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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-11-14 |
Association of neuronal autoantibodies with overall survival in gastric cancer patients
2025-Nov-13, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0495
PMID:41230722
|
研究论文 | 本研究探讨胃癌患者中神经元自身抗体与总体生存期的关联 | 首次在无副肿瘤综合征的胃癌患者中发现神经元自身抗体,并揭示其与生存期缩短和肿瘤免疫抑制微环境的关联 | 单中心队列研究,样本量有限,需要进一步机制研究验证 | 探究胃癌患者神经元自身抗体与临床预后的关系 | 胃癌患者血清样本和肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 免疫荧光,组织基础检测,细胞基础检测,单细胞测序 | NA | 血清学数据,单细胞测序数据,临床预后数据 | 323例胃癌患者(TBA阳性144例,TBA阴性179例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-11-14 |
Pan-cancer single-cell RNA sequencing analysis refines multi-origin monocyte and macrophage lineages
2025-Nov-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1255
PMID:41231218
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析构建泛癌骨髓细胞图谱,揭示肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型及其与临床预后的关联 | 提出肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型:C1QC+ TAMs来源于组织驻留巨噬细胞,SPP1+和ISG15+ TAMs来源于循环单核细胞 | NA | 解析肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 健康组织和泛癌组织中的骨髓细胞群体 | 单细胞组学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2025-11-14 |
PPARα Activation-Mediated Testosterone Reduction as the Key Adverse Outcome Pathway for Cd-Induced Male Infertility: A Novel Integrated Approach
2025-Nov-13, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c09190
PMID:41231235
|
研究论文 | 本研究通过整合多种方法识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 首次系统构建镉诱导男性不育的AOP网络并识别PPARα激活介导睾酮减少为关键通路 | 未明确说明样本规模和研究人群的局限性 | 识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 镉暴露的男性生殖系统 | 环境毒理学 | 男性不育 | 单细胞测序,网络毒理学,分子建模,动物实验 | NA | 单细胞测序数据,NHANES流行病学数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-11-14 |
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2025-Nov-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0940
PMID:41231245
|
研究论文 | 开发了CanSig基准测试工具,用于评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 开发了首个综合评估单细胞转录组特征发现方法可重复性的基准测试框架 | 仅评估了13种方法在12个数据集上的表现,覆盖的癌症类型和方法数量有限 | 建立标准化框架评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 单细胞RNA测序数据和癌症细胞状态发现方法 | 生物信息学 | 多癌种(胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤、皮肤鳞状细胞癌) | 单细胞RNA测序 | 多种整合方法(包括Harmony、BBKNN、fastMNN等) | 单细胞转录组数据 | 185名患者的174,000个恶性细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 325 | 2025-11-14 |
Insulin production is sustained during DNA damage-mediated senescence in adult human beta cells
2025-Nov-13, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06603-3
PMID:41231256
|
研究论文 | 本研究探讨DNA损伤介导的衰老对成人胰岛β细胞胰岛素产生的影响 | 首次证明在DNA损伤介导的衰老过程中,成人胰岛β细胞仍能维持胰岛素产生能力 | 研究主要使用体外诱导的衰老模型,体内验证仍需进一步研究 | 阐明DNA损伤相关衰老对胰岛β细胞胰岛素产生的影响机制 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5人β细胞系 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | Western blot, ELISA, 流式细胞术, FACS, 免疫荧光染色 | NA | 蛋白质印迹数据, 酶联免疫数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5细胞系及公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | Humanislets.com蛋白质组学数据库和Human Pancreas Analysis Program单细胞RNA测序数据库 |
| 326 | 2025-11-14 |
An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0966
PMID:41223328
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和肿瘤芯片技术,识别出一种产生细胞外基质的癌症相关成纤维细胞亚群(ECM-myCAFs),该亚群通过激活SRC激酶和上调G0S2驱动三阴性乳腺癌化疗耐药 | 首次识别出特定的ECM-myCAF亚群在化疗耐药中的关键作用,并揭示SRC激活和G0S2上调是介导耐药的新机制 | 研究主要基于体外模型,需要进一步体内验证;机制细节如ECM-myCAFs分泌的具体因子尚未完全阐明 | 解析三阴性乳腺癌化疗耐药机制,识别驱动耐药的关键CAF亚群 | 三阴性乳腺癌患者样本和肿瘤芯片模型中的癌细胞与癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 肿瘤芯片技术, 高级细胞成像, 功能分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 三阴性乳腺癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2025-11-14 |
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
PMID:41223329
|
研究论文 | 开发了跨物种整合癌症细胞状态的深度学习工具scVital | 使用变分自编码器和判别器创建物种无关的潜在空间,并开发了潜在空间相似性评分新指标 | NA | 克服物种间比较的生物批次效应,识别跨物种共享的细胞状态 | 基因工程小鼠模型和原发性患者样本中的癌细胞状态 | 机器学习 | 胰腺癌,肺癌,肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2025-11-14 |
Label-free selection of marker genes in single-cell and spatial transcriptomics with geneCover
2025-Nov-12, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280539.125
PMID:41224531
|
研究论文 | 介绍了一种名为geneCover的无标记组合方法,用于在单细胞和空间转录组学中选择最优标记基因面板 | 提出首个基于基因-基因相关性的无标记组合方法,能够有效识别稀有细胞类型和细微空间模式,并具有优秀的大数据集扩展性 | 未提及方法在特定数据类型或实验条件下的潜在限制 | 开发无需预定义细胞类型标签的标记基因选择方法,以更好地捕捉细胞和空间异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 组合优化方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 329 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals immune remodeling in bone marrow during aged sepsis
2025-Nov-12, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01966-2
PMID:41225282
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示老年脓毒症中骨髓免疫重塑的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘老年脓毒症的骨髓免疫图谱,发现HSC-髓系细胞间Lgals9-Cd44信号通路的通讯障碍是免疫衰竭的关键机制 | 临床可行性和安全性尚未验证,样本量较小(每组2-3只小鼠) | 探究老年脓毒症免疫功能障碍的分子机制 | 年轻和老年雄性小鼠的骨髓免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,CellChat细胞通讯分析,Transwell迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 10只小鼠(Y-Sham组2只,Y-CLP组3只,A-Sham组2只,A-CLP组3只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2025-11-14 |
Four Decades of Inquiry Into the Genetic Bases of Specific Reading Disability
2025-Nov-11, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR
DOI:10.1044/2025_JSLHR-25-00050
PMID:41091061
|
研究论文 | 本研究通过系统分析40年来与特定阅读障碍相关的候选基因,探索其进化保守性、发育表达模式和功能网络 | 挑战了阅读特异性基因存在的观点,提出特定阅读障碍反映了古老进化神经机制在人类特有脑结构中的破坏 | 基于文献回顾的候选基因方法可能存在选择偏差,功能验证实验不足 | 理解阅读障碍的遗传基础架构 | 175个特定阅读障碍候选基因 | 遗传学 | 特定阅读障碍 | 生物信息学分析、发育转录组分析、单细胞转录组分析、功能通路分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 175个候选基因 | 艾伦脑科学研究所 | 单细胞RNA-seq, 发育转录组学 | 艾伦脑图谱 | 艾伦脑图谱发育和单细胞转录组数据集 |
| 331 | 2025-11-14 |
A phenotype-driven data and drug repurposing strategy used to identify potential treatments targeting chondrocyte hypertrophy in osteoarthritis
2025-Nov-11, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118773
PMID:41223767
|
研究论文 | 本研究通过表型驱动的数据和药物重定位策略,结合单细胞转录组学数据识别能够逆转骨关节炎中软骨细胞肥大表型的潜在治疗方法 | 首次将单细胞转录组学数据与药物重定位策略相结合,应用特征逆转原理来识别针对软骨细胞肥大表型的潜在治疗药物 | 研究主要基于体外实验和离体组织验证,尚未进行体内动物模型或临床试验验证 | 开发针对骨关节炎中软骨细胞肥大表型的有效药物治疗策略 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织外植体 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,基因表达分析,体外细胞培养,离体组织培养 | 特征逆转分析,基因表达速度分析 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 332 | 2025-11-14 |
"Oxygen tone" drives stage-specific OPC phenotypes for cell-based stroke therapy
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102709
PMID:41223837
|
研究论文 | 本研究探索缺氧如何影响缺血性中风后少突胶质前体细胞(OPCs)的表型特征 | 揭示了氧浓度依赖的OPC表型可同时促进血管生成和髓鞘再生 | NA | 探索缺氧环境对OPC功能特性的影响及其在中风细胞治疗中的潜力 | 少突胶质前体细胞(OPCs) | 单细胞转录组学 | 缺血性中风 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2025-11-14 |
Matrix metalloproteinases are hallmark early biomarkers and therapeutic targets in FSHD
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195104
PMID:40966415
|
研究论文 | 本研究揭示了基质金属蛋白酶(MMPs)在面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中作为早期生物标志物和治疗靶点的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序确定FAPs和巨噬细胞是MMPs的主要来源,并证明泛MMP抑制剂batimastat可改善FSHD病理特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究MMPs在FSHD疾病进展中的作用机制及治疗潜力 | 面肩肱型肌营养不良症(FSHD)患者活检样本和iDUX4pA FSHD小鼠模型 | 生物医学研究 | 肌肉营养不良症 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 334 | 2025-11-14 |
Platelets impair the resolution of inflammation in atherosclerotic plaques in insulin-resistant mice after lipid lowering
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193593
PMID:41066197
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研究论文 | 本研究揭示血小板通过阻碍巨噬细胞向促消退表型转化,削弱胰岛素抵抗小鼠动脉粥样硬化斑块在降脂治疗中的炎症消退过程 | 首次证明血小板会阻碍降脂治疗期间动脉粥样硬化斑块的炎症消退,并发现Fcgr4+巨噬细胞亚群在炎症消退中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床数据仅涉及循环单核细胞分析 | 探究血小板在胰岛素抵抗背景下如何影响降脂治疗诱导的动脉粥样硬化斑块炎症消退 | 肥胖且胰岛素抵抗的小鼠模型及临床患者数据 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 小鼠模型及临床患者队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2025-11-14 |
Single Cell Transcriptomics of Traditional Chinese Medicine Bioactives: Mapping Immune, Neural and Hepatic Responses
2025-Nov-10, Zhongguo ying yong sheng li xue za zhi = Zhongguo yingyong shenglixue zazhi = Chinese journal of applied physiology
DOI:10.62958/j.cjap.2025.028
PMID:41207694
|
研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序技术解析中药活性成分对免疫、神经和肝脏系统的细胞特异性反应 | 首次在单细胞分辨率揭示中药活性成分的细胞特异性药效学机制,发现传统批量转录组学研究无法检测的细胞类型特异性反应 | 研究仅使用小鼠模型,样本数量相对有限,需要进一步人体验证 | 阐明中药活性成分在免疫、神经和肝脏系统中的细胞特异性药理作用机制 | 小鼠脾脏、海马体和肝脏组织分离的单细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫荧光 | Seurat,CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过42,000个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 336 | 2025-11-14 |
Descendants of hypertrophic chondrocytes promote angiogenesis by secreting THBS4 during bone growth and injury repair
2025-Nov-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00469-2
PMID:41207902
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研究论文 | 本研究揭示了肥大软骨细胞后代通过分泌THBS4促进血管生成在骨骼生长和损伤修复中的关键作用 | 首次发现肥大软骨细胞后代中特定细胞亚群(PADs)通过分泌THBS4调控血管生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肥大软骨细胞转化在骨骼发育和修复中的病理生理意义 | 小鼠肥大软骨细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,组织透明化,体外细胞培养 | Col10a1-Cre; R26基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠股骨和跖骨样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-11-14 |
Unveiling prognostic biomarkers and immunotherapeutic insights in prostate cancer through multi-omics and machine learning
2025-Nov-10, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03363-z
PMID:41207909
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别前列腺癌预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 整合单细胞和bulk转录组数据,开发包含14种算法和162种算法组合的机器学习框架构建共识免疫预后特征 | NA | 评估前列腺癌相关基因的临床相关性和预后潜力 | 前列腺癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学分析 | 机器学习集成算法 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2025-11-14 |
STAT3 regulates NK and NKT cell differentiation through C-X3-C motif chemokine receptor 1 (CX3CR1) in hyper-IgE syndrome
2025-Nov-10, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00323-1
PMID:41212476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术揭示了STAT3基因突变通过CX3CR1调控NK和NKT细胞分化在高IgE综合征中的作用机制 | 首次发现STAT3突变导致CX3CR1CD57 NK和NKT细胞群体增加,并通过CUT&Tag分析揭示突变STAT3增强与IL-4转录起始位点的结合 | STAT3突变的分子机制仍然复杂且未完全阐明,研究样本量有限 | 探究STAT3突变在高IgE综合征中导致免疫失调的分子机制 | STAT3突变患者、STAT3条件性敲除小鼠的免疫细胞(NK细胞、NKT细胞、CD4 T细胞) | 免疫学 | 高IgE综合征 | 单细胞测序, 流式细胞术, CUT&Tag分析 | NA | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 表观基因组数据 | STAT3突变患者和STAT3条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 339 | 2025-11-14 |
MZT2B promotes malignant phenotypes in NSCLC cells by enhancing mitochondrial function and COX5B expression
2025-Nov-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08182-y
PMID:41213905
|
研究论文 | 本研究揭示MZT2B通过增强线粒体功能和促进COX5B表达驱动非小细胞肺癌恶性进展的分子机制 | 首次发现MZT2B在NSCLC中的致癌作用及其通过调控线粒体功能和COX5B表达促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索NSCLC新型治疗靶点及MZT2B的致癌机制 | 非小细胞肺癌细胞系、临床组织标本和皮下异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, shRNA基因沉默, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 功能实验数据 | TCGA数据库NSCLC组织样本、多种NSCLC细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2025-11-14 |
Distinct autoreactive CD19- plasma cell subsets accumulate in lupus-prone mice
2025-Nov-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65906-6
PMID:41213970
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术鉴定了狼疮易感小鼠中自身反应性CD19⁻浆细胞亚群的积累特征 | 首次发现自身反应性CD19⁻浆细胞亚群在狼疮发病中的关键作用,并揭示其独特的基因表达谱和来源途径 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 鉴定系统性红斑狼疮中致病性浆细胞亚群,为靶向治疗提供依据 | 狼疮易感小鼠和系统性红斑狼疮患者外周血 | 单细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, 遗传模型 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 狼疮易感小鼠模型和SLE患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |