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当前共找到 38549 篇文献,本页显示第 321 - 340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2026-04-17
Single-cell epigenetic and transcriptomic states across the continuum of monoclonal B cell lymphocytosis to chronic lymphocytic leukemia
2026-Apr-15, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学测序技术,描绘了从正常B细胞到低/高计数单克隆B淋巴细胞增多症(LC-/HC-MBL)再到慢性淋巴细胞白血病(CLL)的克隆关系和进化轨迹 整合染色质可及性、转录组、蛋白质组和线粒体DNA(mtDNA)谱的多组学单细胞测序,揭示了从HC-MBL到CLL过渡期间的亚克隆、表观遗传和转录组稳定性,表明这是一个连续的疾病谱系而非不同的进化阶段 未明确提及样本量或技术平台的详细配置,可能限制结果的普适性 阐明早期B细胞扩张和分子进化的时机与性质,以改善疾病进展预测 正常B细胞、低计数单克隆B淋巴细胞增多症(LC-MBL)、高计数单克隆B淋巴细胞增多症(HC-MBL)和慢性淋巴细胞白血病(CLL) 数字病理学 慢性淋巴细胞白血病 单细胞多组学测序 NA 单细胞多组学数据(包括染色质可及性、转录组、蛋白质组和线粒体DNA) NA NA 单细胞多组学 NA NA
322 2026-04-17
Single-cell transcriptomics uncovers heterogenous cell clusters and the biomarker FUT11 in ovarian cancer progression
2026-Apr-15, Cancer cell international IF:5.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
323 2026-04-17
Benchmarking component choices for unpaired single cell RNA and epigenomic integration
2026-Apr-15, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文系统评估了未配对单细胞RNA与表观基因组数据整合流程中的组件选择,利用配对数据集进行基准测试 首次利用配对scRNA-seq与scATAC-seq/ChIP-seq数据系统评估未配对多组学整合流程,明确了各步骤(特征关联、降维、聚类)的最佳选择 研究主要基于特定配对数据集,可能未涵盖所有多组学技术或生物场景 建立稳健的未配对单细胞RNA与表观基因组数据整合通用流程 单细胞多组学数据(scRNA-seq、scATAC-seq、ChIP-seq) 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、ChIP测序 最优传输(OT) 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 NA NA
324 2026-04-17
QCatch: A framework for quality control assessment and analysis of single-cell sequencing data
2026-Apr-15, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 介绍了一个名为QCatch的Python命令行工具,用于生成针对单细胞测序数据量化结果的全面交互式HTML质量控制报告 QCatch专门为alevin-fry和simpleaf的输出设计,提供标准化质量控制报告,包含细胞识别、UMI计数分布、测序饱和度估计和剪接状态信息等可视化与统计,支持无缝集成到下游分析工作流 NA 开发一个质量控制和报告生成工具,以提高单细胞测序数据分析的可靠性和标准化 单细胞测序数据的量化结果 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
325 2026-04-17
Integrated spatial and single‑cell transcriptomics maps disulfidptosis in renal cell carcinoma and reveals PDLIM1 as a prognostic biomarker and potential therapeutic target
2026-Apr-14, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,绘制了肾细胞癌中二硫化物死亡(disulfidptosis)的图谱,并鉴定出PDLIM1作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 首次在肾细胞癌中整合空间和单细胞转录组学数据来系统描绘二硫化物死亡的组织分布、异质性及其临床相关性,并鉴定出PDLIM1这一新的预后标志物和潜在治疗靶点 研究主要基于转录组学数据分析,功能验证仅在细胞系中进行,缺乏体内实验和更广泛的临床样本验证 阐明二硫化物死亡在肾细胞癌中的组织分布、异质性、临床意义,并寻找相关的预后生物标志物和潜在治疗靶点 肾细胞癌组织样本、单细胞RNA测序数据集、TCGA数据库中的肾癌患者数据、肾癌细胞系 数字病理学 肾细胞癌 空间转录组学,单细胞RNA测序,qPCR,细胞增殖、伤口愈合和Transwell实验 RCTD去卷积分析,CytoTRACE干细胞性评估,通路富集分析 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,公共数据库转录组数据 6个肾癌切片的空间转录组数据,4个单细胞RNA测序队列,TCGA-KIRC和KIRP数据集及其他公共数据集 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
326 2026-04-17
STC2-mediated calcium homeostasis dysregulation in the osteosarcoma microenvironment: Insights from single-cell sequencing and machine learning
2026-Apr-14, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序和机器学习方法,探讨了STC2介导的钙稳态失调在骨肉瘤微环境中的作用及其预后和治疗意义 整合多种机器学习算法识别关键预后基因STC2,并结合单细胞测序分析其在骨肉瘤微环境不同细胞类型中的表达,实验验证了STC2对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用 研究结论需要进一步实验验证,特别是STC2作为免疫治疗生物标志物的预测能力 探究钙稳态失调在骨肉瘤进展中的作用,并识别关键预后基因和治疗靶点 骨肉瘤细胞系(U2OS和143B)、骨肉瘤微环境中的不同细胞类型 机器学习 骨肉瘤 单细胞表达谱分析、qPCR、增殖实验、迁移/侵袭实验、免疫解卷积分析 多种机器学习算法组合 基因表达数据、单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
327 2026-04-17
The spatiotemporal dynamics of postnatal vascularization in the mouse brain
2026-Apr-14, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究开发了一个名为LAMBADA的光片显微镜对齐小鼠大脑发育图谱资源,用于高时间分辨率地记录和注释光学透明化发育小鼠大脑,并结合空间转录组学数据,揭示了小鼠大脑出生后血管化的三个不同阶段 开发了LAMBADA资源,首次结合光学透明化大脑成像与对齐的空间转录组学数据,系统描绘了小鼠大脑出生后血管发育的时空动态过程 研究仅限于小鼠模型,未涉及其他物种;空间转录组学数据可能受技术分辨率限制 探究小鼠大脑出生后血管化的时空动态过程及其与神经元回路成熟的整合机制 发育中的小鼠大脑 数字病理学 NA 光学透明化技术、空间转录组学、光片显微镜成像 NA 图像数据、空间转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及发育时间序列的小鼠大脑样本 NA 空间转录组学 NA NA
328 2026-04-17
Amelioration of acute liver failure by a cinnamic acid derivative through inhibition of the ROS-NETosis axis
2026-Apr-13, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能验证,发现肉桂酸衍生物CA7通过抑制ROS-NETosis轴,在急性肝衰竭小鼠模型中发挥显著保护作用 首次揭示CA7通过选择性抑制活性氧产生,进而抑制中性粒细胞胞外诱捕网形成,从而发挥肝保护作用的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 探索急性肝衰竭的新型治疗策略 急性肝衰竭小鼠模型 数字病理 急性肝衰竭 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
329 2026-04-17
Mast cell homeostasis depends on KIT ligand from dermal fibroblasts and perivascular cells in mouse skin
2026-Apr-13, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过免疫荧光分析和单细胞RNA测序,揭示了小鼠皮肤中维持肥大细胞稳态的关键KIT配体来源细胞 首次系统性地通过六种条件性Kitl敲除小鼠模型,明确了皮肤中成纤维细胞和血管周围细胞(而非角质形成细胞)是维持肥大细胞稳态的关键KIT配体来源 研究仅基于小鼠模型,未在人类皮肤中进行验证;且仅关注稳态皮肤,未涉及炎症或疾病状态 探究皮肤中哪些细胞类型通过表达KIT配体来维持肥大细胞的体内稳态 小鼠耳部皮肤中的肥大细胞及其微环境细胞 免疫学 NA 免疫荧光分析,单细胞RNA测序 NA 图像数据,基因表达数据 使用六种条件性Kitl敲除小鼠模型进行研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
330 2026-04-17
Advances and limitations in angiogenesis assays: Integrating in vitro, in vivo, and emerging technologies
2026-Apr-13, Vascular pharmacology IF:3.5Q2
综述 本文全面综述了血管生成检测方法的进展与局限,整合了体外、体内及新兴技术,并提供了一个基于应用的决策框架 超越了单纯的方法描述,引入了一个全面的决策矩阵和算法选择指南,帮助研究者在生理保真度、预期结果、实验室限制和3R伦理原则之间取得平衡 本文是一篇综述,未报告新的原始实验数据,其提出的框架需要在实际研究中进一步验证 为血管生物学研究提供一个战略性的、基于应用的血管生成检测方法选择决策框架 血管生成检测方法(包括体外模型、离体系统、体内平台) 血管生物学 NA 人工智能图像分析、空间转录组学、CRISPR-Cas9筛选 NA 图像、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
331 2026-04-17
EpCAM supports exit from pluripotency of embryonic stem cells via Eomes
2026-Apr-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了EpCAM通过调控Eomes表达,在胚胎干细胞退出多能性并分化为心肌细胞过程中的关键作用 首次发现EpCAM通过Wnt信号通路调控Eomes表达,从而介导胚胎干细胞退出多能性,这一机制在自发性分化过程中至关重要 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型和体外胚胎体分化系统,尚未在完整体内胚胎发育过程中验证 探究EpCAM在胚胎干细胞退出多能性及心肌细胞分化过程中的分子机制 小鼠胚胎干细胞(mESCs)及其在胚胎体中的自发分化过程 发育生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNAseq)、转录组分析、基因敲除、条件性基因再表达 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 野生型和Epcam敲除型小鼠胚胎干细胞在不同分化时间点的样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
332 2026-04-17
Aquaporin 4 knockdown alleviates traumatic brain edema and reduces neuronal axonal growth cone collapse via the RhoA/ROCK pathway
2026-Apr-10, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究探讨了降低水通道蛋白4表达如何通过RhoA/ROCK通路减轻创伤性脑损伤后的脑水肿并减少神经元轴突生长锥塌陷 首次通过单细胞RNA测序揭示AQP4表达下调可减少星形胶质细胞分泌Sema3A,进而通过RhoA-ROCK通路减轻神经元轴突生长锥塌陷,阐明了AQP4影响神经元修复的新机制 研究主要在TBI小鼠模型中进行,其结论在人类临床中的适用性仍需进一步验证 阐明AQP4表达调控对创伤性脑损伤后脑水肿及神经保护作用的影响 创伤性脑损伤小鼠模型、星形胶质细胞、神经元 神经科学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序、DTI-MRI扫描 动物模型(小鼠) 基因表达数据、影像数据 TBI小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
333 2026-04-17
Identifying mitochondria-related signatures for tuberculosis diagnosis through machine learning on single-cell transcriptomics data and experimental verification
2026-Apr-10, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合微阵列和单细胞转录组数据,识别了与线粒体相关的基因标志物,并利用机器学习构建了一个基于血液的诊断模型,用于区分活动性肺结核、潜伏性结核感染和健康对照 首次结合单细胞转录组数据和机器学习方法,从单核细胞谱系中鉴定出与线粒体功能相关的基因标志物,并构建了一个高性能、非痰液依赖的肺结核诊断模型 模型在独立临床队列中的验证样本量相对较小(n=52),且主要基于特定细胞系(THP-1)的感染模型进行验证,需要在更广泛的人群和临床样本中进行进一步验证 开发一种可靠的非痰液依赖的肺结核早期诊断工具 活动性肺结核患者、潜伏性结核感染者和健康对照者的基因表达数据,以及H37Rv感染的THP-1细胞模型 机器学习 肺结核 微阵列,单细胞RNA测序,定量PCR LASSO, SVM-RFE, SVM 基因表达数据(微阵列和scRNA-seq) 训练集(n=125)、验证集(n=30)、两个测试集(GSE54992, n=15; GSE34608, n=26)和一个独立临床队列(n=52),总计约248个样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
334 2026-04-17
Integration of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Analyses in Biomedicine
2026-Apr-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了在生物医学中整合Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据分析的概念、方法基础、互补优势与局限性,并概述了主要的整合策略和工具 强调通过整合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,利用scRNA-seq衍生的细胞类型图谱作为参考矩阵进行Bulk数据的计算重建(解卷积),以克服各自的技术限制,并概述了包括基于参考的解卷积、伪批量聚合和贝叶斯联合建模在内的主要整合策略 本文是一篇综述,未涉及原始实验数据或具体应用案例,主要基于现有文献进行总结,可能未涵盖所有最新进展 探讨在生物医学研究中整合Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据分析的方法与策略,以提升转录组分析的解析度和准确性 Bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据及其在生物医学研究中的应用 生物信息学 NA Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 NA NA Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
335 2026-04-17
Ultrasound-Controlled Nano-Oxygen Delivery Modulates Endothelial Cells to Enhance Tumor Perfusion
2026-Apr-06, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究证明聚焦超声刺激的氧纳米气泡可有效缓解肿瘤缺氧并驱动血管正常化,从而增强肿瘤灌注和化疗疗效 提出了一种时空可控的血管重塑方法,通过聚焦超声刺激氧纳米气泡来诱导肿瘤血管正常化,并首次在单细胞水平识别出毛细血管内皮细胞中的促血管生成亚群CapEC_Spp1为关键响应靶点 未明确说明动物模型的具体类型和数量,临床样本的规模及验证深度可能有限 探索一种非药物依赖的肿瘤血管正常化策略,以克服抗血管生成药物的耐受性和全身毒性 肿瘤内皮细胞,特别是毛细血管内皮细胞亚群 肿瘤治疗与血管生物学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,临床样本数据 临床肿瘤样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
336 2026-04-17
Mesenchymal Tissue-Driven Gene Programs Identify EMP3 as a Key Biomarker of Aggressiveness in Undifferentiated Sarcomas
2026-Apr-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和空间分析,发现EMP3是未分化肉瘤中与上皮-间质转化、肿瘤进展和临床结局相关的关键间质组织驱动的生物标志物 首次将空间转录组学(CosMx)应用于未分化肉瘤异种移植模型,并结合批量RNA-seq数据,系统性地识别出EMP3作为与肿瘤侵袭性和临床预后相关的稳健间质相关生物标志物 研究主要基于异种移植模型和回顾性队列,需要在更大规模的前瞻性临床队列中进一步验证EMP3的预后和治疗价值 识别未分化肉瘤中用于预后评估和治疗分层的分子生物标志物 未分化肉瘤(包括未分化多形性肉瘤)组织、细胞系、异种移植肿瘤模型以及临床队列样本 数字病理学 肉瘤 RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 空间表达数据, 图像数据 两个UPS细胞系衍生的异种移植肿瘤、国家癌症中心队列样本、三十个US组织 NA 空间转录组学, 批量RNA-seq CosMx NA
337 2026-04-17
A palmitoylation-related prognostic risk scoring model and tumor microenvironment characterization in lung adenocarcinoma, using single-cell RNA sequencing data
2026-Apr-06, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,构建了与棕榈酰化相关的预后风险评分模型,并表征了肺腺癌的肿瘤微环境 首次在单细胞水平上揭示了棕榈酰化在肺腺癌中的细胞异质性,并整合多种机器学习算法构建了稳健的预后模型,同时鉴定出SEC61G作为潜在的治疗靶点 研究样本量相对有限,仅使用了10个LUAD样本的单细胞数据,且体外实验未观察到联合治疗的协同效应 探究棕榈酰化相关基因在肺腺癌中的表达模式、预后价值及其对肿瘤微环境和药物敏感性的影响 肺腺癌(LUAD)患者样本,包括TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量RNA-seq数据,以及10个LUAD样本的单细胞RNA测序数据 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),实时定量PCR(RT-qPCR),体外细胞实验 CoxBoost, SuperPC, 以及共10种机器学习算法 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,基因表达数据 10个肺腺癌样本的单细胞RNA测序数据,以及TCGA-LUAD和GSE68465数据集中的批量样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
338 2026-04-17
Anticancer Treatment Influences TREM2 in Tumor-Associated Macrophages in Lung Cancer
2026-Apr, Cancer research and treatment IF:4.1Q2
研究论文 本研究探讨了抗癌治疗对肺腺癌肿瘤微环境中TREM2表达巨噬细胞的影响 首次系统评估化疗药物如顺铂和奥希替尼对TREM2+巨噬细胞在肺癌肿瘤微环境中作用的直接影响 研究主要基于单细胞RNA测序数据集和体外细胞实验,缺乏大规模临床样本验证 探究抗癌治疗如何通过调节TREM2表达影响肿瘤免疫微环境 肺腺癌组织、小鼠肺癌模型及THP-1细胞系 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 配对的正常肺组织与肿瘤组织样本、小鼠模型及THP-1细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
339 2026-04-17
The m6Am methyltransferase PCIF1 promotes osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells through stabilization of Wnt-related transcripts
2026-Apr, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文揭示了m6Am甲基转移酶PCIF1通过稳定Wnt相关转录本促进间充质干细胞成骨分化的机制 首次发现PCIF1作为m6Am甲基转移酶在骨量维持和间充质干细胞成骨分化中的关键作用,并阐明其通过调控Wnt通路基因的mRNA稳定性来影响骨形成 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;PCIF1在其他细胞类型(如骨髓细胞)中的具体作用未完全阐明 探究PCIF1介导的m6Am修饰在骨稳态和成骨分化中的调控功能 间充质干细胞(MSCs)和小鼠模型 表观遗传学 骨质疏松症 GWAS, TWAS, 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
340 2026-04-17
Tumor Core-Edge Divergence in T-Cell Exhaustion and Clonal Expansion in HPV-Related Cervical Squamous Cell Carcinoma Unveiled by Simultaneous Single-Cell RNA and TCR Sequencing
2026-Apr, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA和TCR测序揭示了HPV相关宫颈鳞状细胞癌中肿瘤核心与边缘区域T细胞耗竭和克隆扩增的差异 首次在HPV相关宫颈鳞状细胞癌中同时使用单细胞RNA和TCR测序,系统比较了肿瘤核心与边缘区域的T细胞状态,并识别出一个与压力相关的耗竭CD8 T细胞亚群 样本量相对较小(scRNA-seq n=13, scTCR-seq n=9),且主要聚焦于HPV相关宫颈鳞状细胞癌,其他癌症类型的验证依赖于公共数据集 探究肿瘤空间结构(核心与边缘)对T细胞耗竭状态和克隆性的影响,以寻找预后生物标志物和潜在治疗靶点 HPV相关宫颈鳞状细胞癌患者的配对肿瘤核心与边缘组织样本中的T细胞 单细胞组学 宫颈癌 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 批量RNA测序, 免疫荧光 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 批量转录组数据, 公共癌症基因组数据 13例患者的单细胞RNA测序样本, 9例患者的单细胞TCR测序样本, 41例患者的批量RNA测序数据, 以及来自TCGA和结直肠癌的公共数据集 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq NA NA
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