键机制 | 首次通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，识别出M5模块在心肌细胞状态转变中的关键作用，并发现smtnl1作为枢纽基因 | 研究仅聚焦于斑马鱼胚胎发育早期阶段(24-48 hpf)，未验证在哺乳动物或人类中的保守性 | 阐明心脏发育过程中心肌细胞状态转变的分子机制，为先天性心脏病发病机制提供新见解 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎心脏在24、30、36、48 hpf四个时间点的样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 340 | 2025-11-08 |
Inflammatory niches as spatial drivers of disease mechanisms and targets for personalized treatment
2025-Nov-07, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70170
PMID:41200832
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综述 | 本文探讨炎症微空间作为疾病机制的空间驱动因素及其在个性化治疗中的靶向价值 | 整合单细胞测序与空间分析技术揭示疾病特异性炎症机制，提出空间组织化炎症微环境的新范式 | NA | 解析炎症微空间在疾病机制中的作用并推动个性化治疗策略发展 | 免疫细胞与非免疫细胞在组织空间中的相互作用网络 | 空间转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞测序, 空间分析 | NA | 空间分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |